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***  TRANSFERASE 16-MAR-00 1EM6  ***

LOGs for ID: 21010315005846171

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21010315005846171.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21010315005846171.atom to be opened. Openam> File opened: 21010315005846171.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1574 First residue number = 22 Last residue number = 830 Number of atoms found = 12760 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 10.455900 +/- 14.767207 From: -24.942000 To: 45.770000 = 35.798062 +/- 21.858428 From: -17.708000 To: 90.648000 = 68.058772 +/- 26.830660 From: 16.006000 To: 127.691000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7164 % Filled. Pdbmat> 5248961 non-zero elements. Pdbmat> 574804 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 90.09 +/- 21.84 Maximum number = 133 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.149608E+07 Pdbmat> Larger element = 538.465 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1574 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21010315005846171.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21010315005846171.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21010315005846171.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12760 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1574 residues. Blocpdb> 64 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 75 atoms in block 2 Block first atom: 65 Blocpdb> 65 atoms in block 3 Block first atom: 140 Blocpdb> 73 atoms in block 4 Block first atom: 205 Blocpdb> 61 atoms in block 5 Block first atom: 278 Blocpdb> 73 atoms in block 6 Block first atom: 339 Blocpdb> 76 atoms in block 7 Block first atom: 412 Blocpdb> 72 atoms in block 8 Block first atom: 488 Blocpdb> 69 atoms in block 9 Block first atom: 560 Blocpdb> 63 atoms in block 10 Block first atom: 629 Blocpdb> 56 atoms in block 11 Block first atom: 692 Blocpdb> 63 atoms in block 12 Block first atom: 748 Blocpdb> 68 atoms in block 13 Block first atom: 811 Blocpdb> 55 atoms in block 14 Block first atom: 879 Blocpdb> 49 atoms in block 15 Block first atom: 934 Blocpdb> 59 atoms in block 16 Block first atom: 983 Blocpdb> 58 atoms in block 17 Block first atom: 1042 Blocpdb> 68 atoms in block 18 Block first atom: 1100 Blocpdb> 68 atoms in block 19 Block first atom: 1168 Blocpdb> 69 atoms in block 20 Block first atom: 1236 Blocpdb> 78 atoms in block 21 Block first atom: 1305 Blocpdb> 70 atoms in block 22 Block first atom: 1383 Blocpdb> 68 atoms in block 23 Block first atom: 1453 Blocpdb> 59 atoms in block 24 Block first atom: 1521 Blocpdb> 69 atoms in block 25 Block first atom: 1580 Blocpdb> 62 atoms in block 26 Block first atom: 1649 Blocpdb> 61 atoms in block 27 Block first atom: 1711 Blocpdb> 69 atoms in block 28 Block first atom: 1772 Blocpdb> 28 atoms in block 29 Block first atom: 1841 Blocpdb> 61 atoms in block 30 Block first atom: 1869 Blocpdb> 65 atoms in block 31 Block first atom: 1930 Blocpdb> 67 atoms in block 32 Block first atom: 1995 Blocpdb> 69 atoms in block 33 Block first atom: 2062 Blocpdb> 76 atoms in block 34 Block first atom: 2131 Blocpdb> 57 atoms in block 35 Block first atom: 2207 Blocpdb> 61 atoms in block 36 Block first atom: 2264 Blocpdb> 64 atoms in block 37 Block first atom: 2325 Blocpdb> 62 atoms in block 38 Block first atom: 2389 Blocpdb> 57 atoms in block 39 Block first atom: 2451 Blocpdb> 70 atoms in block 40 Block first atom: 2508 Blocpdb> 70 atoms in block 41 Block first atom: 2578 Blocpdb> 68 atoms in block 42 Block first atom: 2648 Blocpdb> 67 atoms in block 43 Block first atom: 2716 Blocpdb> 71 atoms in block 44 Block first atom: 2783 Blocpdb> 63 atoms in block 45 Block first atom: 2854 Blocpdb> 69 atoms in block 46 Block first atom: 2917 Blocpdb> 73 atoms in block 47 Block first atom: 2986 Blocpdb> 65 atoms in block 48 Block first atom: 3059 Blocpdb> 73 atoms in block 49 Block first atom: 3124 Blocpdb> 61 atoms in block 50 Block first atom: 3197 Blocpdb> 65 atoms in block 51 Block first atom: 3258 Blocpdb> 54 atoms in block 52 Block first atom: 3323 Blocpdb> 58 atoms in block 53 Block first atom: 3377 Blocpdb> 61 atoms in block 54 Block first atom: 3435 Blocpdb> 71 atoms in block 55 Block first atom: 3496 Blocpdb> 68 atoms in block 56 Block first atom: 3567 Blocpdb> 70 atoms in block 57 Block first atom: 3635 Blocpdb> 57 atoms in block 58 Block first atom: 3705 Blocpdb> 61 atoms in block 59 Block first atom: 3762 Blocpdb> 65 atoms in block 60 Block first atom: 3823 Blocpdb> 63 atoms in block 61 Block first atom: 3888 Blocpdb> 65 atoms in block 62 Block first atom: 3951 Blocpdb> 67 atoms in block 63 Block first atom: 4016 Blocpdb> 69 atoms in block 64 Block first atom: 4083 Blocpdb> 72 atoms in block 65 Block first atom: 4152 Blocpdb> 63 atoms in block 66 Block first atom: 4224 Blocpdb> 69 atoms in block 67 Block first atom: 4287 Blocpdb> 74 atoms in block 68 Block first atom: 4356 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4430 Blocpdb> 60 atoms in block 70 Block first atom: 4496 Blocpdb> 66 atoms in block 71 Block first atom: 4556 Blocpdb> 50 atoms in block 72 Block first atom: 4622 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 4672 Blocpdb> 56 atoms in block 74 Block first atom: 4737 Blocpdb> 57 atoms in block 75 Block first atom: 4793 Blocpdb> 66 atoms in block 76 Block first atom: 4850 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 4916 Blocpdb> 60 atoms in block 78 Block first atom: 4982 Blocpdb> 58 atoms in block 79 Block first atom: 5042 Blocpdb> 46 atoms in block 80 Block first atom: 5100 Blocpdb> 64 atoms in block 81 Block first atom: 5146 Blocpdb> 55 atoms in block 82 Block first atom: 5210 Blocpdb> 55 atoms in block 83 Block first atom: 5265 Blocpdb> 63 atoms in block 84 Block first atom: 5320 Blocpdb> 66 atoms in block 85 Block first atom: 5383 Blocpdb> 55 atoms in block 86 Block first atom: 5449 Blocpdb> 77 atoms in block 87 Block first atom: 5504 Blocpdb> 61 atoms in block 88 Block first atom: 5581 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 5642 Blocpdb> 65 atoms in block 90 Block first atom: 5706 Blocpdb> 68 atoms in block 91 Block first atom: 5771 Blocpdb> 79 atoms in block 92 Block first atom: 5839 Blocpdb> 69 atoms in block 93 Block first atom: 5918 Blocpdb> 63 atoms in block 94 Block first atom: 5987 Blocpdb> 71 atoms in block 95 Block first atom: 6050 Blocpdb> 63 atoms in block 96 Block first atom: 6121 Blocpdb> 52 atoms in block 97 Block first atom: 6184 Blocpdb> 69 atoms in block 98 Block first atom: 6236 Blocpdb> 70 atoms in block 99 Block first atom: 6305 Blocpdb> 6 atoms in block 100 Block first atom: 6375 Blocpdb> 64 atoms in block 101 Block first atom: 6381 Blocpdb> 75 atoms in block 102 Block first atom: 6445 Blocpdb> 65 atoms in block 103 Block first atom: 6520 Blocpdb> 73 atoms in block 104 Block first atom: 6585 Blocpdb> 61 atoms in block 105 Block first atom: 6658 Blocpdb> 73 atoms in block 106 Block first atom: 6719 Blocpdb> 76 atoms in block 107 Block first atom: 6792 Blocpdb> 72 atoms in block 108 Block first atom: 6868 Blocpdb> 69 atoms in block 109 Block first atom: 6940 Blocpdb> 63 atoms in block 110 Block first atom: 7009 Blocpdb> 56 atoms in block 111 Block first atom: 7072 Blocpdb> 63 atoms in block 112 Block first atom: 7128 Blocpdb> 68 atoms in block 113 Block first atom: 7191 Blocpdb> 55 atoms in block 114 Block first atom: 7259 Blocpdb> 49 atoms in block 115 Block first atom: 7314 Blocpdb> 59 atoms in block 116 Block first atom: 7363 Blocpdb> 58 atoms in block 117 Block first atom: 7422 Blocpdb> 68 atoms in block 118 Block first atom: 7480 Blocpdb> 68 atoms in block 119 Block first atom: 7548 Blocpdb> 69 atoms in block 120 Block first atom: 7616 Blocpdb> 78 atoms in block 121 Block first atom: 7685 Blocpdb> 70 atoms in block 122 Block first atom: 7763 Blocpdb> 68 atoms in block 123 Block first atom: 7833 Blocpdb> 59 atoms in block 124 Block first atom: 7901 Blocpdb> 69 atoms in block 125 Block first atom: 7960 Blocpdb> 62 atoms in block 126 Block first atom: 8029 Blocpdb> 61 atoms in block 127 Block first atom: 8091 Blocpdb> 69 atoms in block 128 Block first atom: 8152 Blocpdb> 28 atoms in block 129 Block first atom: 8221 Blocpdb> 61 atoms in block 130 Block first atom: 8249 Blocpdb> 65 atoms in block 131 Block first atom: 8310 Blocpdb> 67 atoms in block 132 Block first atom: 8375 Blocpdb> 69 atoms in block 133 Block first atom: 8442 Blocpdb> 76 atoms in block 134 Block first atom: 8511 Blocpdb> 57 atoms in block 135 Block first atom: 8587 Blocpdb> 61 atoms in block 136 Block first atom: 8644 Blocpdb> 64 atoms in block 137 Block first atom: 8705 Blocpdb> 62 atoms in block 138 Block first atom: 8769 Blocpdb> 57 atoms in block 139 Block first atom: 8831 Blocpdb> 70 atoms in block 140 Block first atom: 8888 Blocpdb> 70 atoms in block 141 Block first atom: 8958 Blocpdb> 68 atoms in block 142 Block first atom: 9028 Blocpdb> 67 atoms in block 143 Block first atom: 9096 Blocpdb> 71 atoms in block 144 Block first atom: 9163 Blocpdb> 63 atoms in block 145 Block first atom: 9234 Blocpdb> 69 atoms in block 146 Block first atom: 9297 Blocpdb> 73 atoms in block 147 Block first atom: 9366 Blocpdb> 65 atoms in block 148 Block first atom: 9439 Blocpdb> 73 atoms in block 149 Block first atom: 9504 Blocpdb> 61 atoms in block 150 Block first atom: 9577 Blocpdb> 65 atoms in block 151 Block first atom: 9638 Blocpdb> 54 atoms in block 152 Block first atom: 9703 Blocpdb> 58 atoms in block 153 Block first atom: 9757 Blocpdb> 61 atoms in block 154 Block first atom: 9815 Blocpdb> 71 atoms in block 155 Block first atom: 9876 Blocpdb> 68 atoms in block 156 Block first atom: 9947 Blocpdb> 70 atoms in block 157 Block first atom: 10015 Blocpdb> 57 atoms in block 158 Block first atom: 10085 Blocpdb> 61 atoms in block 159 Block first atom: 10142 Blocpdb> 65 atoms in block 160 Block first atom: 10203 Blocpdb> 63 atoms in block 161 Block first atom: 10268 Blocpdb> 65 atoms in block 162 Block first atom: 10331 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 10396 Blocpdb> 69 atoms in block 164 Block first atom: 10463 Blocpdb> 72 atoms in block 165 Block first atom: 10532 Blocpdb> 63 atoms in block 166 Block first atom: 10604 Blocpdb> 69 atoms in block 167 Block first atom: 10667 Blocpdb> 74 atoms in block 168 Block first atom: 10736 Blocpdb> 66 atoms in block 169 Block first atom: 10810 Blocpdb> 60 atoms in block 170 Block first atom: 10876 Blocpdb> 66 atoms in block 171 Block first atom: 10936 Blocpdb> 50 atoms in block 172 Block first atom: 11002 Blocpdb> 65 atoms in block 173 Block first atom: 11052 Blocpdb> 56 atoms in block 174 Block first atom: 11117 Blocpdb> 57 atoms in block 175 Block first atom: 11173 Blocpdb> 66 atoms in block 176 Block first atom: 11230 Blocpdb> 66 atoms in block 177 Block first atom: 11296 Blocpdb> 60 atoms in block 178 Block first atom: 11362 Blocpdb> 58 atoms in block 179 Block first atom: 11422 Blocpdb> 46 atoms in block 180 Block first atom: 11480 Blocpdb> 64 atoms in block 181 Block first atom: 11526 Blocpdb> 55 atoms in block 182 Block first atom: 11590 Blocpdb> 55 atoms in block 183 Block first atom: 11645 Blocpdb> 63 atoms in block 184 Block first atom: 11700 Blocpdb> 66 atoms in block 185 Block first atom: 11763 Blocpdb> 55 atoms in block 186 Block first atom: 11829 Blocpdb> 77 atoms in block 187 Block first atom: 11884 Blocpdb> 61 atoms in block 188 Block first atom: 11961 Blocpdb> 64 atoms in block 189 Block first atom: 12022 Blocpdb> 65 atoms in block 190 Block first atom: 12086 Blocpdb> 68 atoms in block 191 Block first atom: 12151 Blocpdb> 79 atoms in block 192 Block first atom: 12219 Blocpdb> 69 atoms in block 193 Block first atom: 12298 Blocpdb> 63 atoms in block 194 Block first atom: 12367 Blocpdb> 71 atoms in block 195 Block first atom: 12430 Blocpdb> 63 atoms in block 196 Block first atom: 12501 Blocpdb> 52 atoms in block 197 Block first atom: 12564 Blocpdb> 69 atoms in block 198 Block first atom: 12616 Blocpdb> 70 atoms in block 199 Block first atom: 12685 Blocpdb> 6 atoms in block 200 Block first atom: 12754 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 79 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5249161 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 38280 Prepmat> Matrix trace = 11496080.0000 Prepmat> Last element read: 38280 38280 169.3663 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18272 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12760 RTB> Total mass = 12760.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12760 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 228457.4844 RTB> 62808 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 62808 Diagstd> Projected matrix trace = 228457.4844 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 228457.4844 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4438606 0.4467593 0.9211465 1.7393062 1.9858558 2.7571808 3.2958641 3.6921157 4.0212465 4.5557343 4.8519322 5.3418848 5.8073307 7.5184379 7.7035173 8.4841636 9.3470508 9.8736805 10.1170889 10.5521274 10.9557702 11.0019614 11.2267493 12.3457248 12.5459331 12.6734713 13.1845487 13.3843019 13.7390434 13.9549730 14.5969853 15.0649773 15.2986316 15.6442652 16.2190614 16.5710524 17.2891796 17.4541151 18.3156587 18.7061327 19.6536927 20.0397135 20.9053022 21.2209058 21.7814108 21.9598484 23.3644183 23.4630407 23.6867643 23.8330335 23.8937873 24.4374549 24.7454178 25.4983284 25.5558717 25.8743898 26.4374759 26.7068270 26.7262242 27.1835597 27.4098449 27.7888885 27.9924830 28.4113131 28.7795289 29.1644571 29.2335759 29.4550386 30.1898908 30.8947268 30.9163205 31.6489517 32.6087772 32.8019468 33.2789392 33.3293717 33.9044726 34.6473624 34.7704080 34.9406644 35.1719642 35.4655587 35.6218096 36.5210304 36.8296745 36.9055579 37.0611940 38.3270117 38.4488390 38.6047491 38.8641893 39.1224860 39.7044921 39.9985595 40.2548928 40.7331178 41.0865421 41.6581544 41.8594676 42.1397428 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034337 0.0034340 0.0034341 0.0034347 0.0034349 72.3466745 72.5825268 104.2220563 143.2132841 153.0273762 180.3133590 197.1423497 208.6569876 217.7587564 231.7792067 239.1953004 250.9819800 261.6878499 297.7550177 301.3976150 316.3004415 331.9957938 341.2202641 345.4005803 352.7485958 359.4319991 360.1889106 363.8499270 381.5518603 384.6331962 386.5832851 394.3010333 397.2767436 402.5070839 405.6577536 414.8841705 421.4824741 424.7384465 429.5095896 437.3288613 442.0489110 451.5256990 453.6743213 464.7362524 469.6640136 481.4124976 486.1172519 496.5048616 500.2386447 506.8019576 508.8736338 524.8954004 526.0020387 528.5038426 530.1331256 530.8083874 536.8132993 540.1851927 548.3415249 548.9599103 552.3703243 558.3483982 561.1854812 561.3892397 566.1720735 568.5236940 572.4411800 574.5343401 578.8165403 582.5552503 586.4381685 587.1326763 589.3524302 596.6588011 603.5836398 603.7945392 610.9067799 620.1011504 621.9351320 626.4407736 626.9152632 632.3008658 639.1905854 640.3245803 641.8903689 644.0114539 646.6937792 648.1167852 656.2461845 659.0133624 659.6919244 661.0814692 672.2762364 673.3438464 674.7076705 676.9710338 679.2169294 684.2504673 686.7797099 688.9768306 693.0572431 696.0574344 700.8826232 702.5740918 704.9222528 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12760 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.739 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.986 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.296 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.807 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.14 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00003 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 229680 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00002 1.00003 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21010315005846171.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21010315005846171.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21010315005846171.atom Openam> file on opening on unit 11: 21010315005846171.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1574 First residue number = 22 Last residue number = 830 Number of atoms found = 12760 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4439 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.739 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.986 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.296 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.807 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.14 Bfactors> 106 vectors, 38280 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.443900 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.850 for 1574 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.015 +/- 0.01 Bfactors> = 33.879 +/- 9.64 Bfactors> Shiftng-fct= 33.864 Bfactors> Scaling-fct= 778.553 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21010315005846171.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21010315005846171.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.4 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Chkmod> That is: 12760 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7564 0.0034 0.9964 0.0034 0.9161 0.0034 0.7260 0.0034 0.7126 0.0034 0.7412 72.3468 0.7340 72.5827 0.6727 104.2150 0.6613 143.1945 0.6643 153.0264 0.5934 180.2997 0.6376 197.1380 0.3960 208.6448 0.4449 217.7427 0.3604 231.7760 0.4435 239.1867 0.6342 250.9739 0.5823 261.6692 0.5285 297.7336 0.3536 301.3941 0.2817 316.2838 0.4507 331.9806 0.5833 341.2111 0.5133 345.4354 0.4080 352.6979 0.1753 359.4859 0.6070 360.1413 0.3500 363.8870 0.5662 381.6015 0.5074 384.6790 0.4344 386.5137 0.5373 394.2161 0.4527 397.1958 0.3752 402.5038 0.2361 405.5681 0.1765 414.9092 0.5217 421.3948 0.5504 424.7392 0.4632 429.4326 0.5021 437.3227 0.4274 442.0159 0.3031 451.5170 0.4658 453.6014 0.4975 464.7714 0.3388 469.6924 0.4017 481.3466 0.4727 486.0999 0.4447 496.5393 0.4537 500.2065 0.3249 506.7638 0.4373 508.8535 0.4393 524.8232 0.4638 525.9454 0.4284 528.5173 0.5466 530.0766 0.4196 530.7435 0.4893 536.8182 0.4787 540.2120 0.4344 548.3360 0.2081 548.9807 0.2961 552.2998 0.5436 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21010315005846171.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21010315005846171.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21010315005846171 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom making animated gifs 11 models are in 21010315005846171.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21010315005846171.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21010315005846171.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21010315005846171 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21010315005846171.eigenfacs 21010315005846171.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21010315005846171.eigenfacs 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