*** 4P8L V/S 4FDO MP ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 20122622073737765.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 20122622073737765.atom to be opened.
Openam> File opened: 20122622073737765.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6374
Mean number per residue = 15.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 39.432598 +/- 12.520733 From: 8.765000 To: 70.682000
= 8.977130 +/- 13.156113 From: -22.938000 To: 36.887000
= 4.318315 +/- 10.735974 From: -22.488000 To: 28.999000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6724 % Filled.
Pdbmat> 4886111 non-zero elements.
Pdbmat> 538733 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 169.04 +/- 44.81
Maximum number = 253
Minimum number = 25
Pdbmat> Matrix trace = 1.077466E+07
Pdbmat> Larger element = 884.352
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
426 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 20122622073737765.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 20122622073737765.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
20122622073737765.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6374 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 426 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 48 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 40 atoms in block 3
Block first atom: 83
Blocpdb> 55 atoms in block 4
Block first atom: 123
Blocpdb> 38 atoms in block 5
Block first atom: 178
Blocpdb> 37 atoms in block 6
Block first atom: 216
Blocpdb> 49 atoms in block 7
Block first atom: 253
Blocpdb> 52 atoms in block 8
Block first atom: 302
Blocpdb> 37 atoms in block 9
Block first atom: 354
Blocpdb> 52 atoms in block 10
Block first atom: 391
Blocpdb> 39 atoms in block 11
Block first atom: 443
Blocpdb> 39 atoms in block 12
Block first atom: 482
Blocpdb> 31 atoms in block 13
Block first atom: 521
Blocpdb> 21 atoms in block 14
Block first atom: 552
Blocpdb> 41 atoms in block 15
Block first atom: 573
Blocpdb> 53 atoms in block 16
Block first atom: 614
Blocpdb> 33 atoms in block 17
Block first atom: 667
Blocpdb> 56 atoms in block 18
Block first atom: 700
Blocpdb> 33 atoms in block 19
Block first atom: 756
Blocpdb> 41 atoms in block 20
Block first atom: 789
Blocpdb> 21 atoms in block 21
Block first atom: 830
Blocpdb> 54 atoms in block 22
Block first atom: 851
Blocpdb> 43 atoms in block 23
Block first atom: 905
Blocpdb> 47 atoms in block 24
Block first atom: 948
Blocpdb> 50 atoms in block 25
Block first atom: 995
Blocpdb> 42 atoms in block 26
Block first atom: 1045
Blocpdb> 36 atoms in block 27
Block first atom: 1087
Blocpdb> 57 atoms in block 28
Block first atom: 1123
Blocpdb> 43 atoms in block 29
Block first atom: 1180
Blocpdb> 33 atoms in block 30
Block first atom: 1223
Blocpdb> 45 atoms in block 31
Block first atom: 1256
Blocpdb> 53 atoms in block 32
Block first atom: 1301
Blocpdb> 42 atoms in block 33
Block first atom: 1354
Blocpdb> 53 atoms in block 34
Block first atom: 1396
Blocpdb> 50 atoms in block 35
Block first atom: 1449
Blocpdb> 46 atoms in block 36
Block first atom: 1499
Blocpdb> 40 atoms in block 37
Block first atom: 1545
Blocpdb> 55 atoms in block 38
Block first atom: 1585
Blocpdb> 46 atoms in block 39
Block first atom: 1640
Blocpdb> 24 atoms in block 40
Block first atom: 1686
Blocpdb> 40 atoms in block 41
Block first atom: 1710
Blocpdb> 48 atoms in block 42
Block first atom: 1750
Blocpdb> 43 atoms in block 43
Block first atom: 1798
Blocpdb> 45 atoms in block 44
Block first atom: 1841
Blocpdb> 28 atoms in block 45
Block first atom: 1886
Blocpdb> 41 atoms in block 46
Block first atom: 1914
Blocpdb> 57 atoms in block 47
Block first atom: 1955
Blocpdb> 40 atoms in block 48
Block first atom: 2012
Blocpdb> 52 atoms in block 49
Block first atom: 2052
Blocpdb> 29 atoms in block 50
Block first atom: 2104
Blocpdb> 50 atoms in block 51
Block first atom: 2133
Blocpdb> 50 atoms in block 52
Block first atom: 2183
Blocpdb> 35 atoms in block 53
Block first atom: 2233
Blocpdb> 29 atoms in block 54
Block first atom: 2268
Blocpdb> 54 atoms in block 55
Block first atom: 2297
Blocpdb> 48 atoms in block 56
Block first atom: 2351
Blocpdb> 30 atoms in block 57
Block first atom: 2399
Blocpdb> 40 atoms in block 58
Block first atom: 2429
Blocpdb> 40 atoms in block 59
Block first atom: 2469
Blocpdb> 60 atoms in block 60
Block first atom: 2509
Blocpdb> 43 atoms in block 61
Block first atom: 2569
Blocpdb> 46 atoms in block 62
Block first atom: 2612
Blocpdb> 39 atoms in block 63
Block first atom: 2658
Blocpdb> 45 atoms in block 64
Block first atom: 2697
Blocpdb> 49 atoms in block 65
Block first atom: 2742
Blocpdb> 31 atoms in block 66
Block first atom: 2791
Blocpdb> 40 atoms in block 67
Block first atom: 2822
Blocpdb> 42 atoms in block 68
Block first atom: 2862
Blocpdb> 48 atoms in block 69
Block first atom: 2904
Blocpdb> 46 atoms in block 70
Block first atom: 2952
Blocpdb> 30 atoms in block 71
Block first atom: 2998
Blocpdb> 36 atoms in block 72
Block first atom: 3028
Blocpdb> 59 atoms in block 73
Block first atom: 3064
Blocpdb> 43 atoms in block 74
Block first atom: 3123
Blocpdb> 54 atoms in block 75
Block first atom: 3166
Blocpdb> 41 atoms in block 76
Block first atom: 3220
Blocpdb> 35 atoms in block 77
Block first atom: 3261
Blocpdb> 55 atoms in block 78
Block first atom: 3296
Blocpdb> 41 atoms in block 79
Block first atom: 3351
Blocpdb> 37 atoms in block 80
Block first atom: 3392
Blocpdb> 55 atoms in block 81
Block first atom: 3429
Blocpdb> 43 atoms in block 82
Block first atom: 3484
Blocpdb> 40 atoms in block 83
Block first atom: 3527
Blocpdb> 43 atoms in block 84
Block first atom: 3567
Blocpdb> 50 atoms in block 85
Block first atom: 3610
Blocpdb> 40 atoms in block 86
Block first atom: 3660
Blocpdb> 55 atoms in block 87
Block first atom: 3700
Blocpdb> 7 atoms in block 88
Block first atom: 3755
Blocpdb> 24 atoms in block 89
Block first atom: 3762
Blocpdb> 42 atoms in block 90
Block first atom: 3786
Blocpdb> 53 atoms in block 91
Block first atom: 3828
Blocpdb> 47 atoms in block 92
Block first atom: 3881
Blocpdb> 50 atoms in block 93
Block first atom: 3928
Blocpdb> 58 atoms in block 94
Block first atom: 3978
Blocpdb> 45 atoms in block 95
Block first atom: 4036
Blocpdb> 44 atoms in block 96
Block first atom: 4081
Blocpdb> 53 atoms in block 97
Block first atom: 4125
Blocpdb> 55 atoms in block 98
Block first atom: 4178
Blocpdb> 31 atoms in block 99
Block first atom: 4233
Blocpdb> 46 atoms in block 100
Block first atom: 4264
Blocpdb> 55 atoms in block 101
Block first atom: 4310
Blocpdb> 55 atoms in block 102
Block first atom: 4365
Blocpdb> 35 atoms in block 103
Block first atom: 4420
Blocpdb> 38 atoms in block 104
Block first atom: 4455
Blocpdb> 57 atoms in block 105
Block first atom: 4493
Blocpdb> 51 atoms in block 106
Block first atom: 4550
Blocpdb> 42 atoms in block 107
Block first atom: 4601
Blocpdb> 38 atoms in block 108
Block first atom: 4643
Blocpdb> 45 atoms in block 109
Block first atom: 4681
Blocpdb> 50 atoms in block 110
Block first atom: 4726
Blocpdb> 50 atoms in block 111
Block first atom: 4776
Blocpdb> 61 atoms in block 112
Block first atom: 4826
Blocpdb> 45 atoms in block 113
Block first atom: 4887
Blocpdb> 41 atoms in block 114
Block first atom: 4932
Blocpdb> 44 atoms in block 115
Block first atom: 4973
Blocpdb> 53 atoms in block 116
Block first atom: 5017
Blocpdb> 45 atoms in block 117
Block first atom: 5070
Blocpdb> 44 atoms in block 118
Block first atom: 5115
Blocpdb> 48 atoms in block 119
Block first atom: 5159
Blocpdb> 55 atoms in block 120
Block first atom: 5207
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 5262
Blocpdb> 49 atoms in block 122
Block first atom: 5300
Blocpdb> 42 atoms in block 123
Block first atom: 5349
Blocpdb> 44 atoms in block 124
Block first atom: 5391
Blocpdb> 59 atoms in block 125
Block first atom: 5435
Blocpdb> 42 atoms in block 126
Block first atom: 5494
Blocpdb> 50 atoms in block 127
Block first atom: 5536
Blocpdb> 45 atoms in block 128
Block first atom: 5586
Blocpdb> 45 atoms in block 129
Block first atom: 5631
Blocpdb> 52 atoms in block 130
Block first atom: 5676
Blocpdb> 39 atoms in block 131
Block first atom: 5728
Blocpdb> 47 atoms in block 132
Block first atom: 5767
Blocpdb> 52 atoms in block 133
Block first atom: 5814
Blocpdb> 52 atoms in block 134
Block first atom: 5866
Blocpdb> 58 atoms in block 135
Block first atom: 5918
Blocpdb> 51 atoms in block 136
Block first atom: 5976
Blocpdb> 62 atoms in block 137
Block first atom: 6027
Blocpdb> 45 atoms in block 138
Block first atom: 6089
Blocpdb> 60 atoms in block 139
Block first atom: 6134
Blocpdb> 33 atoms in block 140
Block first atom: 6194
Blocpdb> 51 atoms in block 141
Block first atom: 6227
Blocpdb> 58 atoms in block 142
Block first atom: 6278
Blocpdb> 39 atoms in block 143
Block first atom: 6335
Blocpdb> 143 blocks.
Blocpdb> At most, 62 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4886254 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 19122
Prepmat> Matrix trace = 10774660.0000
Prepmat> Last element read: 19122 19122 455.3867
Prepmat> 10297 lines saved.
Prepmat> 8595 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6374
RTB> Total mass = 6374.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6374
RTB> Number of blocks = 143
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 387564.6013
RTB> 59091 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 858
Diagstd> Nb of non-zero elements: 59091
Diagstd> Projected matrix trace = 387564.6013
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 858 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 387564.6013
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 8.5291846 8.8612824 14.8505288 15.7145878
17.5536734 19.8903954 21.7251510 23.4795928 24.8551743
30.0767959 32.0496094 35.1131619 35.9089342 37.3728713
39.9422413 41.4662472 44.8363947 46.1915804 47.3961294
49.8723410 50.3913126 53.4963587 54.7078068 56.2217533
59.0418012 60.4910952 62.2171822 64.4001217 66.1365584
68.3120621 69.4354064 70.3748028 71.8009245 73.6076119
74.1759524 74.7256985 75.6950824 78.6619527 79.9485679
81.7622709 82.8928743 84.6921110 86.4985658 89.4198521
92.1595401 94.7224342 95.4170880 96.3538191 96.9616663
97.5947655 102.3637219 103.8138949 104.8457624 105.5976650
108.6500297 109.4699191 110.7128406 112.2143724 113.8036992
115.8786121 118.4071726 119.6410221 120.6176039 121.9541198
123.3035080 125.1602898 126.4454751 128.0257493 129.3919020
130.9720020 131.8351810 131.8666063 134.1767026 137.5631223
139.2273433 141.2401420 141.8790722 142.6182136 144.4340551
146.6018062 147.4225959 148.1303629 149.1801957 151.3877092
151.8036925 153.6546713 154.9672164 155.5639043 157.7038860
159.0753681 160.3534669 161.8582046 164.0293114 164.2805757
165.2966792 166.3983434 168.0989305 168.8327172 172.0107460
172.3975470
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034300 0.0034302 0.0034323 0.0034325 0.0034331
0.0034341 317.1385503 323.2537481 418.4718412 430.4738524
454.9663611 484.3028094 506.1470174 526.1875413 541.3818439
595.5401753 614.7614847 643.4728832 650.7235701 663.8554318
686.2960447 699.2663770 727.1275874 738.0345460 747.5955689
766.8760194 770.8557493 794.2503073 803.1930324 814.2306998
834.4015060 844.5804102 856.5455225 871.4422747 883.1125892
897.5196757 904.8691276 910.9695818 920.1535339 931.6582716
935.2481244 938.7074658 944.7765676 963.1138801 970.9584028
981.9101581 988.6757449 999.3480267 1009.9496744 1026.8624049
1042.4744741 1056.8703285 1060.7385668 1065.9326054 1069.2895325
1072.7747497 1098.6726524 1106.4276565 1111.9127784 1115.8927034
1131.9055906 1136.1683284 1142.6001511 1150.3222568 1158.4397994
1168.9526580 1181.6375559 1187.7781657 1192.6159922 1199.2052419
1205.8214260 1214.8665107 1221.0878968 1228.6945828 1235.2328383
1242.7521217 1246.8406134 1246.9892083 1257.8644341 1273.6388342
1281.3198327 1290.5485672 1293.4643109 1296.8291871 1305.0588095
1314.8158804 1318.4914184 1321.6526275 1326.3277817 1336.1049990
1337.9394151 1346.0716088 1351.8085729 1354.4085838 1363.6925807
1369.6094652 1375.1005548 1381.5373788 1390.7722325 1391.8370352
1396.1347748 1400.7795065 1407.9192776 1410.9888613 1424.2068490
1425.8072587
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6374
Rtb_to_modes> Number of blocs = 143
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9768E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9780E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.529
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.861
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 149.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 161.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.4
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00002 1.00005 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 114732 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
1.00002 1.00005 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999
1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 0.99999
1.00002 0.99996 0.99999 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122622073737765.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122622073737765.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 20122622073737765.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122622073737765.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6374
Mean number per residue = 15.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9768E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9780E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9903E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9949E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.529
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.861
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 149.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.4
Bfactors> 106 vectors, 19122 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 8.529000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.626 for 426 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.004 +/- 0.01
Bfactors> = 27.028 +/- 12.91
Bfactors> Shiftng-fct= 27.024
Bfactors> Scaling-fct= 2042.458
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122622073737765.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122622073737765.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4298E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4300E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1326.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1338.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1346.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1370.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1382.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1392.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1396.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1401.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1411.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1424.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1426.
Chkmod> 106 vectors, 19122 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6374 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0002 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8136
0.0034 0.9611
0.0034 0.8055
0.0034 0.7541
0.0034 0.7772
0.0034 0.8055
317.1215 0.4223
323.2347 0.4977
418.4464 0.5461
430.3925 0.3282
454.8992 0.1399
484.2772 0.3915
506.1818 0.4866
526.1695 0.7801
541.4112 0.7244
595.5463 0.3830
614.7388 0.5133
643.4163 0.6790
650.7053 0.7402
663.8014 0.5214
686.2473 0.4793
699.2680 0.0289
727.1256 0.4447
737.9902 0.3042
747.5940 0.3887
766.8251 0.5650
770.8126 0.4024
794.2432 0.2873
803.1747 0.4636
814.1831 0.5614
834.3530 0.5313
844.5365 0.4236
856.5281 0.6373
871.4040 0.3722
883.0977 0.3083
897.4676 0.4417
904.8602 0.4038
910.8994 0.5401
920.1081 0.4708
931.6334 0.3894
935.2335 0.4967
938.6942 0.5133
944.7667 0.4370
963.0606 0.6429
970.9254 0.4900
981.8544 0.2519
988.6162 0.4854
999.2927 0.4241
1009.9147 0.3278
1026.8192 0.5334
1042.4323 0.5407
1056.8114 0.5617
1060.7092 0.4520
1065.8657 0.4388
1069.2344 0.5183
1072.7025 0.3780
1098.8202 0.5273
1106.3061 0.3908
1111.6224 0.5168
1115.8571 0.5207
1132.1173 0.4396
1136.2756 0.5257
1142.4848 0.5476
1150.1992 0.5305
1158.3712 0.4600
1169.0103 0.5543
1181.5510 0.4833
1187.5235 0.4304
1192.4778 0.6200
1199.3793 0.4145
1205.7525 0.4094
1215.0071 0.5819
1220.8159 0.4849
1228.5183 0.3823
1235.2185 0.5064
1242.8316 0.4891
1246.6207 0.4304
1247.0936 0.4614
1257.9196 0.4667
1273.7549 0.4778
1281.1390 0.4176
1290.3098 0.5620
1293.5042 0.2600
1296.6907 0.2606
1304.8489 0.6299
1314.7513 0.4607
1318.3338 0.5427
1321.4604 0.4956
1326.3589 0.5246
1336.1019 0.3863
1337.8657 0.4397
1346.2124 0.4920
1351.8935 0.4279
1354.5076 0.5356
1363.6172 0.4964
1369.6567 0.4822
1375.2410 0.5786
1381.6564 0.6104
1390.5883 0.3399
1391.8596 0.4528
1396.0889 0.5182
1400.7263 0.5340
1407.8633 0.4273
1410.7916 0.4981
1424.1012 0.4671
1425.7562 0.4908
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 20122622073737765.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122622073737765.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 20122622073737765.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122622073737765.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 20122622073737765.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
20122622073737765.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4298E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4300E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 981.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1027.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1188.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1235.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1297.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1326.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1336.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1338.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1346.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1370.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1382.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1392.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1396.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1401.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1411.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1424.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1426.
Projmod> 106 vectors, 19122 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6374
Mean number per residue = 15.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 457
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6989
Mean number per residue = 15.3
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Atom 4035 of first conformer: HIS 315 HE2 not found in second one.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 20122622073737765 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
making animated gifs
11 models are in 20122622073737765.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 426 1.774 396 0.980
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 426 1.619 402 0.870
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 426 1.491 408 0.740
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 426 1.397 408 0.562
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 426 1.345 408 0.458
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 426 1.380 407 0.591
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 426 1.464 407 0.781
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 426 1.584 404 0.941
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 426 1.733 400 1.086
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 426 1.903 394 1.207
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 20122622073737765 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
making animated gifs
11 models are in 20122622073737765.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 426 1.789 404 1.160
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 426 1.630 408 0.986
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 426 1.498 408 0.784
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 426 1.401 408 0.613
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 426 1.346 407 0.477
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 426 1.380 409 0.589
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 426 1.464 409 0.744
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 426 1.586 408 0.927
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 426 1.738 407 1.131
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 426 1.911 397 1.247
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 20122622073737765 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
making animated gifs
11 models are in 20122622073737765.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 426 1.858 401 1.100
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 426 1.690 404 0.929
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 426 1.546 407 0.778
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 426 1.435 408 0.619
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 426 1.364 408 0.497
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 426 1.363 407 0.551
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 426 1.433 406 0.695
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 426 1.544 406 0.895
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 426 1.686 403 1.075
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 426 1.854 398 1.246
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 20122622073737765 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
making animated gifs
11 models are in 20122622073737765.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 426 1.880 401 1.183
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 426 1.704 405 1.024
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 426 1.553 407 0.846
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 426 1.436 408 0.681
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 426 1.362 408 0.538
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 426 1.368 408 0.521
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 426 1.447 408 0.631
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 426 1.567 408 0.791
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 426 1.721 407 0.965
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 426 1.900 401 1.101
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 20122622073737765 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122622073737765.eigenfacs
20122622073737765.atom
making animated gifs
11 models are in 20122622073737765.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122622073737765.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 426 1.914 402 0.978
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 426 1.717 405 0.844
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 426 1.551 406 0.703
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 426 1.425 407 0.581
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 426 1.352 407 0.487
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 426 1.389 408 0.519
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 426 1.495 408 0.640
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 426 1.646 408 0.793
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 426 1.831 407 0.944
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 426 2.042 405 1.088
20122622073737765.10.pdb
20122622073737765.11.pdb
20122622073737765.7.pdb
20122622073737765.8.pdb
20122622073737765.9.pdb
STDERR:
real 0m20.633s
user 0m20.028s
sys 0m0.564s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
