CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  VIRAL PROTEIN 08-OCT-20 7KDK  ***

LOGs for ID: 21011820145742901

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21011820145742901.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21011820145742901.atom to be opened. Openam> File opened: 21011820145742901.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 972 First residue number = 27 Last residue number = 1147 Number of atoms found = 7602 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 171.784891 +/- 15.711170 From: 134.832000 To: 204.415000 = 146.397142 +/- 19.714314 From: 99.278000 To: 197.656000 = 162.299098 +/- 35.356785 From: 72.553000 To: 229.908000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0519 % Filled. Pdbmat> 2735653 non-zero elements. Pdbmat> 298944 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.65 +/- 23.13 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 5.978880E+06 Pdbmat> Larger element = 495.844 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 972 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21011820145742901.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21011820145742901.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21011820145742901.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7602 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 972 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 40 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 48 atoms in block 3 Block first atom: 79 Blocpdb> 41 atoms in block 4 Block first atom: 127 Blocpdb> 38 atoms in block 5 Block first atom: 168 Blocpdb> 44 atoms in block 6 Block first atom: 206 Blocpdb> 43 atoms in block 7 Block first atom: 250 Blocpdb> 49 atoms in block 8 Block first atom: 293 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 342 Blocpdb> 38 atoms in block 10 Block first atom: 365 Blocpdb> 38 atoms in block 11 Block first atom: 403 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 441 Blocpdb> 39 atoms in block 13 Block first atom: 482 Blocpdb> 45 atoms in block 14 Block first atom: 521 Blocpdb> 37 atoms in block 15 Block first atom: 566 Blocpdb> 38 atoms in block 16 Block first atom: 603 Blocpdb> 39 atoms in block 17 Block first atom: 641 Blocpdb> 35 atoms in block 18 Block first atom: 680 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 715 Blocpdb> 42 atoms in block 20 Block first atom: 754 Blocpdb> 40 atoms in block 21 Block first atom: 796 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 836 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 866 Blocpdb> 25 atoms in block 24 Block first atom: 907 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 932 Blocpdb> 47 atoms in block 26 Block first atom: 979 Blocpdb> 40 atoms in block 27 Block first atom: 1026 Blocpdb> 46 atoms in block 28 Block first atom: 1066 Blocpdb> 41 atoms in block 29 Block first atom: 1112 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1153 Blocpdb> 39 atoms in block 31 Block first atom: 1195 Blocpdb> 35 atoms in block 32 Block first atom: 1234 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1269 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1307 Blocpdb> 45 atoms in block 35 Block first atom: 1343 Blocpdb> 39 atoms in block 36 Block first atom: 1388 Blocpdb> 41 atoms in block 37 Block first atom: 1427 Blocpdb> 40 atoms in block 38 Block first atom: 1468 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1508 Blocpdb> 46 atoms in block 40 Block first atom: 1553 Blocpdb> 34 atoms in block 41 Block first atom: 1599 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 1633 Blocpdb> 37 atoms in block 43 Block first atom: 1664 Blocpdb> 38 atoms in block 44 Block first atom: 1701 Blocpdb> 41 atoms in block 45 Block first atom: 1739 Blocpdb> 37 atoms in block 46 Block first atom: 1780 Blocpdb> 42 atoms in block 47 Block first atom: 1817 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 1859 Blocpdb> 37 atoms in block 49 Block first atom: 1904 Blocpdb> 45 atoms in block 50 Block first atom: 1941 Blocpdb> 36 atoms in block 51 Block first atom: 1986 Blocpdb> 42 atoms in block 52 Block first atom: 2022 Blocpdb> 42 atoms in block 53 Block first atom: 2064 Blocpdb> 35 atoms in block 54 Block first atom: 2106 Blocpdb> 53 atoms in block 55 Block first atom: 2141 Blocpdb> 35 atoms in block 56 Block first atom: 2194 Blocpdb> 38 atoms in block 57 Block first atom: 2229 Blocpdb> 39 atoms in block 58 Block first atom: 2267 Blocpdb> 41 atoms in block 59 Block first atom: 2306 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2347 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 2385 Blocpdb> 41 atoms in block 62 Block first atom: 2422 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2463 Blocpdb> 40 atoms in block 64 Block first atom: 2502 Blocpdb> 39 atoms in block 65 Block first atom: 2542 Blocpdb> 40 atoms in block 66 Block first atom: 2581 Blocpdb> 33 atoms in block 67 Block first atom: 2621 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2654 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 2695 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 2739 Blocpdb> 42 atoms in block 71 Block first atom: 2775 Blocpdb> 38 atoms in block 72 Block first atom: 2817 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 2855 Blocpdb> 44 atoms in block 74 Block first atom: 2870 Blocpdb> 31 atoms in block 75 Block first atom: 2914 Blocpdb> 47 atoms in block 76 Block first atom: 2945 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 2992 Blocpdb> 47 atoms in block 78 Block first atom: 3008 Blocpdb> 42 atoms in block 79 Block first atom: 3055 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 3097 Blocpdb> 39 atoms in block 81 Block first atom: 3119 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 3158 Blocpdb> 42 atoms in block 83 Block first atom: 3202 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 3244 Blocpdb> 31 atoms in block 85 Block first atom: 3279 Blocpdb> 39 atoms in block 86 Block first atom: 3310 Blocpdb> 41 atoms in block 87 Block first atom: 3349 Blocpdb> 40 atoms in block 88 Block first atom: 3390 Blocpdb> 38 atoms in block 89 Block first atom: 3430 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 3468 Blocpdb> 39 atoms in block 91 Block first atom: 3498 Blocpdb> 46 atoms in block 92 Block first atom: 3537 Blocpdb> 44 atoms in block 93 Block first atom: 3583 Blocpdb> 36 atoms in block 94 Block first atom: 3627 Blocpdb> 38 atoms in block 95 Block first atom: 3663 Blocpdb> 39 atoms in block 96 Block first atom: 3701 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 3740 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3781 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 3818 Blocpdb> 33 atoms in block 100 Block first atom: 3846 Blocpdb> 38 atoms in block 101 Block first atom: 3879 Blocpdb> 39 atoms in block 102 Block first atom: 3917 Blocpdb> 34 atoms in block 103 Block first atom: 3956 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 3990 Blocpdb> 42 atoms in block 105 Block first atom: 4013 Blocpdb> 34 atoms in block 106 Block first atom: 4055 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 4089 Blocpdb> 41 atoms in block 108 Block first atom: 4125 Blocpdb> 38 atoms in block 109 Block first atom: 4166 Blocpdb> 29 atoms in block 110 Block first atom: 4204 Blocpdb> 38 atoms in block 111 Block first atom: 4233 Blocpdb> 7 atoms in block 112 Block first atom: 4271 Blocpdb> 37 atoms in block 113 Block first atom: 4278 Blocpdb> 38 atoms in block 114 Block first atom: 4315 Blocpdb> 34 atoms in block 115 Block first atom: 4353 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 4387 Blocpdb> 35 atoms in block 117 Block first atom: 4423 Blocpdb> 41 atoms in block 118 Block first atom: 4458 Blocpdb> 35 atoms in block 119 Block first atom: 4499 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 4534 Blocpdb> 37 atoms in block 121 Block first atom: 4573 Blocpdb> 34 atoms in block 122 Block first atom: 4610 Blocpdb> 41 atoms in block 123 Block first atom: 4644 Blocpdb> 34 atoms in block 124 Block first atom: 4685 Blocpdb> 36 atoms in block 125 Block first atom: 4719 Blocpdb> 39 atoms in block 126 Block first atom: 4755 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 4794 Blocpdb> 39 atoms in block 128 Block first atom: 4835 Blocpdb> 33 atoms in block 129 Block first atom: 4874 Blocpdb> 41 atoms in block 130 Block first atom: 4907 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 4948 Blocpdb> 42 atoms in block 132 Block first atom: 4989 Blocpdb> 42 atoms in block 133 Block first atom: 5031 Blocpdb> 40 atoms in block 134 Block first atom: 5073 Blocpdb> 40 atoms in block 135 Block first atom: 5113 Blocpdb> 40 atoms in block 136 Block first atom: 5153 Blocpdb> 35 atoms in block 137 Block first atom: 5193 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 5228 Blocpdb> 44 atoms in block 139 Block first atom: 5273 Blocpdb> 31 atoms in block 140 Block first atom: 5317 Blocpdb> 40 atoms in block 141 Block first atom: 5348 Blocpdb> 36 atoms in block 142 Block first atom: 5388 Blocpdb> 40 atoms in block 143 Block first atom: 5424 Blocpdb> 42 atoms in block 144 Block first atom: 5464 Blocpdb> 34 atoms in block 145 Block first atom: 5506 Blocpdb> 31 atoms in block 146 Block first atom: 5540 Blocpdb> 42 atoms in block 147 Block first atom: 5571 Blocpdb> 23 atoms in block 148 Block first atom: 5613 Blocpdb> 43 atoms in block 149 Block first atom: 5636 Blocpdb> 35 atoms in block 150 Block first atom: 5679 Blocpdb> 46 atoms in block 151 Block first atom: 5714 Blocpdb> 35 atoms in block 152 Block first atom: 5760 Blocpdb> 44 atoms in block 153 Block first atom: 5795 Blocpdb> 42 atoms in block 154 Block first atom: 5839 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 5881 Blocpdb> 32 atoms in block 156 Block first atom: 5922 Blocpdb> 39 atoms in block 157 Block first atom: 5954 Blocpdb> 30 atoms in block 158 Block first atom: 5993 Blocpdb> 34 atoms in block 159 Block first atom: 6023 Blocpdb> 39 atoms in block 160 Block first atom: 6057 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 6096 Blocpdb> 38 atoms in block 162 Block first atom: 6132 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 6170 Blocpdb> 36 atoms in block 164 Block first atom: 6208 Blocpdb> 35 atoms in block 165 Block first atom: 6244 Blocpdb> 41 atoms in block 166 Block first atom: 6279 Blocpdb> 41 atoms in block 167 Block first atom: 6320 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 6361 Blocpdb> 42 atoms in block 169 Block first atom: 6399 Blocpdb> 38 atoms in block 170 Block first atom: 6441 Blocpdb> 43 atoms in block 171 Block first atom: 6479 Blocpdb> 41 atoms in block 172 Block first atom: 6522 Blocpdb> 38 atoms in block 173 Block first atom: 6563 Blocpdb> 35 atoms in block 174 Block first atom: 6601 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 6636 Blocpdb> 36 atoms in block 176 Block first atom: 6670 Blocpdb> 36 atoms in block 177 Block first atom: 6706 Blocpdb> 43 atoms in block 178 Block first atom: 6742 Blocpdb> 39 atoms in block 179 Block first atom: 6785 Blocpdb> 40 atoms in block 180 Block first atom: 6824 Blocpdb> 37 atoms in block 181 Block first atom: 6864 Blocpdb> 37 atoms in block 182 Block first atom: 6901 Blocpdb> 43 atoms in block 183 Block first atom: 6938 Blocpdb> 39 atoms in block 184 Block first atom: 6981 Blocpdb> 38 atoms in block 185 Block first atom: 7020 Blocpdb> 36 atoms in block 186 Block first atom: 7058 Blocpdb> 36 atoms in block 187 Block first atom: 7094 Blocpdb> 42 atoms in block 188 Block first atom: 7130 Blocpdb> 39 atoms in block 189 Block first atom: 7172 Blocpdb> 46 atoms in block 190 Block first atom: 7211 Blocpdb> 42 atoms in block 191 Block first atom: 7257 Blocpdb> 48 atoms in block 192 Block first atom: 7299 Blocpdb> 38 atoms in block 193 Block first atom: 7347 Blocpdb> 39 atoms in block 194 Block first atom: 7385 Blocpdb> 33 atoms in block 195 Block first atom: 7424 Blocpdb> 34 atoms in block 196 Block first atom: 7457 Blocpdb> 42 atoms in block 197 Block first atom: 7491 Blocpdb> 39 atoms in block 198 Block first atom: 7533 Blocpdb> 31 atoms in block 199 Block first atom: 7571 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 53 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2735852 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 22806 Prepmat> Matrix trace = 5978880.0000 Prepmat> Last element read: 22806 22806 89.8312 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 18344 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7602 RTB> Total mass = 7602.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7602 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 216139.6793 RTB> 53031 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53031 Diagstd> Projected matrix trace = 216139.6793 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 216139.6793 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0018147 0.0060378 0.0089604 0.0210433 0.0336380 0.0389388 0.0823246 0.1308385 0.2272072 0.2711875 0.2893291 0.3943715 0.5441871 0.6694756 0.7805076 0.9810122 1.0485012 1.1423680 1.3860642 1.7403029 1.8628717 1.9431406 2.1635891 2.6642894 2.8957701 3.1573075 3.4302462 4.0864923 4.2209429 4.3850361 4.9957517 5.7170204 6.0326415 6.2008495 6.3977132 7.0678641 7.3643992 7.9558922 8.5151104 8.5529698 9.0323692 9.5986330 9.9836621 10.0616995 10.3780654 10.5710836 10.8853991 11.1684078 12.3067862 12.9284223 13.0443698 13.7611007 14.1293011 14.1429464 14.7749322 14.9869041 15.5363138 16.2694668 16.4568619 17.0707184 17.5833697 17.8000888 18.3481567 19.1295134 19.2398758 19.7177100 20.7771478 20.9240889 21.0593671 21.2282073 21.9759240 22.1447930 22.4671997 23.0271977 23.5585054 23.6860255 24.1884868 24.3266324 24.5314506 24.9073442 25.4740552 25.6771338 25.9681881 26.2145000 26.8172369 27.1985422 27.2293386 28.4351897 28.6781293 29.0097607 29.1217479 29.2997468 30.0888091 30.6437413 30.9858617 31.1085496 31.1975158 31.5381358 31.8017166 32.0835564 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034309 0.0034318 0.0034334 0.0034336 0.0034340 0.0034348 4.6259492 8.4379383 10.2792126 15.7525916 19.9163724 21.4282403 31.1573157 39.2792339 51.7614345 56.5496801 58.4105578 68.1942930 80.1068037 88.8510697 95.9364959 107.5554646 111.1935905 116.0642032 127.8459439 143.2543104 148.2131546 151.3726432 159.7285960 177.2498932 184.7895137 192.9539696 201.1212349 219.5182451 223.1002301 227.3954991 242.7144892 259.6451124 266.7159813 270.4088341 274.6677459 288.6950751 294.6890117 306.2948706 316.8767846 317.5804422 326.3593968 336.4340728 343.1154054 344.4537772 349.8271260 353.0652980 358.2757863 362.9032961 380.9496761 390.4523542 392.1993157 402.8300553 408.1836642 408.3807172 417.4053661 420.3889033 428.0251353 438.0078962 440.5232070 448.6639535 455.3510419 458.1486014 465.1483672 474.9492884 476.3173628 482.1959043 494.9806768 496.7279052 498.3310389 500.3246963 509.0598591 511.0119925 514.7184700 521.0937034 527.0710311 528.4956012 534.0717796 535.5947066 537.8447021 541.9497143 548.0804651 550.2607712 553.3706286 555.9888337 562.3442968 566.3280775 566.6486082 579.0597054 581.5280795 584.8807842 586.0086126 587.7967953 595.6590979 601.1269155 604.4732264 605.6687432 606.5341905 609.8363248 612.3793843 615.0869764 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7602 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9820E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9872E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.8147E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.0378E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.9604E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.1043E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3638E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.8939E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2325E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1308 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2712 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2893 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3944 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5442 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6695 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7805 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9810 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.386 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.943 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.664 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.157 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.430 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.086 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.221 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.385 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.996 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.717 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.033 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.956 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.032 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.08 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00004 0.99998 1.00002 0.99997 1.00003 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 136836 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 0.99997 1.00004 0.99998 1.00002 0.99997 1.00003 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21011820145742901.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21011820145742901.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21011820145742901.atom Openam> file on opening on unit 11: 21011820145742901.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 972 First residue number = 27 Last residue number = 1147 Number of atoms found = 7602 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9820E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9872E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.8147E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.0378E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.9604E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.1043E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3638E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.8939E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2325E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1308 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2712 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2893 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3944 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5442 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6695 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7805 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9810 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.386 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.943 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.664 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.157 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.430 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.086 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.221 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.385 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.996 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.717 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.033 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.956 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.08 Bfactors> 106 vectors, 22806 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001815 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.313 for 972 C-alpha atoms. Bfactors> = 1.968 +/- 1.33 Bfactors> = 28.253 +/- 19.45 Bfactors> Shiftng-fct= 26.286 Bfactors> Scaling-fct= 14.661 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21011820145742901.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21011820145742901.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.626 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.0 Chkmod> 106 vectors, 22806 coordinates in file. Chkmod> That is: 7602 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 31 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6465 0.0034 0.6600 0.0034 0.6734 0.0034 0.6417 0.0034 0.8798 0.0034 0.8402 4.6257 0.7074 8.4375 0.5821 10.2788 0.7822 15.7518 0.7063 19.9155 0.5419 21.4274 0.6119 31.1561 0.7476 39.2718 0.6919 51.7584 0.4823 56.5486 0.4222 58.4051 0.6003 68.1938 0.5411 80.1043 0.1706 88.8489 0.4606 95.9319 0.3263 107.5502 0.2556 111.2153 0.6083 116.0405 0.2991 127.8375 0.2560 143.2357 0.2560 148.2119 0.3614 151.3607 0.1677 159.7369 0.1737 177.2327 0.4092 184.7889 0.0541 192.9363 0.2046 201.1054 0.2993 219.4956 0.3624 223.0922 0.1188 227.3848 0.2991 242.7101 0.3241 259.6335 0.2802 266.7125 0.3355 270.4005 0.3731 274.6621 0.2304 288.6855 0.2628 294.6684 0.1760 306.2838 0.3337 316.8611 0.0773 317.5674 0.1966 326.3387 0.0432 336.4261 0.1797 343.1065 0.2932 344.4099 0.3777 349.8447 0.3418 353.0320 0.2081 358.3361 0.2119 362.9136 0.2392 380.9831 0.2222 390.4594 0.2997 392.1168 0.1265 402.7967 0.2615 408.1762 0.1395 408.3206 0.0845 417.3178 0.1622 420.4143 0.2443 428.0575 0.3015 437.9963 0.2332 440.5463 0.2449 448.6353 0.1666 455.2879 0.1693 458.1278 0.2897 465.1518 0.3126 474.9349 0.3413 476.2985 0.3227 482.2032 0.1570 494.9934 0.3049 496.6580 0.2487 498.3171 0.3680 500.3243 0.3288 509.0852 0.3357 510.9348 0.3623 514.7284 0.2466 521.1030 0.1882 527.0651 0.3412 528.5173 0.2423 534.0656 0.3298 535.6088 0.3605 537.8057 0.4220 541.9553 0.1768 548.0133 0.3593 550.2679 0.1909 553.3662 0.2421 555.9172 0.4135 562.3491 0.3929 566.3189 0.1139 566.6312 0.0769 579.0838 0.3471 581.5221 0.4010 584.8581 0.2353 585.9659 0.2745 587.7741 0.3431 595.6453 0.2977 601.0644 0.3709 604.4876 0.1991 605.6569 0.2521 606.5323 0.3064 609.8282 0.2875 612.3366 0.1790 615.0265 0.3044 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21011820145742901 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom making animated gifs 11 models are in 21011820145742901.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21011820145742901 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom making animated gifs 11 models are in 21011820145742901.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21011820145742901 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom making animated gifs 11 models are in 21011820145742901.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21011820145742901 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom making animated gifs 11 models are in 21011820145742901.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21011820145742901 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011820145742901.eigenfacs 21011820145742901.atom making animated gifs 11 models are in 21011820145742901.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011820145742901.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21011820145742901.10.pdb 21011820145742901.11.pdb 21011820145742901.7.pdb 21011820145742901.8.pdb 21011820145742901.9.pdb STDERR: real 0m36.284s user 0m36.072s sys 0m0.196s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.