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***  6JXR-ASP137-ALA  ***

LOGs for ID: 210717020543101373

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210717020543101373.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210717020543101373.atom to be opened. Openam> File opened: 210717020543101373.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1074 First residue number = 22 Last residue number = 1 Number of atoms found = 8463 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 165.905652 +/- 21.904243 From: 107.646000 To: 212.636000 = 144.635730 +/- 14.344313 From: 105.556000 To: 184.940000 = 169.572580 +/- 25.361089 From: 107.647000 To: 228.970000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9404 % Filled. Pdbmat> 3031036 non-zero elements. Pdbmat> 331187 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.27 +/- 21.35 Maximum number = 127 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 6.623740E+06 Pdbmat> Larger element = 483.182 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1074 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210717020543101373.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210717020543101373.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210717020543101373.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8463 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1074 residues. Blocpdb> 46 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 50 atoms in block 2 Block first atom: 47 Blocpdb> 44 atoms in block 3 Block first atom: 97 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 141 Blocpdb> 47 atoms in block 5 Block first atom: 191 Blocpdb> 49 atoms in block 6 Block first atom: 238 Blocpdb> 46 atoms in block 7 Block first atom: 287 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 333 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 384 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 431 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 477 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 527 Blocpdb> 52 atoms in block 13 Block first atom: 547 Blocpdb> 52 atoms in block 14 Block first atom: 599 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 651 Blocpdb> 51 atoms in block 16 Block first atom: 698 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 749 Blocpdb> 48 atoms in block 18 Block first atom: 786 Blocpdb> 48 atoms in block 19 Block first atom: 834 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 882 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 928 Blocpdb> 52 atoms in block 22 Block first atom: 977 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1029 Blocpdb> 54 atoms in block 24 Block first atom: 1076 Blocpdb> 45 atoms in block 25 Block first atom: 1130 Blocpdb> 39 atoms in block 26 Block first atom: 1175 Blocpdb> 42 atoms in block 27 Block first atom: 1214 Blocpdb> 43 atoms in block 28 Block first atom: 1256 Blocpdb> 43 atoms in block 29 Block first atom: 1299 Blocpdb> 45 atoms in block 30 Block first atom: 1342 Blocpdb> 51 atoms in block 31 Block first atom: 1387 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1438 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1476 Blocpdb> 47 atoms in block 34 Block first atom: 1519 Blocpdb> 57 atoms in block 35 Block first atom: 1566 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1623 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1664 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1714 Blocpdb> 50 atoms in block 39 Block first atom: 1757 Blocpdb> 52 atoms in block 40 Block first atom: 1807 Blocpdb> 47 atoms in block 41 Block first atom: 1859 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 1906 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 1955 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2003 Blocpdb> 47 atoms in block 45 Block first atom: 2059 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2106 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 2154 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 2194 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 2239 Blocpdb> 59 atoms in block 50 Block first atom: 2278 Blocpdb> 33 atoms in block 51 Block first atom: 2337 Blocpdb> 45 atoms in block 52 Block first atom: 2370 Blocpdb> 51 atoms in block 53 Block first atom: 2415 Blocpdb> 48 atoms in block 54 Block first atom: 2466 Blocpdb> 44 atoms in block 55 Block first atom: 2514 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2558 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 2602 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 2655 Blocpdb> 51 atoms in block 59 Block first atom: 2703 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2754 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2802 Blocpdb> 48 atoms in block 62 Block first atom: 2846 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 2894 Blocpdb> 55 atoms in block 64 Block first atom: 2941 Blocpdb> 48 atoms in block 65 Block first atom: 2996 Blocpdb> 43 atoms in block 66 Block first atom: 3044 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 3087 Blocpdb> 46 atoms in block 68 Block first atom: 3131 Blocpdb> 46 atoms in block 69 Block first atom: 3177 Blocpdb> 47 atoms in block 70 Block first atom: 3223 Blocpdb> 4 atoms in block 71 Block first atom: 3270 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3274 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3315 Blocpdb> 38 atoms in block 74 Block first atom: 3359 Blocpdb> 47 atoms in block 75 Block first atom: 3397 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 3444 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 3498 Blocpdb> 46 atoms in block 78 Block first atom: 3564 Blocpdb> 55 atoms in block 79 Block first atom: 3610 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3665 Blocpdb> 46 atoms in block 81 Block first atom: 3707 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 3753 Blocpdb> 54 atoms in block 83 Block first atom: 3798 Blocpdb> 49 atoms in block 84 Block first atom: 3852 Blocpdb> 44 atoms in block 85 Block first atom: 3901 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3945 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3987 Blocpdb> 43 atoms in block 88 Block first atom: 4024 Blocpdb> 44 atoms in block 89 Block first atom: 4067 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 4111 Blocpdb> 52 atoms in block 91 Block first atom: 4158 Blocpdb> 43 atoms in block 92 Block first atom: 4210 Blocpdb> 47 atoms in block 93 Block first atom: 4253 Blocpdb> 49 atoms in block 94 Block first atom: 4300 Blocpdb> 43 atoms in block 95 Block first atom: 4349 Blocpdb> 50 atoms in block 96 Block first atom: 4392 Blocpdb> 46 atoms in block 97 Block first atom: 4442 Blocpdb> 49 atoms in block 98 Block first atom: 4488 Blocpdb> 48 atoms in block 99 Block first atom: 4537 Blocpdb> 45 atoms in block 100 Block first atom: 4585 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 4630 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 4675 Blocpdb> 46 atoms in block 103 Block first atom: 4720 Blocpdb> 49 atoms in block 104 Block first atom: 4766 Blocpdb> 42 atoms in block 105 Block first atom: 4815 Blocpdb> 48 atoms in block 106 Block first atom: 4857 Blocpdb> 50 atoms in block 107 Block first atom: 4905 Blocpdb> 52 atoms in block 108 Block first atom: 4955 Blocpdb> 47 atoms in block 109 Block first atom: 5007 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 5054 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 5102 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 5146 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 5202 Blocpdb> 41 atoms in block 114 Block first atom: 5214 Blocpdb> 53 atoms in block 115 Block first atom: 5255 Blocpdb> 41 atoms in block 116 Block first atom: 5308 Blocpdb> 45 atoms in block 117 Block first atom: 5349 Blocpdb> 55 atoms in block 118 Block first atom: 5394 Blocpdb> 60 atoms in block 119 Block first atom: 5449 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 5509 Blocpdb> 51 atoms in block 121 Block first atom: 5548 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 5599 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 5635 Blocpdb> 48 atoms in block 124 Block first atom: 5679 Blocpdb> 48 atoms in block 125 Block first atom: 5727 Blocpdb> 48 atoms in block 126 Block first atom: 5775 Blocpdb> 39 atoms in block 127 Block first atom: 5823 Blocpdb> 47 atoms in block 128 Block first atom: 5862 Blocpdb> 46 atoms in block 129 Block first atom: 5909 Blocpdb> 45 atoms in block 130 Block first atom: 5955 Blocpdb> 44 atoms in block 131 Block first atom: 6000 Blocpdb> 46 atoms in block 132 Block first atom: 6044 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 6090 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 6140 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6186 Blocpdb> 49 atoms in block 136 Block first atom: 6231 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 6280 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 6321 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6367 Blocpdb> 56 atoms in block 140 Block first atom: 6415 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6471 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6514 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6558 Blocpdb> 53 atoms in block 144 Block first atom: 6605 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 6658 Blocpdb> 47 atoms in block 146 Block first atom: 6703 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 6750 Blocpdb> 54 atoms in block 148 Block first atom: 6807 Blocpdb> 50 atoms in block 149 Block first atom: 6861 Blocpdb> 55 atoms in block 150 Block first atom: 6911 Blocpdb> 49 atoms in block 151 Block first atom: 6966 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 7015 Blocpdb> 48 atoms in block 153 Block first atom: 7059 Blocpdb> 41 atoms in block 154 Block first atom: 7107 Blocpdb> 51 atoms in block 155 Block first atom: 7148 Blocpdb> 37 atoms in block 156 Block first atom: 7199 Blocpdb> 53 atoms in block 157 Block first atom: 7236 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 7289 Blocpdb> 45 atoms in block 159 Block first atom: 7330 Blocpdb> 41 atoms in block 160 Block first atom: 7375 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7416 Blocpdb> 51 atoms in block 162 Block first atom: 7460 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 7511 Blocpdb> 43 atoms in block 164 Block first atom: 7549 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7592 Blocpdb> 57 atoms in block 166 Block first atom: 7639 Blocpdb> 41 atoms in block 167 Block first atom: 7696 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7737 Blocpdb> 43 atoms in block 169 Block first atom: 7787 Blocpdb> 50 atoms in block 170 Block first atom: 7830 Blocpdb> 52 atoms in block 171 Block first atom: 7880 Blocpdb> 47 atoms in block 172 Block first atom: 7932 Blocpdb> 49 atoms in block 173 Block first atom: 7979 Blocpdb> 48 atoms in block 174 Block first atom: 8028 Blocpdb> 56 atoms in block 175 Block first atom: 8076 Blocpdb> 47 atoms in block 176 Block first atom: 8132 Blocpdb> 48 atoms in block 177 Block first atom: 8179 Blocpdb> 40 atoms in block 178 Block first atom: 8227 Blocpdb> 42 atoms in block 179 Block first atom: 8267 Blocpdb> 39 atoms in block 180 Block first atom: 8309 Blocpdb> 59 atoms in block 181 Block first atom: 8348 Blocpdb> 28 atoms in block 182 Block first atom: 8407 Blocpdb> 29 atoms in block 183 Block first atom: 8434 Blocpdb> 183 blocks. Blocpdb> At most, 66 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3031219 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 25389 Prepmat> Matrix trace = 6623740.0000 Prepmat> Last element read: 25389 25389 237.6029 Prepmat> 16837 lines saved. Prepmat> 15323 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8463 RTB> Total mass = 8463.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8463 RTB> Number of blocks = 183 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188359.0013 RTB> 51723 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1098 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51723 Diagstd> Projected matrix trace = 188359.0013 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1098 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188359.0013 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1914812 0.2744139 0.4169640 0.5492303 0.6909028 1.2287064 1.4571781 1.8537251 1.9822022 2.1655708 2.2754718 2.5518529 3.2645547 3.5100974 3.7750326 3.9651775 4.2093704 4.7220028 4.8033502 5.2514855 5.6047939 5.7068593 6.0449740 6.1938723 6.5416701 6.9348583 7.0912118 7.2033452 7.6272549 7.6743181 8.4106905 9.1921472 9.2547366 9.4039691 10.0999473 10.4742200 10.5391339 11.2879865 11.7931205 11.9131610 12.3053838 12.5895157 12.7662932 13.2705088 13.9240433 14.1169976 14.1702359 14.5145880 14.7728464 15.2672081 15.5669521 15.8851153 16.6673870 16.9783062 17.6720267 18.1221243 18.3835961 18.7699042 19.0431690 19.4564630 19.7495042 20.0599561 20.2080316 20.5854358 21.2798124 21.4898337 21.7348659 22.1378578 22.6137913 22.8191198 23.2246907 23.4905263 23.6884749 23.9465383 24.2406376 24.9539284 25.2215634 25.4508581 25.6631957 26.0938580 26.4792787 26.6022466 26.8322297 27.2409430 28.0605397 28.1991528 28.4276264 28.8972040 29.2577671 29.8738704 30.5088759 30.6373713 30.9018122 31.5863585 31.8707722 31.9616744 32.3688870 32.8042324 33.4316218 33.6928974 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034312 0.0034325 0.0034336 0.0034337 0.0034337 0.0034339 47.5180262 56.8850796 70.1204282 80.4771366 90.2617485 120.3702974 131.0845759 147.8488481 152.8865399 159.8017305 163.8064527 173.4694872 196.2037288 203.4486740 210.9869697 216.2353021 222.7941859 235.9708749 237.9947662 248.8492664 257.0840319 259.4142713 266.9884645 270.2566595 277.7407464 285.9657867 289.1715143 291.4488813 299.9020332 300.8258672 314.9278781 329.2333070 330.3522830 333.0050936 345.1078472 351.4439946 352.5313477 364.8409027 372.9148238 374.8079426 380.9279694 385.3006950 387.9963930 395.5843189 405.2079544 408.0059067 408.7745236 413.7115410 417.3759030 424.3020134 428.4469690 432.8032026 443.3319589 447.4478863 456.4975589 462.2743883 465.5973665 470.4639044 473.8761931 478.9908604 482.5845108 486.3627099 488.1544879 492.6917763 500.9324641 503.3983726 506.2601726 510.9319681 516.3949311 518.7340120 523.3235149 526.3100389 528.5229266 531.3940056 534.6472032 542.4562817 545.3574902 547.8308622 550.1114040 554.7079981 558.7896526 560.0856403 562.5014701 566.7693404 575.2323341 576.6513467 578.9826908 583.7450251 587.3755562 593.5277469 599.8026541 601.0644329 603.6528494 610.3023756 613.0438973 613.9175399 617.8160176 621.9567998 627.8761738 630.3248950 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8463 Rtb_to_modes> Number of blocs = 183 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9837E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2744 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.854 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.965 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.722 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.803 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.045 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.203 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.674 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.411 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1098 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00005 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99995 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 152334 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00005 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00005 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99996 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99995 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99996 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210717020543101373.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210717020543101373.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210717020543101373.atom Openam> file on opening on unit 11: 210717020543101373.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1074 First residue number = 22 Last residue number = 1 Number of atoms found = 8463 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9837E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9977E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.854 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.965 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.722 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.803 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.045 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.203 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.674 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.411 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Bfactors> 106 vectors, 25389 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.191500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.683 for 1073 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.046 +/- 0.04 Bfactors> = 50.592 +/- 20.72 Bfactors> Shiftng-fct= 50.547 Bfactors> Scaling-fct= 506.662 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210717020543101373.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210717020543101373.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.3 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Chkmod> That is: 8463 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7323 0.0034 0.6994 0.0034 0.9863 0.0034 0.6649 0.0034 0.7186 0.0034 0.9872 47.5183 0.5277 56.8812 0.6905 70.1204 0.3230 80.4715 0.6311 90.2577 0.4697 120.3795 0.4673 131.0709 0.5541 147.8535 0.1501 152.8722 0.3017 159.8107 0.5627 163.7824 0.3999 173.4670 0.6151 196.2087 0.4490 203.4371 0.4760 210.9770 0.5154 216.2212 0.2870 222.7748 0.6361 235.9607 0.4650 237.9759 0.6141 248.8271 0.5199 257.0777 0.3328 259.4063 0.4437 266.9776 0.2476 270.2478 0.2744 277.7358 0.6148 285.9564 0.3041 289.1548 0.3959 291.4294 0.3860 299.8841 0.5613 300.8067 0.5387 314.9202 0.5596 329.2165 0.2346 330.3428 0.5478 332.9913 0.4501 345.0939 0.1902 351.3581 0.2823 352.5307 0.2255 364.8578 0.4148 372.8495 0.5578 374.7421 0.4063 380.9831 0.4607 385.2916 0.4205 388.0361 0.3994 395.5598 0.3875 405.1317 0.3464 408.0318 0.5065 408.7536 0.2611 413.6284 0.4152 417.3178 0.3965 424.3226 0.3066 428.4705 0.3693 432.8512 0.4789 443.3477 0.4138 447.4510 0.3641 456.4518 0.4782 462.2275 0.2488 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small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717020543101373.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210717020543101373 8 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating 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getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 210717020543101373 9 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=50 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom making animated gifs 6 models are in 210717020543101373.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717020543101373.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717020543101373.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210717020543101373 10 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom 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6 models are in 210717020543101373.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210717020543101373 11 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717020543101373.eigenfacs 210717020543101373.atom calculating perturbed structure for DQ=50 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