*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 210220065318110960.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 210220065318110960.atom to be opened.
Openam> File opened: 210220065318110960.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1017
First residue number = 1
Last residue number = 1030
Number of atoms found = 7718
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -17.509047 +/- 25.976491 From: -70.394000 To: 48.259000
= 8.924459 +/- 21.126216 From: -36.355000 To: 56.722000
= -30.875412 +/- 15.325479 From: -70.299000 To: 7.701000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.0886 % Filled.
Pdbmat> 2918189 non-zero elements.
Pdbmat> 319149 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.70 +/- 20.59
Maximum number = 131
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 6.382980E+06
Pdbmat> Larger element = 521.277
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1017 non-zero elements, NRBL set to 6
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 210220065318110960.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 6
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 210220065318110960.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
210220065318110960.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 7718 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 6 residue(s) per block.
Blocpdb> 1017 residues.
Blocpdb> 53 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 50 atoms in block 2
Block first atom: 54
Blocpdb> 49 atoms in block 3
Block first atom: 104
Blocpdb> 37 atoms in block 4
Block first atom: 153
Blocpdb> 44 atoms in block 5
Block first atom: 190
Blocpdb> 50 atoms in block 6
Block first atom: 234
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 284
Blocpdb> 42 atoms in block 8
Block first atom: 321
Blocpdb> 39 atoms in block 9
Block first atom: 363
Blocpdb> 47 atoms in block 10
Block first atom: 402
Blocpdb> 47 atoms in block 11
Block first atom: 449
Blocpdb> 46 atoms in block 12
Block first atom: 496
Blocpdb> 55 atoms in block 13
Block first atom: 542
Blocpdb> 41 atoms in block 14
Block first atom: 597
Blocpdb> 41 atoms in block 15
Block first atom: 638
Blocpdb> 50 atoms in block 16
Block first atom: 679
Blocpdb> 42 atoms in block 17
Block first atom: 729
Blocpdb> 46 atoms in block 18
Block first atom: 771
Blocpdb> 47 atoms in block 19
Block first atom: 817
Blocpdb> 46 atoms in block 20
Block first atom: 864
Blocpdb> 49 atoms in block 21
Block first atom: 910
Blocpdb> 47 atoms in block 22
Block first atom: 959
Blocpdb> 51 atoms in block 23
Block first atom: 1006
Blocpdb> 38 atoms in block 24
Block first atom: 1057
Blocpdb> 40 atoms in block 25
Block first atom: 1095
Blocpdb> 48 atoms in block 26
Block first atom: 1135
Blocpdb> 49 atoms in block 27
Block first atom: 1183
Blocpdb> 49 atoms in block 28
Block first atom: 1232
Blocpdb> 39 atoms in block 29
Block first atom: 1281
Blocpdb> 48 atoms in block 30
Block first atom: 1320
Blocpdb> 54 atoms in block 31
Block first atom: 1368
Blocpdb> 51 atoms in block 32
Block first atom: 1422
Blocpdb> 51 atoms in block 33
Block first atom: 1473
Blocpdb> 39 atoms in block 34
Block first atom: 1524
Blocpdb> 42 atoms in block 35
Block first atom: 1563
Blocpdb> 44 atoms in block 36
Block first atom: 1605
Blocpdb> 37 atoms in block 37
Block first atom: 1649
Blocpdb> 41 atoms in block 38
Block first atom: 1686
Blocpdb> 45 atoms in block 39
Block first atom: 1727
Blocpdb> 47 atoms in block 40
Block first atom: 1772
Blocpdb> 50 atoms in block 41
Block first atom: 1819
Blocpdb> 50 atoms in block 42
Block first atom: 1869
Blocpdb> 40 atoms in block 43
Block first atom: 1919
Blocpdb> 52 atoms in block 44
Block first atom: 1959
Blocpdb> 39 atoms in block 45
Block first atom: 2011
Blocpdb> 43 atoms in block 46
Block first atom: 2050
Blocpdb> 49 atoms in block 47
Block first atom: 2093
Blocpdb> 32 atoms in block 48
Block first atom: 2142
Blocpdb> 43 atoms in block 49
Block first atom: 2174
Blocpdb> 37 atoms in block 50
Block first atom: 2217
Blocpdb> 42 atoms in block 51
Block first atom: 2254
Blocpdb> 48 atoms in block 52
Block first atom: 2296
Blocpdb> 50 atoms in block 53
Block first atom: 2344
Blocpdb> 44 atoms in block 54
Block first atom: 2394
Blocpdb> 53 atoms in block 55
Block first atom: 2438
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2491
Blocpdb> 50 atoms in block 57
Block first atom: 2529
Blocpdb> 41 atoms in block 58
Block first atom: 2579
Blocpdb> 49 atoms in block 59
Block first atom: 2620
Blocpdb> 56 atoms in block 60
Block first atom: 2669
Blocpdb> 50 atoms in block 61
Block first atom: 2725
Blocpdb> 42 atoms in block 62
Block first atom: 2775
Blocpdb> 41 atoms in block 63
Block first atom: 2817
Blocpdb> 42 atoms in block 64
Block first atom: 2858
Blocpdb> 45 atoms in block 65
Block first atom: 2900
Blocpdb> 49 atoms in block 66
Block first atom: 2945
Blocpdb> 40 atoms in block 67
Block first atom: 2994
Blocpdb> 43 atoms in block 68
Block first atom: 3034
Blocpdb> 43 atoms in block 69
Block first atom: 3077
Blocpdb> 50 atoms in block 70
Block first atom: 3120
Blocpdb> 41 atoms in block 71
Block first atom: 3170
Blocpdb> 48 atoms in block 72
Block first atom: 3211
Blocpdb> 44 atoms in block 73
Block first atom: 3259
Blocpdb> 37 atoms in block 74
Block first atom: 3303
Blocpdb> 42 atoms in block 75
Block first atom: 3340
Blocpdb> 46 atoms in block 76
Block first atom: 3382
Blocpdb> 41 atoms in block 77
Block first atom: 3428
Blocpdb> 49 atoms in block 78
Block first atom: 3469
Blocpdb> 49 atoms in block 79
Block first atom: 3518
Blocpdb> 39 atoms in block 80
Block first atom: 3567
Blocpdb> 41 atoms in block 81
Block first atom: 3606
Blocpdb> 43 atoms in block 82
Block first atom: 3647
Blocpdb> 43 atoms in block 83
Block first atom: 3690
Blocpdb> 7 atoms in block 84
Block first atom: 3733
Blocpdb> 59 atoms in block 85
Block first atom: 3740
Blocpdb> 51 atoms in block 86
Block first atom: 3799
Blocpdb> 53 atoms in block 87
Block first atom: 3850
Blocpdb> 38 atoms in block 88
Block first atom: 3903
Blocpdb> 54 atoms in block 89
Block first atom: 3941
Blocpdb> 50 atoms in block 90
Block first atom: 3995
Blocpdb> 40 atoms in block 91
Block first atom: 4045
Blocpdb> 59 atoms in block 92
Block first atom: 4085
Blocpdb> 45 atoms in block 93
Block first atom: 4144
Blocpdb> 45 atoms in block 94
Block first atom: 4189
Blocpdb> 49 atoms in block 95
Block first atom: 4234
Blocpdb> 37 atoms in block 96
Block first atom: 4283
Blocpdb> 48 atoms in block 97
Block first atom: 4320
Blocpdb> 47 atoms in block 98
Block first atom: 4368
Blocpdb> 55 atoms in block 99
Block first atom: 4415
Blocpdb> 40 atoms in block 100
Block first atom: 4470
Blocpdb> 45 atoms in block 101
Block first atom: 4510
Blocpdb> 43 atoms in block 102
Block first atom: 4555
Blocpdb> 40 atoms in block 103
Block first atom: 4598
Blocpdb> 48 atoms in block 104
Block first atom: 4638
Blocpdb> 59 atoms in block 105
Block first atom: 4686
Blocpdb> 38 atoms in block 106
Block first atom: 4745
Blocpdb> 49 atoms in block 107
Block first atom: 4783
Blocpdb> 54 atoms in block 108
Block first atom: 4832
Blocpdb> 50 atoms in block 109
Block first atom: 4886
Blocpdb> 47 atoms in block 110
Block first atom: 4936
Blocpdb> 44 atoms in block 111
Block first atom: 4983
Blocpdb> 36 atoms in block 112
Block first atom: 5027
Blocpdb> 55 atoms in block 113
Block first atom: 5063
Blocpdb> 37 atoms in block 114
Block first atom: 5118
Blocpdb> 51 atoms in block 115
Block first atom: 5155
Blocpdb> 52 atoms in block 116
Block first atom: 5206
Blocpdb> 43 atoms in block 117
Block first atom: 5258
Blocpdb> 47 atoms in block 118
Block first atom: 5301
Blocpdb> 44 atoms in block 119
Block first atom: 5348
Blocpdb> 54 atoms in block 120
Block first atom: 5392
Blocpdb> 50 atoms in block 121
Block first atom: 5446
Blocpdb> 37 atoms in block 122
Block first atom: 5496
Blocpdb> 42 atoms in block 123
Block first atom: 5533
Blocpdb> 42 atoms in block 124
Block first atom: 5575
Blocpdb> 47 atoms in block 125
Block first atom: 5617
Blocpdb> 50 atoms in block 126
Block first atom: 5664
Blocpdb> 53 atoms in block 127
Block first atom: 5714
Blocpdb> 51 atoms in block 128
Block first atom: 5767
Blocpdb> 47 atoms in block 129
Block first atom: 5818
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 5865
Blocpdb> 60 atoms in block 131
Block first atom: 5911
Blocpdb> 44 atoms in block 132
Block first atom: 5971
Blocpdb> 47 atoms in block 133
Block first atom: 6015
Blocpdb> 52 atoms in block 134
Block first atom: 6062
Blocpdb> 50 atoms in block 135
Block first atom: 6114
Blocpdb> 43 atoms in block 136
Block first atom: 6164
Blocpdb> 46 atoms in block 137
Block first atom: 6207
Blocpdb> 37 atoms in block 138
Block first atom: 6253
Blocpdb> 36 atoms in block 139
Block first atom: 6290
Blocpdb> 45 atoms in block 140
Block first atom: 6326
Blocpdb> 46 atoms in block 141
Block first atom: 6371
Blocpdb> 50 atoms in block 142
Block first atom: 6417
Blocpdb> 48 atoms in block 143
Block first atom: 6467
Blocpdb> 29 atoms in block 144
Block first atom: 6515
Blocpdb> 46 atoms in block 145
Block first atom: 6544
Blocpdb> 42 atoms in block 146
Block first atom: 6590
Blocpdb> 45 atoms in block 147
Block first atom: 6632
Blocpdb> 54 atoms in block 148
Block first atom: 6677
Blocpdb> 45 atoms in block 149
Block first atom: 6731
Blocpdb> 45 atoms in block 150
Block first atom: 6776
Blocpdb> 36 atoms in block 151
Block first atom: 6821
Blocpdb> 45 atoms in block 152
Block first atom: 6857
Blocpdb> 41 atoms in block 153
Block first atom: 6902
Blocpdb> 50 atoms in block 154
Block first atom: 6943
Blocpdb> 42 atoms in block 155
Block first atom: 6993
Blocpdb> 41 atoms in block 156
Block first atom: 7035
Blocpdb> 48 atoms in block 157
Block first atom: 7076
Blocpdb> 54 atoms in block 158
Block first atom: 7124
Blocpdb> 41 atoms in block 159
Block first atom: 7178
Blocpdb> 38 atoms in block 160
Block first atom: 7219
Blocpdb> 56 atoms in block 161
Block first atom: 7257
Blocpdb> 44 atoms in block 162
Block first atom: 7313
Blocpdb> 43 atoms in block 163
Block first atom: 7357
Blocpdb> 41 atoms in block 164
Block first atom: 7400
Blocpdb> 30 atoms in block 165
Block first atom: 7441
Blocpdb> 42 atoms in block 166
Block first atom: 7471
Blocpdb> 34 atoms in block 167
Block first atom: 7513
Blocpdb> 41 atoms in block 168
Block first atom: 7547
Blocpdb> 53 atoms in block 169
Block first atom: 7588
Blocpdb> 50 atoms in block 170
Block first atom: 7641
Blocpdb> 28 atoms in block 171
Block first atom: 7690
Blocpdb> 171 blocks.
Blocpdb> At most, 60 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2918360 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 23154
Prepmat> Matrix trace = 6382980.0000
Prepmat> Last element read: 23154 23154 127.6840
Prepmat> 14707 lines saved.
Prepmat> 13277 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7718
RTB> Total mass = 7718.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 7718
RTB> Number of blocks = 171
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 185123.4590
RTB> 48879 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1026
Diagstd> Nb of non-zero elements: 48879
Diagstd> Projected matrix trace = 185123.4590
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1026 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 185123.4590
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0932957 0.2548251 0.3778046 0.5264463
0.5882417 0.8830168 1.3843955 1.8004323 2.3067567
2.3614495 3.1491138 3.2790594 3.7065160 3.9951955
4.1635291 4.6714369 5.2348572 5.5587525 5.7706306
6.3676935 6.4835311 7.0708810 7.3967330 7.8886804
8.2404440 8.5885934 9.2152563 9.9969190 10.3662937
10.6300034 10.8736824 10.9794472 11.6316109 11.8854157
12.2079880 12.2801621 13.4743514 14.0451721 14.1284745
14.7821465 15.3662947 15.5588967 15.7815879 16.7591336
17.7324995 17.9873127 18.6727112 19.2986787 19.7399850
20.3532155 20.7527661 21.2438332 21.9435604 22.2184335
22.8014339 23.1905838 23.5768119 24.2282542 24.5104927
24.9288644 25.1145009 25.7514148 25.8662723 26.1582865
27.2982612 28.0174596 28.2286547 28.8455450 28.9351871
29.6317477 30.2981960 31.0620033 31.3294423 31.8013071
32.1132170 32.6608682 32.8818160 33.1206642 33.6438506
34.1018623 35.0703500 35.5115443 35.8137283 36.2349268
36.9696872 37.1313996 37.7472796 38.4960359 38.8576969
39.0993411 39.5871357 40.1267865 40.4784797 40.8021135
40.9916023 41.4438214 41.7900661 42.0566826 42.5453971
42.8988100
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034316 0.0034335 0.0034340 0.0034341 0.0034346
0.0034359 33.1685252 54.8171401 66.7465586 78.7902237
83.2862241 102.0421868 127.7689649 145.7080941 164.9286775
166.8724395 192.7034351 196.6391209 209.0635008 217.0522520
221.5777177 234.7040166 248.4549776 256.0259272 260.8596563
274.0225826 276.5037836 288.7566836 295.3352262 304.9983306
311.7242489 318.2411254 329.6468951 343.3431337 349.6286668
354.0478661 358.0829172 359.8201810 370.3524419 374.3712315
379.4174724 380.5373861 398.6109411 406.9666421 408.1717241
417.5072598 425.6766810 428.3361002 431.3905529 444.5504578
457.2779483 460.5517351 469.2442623 477.0446920 482.4681947
489.9049145 494.6901649 500.5088049 508.6848777 511.8609498
518.5329518 522.9391070 527.2757759 534.5106232 537.6149050
542.1837881 544.1987704 551.0561174 552.2836708 555.3923921
567.3653028 574.7906005 576.9529140 583.2230161 584.1285427
591.1176317 597.7280893 605.2154571 607.8152778 612.3754416
615.3712285 620.5962436 622.6918443 624.9493185 629.8659449
634.1388033 643.0804845 647.1129032 649.8603610 653.6706338
660.2648361 661.7073215 667.1724578 673.7569931 676.9144863
679.0159868 683.2384838 687.8796649 690.8875657 693.6439619
695.2527699 699.0772629 701.9914281 704.2271864 708.3070609
711.2428324
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7718
Rtb_to_modes> Number of blocs = 171
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.23
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
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1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
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1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
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1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 138924 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 0.99999
1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996
1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001
0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998
1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001
0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 210220065318110960.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
210220065318110960.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 210220065318110960.atom
Openam> file on opening on unit 11:
210220065318110960.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1017
First residue number = 1
Last residue number = 1030
Number of atoms found = 7718
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2548
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3778
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5882
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8830
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.384
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.361
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.707
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.671
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.071
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.397
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.889
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.240
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.589
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.215
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90
Bfactors> 106 vectors, 23154 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.093296
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.034 for 1017 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.062 +/- 0.28
Bfactors> = 76.186 +/- 22.46
Bfactors> Shiftng-fct= 76.124
Bfactors> Scaling-fct= 80.486
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 210220065318110960.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
210220065318110960.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2
Chkmod> 106 vectors, 23154 coordinates in file.
Chkmod> That is: 7718 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.6520
0.0034 0.9031
0.0034 0.7570
0.0034 0.9137
0.0034 0.8437
0.0034 0.8513
33.1671 0.0185
54.8121 0.0606
66.7433 0.6597
78.7834 0.6063
83.2797 0.6553
102.0368 0.0213
127.7452 0.6444
145.6843 0.2706
164.9303 0.6424
166.8494 0.6468
192.6917 0.3775
196.6289 0.4020
209.0682 0.0941
217.0376 0.1555
221.5807 0.3727
234.6830 0.5495
248.4477 0.4698
256.0206 0.4313
260.8568 0.4420
274.0174 0.3787
276.5019 0.5023
288.7467 0.5169
295.3279 0.4877
304.9914 0.1582
311.7025 0.4927
318.2350 0.2783
329.6282 0.4064
343.3298 0.0907
349.6762 0.3721
354.0326 0.4192
358.0069 0.4893
359.8138 0.3393
370.3109 0.4183
374.4273 0.6472
379.4324 0.4503
380.5185 0.2175
398.5295 0.5001
407.0191 0.6197
408.1762 0.5959
417.4590 0.6422
425.7097 0.6659
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getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 7 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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210220065318110960.atom
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210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
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210220065318110960.atom
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getting mode 8
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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210220065318110960.atom
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210220065318110960.atom
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210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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calculating perturbed structure for DQ=60
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210220065318110960.atom
getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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210220065318110960.atom
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210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
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running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 11 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
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running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 12 -100 100 20 0 0
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generate a series of perturbations for mode 12
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210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
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210220065318110960.atom
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running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 13 -100 100 20 0 0
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generate a series of perturbations for mode 13
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getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 14 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
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210220065318110960.eigenfacs
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210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
210220065318110960.eigenfacs
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210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 15 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=60
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
210220065318110960.eigenfacs
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getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 210220065318110960 16 -100 100 20 0 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
210220065318110960.eigenfacs
210220065318110960.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
210220065318110960.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=100
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