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LOGs for ID: 210705160701136603

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210705160701136603.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210705160701136603.atom to be opened. Openam> File opened: 210705160701136603.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 149 First residue number = 2 Last residue number = 150 Number of atoms found = 2434 Mean number per residue = 16.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 26.999013 +/- 10.549702 From: 3.429000 To: 53.690000 = -7.394200 +/- 7.333195 From: -23.753000 To: 10.951000 = -10.737344 +/- 9.266289 From: -31.264000 To: 10.363000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.2796 % Filled. Pdbmat> 1674350 non-zero elements. Pdbmat> 184449 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 151.56 +/- 44.71 Maximum number = 233 Minimum number = 22 Pdbmat> Matrix trace = 3.688980E+06 Pdbmat> Larger element = 837.253 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 149 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210705160701136603.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210705160701136603.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210705160701136603.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2434 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 149 residues. Blocpdb> 11 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 10 atoms in block 2 Block first atom: 12 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 22 Blocpdb> 12 atoms in block 4 Block first atom: 44 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 56 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 71 Blocpdb> 10 atoms in block 7 Block first atom: 95 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 105 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 129 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 144 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 163 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 182 Blocpdb> 7 atoms in block 13 Block first atom: 206 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 213 Blocpdb> 22 atoms in block 15 Block first atom: 233 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 255 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 274 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 288 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 312 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 329 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 343 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 362 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 386 Blocpdb> 10 atoms in block 24 Block first atom: 398 Blocpdb> 15 atoms in block 25 Block first atom: 408 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 423 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 437 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 444 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 466 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 485 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 504 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 528 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 545 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 552 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 566 Blocpdb> 12 atoms in block 36 Block first atom: 581 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 593 Blocpdb> 11 atoms in block 38 Block first atom: 612 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 623 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 639 Blocpdb> 7 atoms in block 41 Block first atom: 653 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 660 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 676 Blocpdb> 17 atoms in block 44 Block first atom: 691 Blocpdb> 15 atoms in block 45 Block first atom: 708 Blocpdb> 10 atoms in block 46 Block first atom: 723 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 733 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 757 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 773 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 787 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 809 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 831 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 850 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 869 Blocpdb> 11 atoms in block 55 Block first atom: 891 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 902 Blocpdb> 10 atoms in block 57 Block first atom: 924 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 934 Blocpdb> 11 atoms in block 59 Block first atom: 950 Blocpdb> 24 atoms in block 60 Block first atom: 961 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 985 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 1000 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 1019 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 1033 Blocpdb> 11 atoms in block 65 Block first atom: 1053 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 1064 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1075 Blocpdb> 15 atoms in block 68 Block first atom: 1089 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1121 Blocpdb> 15 atoms in block 71 Block first atom: 1138 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1153 Blocpdb> 20 atoms in block 73 Block first atom: 1175 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1195 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1219 Blocpdb> 15 atoms in block 76 Block first atom: 1238 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1253 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1270 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1292 Blocpdb> 21 atoms in block 80 Block first atom: 1308 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1329 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1349 Blocpdb> 7 atoms in block 83 Block first atom: 1371 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1378 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 1395 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1406 Blocpdb> 15 atoms in block 87 Block first atom: 1425 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1440 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 1455 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 1479 Blocpdb> 20 atoms in block 91 Block first atom: 1499 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1519 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 1534 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 1554 Blocpdb> 20 atoms in block 95 Block first atom: 1561 Blocpdb> 16 atoms in block 96 Block first atom: 1581 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1597 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1616 Blocpdb> 14 atoms in block 99 Block first atom: 1630 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 1644 Blocpdb> 14 atoms in block 101 Block first atom: 1655 Blocpdb> 14 atoms in block 102 Block first atom: 1669 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1683 Blocpdb> 24 atoms in block 104 Block first atom: 1697 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1721 Blocpdb> 11 atoms in block 106 Block first atom: 1738 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 1749 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1768 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1787 Blocpdb> 10 atoms in block 110 Block first atom: 1802 Blocpdb> 10 atoms in block 111 Block first atom: 1812 Blocpdb> 14 atoms in block 112 Block first atom: 1822 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1836 Blocpdb> 11 atoms in block 114 Block first atom: 1851 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1862 Blocpdb> 17 atoms in block 116 Block first atom: 1879 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1896 Blocpdb> 14 atoms in block 118 Block first atom: 1913 Blocpdb> 10 atoms in block 119 Block first atom: 1927 Blocpdb> 11 atoms in block 120 Block first atom: 1937 Blocpdb> 16 atoms in block 121 Block first atom: 1948 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1964 Blocpdb> 14 atoms in block 123 Block first atom: 1983 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 1997 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2004 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 2018 Blocpdb> 19 atoms in block 127 Block first atom: 2034 Blocpdb> 19 atoms in block 128 Block first atom: 2053 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 2072 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2087 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 2101 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 2123 Blocpdb> 20 atoms in block 133 Block first atom: 2143 Blocpdb> 12 atoms in block 134 Block first atom: 2163 Blocpdb> 12 atoms in block 135 Block first atom: 2175 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2187 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2199 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2218 Blocpdb> 16 atoms in block 139 Block first atom: 2237 Blocpdb> 11 atoms in block 140 Block first atom: 2253 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2264 Blocpdb> 11 atoms in block 142 Block first atom: 2278 Blocpdb> 24 atoms in block 143 Block first atom: 2289 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2313 Blocpdb> 24 atoms in block 145 Block first atom: 2329 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2353 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2372 Blocpdb> 21 atoms in block 148 Block first atom: 2392 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 2412 Blocpdb> 149 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1674499 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7302 Prepmat> Matrix trace = 3688980.0000 Prepmat> Last element read: 7302 7302 228.6581 Prepmat> 11176 lines saved. Prepmat> 9112 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2434 RTB> Total mass = 2434.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2434 RTB> Number of blocks = 149 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 407850.1603 RTB> 72033 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 894 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72033 Diagstd> Projected matrix trace = 407850.1603 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 894 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 407850.1603 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 8.8161873 9.9126728 11.0661052 19.4348090 22.6907326 27.0421541 30.2883326 31.6789016 34.0482153 35.9056568 37.4286584 41.3799045 42.6987546 44.8558318 48.1681155 49.1985900 52.6412777 54.5113633 56.1318237 57.1771131 58.8924054 61.2776814 63.4914646 64.3302634 68.5898685 70.9291059 77.0233100 77.7144761 78.6898506 80.0607254 82.8861924 85.2010892 86.6149381 88.7418585 90.3367940 93.4809168 95.4428122 98.7928956 99.3395983 103.5335376 104.7927606 107.8623492 108.5852612 111.2070263 112.1110608 114.1603581 115.4455644 118.2787238 121.4764507 122.2951803 124.9735539 126.1358768 127.3071980 131.2936037 134.7214263 135.3532666 136.0098255 137.1709818 138.3652387 140.0316042 142.6963563 144.2351194 145.6903310 146.9119360 148.5468456 148.8742864 151.4494167 152.6220518 154.3406316 157.2002203 157.5041453 158.5208930 159.4515668 160.3711092 162.0890155 164.0434805 165.3755113 166.8967044 168.5238945 169.5800315 171.1900982 172.6046728 174.2944088 174.8464724 175.7430558 177.6875034 180.4720600 181.6562071 183.4656117 185.0020103 188.0175418 188.6294156 189.6844804 192.2572010 193.5592971 194.6235386 195.2963629 196.3230594 199.1952796 199.4194168 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034287 0.0034319 0.0034324 0.0034346 0.0034350 0.0034355 322.4301791 341.8933588 361.2373750 478.7242403 517.2726768 564.6975735 597.6307880 611.1957668 633.6398119 650.6938735 664.3507205 698.5379771 709.5824806 727.2851791 753.6593791 761.6783450 787.8771244 801.7496928 813.5792365 821.1195499 833.3451780 850.0538575 865.2726030 870.9694962 899.3428070 914.5501451 953.0295557 957.2959954 963.2846521 971.6392291 988.6358960 1002.3464434 1010.6288227 1022.9620914 1032.1138764 1049.9213370 1060.8815435 1079.3396657 1082.3219845 1104.9326504 1111.6316947 1127.7951370 1131.5681643 1145.1474073 1149.7926054 1160.2536450 1166.7663781 1180.9964584 1196.8544185 1200.8809380 1213.9598977 1219.5920801 1225.2416741 1244.2769749 1260.4151547 1263.3673561 1266.4277612 1271.8222071 1277.3466654 1285.0153406 1297.1844149 1304.1597406 1310.7221698 1316.2058638 1323.5092996 1324.9671981 1336.3772778 1341.5409202 1349.0728954 1361.5131974 1362.8287110 1367.2204174 1371.2280093 1375.1761980 1382.5220688 1390.8322996 1396.4676525 1402.8755969 1409.6978055 1414.1081851 1420.8054056 1426.6635144 1433.6297613 1435.8984198 1439.5752357 1447.5171667 1458.8151609 1463.5932614 1470.8643332 1477.0102325 1488.9992034 1491.4200935 1495.5852724 1505.6935427 1510.7837274 1514.9313833 1517.5477247 1521.5314614 1532.6211043 1533.4831249 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2434 Rtb_to_modes> Number of blocs = 149 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9696E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.816 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99995 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00001 0.99999 1.00004 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210705160701136603.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210705160701136603.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210705160701136603.atom Openam> file on opening on unit 11: 210705160701136603.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 149 First residue number = 2 Last residue number = 150 Number of atoms found = 2434 Mean number per residue = 16.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9696E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9883E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.816 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du 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vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 194.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 196.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.4 Bfactors> 106 vectors, 7302 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 8.816000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.476 for 150 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.007 +/- 0.01 Bfactors> = 17.021 +/- 7.27 Bfactors> Shiftng-fct= 17.014 Bfactors> Scaling-fct= 929.735 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210705160701136603.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210705160701136603.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4286E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1272. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1304. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1311. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1316. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1323. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1349. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1363. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1367. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1371. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1403. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1410. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1414. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1421. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1436. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1439. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1448. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1459. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1464. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1477. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1489. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1491. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1496. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1506. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1511. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1515. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1517. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1521. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1533. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1533. Chkmod> 106 vectors, 7302 coordinates in file. Chkmod> That is: 2434 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7192 0.0034 0.7704 0.0034 0.9456 0.0034 0.9395 0.0034 0.8722 0.0034 0.7515 322.4129 0.3717 341.8843 0.4357 361.2854 0.5812 478.6445 0.3717 517.2421 0.2481 564.6508 0.2882 597.6216 0.4948 611.1801 0.3798 633.6292 0.2286 650.7053 0.3581 664.3341 0.4691 698.5088 0.1541 709.5624 0.2054 727.2877 0.2007 753.6418 0.3289 761.6566 0.0849 787.8337 0.5158 801.7053 0.5304 813.5311 0.3278 821.1050 0.4304 833.2924 0.5888 850.0334 0.4333 865.2255 0.3428 870.9303 0.3977 899.3051 0.4717 914.5166 0.4635 952.9682 0.5695 957.2273 0.4194 963.2442 0.2565 971.5931 0.4543 988.6162 0.2951 1002.2970 0.4429 1010.5566 0.4172 1022.9075 0.6210 1032.0879 0.5309 1049.8711 0.4931 1060.8204 0.6786 1079.2775 0.4983 1082.2777 0.3994 1104.7063 0.4143 1111.6224 0.4144 1127.9435 0.3833 1131.5964 0.3725 1145.0621 0.1081 1149.6865 0.1036 1160.4053 0.3250 1166.4860 0.3420 1181.0520 0.4240 1196.9190 0.3460 1200.8530 0.2920 1214.0362 0.4117 1219.3663 0.4809 1225.1544 0.2730 1244.2539 0.4535 1260.2608 0.5037 1263.5312 0.1883 1266.3277 0.5030 1271.9021 0.3936 1277.4523 0.3921 1284.8152 0.2598 1297.1453 0.2639 1303.9450 0.4187 1310.7094 0.4223 1316.0959 0.3766 1323.2438 0.4867 1325.0247 0.4411 1336.1019 0.3678 1341.3864 0.3838 1348.8374 0.4904 1361.4538 0.4072 1362.7523 0.3144 1367.0716 0.3062 1371.3774 0.2919 1375.2410 0.2722 1382.5096 0.3157 1390.5883 0.3715 1396.5111 0.2421 1402.8292 0.1290 1409.5374 0.3942 1414.1307 0.3030 1420.7855 0.2158 1426.5830 0.3089 1433.5912 0.3700 1435.6460 0.1018 1439.3371 0.2577 1447.5059 0.3600 1458.8655 0.4349 1463.7068 0.3183 1470.9390 0.3549 1476.9388 0.4729 1488.8658 0.3591 1491.2398 0.4639 1495.5822 0.2960 1505.7965 0.4353 1510.8777 0.3906 1514.7747 0.3297 1517.4967 0.4184 1521.3768 0.3707 1532.5735 0.3171 1533.3426 0.4052 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 210705160701136603.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210705160701136603.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 210705160701136603.atom Openam> file on opening on unit 11: 210705160701136603.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 210705160701136603.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 210705160701136603.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4286E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1032. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1181. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1225. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1266. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1272. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1304. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1311. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1316. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1323. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1349. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1363. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1367. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1371. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1397. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1403. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1410. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1414. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1421. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1436. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1439. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1448. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1459. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1464. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1477. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1489. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1491. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1496. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1506. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1511. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1515. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1517. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1521. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1533. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1533. Projmod> 106 vectors, 7302 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 149 First residue number = 2 Last residue number = 150 Number of atoms found = 2434 Mean number per residue = 16.3 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 142 First residue number = 2 Last residue number = 150 Number of atoms found = 1183 Mean number per residue = 8.3 %Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer. %Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer. %Projmod-Er> Not enough of them. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 210705160701136603 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom making animated gifs 11 models are in 210705160701136603.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210705160701136603.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210705160701136603.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 142 2.758 124 1.583 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 142 2.546 125 1.546 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 142 2.381 127 1.551 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 142 2.272 126 1.558 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 142 2.228 127 1.622 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 142 2.252 125 1.679 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 142 2.342 119 1.707 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 142 2.492 117 1.805 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 142 2.690 110 1.837 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 142 2.928 106 1.850 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 142 3.196 100 1.916 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210705160701136603 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 142 2.285 123 1.932 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 142 2.148 130 1.883 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 142 2.072 132 1.812 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 142 2.065 128 1.724 MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 142 2.127 126 1.673 MODEL 6 MODE=8 DQ=0 142 2.252 125 1.679 MODEL 7 MODE=8 DQ=20 142 2.431 123 1.708 MODEL 8 MODE=8 DQ=40 142 2.653 118 1.727 MODEL 9 MODE=8 DQ=60 142 2.907 115 1.798 MODEL 10 MODE=8 DQ=80 142 3.187 110 1.886 MODEL 11 MODE=8 DQ=100 142 3.486 98 1.793 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 210705160701136603 9 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210705160701136603.eigenfacs 210705160701136603.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 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