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LOGs for ID: 201230112405142248

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 201230112405142248.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 201230112405142248.atom to be opened. Openam> File opened: 201230112405142248.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1984 First residue number = 27 Last residue number = 4 Number of atoms found = 15993 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -170.563824 +/- 136.171819 From: -373.462000 To: 33.614000 = 3.132414 +/- 13.407194 From: -41.682000 To: 38.611000 = -71.908374 +/- 69.592196 From: -190.584000 To: 42.738000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.6203 % Filled. Pdbmat> 6181293 non-zero elements. Pdbmat> 676245 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.57 +/- 23.15 Maximum number = 138 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.352490E+07 Pdbmat> Larger element = 521.555 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1984 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 201230112405142248.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 201230112405142248.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 201230112405142248.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 15993 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1984 residues. Blocpdb> 88 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 77 atoms in block 2 Block first atom: 89 Blocpdb> 71 atoms in block 3 Block first atom: 166 Blocpdb> 86 atoms in block 4 Block first atom: 237 Blocpdb> 82 atoms in block 5 Block first atom: 323 Blocpdb> 85 atoms in block 6 Block first atom: 405 Blocpdb> 79 atoms in block 7 Block first atom: 490 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 569 Blocpdb> 80 atoms in block 9 Block first atom: 640 Blocpdb> 92 atoms in block 10 Block first atom: 720 Blocpdb> 76 atoms in block 11 Block first atom: 812 Blocpdb> 80 atoms in block 12 Block first atom: 888 Blocpdb> 85 atoms in block 13 Block first atom: 968 Blocpdb> 72 atoms in block 14 Block first atom: 1053 Blocpdb> 86 atoms in block 15 Block first atom: 1125 Blocpdb> 85 atoms in block 16 Block first atom: 1211 Blocpdb> 74 atoms in block 17 Block first atom: 1296 Blocpdb> 78 atoms in block 18 Block first atom: 1370 Blocpdb> 81 atoms in block 19 Block first atom: 1448 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 1529 Blocpdb> 73 atoms in block 21 Block first atom: 1545 Blocpdb> 72 atoms in block 22 Block first atom: 1618 Blocpdb> 73 atoms in block 23 Block first atom: 1690 Blocpdb> 81 atoms in block 24 Block first atom: 1763 Blocpdb> 87 atoms in block 25 Block first atom: 1844 Blocpdb> 82 atoms in block 26 Block first atom: 1931 Blocpdb> 80 atoms in block 27 Block first atom: 2013 Blocpdb> 86 atoms in block 28 Block first atom: 2093 Blocpdb> 84 atoms in block 29 Block first atom: 2179 Blocpdb> 91 atoms in block 30 Block first atom: 2263 Blocpdb> 77 atoms in block 31 Block first atom: 2354 Blocpdb> 80 atoms in block 32 Block first atom: 2431 Blocpdb> 78 atoms in block 33 Block first atom: 2511 Blocpdb> 79 atoms in block 34 Block first atom: 2589 Blocpdb> 67 atoms in block 35 Block first atom: 2668 Blocpdb> 87 atoms in block 36 Block first atom: 2735 Blocpdb> 75 atoms in block 37 Block first atom: 2822 Blocpdb> 86 atoms in block 38 Block first atom: 2897 Blocpdb> 77 atoms in block 39 Block first atom: 2983 Blocpdb> 86 atoms in block 40 Block first atom: 3060 Blocpdb> 78 atoms in block 41 Block first atom: 3146 Blocpdb> 81 atoms in block 42 Block first atom: 3224 Blocpdb> 74 atoms in block 43 Block first atom: 3305 Blocpdb> 83 atoms in block 44 Block first atom: 3379 Blocpdb> 73 atoms in block 45 Block first atom: 3462 Blocpdb> 88 atoms in block 46 Block first atom: 3535 Blocpdb> 67 atoms in block 47 Block first atom: 3623 Blocpdb> 86 atoms in block 48 Block first atom: 3690 Blocpdb> 77 atoms in block 49 Block first atom: 3776 Blocpdb> 62 atoms in block 50 Block first atom: 3853 Blocpdb> 83 atoms in block 51 Block first atom: 3915 Blocpdb> 86 atoms in block 52 Block first atom: 3998 Blocpdb> 83 atoms in block 53 Block first atom: 4084 Blocpdb> 82 atoms in block 54 Block first atom: 4167 Blocpdb> 87 atoms in block 55 Block first atom: 4249 Blocpdb> 86 atoms in block 56 Block first atom: 4336 Blocpdb> 77 atoms in block 57 Block first atom: 4422 Blocpdb> 78 atoms in block 58 Block first atom: 4499 Blocpdb> 90 atoms in block 59 Block first atom: 4577 Blocpdb> 87 atoms in block 60 Block first atom: 4667 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 4754 Blocpdb> 80 atoms in block 62 Block first atom: 4770 Blocpdb> 77 atoms in block 63 Block first atom: 4850 Blocpdb> 87 atoms in block 64 Block first atom: 4927 Blocpdb> 76 atoms in block 65 Block first atom: 5014 Blocpdb> 73 atoms in block 66 Block first atom: 5090 Blocpdb> 81 atoms in block 67 Block first atom: 5163 Blocpdb> 84 atoms in block 68 Block first atom: 5244 Blocpdb> 78 atoms in block 69 Block first atom: 5328 Blocpdb> 84 atoms in block 70 Block first atom: 5406 Blocpdb> 86 atoms in block 71 Block first atom: 5490 Blocpdb> 81 atoms in block 72 Block first atom: 5576 Blocpdb> 81 atoms in block 73 Block first atom: 5657 Blocpdb> 80 atoms in block 74 Block first atom: 5738 Blocpdb> 76 atoms in block 75 Block first atom: 5818 Blocpdb> 78 atoms in block 76 Block first atom: 5894 Blocpdb> 76 atoms in block 77 Block first atom: 5972 Blocpdb> 83 atoms in block 78 Block first atom: 6048 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 6131 Blocpdb> 79 atoms in block 80 Block first atom: 6213 Blocpdb> 82 atoms in block 81 Block first atom: 6292 Blocpdb> 101 atoms in block 82 Block first atom: 6374 Blocpdb> 73 atoms in block 83 Block first atom: 6475 Blocpdb> 87 atoms in block 84 Block first atom: 6548 Blocpdb> 77 atoms in block 85 Block first atom: 6635 Blocpdb> 92 atoms in block 86 Block first atom: 6712 Blocpdb> 69 atoms in block 87 Block first atom: 6804 Blocpdb> 80 atoms in block 88 Block first atom: 6873 Blocpdb> 90 atoms in block 89 Block first atom: 6953 Blocpdb> 69 atoms in block 90 Block first atom: 7043 Blocpdb> 75 atoms in block 91 Block first atom: 7112 Blocpdb> 89 atoms in block 92 Block first atom: 7187 Blocpdb> 86 atoms in block 93 Block first atom: 7276 Blocpdb> 63 atoms in block 94 Block first atom: 7362 Blocpdb> 90 atoms in block 95 Block first atom: 7425 Blocpdb> 74 atoms in block 96 Block first atom: 7515 Blocpdb> 81 atoms in block 97 Block first atom: 7589 Blocpdb> 87 atoms in block 98 Block first atom: 7670 Blocpdb> 91 atoms in block 99 Block first atom: 7757 Blocpdb> 84 atoms in block 100 Block first atom: 7848 Blocpdb> 88 atoms in block 101 Block first atom: 7932 Blocpdb> 77 atoms in block 102 Block first atom: 8020 Blocpdb> 71 atoms in block 103 Block first atom: 8097 Blocpdb> 86 atoms in block 104 Block first atom: 8168 Blocpdb> 82 atoms in block 105 Block first atom: 8254 Blocpdb> 85 atoms in block 106 Block first atom: 8336 Blocpdb> 79 atoms in block 107 Block first atom: 8421 Blocpdb> 71 atoms in block 108 Block first atom: 8500 Blocpdb> 80 atoms in block 109 Block first atom: 8571 Blocpdb> 92 atoms in block 110 Block first atom: 8651 Blocpdb> 76 atoms in block 111 Block first atom: 8743 Blocpdb> 80 atoms in block 112 Block first atom: 8819 Blocpdb> 85 atoms in block 113 Block first atom: 8899 Blocpdb> 72 atoms in block 114 Block first atom: 8984 Blocpdb> 86 atoms in block 115 Block first atom: 9056 Blocpdb> 85 atoms in block 116 Block first atom: 9142 Blocpdb> 74 atoms in block 117 Block first atom: 9227 Blocpdb> 78 atoms in block 118 Block first atom: 9301 Blocpdb> 81 atoms in block 119 Block first atom: 9379 Blocpdb> 37 atoms in block 120 Block first atom: 9460 Blocpdb> 73 atoms in block 121 Block first atom: 9497 Blocpdb> 72 atoms in block 122 Block first atom: 9570 Blocpdb> 73 atoms in block 123 Block first atom: 9642 Blocpdb> 81 atoms in block 124 Block first atom: 9715 Blocpdb> 87 atoms in block 125 Block first atom: 9796 Blocpdb> 82 atoms in block 126 Block first atom: 9883 Blocpdb> 80 atoms in block 127 Block first atom: 9965 Blocpdb> 86 atoms in block 128 Block first atom: 10045 Blocpdb> 84 atoms in block 129 Block first atom: 10131 Blocpdb> 91 atoms in block 130 Block first atom: 10215 Blocpdb> 77 atoms in block 131 Block first atom: 10306 Blocpdb> 80 atoms in block 132 Block first atom: 10383 Blocpdb> 78 atoms in block 133 Block first atom: 10463 Blocpdb> 79 atoms in block 134 Block first atom: 10541 Blocpdb> 67 atoms in block 135 Block first atom: 10620 Blocpdb> 87 atoms in block 136 Block first atom: 10687 Blocpdb> 75 atoms in block 137 Block first atom: 10774 Blocpdb> 86 atoms in block 138 Block first atom: 10849 Blocpdb> 77 atoms in block 139 Block first atom: 10935 Blocpdb> 86 atoms in block 140 Block first atom: 11012 Blocpdb> 78 atoms in block 141 Block first atom: 11098 Blocpdb> 81 atoms in block 142 Block first atom: 11176 Blocpdb> 74 atoms in block 143 Block first atom: 11257 Blocpdb> 83 atoms in block 144 Block first atom: 11331 Blocpdb> 73 atoms in block 145 Block first atom: 11414 Blocpdb> 88 atoms in block 146 Block first atom: 11487 Blocpdb> 67 atoms in block 147 Block first atom: 11575 Blocpdb> 86 atoms in block 148 Block first atom: 11642 Blocpdb> 77 atoms in block 149 Block first atom: 11728 Blocpdb> 62 atoms in block 150 Block first atom: 11805 Blocpdb> 83 atoms in block 151 Block first atom: 11867 Blocpdb> 86 atoms in block 152 Block first atom: 11950 Blocpdb> 83 atoms in block 153 Block first atom: 12036 Blocpdb> 82 atoms in block 154 Block first atom: 12119 Blocpdb> 87 atoms in block 155 Block first atom: 12201 Blocpdb> 86 atoms in block 156 Block first atom: 12288 Blocpdb> 77 atoms in block 157 Block first atom: 12374 Blocpdb> 78 atoms in block 158 Block first atom: 12451 Blocpdb> 90 atoms in block 159 Block first atom: 12529 Blocpdb> 87 atoms in block 160 Block first atom: 12619 Blocpdb> 7 atoms in block 161 Block first atom: 12706 Blocpdb> 84 atoms in block 162 Block first atom: 12713 Blocpdb> 70 atoms in block 163 Block first atom: 12797 Blocpdb> 91 atoms in block 164 Block first atom: 12867 Blocpdb> 77 atoms in block 165 Block first atom: 12958 Blocpdb> 71 atoms in block 166 Block first atom: 13035 Blocpdb> 82 atoms in block 167 Block first atom: 13106 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 13188 Blocpdb> 80 atoms in block 169 Block first atom: 13271 Blocpdb> 83 atoms in block 170 Block first atom: 13351 Blocpdb> 87 atoms in block 171 Block first atom: 13434 Blocpdb> 82 atoms in block 172 Block first atom: 13521 Blocpdb> 79 atoms in block 173 Block first atom: 13603 Blocpdb> 82 atoms in block 174 Block first atom: 13682 Blocpdb> 75 atoms in block 175 Block first atom: 13764 Blocpdb> 78 atoms in block 176 Block first atom: 13839 Blocpdb> 73 atoms in block 177 Block first atom: 13917 Blocpdb> 82 atoms in block 178 Block first atom: 13990 Blocpdb> 85 atoms in block 179 Block first atom: 14072 Blocpdb> 79 atoms in block 180 Block first atom: 14157 Blocpdb> 85 atoms in block 181 Block first atom: 14236 Blocpdb> 94 atoms in block 182 Block first atom: 14321 Blocpdb> 76 atoms in block 183 Block first atom: 14415 Blocpdb> 90 atoms in block 184 Block first atom: 14491 Blocpdb> 79 atoms in block 185 Block first atom: 14581 Blocpdb> 86 atoms in block 186 Block first atom: 14660 Blocpdb> 70 atoms in block 187 Block first atom: 14746 Blocpdb> 85 atoms in block 188 Block first atom: 14816 Blocpdb> 82 atoms in block 189 Block first atom: 14901 Blocpdb> 73 atoms in block 190 Block first atom: 14983 Blocpdb> 79 atoms in block 191 Block first atom: 15056 Blocpdb> 84 atoms in block 192 Block first atom: 15135 Blocpdb> 83 atoms in block 193 Block first atom: 15219 Blocpdb> 73 atoms in block 194 Block first atom: 15302 Blocpdb> 84 atoms in block 195 Block first atom: 15375 Blocpdb> 78 atoms in block 196 Block first atom: 15459 Blocpdb> 77 atoms in block 197 Block first atom: 15537 Blocpdb> 87 atoms in block 198 Block first atom: 15614 Blocpdb> 91 atoms in block 199 Block first atom: 15701 Blocpdb> 76 atoms in block 200 Block first atom: 15792 Blocpdb> 30 atoms in block 201 Block first atom: 15868 Blocpdb> 30 atoms in block 202 Block first atom: 15898 Blocpdb> 33 atoms in block 203 Block first atom: 15928 Blocpdb> 33 atoms in block 204 Block first atom: 15960 Blocpdb> 204 blocks. Blocpdb> At most, 101 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6181497 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 47979 Prepmat> Matrix trace = 13524900.0000 Prepmat> Last element read: 47979 47979 152.5591 Prepmat> 20911 lines saved. Prepmat> 19472 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15993 RTB> Total mass = 15993.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 15993 RTB> Number of blocks = 204 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 198561.2439 RTB> 48708 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1224 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48708 Diagstd> Projected matrix trace = 198561.2439 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1224 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 198561.2439 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0010844 0.0014155 0.0077789 0.0106325 0.0129874 0.0376144 0.0534456 0.0875209 0.1041415 0.1650127 0.2405406 0.2763997 0.3587535 0.5006808 0.5816046 0.6828317 0.7289240 0.8057454 0.9658090 0.9946081 1.1458436 1.1954554 1.3565245 1.6268360 1.9457037 2.1239816 2.3616366 2.5046811 3.1392795 3.2550909 3.2729373 3.6195229 4.1437399 4.3960375 4.5084132 4.6478752 4.6793895 5.1347008 5.9096901 6.0719743 6.3945353 6.4990301 6.8132734 7.1474286 7.5182687 7.6801389 7.9402735 8.5649435 8.9742638 9.3244912 10.5191177 10.6425191 11.1257618 11.2808603 11.6954943 12.1506048 12.6230393 12.6727248 12.8402141 13.1925104 13.5788510 14.1426189 14.4862938 14.7016884 15.9717025 16.1965853 16.4410412 16.5764317 16.9545883 17.5323800 18.0376036 18.7161587 18.8416948 19.1171962 19.3989206 20.0629449 20.5632477 21.0130402 21.7280804 22.1075679 22.3063267 22.6177781 22.7600202 23.3309255 23.7420016 23.8398999 23.9766149 24.6784893 24.6921458 24.8001902 25.3322185 25.5549740 26.1455479 26.4838482 26.7848681 26.9203786 27.3397162 27.6516327 27.7736623 28.3056008 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034336 0.0034338 0.0034338 0.0034340 0.0034344 3.5758863 4.0856009 9.5775188 11.1972992 12.3753259 21.0606919 25.1044844 32.1255995 35.0434706 44.1117195 53.2585720 57.0905251 65.0419206 76.8379479 82.8150343 89.7329823 92.7120997 97.4752115 106.7187952 108.2982084 116.2406287 118.7304092 126.4762863 138.5055468 151.4724436 158.2598166 166.8790500 171.8586910 192.4023046 195.9191285 196.4554692 206.5955422 221.0505111 227.6805711 230.5723028 234.1113720 234.9037117 246.0667026 263.9840168 267.5840615 274.5995204 276.8340810 283.4478632 290.3154797 297.7516676 300.9399308 305.9940707 317.8026624 325.3079637 331.5949069 352.1964201 354.2562328 362.2097695 364.7257211 371.3680791 378.5247035 385.8133466 386.5719008 389.1180817 394.4200680 400.1536579 408.3759894 413.3081073 416.3694788 433.9811703 437.0257347 440.3114100 442.1206543 447.1352460 454.6903292 461.1951161 469.7898613 471.3627542 474.7963585 478.2820293 486.3989413 492.4261791 497.7826162 506.1811402 510.5823098 512.8723775 516.4404484 518.0618373 524.5190475 529.1197166 530.2094867 531.7276136 539.4541837 539.6034240 540.7826955 546.5525094 548.9502686 555.2571432 558.8378656 562.0048144 563.4246737 567.7959380 571.0257198 572.2843312 577.7387119 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15993 Rtb_to_modes> Number of blocs = 204 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0844E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4155E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7789E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0633E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.2987E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.7614E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3446E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7521E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1041 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2405 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2764 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3588 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5007 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5816 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7289 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.627 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.124 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.505 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.139 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.273 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.135 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.813 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.147 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.680 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.974 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.31 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1224 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 287874 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00004 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201230112405142248.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201230112405142248.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 201230112405142248.atom Openam> file on opening on unit 11: 201230112405142248.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1984 First residue number = 27 Last residue number = 4 Number of atoms found = 15993 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0844E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4155E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7789E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0633E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.2987E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.7614E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.3446E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7521E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1041 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2405 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2764 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3588 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5007 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5816 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7289 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.627 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.124 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.505 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.139 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.273 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.135 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.813 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.147 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.974 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.31 Bfactors> 106 vectors, 47979 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.001084 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.462 for 1984 C-alpha atoms. Bfactors> = 1.967 +/- 1.17 Bfactors> = 57.629 +/- 30.85 Bfactors> Shiftng-fct= 55.662 Bfactors> Scaling-fct= 26.371 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201230112405142248.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201230112405142248.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.576 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.085 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.577 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 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Chkmod> That is: 15993 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8839 0.0034 0.7201 0.0034 0.8922 0.0034 0.8165 0.0034 0.9739 0.0034 0.9185 3.5758 0.7321 4.0854 0.7130 9.5771 0.8060 11.1971 0.5798 12.3746 0.7321 21.0597 0.7668 25.1035 0.7360 32.1242 0.8076 35.0350 0.3128 44.1081 0.6152 53.2518 0.7102 57.0881 0.7026 65.0433 0.7278 76.8361 0.6749 82.8112 0.6297 89.7271 0.4390 92.7066 0.6452 97.4683 0.7013 106.7137 0.6515 108.2931 0.6565 116.2436 0.6648 118.7027 0.6269 126.4930 0.7355 138.5066 0.8186 151.4775 0.7755 158.2537 0.7565 166.8847 0.6917 171.8623 0.5248 192.3855 0.6411 195.9080 0.4035 196.4489 0.3912 206.6003 0.3907 221.0480 0.5301 227.6698 0.7000 230.5518 0.6086 234.1045 0.6201 234.8839 0.6584 246.0633 0.5554 263.9796 0.5195 267.5731 0.5555 274.5977 0.6159 276.8216 0.5650 283.4300 0.4799 290.2943 0.7456 297.7336 0.4990 300.9243 0.3874 305.9757 0.6524 317.7901 0.5239 325.2892 0.3845 331.5719 0.4195 352.1961 0.5693 354.1991 0.3989 362.2632 0.3201 364.6962 0.4798 371.4237 0.5264 378.4990 0.0129 385.7503 0.3036 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201230112405142248.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201230112405142248.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 201230112405142248 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 201230112405142248 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201230112405142248.eigenfacs 201230112405142248.atom 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