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LOGs for ID: 210220065313110940

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210220065313110940.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210220065313110940.atom to be opened. Openam> File opened: 210220065313110940.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1017 First residue number = 1 Last residue number = 1030 Number of atoms found = 7718 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -17.509047 +/- 25.976491 From: -70.394000 To: 48.259000 = 8.924459 +/- 21.126216 From: -36.355000 To: 56.722000 = -30.875412 +/- 15.325479 From: -70.299000 To: 7.701000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0886 % Filled. Pdbmat> 2918189 non-zero elements. Pdbmat> 319149 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.70 +/- 20.59 Maximum number = 131 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 6.382980E+06 Pdbmat> Larger element = 521.277 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1017 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210220065313110940.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210220065313110940.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210220065313110940.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7718 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1017 residues. Blocpdb> 53 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 50 atoms in block 2 Block first atom: 54 Blocpdb> 49 atoms in block 3 Block first atom: 104 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 153 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 190 Blocpdb> 50 atoms in block 6 Block first atom: 234 Blocpdb> 37 atoms in block 7 Block first atom: 284 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 321 Blocpdb> 39 atoms in block 9 Block first atom: 363 Blocpdb> 47 atoms in block 10 Block first atom: 402 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 449 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 496 Blocpdb> 55 atoms in block 13 Block first atom: 542 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 597 Blocpdb> 41 atoms in block 15 Block first atom: 638 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 679 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 729 Blocpdb> 46 atoms in block 18 Block first atom: 771 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 817 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 864 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 910 Blocpdb> 47 atoms in block 22 Block first atom: 959 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 1006 Blocpdb> 38 atoms in block 24 Block first atom: 1057 Blocpdb> 40 atoms in block 25 Block first atom: 1095 Blocpdb> 48 atoms in block 26 Block first atom: 1135 Blocpdb> 49 atoms in block 27 Block first atom: 1183 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1232 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 1281 Blocpdb> 48 atoms in block 30 Block first atom: 1320 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1368 Blocpdb> 51 atoms in block 32 Block first atom: 1422 Blocpdb> 51 atoms in block 33 Block first atom: 1473 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1524 Blocpdb> 42 atoms in block 35 Block first atom: 1563 Blocpdb> 44 atoms in block 36 Block first atom: 1605 Blocpdb> 37 atoms in block 37 Block first atom: 1649 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1686 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 47 atoms in block 40 Block first atom: 1772 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 50 atoms in block 42 Block first atom: 1869 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1919 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 1959 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 2011 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 2050 Blocpdb> 49 atoms in block 47 Block first atom: 2093 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 2142 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 2174 Blocpdb> 37 atoms in block 50 Block first atom: 2217 Blocpdb> 42 atoms in block 51 Block first atom: 2254 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2296 Blocpdb> 50 atoms in block 53 Block first atom: 2344 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2394 Blocpdb> 53 atoms in block 55 Block first atom: 2438 Blocpdb> 38 atoms in block 56 Block first atom: 2491 Blocpdb> 50 atoms in block 57 Block first atom: 2529 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2579 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2620 Blocpdb> 56 atoms in block 60 Block first atom: 2669 Blocpdb> 50 atoms in block 61 Block first atom: 2725 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2775 Blocpdb> 41 atoms in block 63 Block first atom: 2817 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 2858 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 2900 Blocpdb> 49 atoms in block 66 Block first atom: 2945 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2994 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 3034 Blocpdb> 43 atoms in block 69 Block first atom: 3077 Blocpdb> 50 atoms in block 70 Block first atom: 3120 Blocpdb> 41 atoms in block 71 Block first atom: 3170 Blocpdb> 48 atoms in block 72 Block first atom: 3211 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3259 Blocpdb> 37 atoms in block 74 Block first atom: 3303 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 3340 Blocpdb> 46 atoms in block 76 Block first atom: 3382 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3428 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3469 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 3518 Blocpdb> 39 atoms in block 80 Block first atom: 3567 Blocpdb> 41 atoms in block 81 Block first atom: 3606 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3647 Blocpdb> 43 atoms in block 83 Block first atom: 3690 Blocpdb> 7 atoms in block 84 Block first atom: 3733 Blocpdb> 59 atoms in block 85 Block first atom: 3740 Blocpdb> 51 atoms in block 86 Block first atom: 3799 Blocpdb> 53 atoms in block 87 Block first atom: 3850 Blocpdb> 38 atoms in block 88 Block first atom: 3903 Blocpdb> 54 atoms in block 89 Block first atom: 3941 Blocpdb> 50 atoms in block 90 Block first atom: 3995 Blocpdb> 40 atoms in block 91 Block first atom: 4045 Blocpdb> 59 atoms in block 92 Block first atom: 4085 Blocpdb> 45 atoms in block 93 Block first atom: 4144 Blocpdb> 45 atoms in block 94 Block first atom: 4189 Blocpdb> 49 atoms in block 95 Block first atom: 4234 Blocpdb> 37 atoms in block 96 Block first atom: 4283 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 4320 Blocpdb> 47 atoms in block 98 Block first atom: 4368 Blocpdb> 55 atoms in block 99 Block first atom: 4415 Blocpdb> 40 atoms in block 100 Block first atom: 4470 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 4510 Blocpdb> 43 atoms in block 102 Block first atom: 4555 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 4598 Blocpdb> 48 atoms in block 104 Block first atom: 4638 Blocpdb> 59 atoms in block 105 Block first atom: 4686 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 4745 Blocpdb> 49 atoms in block 107 Block first atom: 4783 Blocpdb> 54 atoms in block 108 Block first atom: 4832 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 4886 Blocpdb> 47 atoms in block 110 Block first atom: 4936 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 4983 Blocpdb> 36 atoms in block 112 Block first atom: 5027 Blocpdb> 55 atoms in block 113 Block first atom: 5063 Blocpdb> 37 atoms in block 114 Block first atom: 5118 Blocpdb> 51 atoms in block 115 Block first atom: 5155 Blocpdb> 52 atoms in block 116 Block first atom: 5206 Blocpdb> 43 atoms in block 117 Block first atom: 5258 Blocpdb> 47 atoms in block 118 Block first atom: 5301 Blocpdb> 44 atoms in block 119 Block first atom: 5348 Blocpdb> 54 atoms in block 120 Block first atom: 5392 Blocpdb> 50 atoms in block 121 Block first atom: 5446 Blocpdb> 37 atoms in block 122 Block first atom: 5496 Blocpdb> 42 atoms in block 123 Block first atom: 5533 Blocpdb> 42 atoms in block 124 Block first atom: 5575 Blocpdb> 47 atoms in block 125 Block first atom: 5617 Blocpdb> 50 atoms in block 126 Block first atom: 5664 Blocpdb> 53 atoms in block 127 Block first atom: 5714 Blocpdb> 51 atoms in block 128 Block first atom: 5767 Blocpdb> 47 atoms in block 129 Block first atom: 5818 Blocpdb> 46 atoms in block 130 Block first atom: 5865 Blocpdb> 60 atoms in block 131 Block first atom: 5911 Blocpdb> 44 atoms in block 132 Block first atom: 5971 Blocpdb> 47 atoms in block 133 Block first atom: 6015 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6062 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 6114 Blocpdb> 43 atoms in block 136 Block first atom: 6164 Blocpdb> 46 atoms in block 137 Block first atom: 6207 Blocpdb> 37 atoms in block 138 Block first atom: 6253 Blocpdb> 36 atoms in block 139 Block first atom: 6290 Blocpdb> 45 atoms in block 140 Block first atom: 6326 Blocpdb> 46 atoms in block 141 Block first atom: 6371 Blocpdb> 50 atoms in block 142 Block first atom: 6417 Blocpdb> 48 atoms in block 143 Block first atom: 6467 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 6515 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 6544 Blocpdb> 42 atoms in block 146 Block first atom: 6590 Blocpdb> 45 atoms in block 147 Block first atom: 6632 Blocpdb> 54 atoms in block 148 Block first atom: 6677 Blocpdb> 45 atoms in block 149 Block first atom: 6731 Blocpdb> 45 atoms in block 150 Block first atom: 6776 Blocpdb> 36 atoms in block 151 Block first atom: 6821 Blocpdb> 45 atoms in block 152 Block first atom: 6857 Blocpdb> 41 atoms in block 153 Block first atom: 6902 Blocpdb> 50 atoms in block 154 Block first atom: 6943 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 6993 Blocpdb> 41 atoms in block 156 Block first atom: 7035 Blocpdb> 48 atoms in block 157 Block first atom: 7076 Blocpdb> 54 atoms in block 158 Block first atom: 7124 Blocpdb> 41 atoms in block 159 Block first atom: 7178 Blocpdb> 38 atoms in block 160 Block first atom: 7219 Blocpdb> 56 atoms in block 161 Block first atom: 7257 Blocpdb> 44 atoms in block 162 Block first atom: 7313 Blocpdb> 43 atoms in block 163 Block first atom: 7357 Blocpdb> 41 atoms in block 164 Block first atom: 7400 Blocpdb> 30 atoms in block 165 Block first atom: 7441 Blocpdb> 42 atoms in block 166 Block first atom: 7471 Blocpdb> 34 atoms in block 167 Block first atom: 7513 Blocpdb> 41 atoms in block 168 Block first atom: 7547 Blocpdb> 53 atoms in block 169 Block first atom: 7588 Blocpdb> 50 atoms in block 170 Block first atom: 7641 Blocpdb> 28 atoms in block 171 Block first atom: 7690 Blocpdb> 171 blocks. Blocpdb> At most, 60 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2918360 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23154 Prepmat> Matrix trace = 6382980.0000 Prepmat> Last element read: 23154 23154 127.6840 Prepmat> 14707 lines saved. Prepmat> 13277 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7718 RTB> Total mass = 7718.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7718 RTB> Number of blocks = 171 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 185123.4590 RTB> 48879 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1026 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48879 Diagstd> Projected matrix trace = 185123.4590 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1026 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 185123.4590 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0932957 0.2548251 0.3778046 0.5264463 0.5882417 0.8830168 1.3843955 1.8004323 2.3067567 2.3614495 3.1491138 3.2790594 3.7065160 3.9951955 4.1635291 4.6714369 5.2348572 5.5587525 5.7706306 6.3676935 6.4835311 7.0708810 7.3967330 7.8886804 8.2404440 8.5885934 9.2152563 9.9969190 10.3662937 10.6300034 10.8736824 10.9794472 11.6316109 11.8854157 12.2079880 12.2801621 13.4743514 14.0451721 14.1284745 14.7821465 15.3662947 15.5588967 15.7815879 16.7591336 17.7324995 17.9873127 18.6727112 19.2986787 19.7399850 20.3532155 20.7527661 21.2438332 21.9435604 22.2184335 22.8014339 23.1905838 23.5768119 24.2282542 24.5104927 24.9288644 25.1145009 25.7514148 25.8662723 26.1582865 27.2982612 28.0174596 28.2286547 28.8455450 28.9351871 29.6317477 30.2981960 31.0620033 31.3294423 31.8013071 32.1132170 32.6608682 32.8818160 33.1206642 33.6438506 34.1018623 35.0703500 35.5115443 35.8137283 36.2349268 36.9696872 37.1313996 37.7472796 38.4960359 38.8576969 39.0993411 39.5871357 40.1267865 40.4784797 40.8021135 40.9916023 41.4438214 41.7900661 42.0566826 42.5453971 42.8988100 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034335 0.0034340 0.0034341 0.0034346 0.0034359 33.1685252 54.8171401 66.7465586 78.7902237 83.2862241 102.0421868 127.7689649 145.7080941 164.9286775 166.8724395 192.7034351 196.6391209 209.0635008 217.0522520 221.5777177 234.7040166 248.4549776 256.0259272 260.8596563 274.0225826 276.5037836 288.7566836 295.3352262 304.9983306 311.7242489 318.2411254 329.6468951 343.3431337 349.6286668 354.0478661 358.0829172 359.8201810 370.3524419 374.3712315 379.4174724 380.5373861 398.6109411 406.9666421 408.1717241 417.5072598 425.6766810 428.3361002 431.3905529 444.5504578 457.2779483 460.5517351 469.2442623 477.0446920 482.4681947 489.9049145 494.6901649 500.5088049 508.6848777 511.8609498 518.5329518 522.9391070 527.2757759 534.5106232 537.6149050 542.1837881 544.1987704 551.0561174 552.2836708 555.3923921 567.3653028 574.7906005 576.9529140 583.2230161 584.1285427 591.1176317 597.7280893 605.2154571 607.8152778 612.3754416 615.3712285 620.5962436 622.6918443 624.9493185 629.8659449 634.1388033 643.0804845 647.1129032 649.8603610 653.6706338 660.2648361 661.7073215 667.1724578 673.7569931 676.9144863 679.0159868 683.2384838 687.8796649 690.8875657 693.6439619 695.2527699 699.0772629 701.9914281 704.2271864 708.3070609 711.2428324 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7718 Rtb_to_modes> Number of blocs = 171 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3296E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2548 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3778 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8830 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.384 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.361 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.279 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.368 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.397 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.589 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 138924 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00005 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210220065313110940.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210220065313110940.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210220065313110940.atom Openam> file on opening on unit 11: 210220065313110940.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1017 First residue number = 1 Last residue number = 1030 Number of atoms found = 7718 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.3296E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2548 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3778 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8830 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.384 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.361 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.279 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.368 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.397 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.589 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Bfactors> 106 vectors, 23154 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.093296 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.034 for 1017 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.062 +/- 0.28 Bfactors> = 76.186 +/- 22.46 Bfactors> Shiftng-fct= 76.124 Bfactors> Scaling-fct= 80.486 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210220065313110940.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210220065313110940.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Chkmod> 106 vectors, 23154 coordinates in file. Chkmod> That is: 7718 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6520 0.0034 0.9031 0.0034 0.7570 0.0034 0.9137 0.0034 0.8437 0.0034 0.8513 33.1671 0.0185 54.8121 0.0606 66.7433 0.6597 78.7834 0.6063 83.2797 0.6553 102.0368 0.0213 127.7452 0.6444 145.6843 0.2706 164.9303 0.6424 166.8494 0.6468 192.6917 0.3775 196.6289 0.4020 209.0682 0.0941 217.0376 0.1555 221.5807 0.3727 234.6830 0.5495 248.4477 0.4698 256.0206 0.4313 260.8568 0.4420 274.0174 0.3787 276.5019 0.5023 288.7467 0.5169 295.3279 0.4877 304.9914 0.1582 311.7025 0.4927 318.2350 0.2783 329.6282 0.4064 343.3298 0.0907 349.6762 0.3721 354.0326 0.4192 358.0069 0.4893 359.8138 0.3393 370.3109 0.4183 374.4273 0.6472 379.4324 0.4503 380.5185 0.2175 398.5295 0.5001 407.0191 0.6197 408.1762 0.5959 417.4590 0.6422 425.7097 0.6659 428.3329 0.3391 431.3503 0.4776 444.5429 0.5388 457.2261 0.3178 460.5664 0.3354 469.1901 0.5197 477.0405 0.6148 482.4477 0.4039 489.8452 0.4796 494.6360 0.5056 500.4422 0.4222 508.6218 0.3204 511.8570 0.3711 518.4944 0.4608 522.9101 0.4319 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210220065313110940.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210220065313110940.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210220065313110940 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210220065313110940 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom making animated gifs 11 models are in 210220065313110940.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210220065313110940.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210220065313110940.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210220065313110940 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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210220065313110940.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210220065313110940 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210220065313110940.eigenfacs 210220065313110940.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210220065313110940.eigenfacs 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