***  robetta1 elnémo nma  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 201229001245125947.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 201229001245125947.atom to be opened.
Openam> File opened: 201229001245125947.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 721
First residue number = 1
Last residue number = 721
Number of atoms found = 11438
Mean number per residue = 15.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 23.923261 +/- 16.272395 From: -18.738000 To: 70.014000
= -3.438122 +/- 21.343438 From: -63.426000 To: 39.015000
= -21.610813 +/- 24.665395 From: -84.846000 To: 23.524000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3564 % Filled.
Pdbmat> 7985919 non-zero elements.
Pdbmat> 879834 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 153.84 +/- 49.87
Maximum number = 263
Minimum number = 22
Pdbmat> Matrix trace = 1.759668E+07
Pdbmat> Larger element = 920.083
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
721 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 201229001245125947.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 201229001245125947.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
201229001245125947.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 11438 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 721 residues.
Blocpdb> 79 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 78 atoms in block 2
Block first atom: 80
Blocpdb> 64 atoms in block 3
Block first atom: 158
Blocpdb> 50 atoms in block 4
Block first atom: 222
Blocpdb> 68 atoms in block 5
Block first atom: 272
Blocpdb> 61 atoms in block 6
Block first atom: 340
Blocpdb> 75 atoms in block 7
Block first atom: 401
Blocpdb> 56 atoms in block 8
Block first atom: 476
Blocpdb> 62 atoms in block 9
Block first atom: 532
Blocpdb> 63 atoms in block 10
Block first atom: 594
Blocpdb> 61 atoms in block 11
Block first atom: 657
Blocpdb> 61 atoms in block 12
Block first atom: 718
Blocpdb> 80 atoms in block 13
Block first atom: 779
Blocpdb> 72 atoms in block 14
Block first atom: 859
Blocpdb> 57 atoms in block 15
Block first atom: 931
Blocpdb> 67 atoms in block 16
Block first atom: 988
Blocpdb> 52 atoms in block 17
Block first atom: 1055
Blocpdb> 56 atoms in block 18
Block first atom: 1107
Blocpdb> 58 atoms in block 19
Block first atom: 1163
Blocpdb> 52 atoms in block 20
Block first atom: 1221
Blocpdb> 59 atoms in block 21
Block first atom: 1273
Blocpdb> 50 atoms in block 22
Block first atom: 1332
Blocpdb> 56 atoms in block 23
Block first atom: 1382
Blocpdb> 60 atoms in block 24
Block first atom: 1438
Blocpdb> 56 atoms in block 25
Block first atom: 1498
Blocpdb> 49 atoms in block 26
Block first atom: 1554
Blocpdb> 68 atoms in block 27
Block first atom: 1603
Blocpdb> 63 atoms in block 28
Block first atom: 1671
Blocpdb> 48 atoms in block 29
Block first atom: 1734
Blocpdb> 57 atoms in block 30
Block first atom: 1782
Blocpdb> 74 atoms in block 31
Block first atom: 1839
Blocpdb> 68 atoms in block 32
Block first atom: 1913
Blocpdb> 62 atoms in block 33
Block first atom: 1981
Blocpdb> 78 atoms in block 34
Block first atom: 2043
Blocpdb> 59 atoms in block 35
Block first atom: 2121
Blocpdb> 62 atoms in block 36
Block first atom: 2180
Blocpdb> 68 atoms in block 37
Block first atom: 2242
Blocpdb> 54 atoms in block 38
Block first atom: 2310
Blocpdb> 75 atoms in block 39
Block first atom: 2364
Blocpdb> 60 atoms in block 40
Block first atom: 2439
Blocpdb> 66 atoms in block 41
Block first atom: 2499
Blocpdb> 71 atoms in block 42
Block first atom: 2565
Blocpdb> 67 atoms in block 43
Block first atom: 2636
Blocpdb> 63 atoms in block 44
Block first atom: 2703
Blocpdb> 51 atoms in block 45
Block first atom: 2766
Blocpdb> 44 atoms in block 46
Block first atom: 2817
Blocpdb> 51 atoms in block 47
Block first atom: 2861
Blocpdb> 70 atoms in block 48
Block first atom: 2912
Blocpdb> 60 atoms in block 49
Block first atom: 2982
Blocpdb> 68 atoms in block 50
Block first atom: 3042
Blocpdb> 57 atoms in block 51
Block first atom: 3110
Blocpdb> 58 atoms in block 52
Block first atom: 3167
Blocpdb> 77 atoms in block 53
Block first atom: 3225
Blocpdb> 60 atoms in block 54
Block first atom: 3302
Blocpdb> 68 atoms in block 55
Block first atom: 3362
Blocpdb> 51 atoms in block 56
Block first atom: 3430
Blocpdb> 46 atoms in block 57
Block first atom: 3481
Blocpdb> 58 atoms in block 58
Block first atom: 3527
Blocpdb> 75 atoms in block 59
Block first atom: 3585
Blocpdb> 62 atoms in block 60
Block first atom: 3660
Blocpdb> 57 atoms in block 61
Block first atom: 3722
Blocpdb> 71 atoms in block 62
Block first atom: 3779
Blocpdb> 64 atoms in block 63
Block first atom: 3850
Blocpdb> 68 atoms in block 64
Block first atom: 3914
Blocpdb> 71 atoms in block 65
Block first atom: 3982
Blocpdb> 61 atoms in block 66
Block first atom: 4053
Blocpdb> 64 atoms in block 67
Block first atom: 4114
Blocpdb> 70 atoms in block 68
Block first atom: 4178
Blocpdb> 65 atoms in block 69
Block first atom: 4248
Blocpdb> 87 atoms in block 70
Block first atom: 4313
Blocpdb> 57 atoms in block 71
Block first atom: 4400
Blocpdb> 63 atoms in block 72
Block first atom: 4457
Blocpdb> 78 atoms in block 73
Block first atom: 4520
Blocpdb> 58 atoms in block 74
Block first atom: 4598
Blocpdb> 61 atoms in block 75
Block first atom: 4656
Blocpdb> 70 atoms in block 76
Block first atom: 4717
Blocpdb> 61 atoms in block 77
Block first atom: 4787
Blocpdb> 58 atoms in block 78
Block first atom: 4848
Blocpdb> 65 atoms in block 79
Block first atom: 4906
Blocpdb> 65 atoms in block 80
Block first atom: 4971
Blocpdb> 69 atoms in block 81
Block first atom: 5036
Blocpdb> 52 atoms in block 82
Block first atom: 5105
Blocpdb> 51 atoms in block 83
Block first atom: 5157
Blocpdb> 70 atoms in block 84
Block first atom: 5208
Blocpdb> 41 atoms in block 85
Block first atom: 5278
Blocpdb> 59 atoms in block 86
Block first atom: 5319
Blocpdb> 56 atoms in block 87
Block first atom: 5378
Blocpdb> 52 atoms in block 88
Block first atom: 5434
Blocpdb> 69 atoms in block 89
Block first atom: 5486
Blocpdb> 66 atoms in block 90
Block first atom: 5555
Blocpdb> 52 atoms in block 91
Block first atom: 5621
Blocpdb> 77 atoms in block 92
Block first atom: 5673
Blocpdb> 73 atoms in block 93
Block first atom: 5750
Blocpdb> 76 atoms in block 94
Block first atom: 5823
Blocpdb> 71 atoms in block 95
Block first atom: 5899
Blocpdb> 61 atoms in block 96
Block first atom: 5970
Blocpdb> 69 atoms in block 97
Block first atom: 6031
Blocpdb> 57 atoms in block 98
Block first atom: 6100
Blocpdb> 60 atoms in block 99
Block first atom: 6157
Blocpdb> 61 atoms in block 100
Block first atom: 6217
Blocpdb> 59 atoms in block 101
Block first atom: 6278
Blocpdb> 69 atoms in block 102
Block first atom: 6337
Blocpdb> 77 atoms in block 103
Block first atom: 6406
Blocpdb> 70 atoms in block 104
Block first atom: 6483
Blocpdb> 76 atoms in block 105
Block first atom: 6553
Blocpdb> 68 atoms in block 106
Block first atom: 6629
Blocpdb> 74 atoms in block 107
Block first atom: 6697
Blocpdb> 57 atoms in block 108
Block first atom: 6771
Blocpdb> 64 atoms in block 109
Block first atom: 6828
Blocpdb> 58 atoms in block 110
Block first atom: 6892
Blocpdb> 65 atoms in block 111
Block first atom: 6950
Blocpdb> 58 atoms in block 112
Block first atom: 7015
Blocpdb> 54 atoms in block 113
Block first atom: 7073
Blocpdb> 68 atoms in block 114
Block first atom: 7127
Blocpdb> 58 atoms in block 115
Block first atom: 7195
Blocpdb> 70 atoms in block 116
Block first atom: 7253
Blocpdb> 62 atoms in block 117
Block first atom: 7323
Blocpdb> 68 atoms in block 118
Block first atom: 7385
Blocpdb> 74 atoms in block 119
Block first atom: 7453
Blocpdb> 59 atoms in block 120
Block first atom: 7527
Blocpdb> 74 atoms in block 121
Block first atom: 7586
Blocpdb> 75 atoms in block 122
Block first atom: 7660
Blocpdb> 59 atoms in block 123
Block first atom: 7735
Blocpdb> 56 atoms in block 124
Block first atom: 7794
Blocpdb> 51 atoms in block 125
Block first atom: 7850
Blocpdb> 70 atoms in block 126
Block first atom: 7901
Blocpdb> 66 atoms in block 127
Block first atom: 7971
Blocpdb> 65 atoms in block 128
Block first atom: 8037
Blocpdb> 67 atoms in block 129
Block first atom: 8102
Blocpdb> 64 atoms in block 130
Block first atom: 8169
Blocpdb> 58 atoms in block 131
Block first atom: 8233
Blocpdb> 62 atoms in block 132
Block first atom: 8291
Blocpdb> 62 atoms in block 133
Block first atom: 8353
Blocpdb> 60 atoms in block 134
Block first atom: 8415
Blocpdb> 60 atoms in block 135
Block first atom: 8475
Blocpdb> 59 atoms in block 136
Block first atom: 8535
Blocpdb> 56 atoms in block 137
Block first atom: 8594
Blocpdb> 57 atoms in block 138
Block first atom: 8650
Blocpdb> 66 atoms in block 139
Block first atom: 8707
Blocpdb> 75 atoms in block 140
Block first atom: 8773
Blocpdb> 64 atoms in block 141
Block first atom: 8848
Blocpdb> 63 atoms in block 142
Block first atom: 8912
Blocpdb> 51 atoms in block 143
Block first atom: 8975
Blocpdb> 74 atoms in block 144
Block first atom: 9026
Blocpdb> 46 atoms in block 145
Block first atom: 9100
Blocpdb> 67 atoms in block 146
Block first atom: 9146
Blocpdb> 63 atoms in block 147
Block first atom: 9213
Blocpdb> 59 atoms in block 148
Block first atom: 9276
Blocpdb> 83 atoms in block 149
Block first atom: 9335
Blocpdb> 56 atoms in block 150
Block first atom: 9418
Blocpdb> 65 atoms in block 151
Block first atom: 9474
Blocpdb> 58 atoms in block 152
Block first atom: 9539
Blocpdb> 64 atoms in block 153
Block first atom: 9597
Blocpdb> 71 atoms in block 154
Block first atom: 9661
Blocpdb> 56 atoms in block 155
Block first atom: 9732
Blocpdb> 69 atoms in block 156
Block first atom: 9788
Blocpdb> 49 atoms in block 157
Block first atom: 9857
Blocpdb> 56 atoms in block 158
Block first atom: 9906
Blocpdb> 59 atoms in block 159
Block first atom: 9962
Blocpdb> 62 atoms in block 160
Block first atom: 10021
Blocpdb> 77 atoms in block 161
Block first atom: 10083
Blocpdb> 72 atoms in block 162
Block first atom: 10160
Blocpdb> 67 atoms in block 163
Block first atom: 10232
Blocpdb> 69 atoms in block 164
Block first atom: 10299
Blocpdb> 67 atoms in block 165
Block first atom: 10368
Blocpdb> 73 atoms in block 166
Block first atom: 10435
Blocpdb> 63 atoms in block 167
Block first atom: 10508
Blocpdb> 60 atoms in block 168
Block first atom: 10571
Blocpdb> 65 atoms in block 169
Block first atom: 10631
Blocpdb> 67 atoms in block 170
Block first atom: 10696
Blocpdb> 64 atoms in block 171
Block first atom: 10763
Blocpdb> 68 atoms in block 172
Block first atom: 10827
Blocpdb> 59 atoms in block 173
Block first atom: 10895
Blocpdb> 63 atoms in block 174
Block first atom: 10954
Blocpdb> 64 atoms in block 175
Block first atom: 11017
Blocpdb> 69 atoms in block 176
Block first atom: 11081
Blocpdb> 70 atoms in block 177
Block first atom: 11150
Blocpdb> 67 atoms in block 178
Block first atom: 11220
Blocpdb> 61 atoms in block 179
Block first atom: 11287
Blocpdb> 70 atoms in block 180
Block first atom: 11348
Blocpdb> 21 atoms in block 181
Block first atom: 11417
Blocpdb> 181 blocks.
Blocpdb> At most, 87 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 7986100 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 34314
Prepmat> Matrix trace = 17596680.0000
Prepmat> Last element read: 34314 34314 377.3496
Prepmat> 16472 lines saved.
Prepmat> 14845 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11438
RTB> Total mass = 11438.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 11438
RTB> Number of blocks = 181
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 403908.1488
RTB> 55821 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1086
Diagstd> Nb of non-zero elements: 55821
Diagstd> Projected matrix trace = 403908.1488
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1086 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 403908.1488
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0826560 0.1491846 0.2088705 0.2213764
0.4200385 0.4645906 0.6426906 0.7583650 0.8933855
1.4887093 1.8788510 1.9358304 2.1643575 2.5189958
2.7026580 3.0776089 3.7619040 4.2665553 5.2286845
5.5712850 5.8643682 6.2021490 6.2448540 7.1974791
7.6194971 8.1628934 9.0299931 9.5700099 10.5995624
10.9048190 11.9580316 13.1880680 13.9104783 14.5692205
15.7185733 15.9432403 16.6403981 16.9662230 18.6038937
19.5789198 21.0030279 21.5034057 22.0920785 23.2322487
23.6082795 24.6194682 25.6708991 26.6625128 26.9178055
28.2501141 29.8663976 30.0614360 30.8671522 32.3045531
33.3732734 34.0979485 35.2750688 35.4784229 36.1386116
37.2327454 38.7361053 39.0694885 39.9289026 40.0213804
42.4354964 43.2984282 44.6532789 45.4639106 46.2301178
46.5619292 47.1890476 48.0381971 49.6473162 50.5630849
50.9104066 51.6207169 52.0656249 53.2148769 53.7349487
55.5783122 56.8541789 57.3547998 57.9632798 58.4821654
59.3909843 59.6629946 60.6209063 62.0557371 63.5064724
64.3893809 65.3607346 65.8236494 66.4959975 66.9409681
68.3588370 68.7009416 69.5269190 70.3437792 70.6438637
71.4447759
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034295 0.0034316 0.0034317 0.0034317 0.0034339
0.0034340 31.2199724 41.9427898 49.6288030 51.0929489
70.3784692 74.0168303 87.0555047 94.5658706 102.6395503
132.4952278 148.8474692 151.0876392 159.7569581 172.3490943
178.5216224 190.5030761 210.6197711 224.3024267 248.3084499
256.3143768 262.9698122 270.4371665 271.3666195 291.3301869
299.7494766 310.2539666 326.3164665 335.9320755 353.5405619
358.5952324 375.5131312 394.3536532 405.0105271 414.4894095
430.5284376 433.5943114 442.9728778 447.2886369 468.3787736
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527.6275318 538.8087177 550.1939618 560.7197049 563.3977471
577.1721718 593.4535081 595.3880879 603.3142205 617.2017504
627.3280166 634.1024121 644.9547045 646.8110538 652.8013023
662.6097329 675.8545727 678.7567208 686.1814406 686.9756001
707.3916413 714.5478976 725.6412417 732.1982298 738.3423510
740.9872976 745.9605948 752.6423125 765.1439851 772.1684657
774.8159691 780.2024254 783.5574115 792.1579976 796.0194868
809.5579782 818.7974399 822.3944379 826.7453408 830.4375963
836.8652637 838.7794931 845.4861405 855.4334912 865.3748615
871.3696012 877.9175736 881.0209963 885.5091086 888.4669450
897.8268993 900.0707015 905.4652185 910.7687665 912.7093556
917.8686137
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11438
Rtb_to_modes> Number of blocs = 181
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.44
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1086 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 205884 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
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1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999
1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999
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1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99997
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1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201229001245125947.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201229001245125947.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 201229001245125947.atom
Openam> file on opening on unit 11:
201229001245125947.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 721
First residue number = 1
Last residue number = 721
Number of atoms found = 11438
Mean number per residue = 15.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.44
Bfactors> 106 vectors, 34314 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.082656
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.573 for 721 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.059 +/- 0.09
Bfactors> = 5.226 +/- 5.33
Bfactors> Shiftng-fct= 5.167
Bfactors> Scaling-fct= 60.481
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201229001245125947.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201229001245125947.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4293E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.8
Chkmod> 106 vectors, 34314 coordinates in file.
Chkmod> That is: 11438 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7081
0.0034 0.9476
0.0034 0.7696
0.0034 0.7132
0.0034 0.8106
0.0034 0.9661
31.2186 0.5494
41.9432 0.4239
49.6302 0.1500
51.0935 0.2298
70.3722 0.6493
74.0144 0.4124
87.0524 0.2098
94.5640 0.5217
102.6360 0.3593
132.5025 0.5462
148.8470 0.3718
151.0878 0.3029
159.7369 0.0841
172.3418 0.5629
178.5253 0.6326
190.5070 0.2690
210.6134 0.5082
224.3045 0.1589
248.3053 0.4794
256.2968 0.2082
262.9503 0.2714
270.4223 0.3307
271.3581 0.3764
291.3080 0.3091
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getting mode 11
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