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LOGs for ID: 210217052850102084

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210217052850102084.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210217052850102084.atom to be opened. Openam> File opened: 210217052850102084.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1024 First residue number = 1 Last residue number = 1030 Number of atoms found = 7764 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 157.532605 +/- 11.446391 From: 128.727000 To: 185.360000 = 156.511488 +/- 14.969223 From: 121.599000 To: 219.338000 = 278.461727 +/- 31.995279 From: 210.653000 To: 340.635000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0239 % Filled. Pdbmat> 2777598 non-zero elements. Pdbmat> 303486 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.18 +/- 20.06 Maximum number = 126 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 6.069720E+06 Pdbmat> Larger element = 491.678 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1024 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210217052850102084.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210217052850102084.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210217052850102084.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7764 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1024 residues. Blocpdb> 53 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 50 atoms in block 2 Block first atom: 54 Blocpdb> 49 atoms in block 3 Block first atom: 104 Blocpdb> 37 atoms in block 4 Block first atom: 153 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 190 Blocpdb> 50 atoms in block 6 Block first atom: 234 Blocpdb> 37 atoms in block 7 Block first atom: 284 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 321 Blocpdb> 39 atoms in block 9 Block first atom: 363 Blocpdb> 47 atoms in block 10 Block first atom: 402 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 449 Blocpdb> 46 atoms in block 12 Block first atom: 496 Blocpdb> 55 atoms in block 13 Block first atom: 542 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 597 Blocpdb> 41 atoms in block 15 Block first atom: 638 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 679 Blocpdb> 42 atoms in block 17 Block first atom: 729 Blocpdb> 46 atoms in block 18 Block first atom: 771 Blocpdb> 47 atoms in block 19 Block first atom: 817 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 864 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 910 Blocpdb> 47 atoms in block 22 Block first atom: 959 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 1006 Blocpdb> 38 atoms in block 24 Block first atom: 1057 Blocpdb> 40 atoms in block 25 Block first atom: 1095 Blocpdb> 48 atoms in block 26 Block first atom: 1135 Blocpdb> 49 atoms in block 27 Block first atom: 1183 Blocpdb> 49 atoms in block 28 Block first atom: 1232 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 1281 Blocpdb> 48 atoms in block 30 Block first atom: 1320 Blocpdb> 54 atoms in block 31 Block first atom: 1368 Blocpdb> 51 atoms in block 32 Block first atom: 1422 Blocpdb> 51 atoms in block 33 Block first atom: 1473 Blocpdb> 39 atoms in block 34 Block first atom: 1524 Blocpdb> 42 atoms in block 35 Block first atom: 1563 Blocpdb> 44 atoms in block 36 Block first atom: 1605 Blocpdb> 37 atoms in block 37 Block first atom: 1649 Blocpdb> 41 atoms in block 38 Block first atom: 1686 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1727 Blocpdb> 47 atoms in block 40 Block first atom: 1772 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 1819 Blocpdb> 50 atoms in block 42 Block first atom: 1869 Blocpdb> 40 atoms in block 43 Block first atom: 1919 Blocpdb> 52 atoms in block 44 Block first atom: 1959 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 2011 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 2050 Blocpdb> 49 atoms in block 47 Block first atom: 2093 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 2142 Blocpdb> 43 atoms in block 49 Block first atom: 2174 Blocpdb> 37 atoms in block 50 Block first atom: 2217 Blocpdb> 42 atoms in block 51 Block first atom: 2254 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2296 Blocpdb> 50 atoms in block 53 Block first atom: 2344 Blocpdb> 44 atoms in block 54 Block first atom: 2394 Blocpdb> 53 atoms in block 55 Block first atom: 2438 Blocpdb> 38 atoms in block 56 Block first atom: 2491 Blocpdb> 50 atoms in block 57 Block first atom: 2529 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2579 Blocpdb> 49 atoms in block 59 Block first atom: 2620 Blocpdb> 56 atoms in block 60 Block first atom: 2669 Blocpdb> 50 atoms in block 61 Block first atom: 2725 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2775 Blocpdb> 41 atoms in block 63 Block first atom: 2817 Blocpdb> 42 atoms in block 64 Block first atom: 2858 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 2900 Blocpdb> 49 atoms in block 66 Block first atom: 2945 Blocpdb> 40 atoms in block 67 Block first atom: 2994 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 3034 Blocpdb> 43 atoms in block 69 Block first atom: 3077 Blocpdb> 50 atoms in block 70 Block first atom: 3120 Blocpdb> 41 atoms in block 71 Block first atom: 3170 Blocpdb> 48 atoms in block 72 Block first atom: 3211 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3259 Blocpdb> 37 atoms in block 74 Block first atom: 3303 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 3340 Blocpdb> 46 atoms in block 76 Block first atom: 3382 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 3428 Blocpdb> 49 atoms in block 78 Block first atom: 3469 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 3518 Blocpdb> 39 atoms in block 80 Block first atom: 3567 Blocpdb> 41 atoms in block 81 Block first atom: 3606 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3647 Blocpdb> 43 atoms in block 83 Block first atom: 3690 Blocpdb> 7 atoms in block 84 Block first atom: 3733 Blocpdb> 40 atoms in block 85 Block first atom: 3740 Blocpdb> 59 atoms in block 86 Block first atom: 3780 Blocpdb> 51 atoms in block 87 Block first atom: 3839 Blocpdb> 53 atoms in block 88 Block first atom: 3890 Blocpdb> 38 atoms in block 89 Block first atom: 3943 Blocpdb> 54 atoms in block 90 Block first atom: 3981 Blocpdb> 50 atoms in block 91 Block first atom: 4035 Blocpdb> 40 atoms in block 92 Block first atom: 4085 Blocpdb> 59 atoms in block 93 Block first atom: 4125 Blocpdb> 45 atoms in block 94 Block first atom: 4184 Blocpdb> 45 atoms in block 95 Block first atom: 4229 Blocpdb> 49 atoms in block 96 Block first atom: 4274 Blocpdb> 37 atoms in block 97 Block first atom: 4323 Blocpdb> 48 atoms in block 98 Block first atom: 4360 Blocpdb> 47 atoms in block 99 Block first atom: 4408 Blocpdb> 55 atoms in block 100 Block first atom: 4455 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 4510 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 4550 Blocpdb> 43 atoms in block 103 Block first atom: 4595 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 4638 Blocpdb> 48 atoms in block 105 Block first atom: 4678 Blocpdb> 59 atoms in block 106 Block first atom: 4726 Blocpdb> 38 atoms in block 107 Block first atom: 4785 Blocpdb> 49 atoms in block 108 Block first atom: 4823 Blocpdb> 54 atoms in block 109 Block first atom: 4872 Blocpdb> 50 atoms in block 110 Block first atom: 4926 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 4976 Blocpdb> 44 atoms in block 112 Block first atom: 5023 Blocpdb> 36 atoms in block 113 Block first atom: 5067 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 5103 Blocpdb> 37 atoms in block 115 Block first atom: 5158 Blocpdb> 51 atoms in block 116 Block first atom: 5195 Blocpdb> 52 atoms in block 117 Block first atom: 5246 Blocpdb> 43 atoms in block 118 Block first atom: 5298 Blocpdb> 47 atoms in block 119 Block first atom: 5341 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 5388 Blocpdb> 54 atoms in block 121 Block first atom: 5432 Blocpdb> 50 atoms in block 122 Block first atom: 5486 Blocpdb> 37 atoms in block 123 Block first atom: 5536 Blocpdb> 42 atoms in block 124 Block first atom: 5573 Blocpdb> 42 atoms in block 125 Block first atom: 5615 Blocpdb> 47 atoms in block 126 Block first atom: 5657 Blocpdb> 50 atoms in block 127 Block first atom: 5704 Blocpdb> 53 atoms in block 128 Block first atom: 5754 Blocpdb> 51 atoms in block 129 Block first atom: 5807 Blocpdb> 47 atoms in block 130 Block first atom: 5858 Blocpdb> 46 atoms in block 131 Block first atom: 5905 Blocpdb> 60 atoms in block 132 Block first atom: 5951 Blocpdb> 44 atoms in block 133 Block first atom: 6011 Blocpdb> 47 atoms in block 134 Block first atom: 6055 Blocpdb> 52 atoms in block 135 Block first atom: 6102 Blocpdb> 50 atoms in block 136 Block first atom: 6154 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 6204 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 6247 Blocpdb> 37 atoms in block 139 Block first atom: 6293 Blocpdb> 36 atoms in block 140 Block first atom: 6330 Blocpdb> 45 atoms in block 141 Block first atom: 6366 Blocpdb> 46 atoms in block 142 Block first atom: 6411 Blocpdb> 50 atoms in block 143 Block first atom: 6457 Blocpdb> 48 atoms in block 144 Block first atom: 6507 Blocpdb> 44 atoms in block 145 Block first atom: 6555 Blocpdb> 42 atoms in block 146 Block first atom: 6599 Blocpdb> 44 atoms in block 147 Block first atom: 6641 Blocpdb> 43 atoms in block 148 Block first atom: 6685 Blocpdb> 55 atoms in block 149 Block first atom: 6728 Blocpdb> 47 atoms in block 150 Block first atom: 6783 Blocpdb> 41 atoms in block 151 Block first atom: 6830 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 6871 Blocpdb> 41 atoms in block 153 Block first atom: 6911 Blocpdb> 48 atoms in block 154 Block first atom: 6952 Blocpdb> 47 atoms in block 155 Block first atom: 7000 Blocpdb> 40 atoms in block 156 Block first atom: 7047 Blocpdb> 43 atoms in block 157 Block first atom: 7087 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 7130 Blocpdb> 49 atoms in block 159 Block first atom: 7179 Blocpdb> 42 atoms in block 160 Block first atom: 7228 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7270 Blocpdb> 53 atoms in block 162 Block first atom: 7314 Blocpdb> 41 atoms in block 163 Block first atom: 7367 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7408 Blocpdb> 41 atoms in block 165 Block first atom: 7453 Blocpdb> 29 atoms in block 166 Block first atom: 7494 Blocpdb> 43 atoms in block 167 Block first atom: 7523 Blocpdb> 35 atoms in block 168 Block first atom: 7566 Blocpdb> 41 atoms in block 169 Block first atom: 7601 Blocpdb> 52 atoms in block 170 Block first atom: 7642 Blocpdb> 50 atoms in block 171 Block first atom: 7694 Blocpdb> 21 atoms in block 172 Block first atom: 7743 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 60 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2777770 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23292 Prepmat> Matrix trace = 6069720.0000 Prepmat> Last element read: 23292 23292 35.5259 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13452 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7764 RTB> Total mass = 7764.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7764 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 171379.5379 RTB> 48756 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48756 Diagstd> Projected matrix trace = 171379.5379 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 171379.5379 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0919937 0.2478021 0.3881412 0.5134985 0.6395290 0.9373663 1.3658397 1.8454463 2.3251219 2.4566805 2.8292679 3.1862246 3.5107121 3.7579564 3.9347429 4.2047607 4.3787245 4.8138292 5.4282516 5.5947928 5.6863505 6.6833037 6.7355777 7.3924864 7.6183990 8.1488310 8.4441473 8.6314540 8.9983423 9.1255312 9.5204154 9.8573988 10.3218445 10.7914749 10.9632668 11.3199141 11.5034128 12.0691395 12.1276824 12.3351034 12.5392277 13.0046788 13.4546764 13.7542345 13.9657500 14.1971640 14.7888688 15.0901640 15.3455091 15.7361696 15.9001894 16.1645804 16.4575849 16.8491812 17.4966282 18.0029343 18.4259845 18.7947191 19.2562498 19.7246807 20.1262440 20.6344120 21.3396992 21.9143390 22.1675816 22.5856194 22.6862623 23.0077697 23.2806563 23.5705003 24.1737859 24.3190610 24.9865723 25.4469585 25.7645225 26.1322915 26.4730755 26.8006916 26.9233286 27.2302548 27.6717589 28.3231524 28.7693609 28.8687478 29.1728853 29.5825058 30.2432534 30.9050286 31.2450392 31.4593587 31.8101903 32.1567445 32.3869519 32.6314530 32.8137476 33.6969378 34.1116786 34.3697179 34.4519928 34.9101379 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034327 0.0034332 0.0034336 0.0034340 0.0034346 32.9362643 54.0564812 67.6534783 77.8152779 86.8411191 105.1356366 126.9097963 147.5183297 165.5839132 170.2039449 182.6553152 193.8355703 203.4664891 210.5092322 215.4038483 222.6721590 227.2317907 238.2542294 253.0027631 256.8545619 258.9477217 280.7313270 281.8270696 295.2504361 299.7278769 309.9866102 315.5536306 319.0342149 325.7440832 328.0381529 335.0604983 340.9388128 348.8782834 356.7267539 359.5549505 365.3565062 368.3058625 377.2536351 378.1674867 381.3876961 384.5303956 391.6021757 398.3198123 402.7295463 405.8143617 409.1627415 417.6021805 421.8346590 425.3886822 430.7693486 433.0085080 436.5937334 440.5328843 445.7431525 454.2264942 460.7516809 466.1338377 470.7747919 476.5200025 482.2811316 487.1656364 493.2775262 501.6368436 508.3460677 511.2748595 516.0731722 517.2217207 520.8738343 523.9536737 527.2051946 533.9094604 535.5113516 542.8109767 547.7888915 551.1963456 555.1163603 558.7241963 562.1707959 563.4555439 566.6581418 571.2334923 577.9178053 582.4523307 583.4575356 586.5228994 590.6262698 597.1858849 603.6842635 606.9959831 609.0742131 612.4609647 615.7881364 617.9883932 620.3167185 622.0469957 630.3626875 634.2300653 636.6243769 637.3859029 641.6099089 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7764 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.1994E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.366 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.186 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.758 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.205 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.379 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.814 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.428 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.595 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.618 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.444 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.998 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00004 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 139752 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00004 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00004 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00004 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210217052850102084.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210217052850102084.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210217052850102084.atom Openam> file on opening on unit 11: 210217052850102084.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1024 First residue number = 1 Last residue number = 1030 Number of atoms found = 7764 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9927E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.1994E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.366 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.758 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.205 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.379 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.814 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.428 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.595 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.618 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.444 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.998 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Bfactors> 106 vectors, 23292 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.091994 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.039 for 1024 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.063 +/- 0.28 Bfactors> = 32.844 +/- 25.93 Bfactors> Shiftng-fct= 32.782 Bfactors> Scaling-fct= 91.609 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210217052850102084.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210217052850102084.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 7764 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210217052850102084.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210217052850102084.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210217052850102084 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210217052850102084 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210217052850102084 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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210217052850102084.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210217052850102084 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210217052850102084.eigenfacs 210217052850102084.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210217052850102084.eigenfacs 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