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***  ca_my_mu_3  ***

LOGs for ID: 21011507581093769

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21011507581093769.atom Pdbmat> Distance cutoff = 12.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21011507581093769.atom to be opened. Openam> File opened: 21011507581093769.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 229 First residue number = 2 Last residue number = 1935 Number of atoms found = 229 Mean number per residue = 1.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 59.345633 +/- 10.846029 From: 40.070000 To: 83.490000 = 178.169607 +/- 9.086458 From: 156.920000 To: 198.610000 = -145.161223 +/- 10.274171 From: -165.790000 To: -122.820000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 12.7725 % Filled. Pdbmat> 30185 non-zero elements. Pdbmat> 3204 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 27.98 +/- 8.23 Maximum number = 45 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 64080.0 Pdbmat> Larger element = 183.519 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 229 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21011507581093769.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21011507581093769.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21011507581093769.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 229 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 229 residues. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 1 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 2th, in residue 3 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 1 Block first atom: 1 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 2 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 6th, in residue 7 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 2 Block first atom: 5 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 3 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 10th, in residue 11 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 3 Block first atom: 9 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 4 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 14th, in residue 15 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 4 Block first atom: 13 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 5 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 18th, in residue 19 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 5 Block first atom: 17 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 6 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 22th, in residue 23 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 6 Block first atom: 21 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 7 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 26th, in residue 27 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 7 Block first atom: 25 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 8 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 30th, in residue 31 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 8 Block first atom: 29 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 9 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 34th, in residue 35 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 9 Block first atom: 33 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 10 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 38th, in residue 39 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 10 Block first atom: 37 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 11 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 42th, in residue 43 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 11 Block first atom: 41 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 12 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 46th, in residue 47 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 12 Block first atom: 45 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 13 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 50th, in residue 51 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 13 Block first atom: 49 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 14 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 54th, in residue 55 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 14 Block first atom: 53 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 15 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 58th, in residue 59 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 15 Block first atom: 57 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 16 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 62th, in residue 63 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 16 Block first atom: 61 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 17 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 66th, in residue 67 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 17 Block first atom: 65 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 18 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 70th, in residue 71 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 18 Block first atom: 69 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 19 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 74th, in residue 75 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 19 Block first atom: 73 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 20 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 78th, in residue 79 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 20 Block first atom: 77 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 21 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 82th, in residue 83 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 21 Block first atom: 81 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 22 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 86th, in residue 87 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 22 Block first atom: 85 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 23 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 90th, in residue 91 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 23 Block first atom: 89 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 24 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 93th, in residue 94 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 24 Block first atom: 93 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 25 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 97th, in residue 5 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 25 Block first atom: 96 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 26 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 101th, in residue 9 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 26 Block first atom: 100 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 27 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 105th, in residue 13 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 27 Block first atom: 104 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 28 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 109th, in residue 17 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 28 Block first atom: 108 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 29 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 113th, in residue 21 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 29 Block first atom: 112 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 30 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 117th, in residue 25 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 30 Block first atom: 116 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 31 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 121th, in residue 29 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 31 Block first atom: 120 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 32 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 125th, in residue 33 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 32 Block first atom: 124 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 33 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 129th, in residue 37 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 33 Block first atom: 128 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 34 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 133th, in residue 41 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 34 Block first atom: 132 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 35 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 137th, in residue 45 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 35 Block first atom: 136 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 36 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 141th, in residue 49 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 36 Block first atom: 140 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 37 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 145th, in residue 53 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 37 Block first atom: 144 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 38 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 149th, in residue 57 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 38 Block first atom: 148 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 39 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 153th, in residue 61 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 39 Block first atom: 152 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 40 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 157th, in residue 65 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 40 Block first atom: 156 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 41 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 161th, in residue 69 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 41 Block first atom: 160 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 42 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 165th, in residue 73 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 42 Block first atom: 164 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 43 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 169th, in residue 77 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 43 Block first atom: 168 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 44 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 173th, in residue 81 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 44 Block first atom: 172 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 45 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 177th, in residue 85 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 45 Block first atom: 176 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 46 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 181th, in residue 89 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 46 Block first atom: 180 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 47 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 185th, in residue 93 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 47 Block first atom: 184 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 48 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 188th, in residue 1894 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 48 Block first atom: 187 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 49 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 192th, in residue 1898 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 49 Block first atom: 191 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 50 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 196th, in residue 1902 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 50 Block first atom: 195 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 200th, in residue 1906 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 51 Block first atom: 199 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 204th, in residue 1910 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 52 Block first atom: 203 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 53 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 208th, in residue 1914 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 53 Block first atom: 207 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 54 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 212th, in residue 1918 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 54 Block first atom: 211 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 55 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 216th, in residue 1922 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 55 Block first atom: 215 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 56 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 220th, in residue 1926 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 56 Block first atom: 219 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 57 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 224th, in residue 1930 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 57 Block first atom: 223 Blocpdb> 3 atoms in block 58 Block first atom: 226 Blocpdb> 58 blocks. Blocpdb> At most, 4 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 30243 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 687 Prepmat> Matrix trace = 64080.0000 Prepmat> Last element read: 687 687 49.8931 Prepmat> 1712 lines saved. Prepmat> 1230 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 229 RTB> Total mass = 229.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 229 RTB> Number of blocks = 58 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 29574.1108 RTB> 16446 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 348 Diagstd> Nb of non-zero elements: 16446 Diagstd> Projected matrix trace = 29574.1108 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 348 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 29574.1108 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.3376456 3.8490471 3.8743665 5.6416384 6.7790197 7.7434036 9.5303257 10.2716816 10.9307679 11.2818121 12.0508212 12.7808515 13.5984103 13.7469965 14.6089674 15.4099427 15.6573610 16.2035371 16.7725595 17.5670402 17.9533705 18.2956206 19.4383814 19.4699059 20.1035745 21.1188966 21.1788629 22.0575246 22.5683013 23.4893208 24.0874997 24.5209188 24.7099009 24.8103043 25.3736086 25.7994123 26.9212604 27.7230347 28.6090356 28.8501963 29.0019923 30.6019009 31.0720289 31.5185335 32.3691514 32.9229640 33.4844205 33.6079449 34.4497988 35.1451365 35.8436546 36.1417452 36.7058406 36.9719565 37.4275119 38.3692364 38.8748229 39.3551780 39.8188931 40.0980464 40.5696704 41.0466878 41.7534154 42.3605456 42.8605241 43.4143956 44.4014604 44.6826806 45.2970174 45.5840497 46.2765468 46.5212456 47.3535103 48.0579722 48.3308579 48.8164244 49.1654344 49.7548909 50.6796979 51.0649545 51.1385622 52.0023979 52.1121876 52.2361809 52.7014833 53.1352195 53.9661415 54.1116518 54.4617235 55.4539730 55.6152594 55.7737235 56.1979874 56.5415124 57.4782353 57.8437208 57.8974683 58.5757385 58.7425425 58.9632566 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034335 0.0034336 0.0034337 0.0034338 0.0034339 198.3879963 213.0452696 213.7448363 257.9276516 282.7344504 302.1768760 335.2348442 348.0294979 359.0216315 364.7411072 376.9672332 388.2175595 400.4417500 402.6235659 415.0544172 426.2808199 429.6893230 437.1195129 444.7284883 455.1395521 460.1169975 464.4819617 478.7682363 479.1563044 486.8911959 499.0348691 499.7428624 510.0040983 515.8752780 526.2965336 532.9557372 537.7292368 539.7973920 540.8929559 546.9988317 551.5694289 563.4339019 571.7624949 580.8271242 583.2700361 584.8024684 600.7163911 605.3131186 609.6467765 617.8185411 623.0813381 628.3717816 629.5297502 637.3656074 643.7657947 650.1318194 652.8296035 657.9045155 660.2850999 664.3405457 672.6464558 677.0636403 681.2338522 685.2355276 687.6332798 691.6653505 695.7197613 701.6835308 706.7666574 710.9253799 715.5041545 723.5922511 725.8800995 730.8530835 733.1650142 738.7130173 740.6635072 747.2593702 752.7972102 754.9314745 758.7142892 761.4216492 765.9724849 773.0583738 775.9911264 776.5502021 783.0815019 783.9077041 784.8397467 788.3275419 791.5648845 797.7300724 798.8048184 801.3845599 808.6519044 809.8270217 810.9799177 814.0585869 816.5428695 823.2789154 825.8922504 826.2758645 831.1016923 832.2842004 833.8463101 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 229 Rtb_to_modes> Number of blocs = 58 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.779 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.96 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 348 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00003 1.00005 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99993 0.99996 0.99996 0.99995 0.99995 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 4122 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00003 1.00005 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 0.99996 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 0.99993 0.99996 0.99996 0.99995 0.99995 0.99998 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 0.99999 1.00004 1.00004 1.00003 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21011507581093769.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21011507581093769.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21011507581093769.atom Openam> file on opening on unit 11: 21011507581093769.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 229 First residue number = 2 Last residue number = 1935 Number of atoms found = 229 Mean number per residue = 1.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.779 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.96 Bfactors> 106 vectors, 687 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.338000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.311 +/- 0.33 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.311 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21011507581093769.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21011507581093769.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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vecteur en lecture: 740.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.8 Chkmod> 106 vectors, 687 coordinates in file. Chkmod> That is: 229 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 96 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7663 0.0034 0.7367 0.0034 0.9750 0.0034 0.8334 0.0034 0.8997 0.0034 0.7635 198.3900 0.5642 213.0348 0.6192 213.7256 0.6643 257.9248 0.0657 282.7219 0.2978 302.1560 0.0466 335.2147 0.5197 347.9861 0.3108 358.9936 0.5311 364.6962 0.2393 376.9382 0.2891 388.1880 0.5147 400.4480 0.4044 402.6503 0.2669 415.0513 0.4180 426.2633 0.4782 429.7071 0.4086 437.0530 0.5123 444.6755 0.5265 455.1584 0.4279 460.0541 0.4220 464.5176 0.5807 478.7676 0.4971 479.1369 0.5191 486.8270 0.4384 499.0265 0.5218 499.7348 0.5543 510.0108 0.3702 515.8725 0.4164 526.2815 0.4276 532.9605 0.5383 537.6961 0.3092 539.7753 0.3185 540.8664 0.1974 546.9365 0.5211 551.5520 0.4369 563.3965 0.6223 571.7067 0.5196 580.8120 0.4167 583.2430 0.3319 584.7573 0.3676 600.6719 0.5065 605.2674 0.4960 609.6348 0.4809 617.8001 0.4167 623.0265 0.2673 628.3033 0.4033 629.5220 0.4808 637.3401 0.4813 643.7827 0.4012 650.0708 0.3358 652.7858 0.5730 657.9135 0.5432 660.2393 0.3394 664.3341 0.3990 672.6243 0.6102 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011507581093769.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011507581093769.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21011507581093769 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21011507581093769.eigenfacs 21011507581093769.atom making animated gifs 11 models are in 21011507581093769.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011507581093769.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21011507581093769.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21011507581093769 9 -100 100 20 on 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