CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 21071218450377297

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21071218450377297.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21071218450377297.atom to be opened. Openam> File opened: 21071218450377297.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 326 First residue number = -4 Last residue number = 329 Number of atoms found = 2482 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 3.480252 +/- 25.066091 From: -49.063000 To: 58.642000 = 1.911262 +/- 14.102684 From: -36.017000 To: 29.577000 = -2.766905 +/- 8.095578 From: -23.343000 To: 16.983000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.8438 % Filled. Pdbmat> 788442 non-zero elements. Pdbmat> 85965 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 69.27 +/- 22.99 Maximum number = 125 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.719300E+06 Pdbmat> Larger element = 468.184 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 326 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21071218450377297.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21071218450377297.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21071218450377297.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2482 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 326 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 22 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 18 atoms in block 3 Block first atom: 36 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 54 Blocpdb> 16 atoms in block 5 Block first atom: 70 Blocpdb> 10 atoms in block 6 Block first atom: 86 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 96 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 114 Blocpdb> 16 atoms in block 9 Block first atom: 127 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 143 Blocpdb> 12 atoms in block 11 Block first atom: 162 Blocpdb> 13 atoms in block 12 Block first atom: 174 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 187 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 204 Blocpdb> 16 atoms in block 15 Block first atom: 220 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 236 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 253 Blocpdb> 16 atoms in block 18 Block first atom: 264 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 280 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 292 Blocpdb> 17 atoms in block 21 Block first atom: 315 Blocpdb> 13 atoms in block 22 Block first atom: 332 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 345 Blocpdb> 15 atoms in block 24 Block first atom: 364 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 379 Blocpdb> 17 atoms in block 26 Block first atom: 395 Blocpdb> 16 atoms in block 27 Block first atom: 412 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 428 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 448 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 459 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 473 Blocpdb> 13 atoms in block 32 Block first atom: 491 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 504 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 524 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 539 Blocpdb> 12 atoms in block 36 Block first atom: 553 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 565 Blocpdb> 15 atoms in block 38 Block first atom: 581 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 596 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 618 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 633 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 649 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 664 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 679 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 692 Blocpdb> 12 atoms in block 46 Block first atom: 704 Blocpdb> 20 atoms in block 47 Block first atom: 716 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 736 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 751 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 768 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 790 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 809 Blocpdb> 13 atoms in block 53 Block first atom: 823 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 836 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 856 Blocpdb> 15 atoms in block 56 Block first atom: 869 Blocpdb> 9 atoms in block 57 Block first atom: 884 Blocpdb> 15 atoms in block 58 Block first atom: 893 Blocpdb> 20 atoms in block 59 Block first atom: 908 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 928 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 942 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 958 Blocpdb> 15 atoms in block 63 Block first atom: 971 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 986 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 1001 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1015 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 1034 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1045 Blocpdb> 10 atoms in block 69 Block first atom: 1061 Blocpdb> 15 atoms in block 70 Block first atom: 1071 Blocpdb> 11 atoms in block 71 Block first atom: 1086 Blocpdb> 15 atoms in block 72 Block first atom: 1097 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1112 Blocpdb> 18 atoms in block 74 Block first atom: 1122 Blocpdb> 14 atoms in block 75 Block first atom: 1140 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1154 Blocpdb> 18 atoms in block 77 Block first atom: 1167 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1185 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 1204 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1216 Blocpdb> 17 atoms in block 81 Block first atom: 1235 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1252 Blocpdb> 11 atoms in block 83 Block first atom: 1271 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 1282 Blocpdb> 15 atoms in block 85 Block first atom: 1296 Blocpdb> 16 atoms in block 86 Block first atom: 1311 Blocpdb> 16 atoms in block 87 Block first atom: 1327 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1343 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1359 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1374 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1391 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1408 Blocpdb> 15 atoms in block 93 Block first atom: 1423 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 1438 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1458 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1477 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1491 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1507 Blocpdb> 13 atoms in block 99 Block first atom: 1523 Blocpdb> 12 atoms in block 100 Block first atom: 1536 Blocpdb> 13 atoms in block 101 Block first atom: 1548 Blocpdb> 17 atoms in block 102 Block first atom: 1561 Blocpdb> 12 atoms in block 103 Block first atom: 1578 Blocpdb> 12 atoms in block 104 Block first atom: 1590 Blocpdb> 20 atoms in block 105 Block first atom: 1602 Blocpdb> 9 atoms in block 106 Block first atom: 1622 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1631 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1652 Blocpdb> 13 atoms in block 109 Block first atom: 1667 Blocpdb> 18 atoms in block 110 Block first atom: 1680 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1698 Blocpdb> 11 atoms in block 112 Block first atom: 1712 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 1723 Blocpdb> 13 atoms in block 114 Block first atom: 1735 Blocpdb> 13 atoms in block 115 Block first atom: 1748 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 1761 Blocpdb> 12 atoms in block 117 Block first atom: 1772 Blocpdb> 15 atoms in block 118 Block first atom: 1784 Blocpdb> 13 atoms in block 119 Block first atom: 1799 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1812 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1830 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1849 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1864 Blocpdb> 14 atoms in block 124 Block first atom: 1879 Blocpdb> 13 atoms in block 125 Block first atom: 1893 Blocpdb> 17 atoms in block 126 Block first atom: 1906 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1923 Blocpdb> 16 atoms in block 128 Block first atom: 1939 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 1955 Blocpdb> 16 atoms in block 130 Block first atom: 1975 Blocpdb> 12 atoms in block 131 Block first atom: 1991 Blocpdb> 22 atoms in block 132 Block first atom: 2003 Blocpdb> 12 atoms in block 133 Block first atom: 2025 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 2037 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2050 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2064 Blocpdb> 16 atoms in block 137 Block first atom: 2076 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2092 Blocpdb> 13 atoms in block 139 Block first atom: 2105 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2118 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2133 Blocpdb> 12 atoms in block 142 Block first atom: 2150 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2162 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2178 Blocpdb> 14 atoms in block 145 Block first atom: 2194 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2208 Blocpdb> 19 atoms in block 147 Block first atom: 2222 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 2241 Blocpdb> 14 atoms in block 149 Block first atom: 2258 Blocpdb> 13 atoms in block 150 Block first atom: 2272 Blocpdb> 13 atoms in block 151 Block first atom: 2285 Blocpdb> 13 atoms in block 152 Block first atom: 2298 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 2311 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2328 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2344 Blocpdb> 16 atoms in block 156 Block first atom: 2357 Blocpdb> 15 atoms in block 157 Block first atom: 2373 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 2388 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 2406 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2425 Blocpdb> 15 atoms in block 161 Block first atom: 2441 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2456 Blocpdb> 14 atoms in block 163 Block first atom: 2468 Blocpdb> 163 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 788605 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7446 Prepmat> Matrix trace = 1719300.0000 Prepmat> Last element read: 7446 7446 43.3002 Prepmat> 13367 lines saved. Prepmat> 11936 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2482 RTB> Total mass = 2482.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2482 RTB> Number of blocks = 163 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 185685.3878 RTB> 49035 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 978 Diagstd> Nb of non-zero elements: 49035 Diagstd> Projected matrix trace = 185685.3878 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 978 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 185685.3878 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0002441 0.0009703 0.0030717 0.0489847 0.1021682 0.1316788 0.1679253 0.1825400 0.9238394 1.0358270 1.3471221 1.4195131 1.7052807 1.8018650 1.8614927 2.0706647 2.2431817 2.4898127 2.7266091 3.1985387 3.3891491 3.5589370 3.9963997 4.3105903 4.4161320 5.0845083 5.5809049 5.9189218 6.0949654 6.4295459 6.6778512 6.8136150 7.3962451 7.6720534 8.0124335 8.3043493 8.4785412 8.5182993 9.4751053 9.5579195 10.1205011 10.7060108 11.1364148 11.1999047 11.5830269 12.5019712 13.2856718 13.4734324 14.0670740 14.2125115 15.2641321 15.5133369 16.2510099 16.3975185 16.9137283 16.9787715 17.2534441 17.3878789 18.2843138 18.8662072 18.9505381 20.2532888 20.5437637 20.7779522 21.1433811 21.4330863 21.8532017 22.2756261 22.3706758 23.7465663 24.2694750 25.0020898 26.4543556 26.5497606 27.3279990 27.3769852 27.8351293 28.1085494 28.5150077 28.9703606 29.3811533 29.5335501 30.3685734 31.3378658 31.9404949 32.3433858 32.6668116 32.6936383 33.9182424 34.2094181 35.1074211 35.1817121 35.5999679 35.8526253 36.3188382 37.2657891 37.3205711 38.0790927 38.3527425 39.1313200 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034328 0.0034335 0.0034337 0.0034337 0.0034342 1.6965278 3.3826488 6.0184672 24.0339573 34.7098840 39.4051745 44.4993141 46.3953392 104.3742870 110.5194957 126.0372022 129.3793558 141.8055449 145.7660548 148.1582858 156.2608463 162.6400516 171.3478330 179.3109139 194.2097745 199.9128075 204.8591791 217.0849628 225.4569642 228.2003474 244.8610807 256.5355705 264.1901252 268.0901778 275.3502223 280.6167884 283.4549698 295.3254862 300.7814775 307.3813399 312.9306366 316.1956188 316.9361127 334.2622274 335.7198063 345.4588226 355.3113814 362.3831365 363.4146618 369.5781721 383.9587128 395.8102533 398.5973478 407.2838280 409.3838395 424.2592680 427.7085104 437.7593766 439.7282279 446.5961294 447.4540178 451.0588210 452.8126840 464.3384139 471.6692682 472.7222604 488.7008090 492.1928328 494.9902576 499.3240674 502.7332811 507.6364719 512.5193186 513.6116096 529.1705792 534.9651255 542.9795029 558.5266157 559.5328445 567.6742526 568.1828103 572.9172542 575.7242161 579.8718507 584.4834666 588.6127974 590.1373577 598.4218958 607.8969834 613.7140994 617.5726018 620.6527074 620.9075015 632.4292527 635.1380389 643.4202786 644.1006914 647.9180564 650.2131692 654.4270678 662.9036967 663.3907642 670.0983931 672.5018647 679.2936100 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2482 Rtb_to_modes> Number of blocs = 163 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.4408E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7034E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0717E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.8985E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1022 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1317 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9238 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.420 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.705 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.861 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.490 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.727 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.389 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.311 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.416 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.085 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.919 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.095 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.678 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.304 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.558 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 978 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 1.00003 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 1.00005 1.00001 1.00001 0.99997 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00005 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 44676 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 1.00004 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00004 0.99996 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 0.99999 0.99998 0.99999 0.99995 1.00003 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 1.00005 1.00001 1.00001 0.99997 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00005 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21071218450377297.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21071218450377297.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21071218450377297.atom Openam> file on opening on unit 11: 21071218450377297.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 326 First residue number = -4 Last residue number = 329 Number of atoms found = 2482 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.4408E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7034E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0717E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.8985E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1022 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1317 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9238 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.705 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.861 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.490 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.727 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.389 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.311 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.416 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.919 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.095 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.678 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.304 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.558 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13 Bfactors> 106 vectors, 7446 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000244 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.367 for 326 C-alpha atoms. Bfactors> = 33.059 +/- 29.68 Bfactors> = 37.165 +/- 15.94 Bfactors> Shiftng-fct= 4.106 Bfactors> Scaling-fct= 0.537 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21071218450377297.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21071218450377297.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1.696 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.383 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 6.018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Chkmod> 106 vectors, 7446 coordinates in file. Chkmod> That is: 2482 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 64 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 92 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 97 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8222 0.0034 0.7262 0.0034 0.9994 0.0034 0.7396 0.0034 0.8277 0.0034 0.7965 1.6965 0.7060 3.3825 0.5377 6.0182 0.6430 24.0330 0.4796 34.7138 0.5012 39.4067 0.0439 44.4941 0.0951 46.3883 0.4270 104.3676 0.3876 110.5240 0.0767 126.0261 0.2522 129.3960 0.0257 141.7878 0.3367 145.7653 0.2665 148.1323 0.1721 156.2668 0.1785 162.6265 0.0947 171.3469 0.1488 179.3161 0.1867 194.2154 0.0989 199.8998 0.1552 204.8522 0.1448 217.0648 0.2888 225.4580 0.0775 228.1871 0.0294 244.8624 0.0678 256.5267 0.1754 264.1805 0.0810 268.0794 0.2138 275.3481 0.1538 280.6079 0.3934 283.4508 0.1769 295.3079 0.1924 300.7675 0.2888 307.3598 0.3046 312.9106 0.1608 316.1906 0.2521 316.9169 0.1833 334.2460 0.1173 335.7068 0.3116 345.4354 0.1522 355.3623 0.1469 362.4259 0.2827 363.4006 0.2587 369.5140 0.2882 383.9120 0.2073 395.8577 0.3541 398.5295 0.3001 407.3087 0.3083 409.3301 0.1675 424.1836 0.1137 427.6442 0.2835 437.7270 0.3228 439.7426 0.2689 446.5277 0.2613 447.4510 0.2979 450.9944 0.2542 452.8209 0.2806 464.2637 0.2229 471.6964 0.2929 472.6953 0.2622 488.6402 0.3385 492.1266 0.2425 494.9934 0.2408 499.2627 0.2968 502.6755 0.1688 507.5775 0.3778 512.5476 0.1959 513.5818 0.2815 529.1861 0.1846 534.9479 0.1786 542.9335 0.2001 558.4567 0.2117 559.5113 0.1654 567.6707 0.3085 568.1897 0.3323 572.9428 0.1966 575.7144 0.2240 579.8977 0.2707 584.4547 0.1477 588.5760 0.2876 590.0766 0.3541 598.4103 0.2791 607.8916 0.3983 613.6830 0.1451 617.5138 0.2283 620.6564 0.1630 620.8463 0.2651 632.4185 0.2884 635.1162 0.1845 643.4163 0.2200 644.0574 0.1705 647.8905 0.2716 650.1615 0.2863 654.4094 0.0630 662.9127 0.2167 663.3572 0.2354 670.0776 0.1489 672.4490 0.3157 679.2530 0.2185 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21071218450377297 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom making animated gifs 11 models are in 21071218450377297.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21071218450377297 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom making animated gifs 11 models are in 21071218450377297.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21071218450377297 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom making animated gifs 11 models are in 21071218450377297.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21071218450377297 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom making animated gifs 11 models are in 21071218450377297.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21071218450377297 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21071218450377297.eigenfacs 21071218450377297.atom making animated gifs 11 models are in 21071218450377297.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21071218450377297.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21071218450377297.10.pdb 21071218450377297.11.pdb 21071218450377297.7.pdb 21071218450377297.8.pdb 21071218450377297.9.pdb STDERR: real 0m11.820s user 0m11.780s sys 0m0.032s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.