*** 4FF6 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 201226195629118096.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 201226195629118096.atom to be opened.
Openam> File opened: 201226195629118096.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 423
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6352
Mean number per residue = 15.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 12.487195 +/- 12.009599 From: -16.860000 To: 40.268000
= -11.891669 +/- 13.741791 From: -54.783000 To: 17.067000
= 36.560946 +/- 12.091805 From: 5.892000 To: 65.605000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6322 % Filled.
Pdbmat> 4779363 non-zero elements.
Pdbmat> 526889 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 165.90 +/- 46.22
Maximum number = 250
Minimum number = 26
Pdbmat> Matrix trace = 1.053778E+07
Pdbmat> Larger element = 898.139
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
423 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 201226195629118096.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 201226195629118096.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
201226195629118096.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6352 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 423 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 48 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 40 atoms in block 3
Block first atom: 83
Blocpdb> 38 atoms in block 4
Block first atom: 123
Blocpdb> 38 atoms in block 5
Block first atom: 161
Blocpdb> 37 atoms in block 6
Block first atom: 199
Blocpdb> 49 atoms in block 7
Block first atom: 236
Blocpdb> 52 atoms in block 8
Block first atom: 285
Blocpdb> 37 atoms in block 9
Block first atom: 337
Blocpdb> 52 atoms in block 10
Block first atom: 374
Blocpdb> 39 atoms in block 11
Block first atom: 426
Blocpdb> 39 atoms in block 12
Block first atom: 465
Blocpdb> 36 atoms in block 13
Block first atom: 504
Blocpdb> 37 atoms in block 14
Block first atom: 540
Blocpdb> 39 atoms in block 15
Block first atom: 577
Blocpdb> 50 atoms in block 16
Block first atom: 616
Blocpdb> 42 atoms in block 17
Block first atom: 666
Blocpdb> 40 atoms in block 18
Block first atom: 708
Blocpdb> 41 atoms in block 19
Block first atom: 748
Blocpdb> 28 atoms in block 20
Block first atom: 789
Blocpdb> 42 atoms in block 21
Block first atom: 817
Blocpdb> 48 atoms in block 22
Block first atom: 859
Blocpdb> 47 atoms in block 23
Block first atom: 907
Blocpdb> 47 atoms in block 24
Block first atom: 954
Blocpdb> 47 atoms in block 25
Block first atom: 1001
Blocpdb> 34 atoms in block 26
Block first atom: 1048
Blocpdb> 55 atoms in block 27
Block first atom: 1082
Blocpdb> 47 atoms in block 28
Block first atom: 1137
Blocpdb> 29 atoms in block 29
Block first atom: 1184
Blocpdb> 49 atoms in block 30
Block first atom: 1213
Blocpdb> 48 atoms in block 31
Block first atom: 1262
Blocpdb> 49 atoms in block 32
Block first atom: 1310
Blocpdb> 43 atoms in block 33
Block first atom: 1359
Blocpdb> 46 atoms in block 34
Block first atom: 1402
Blocpdb> 54 atoms in block 35
Block first atom: 1448
Blocpdb> 49 atoms in block 36
Block first atom: 1502
Blocpdb> 45 atoms in block 37
Block first atom: 1551
Blocpdb> 47 atoms in block 38
Block first atom: 1596
Blocpdb> 30 atoms in block 39
Block first atom: 1643
Blocpdb> 39 atoms in block 40
Block first atom: 1673
Blocpdb> 42 atoms in block 41
Block first atom: 1712
Blocpdb> 46 atoms in block 42
Block first atom: 1754
Blocpdb> 48 atoms in block 43
Block first atom: 1800
Blocpdb> 28 atoms in block 44
Block first atom: 1848
Blocpdb> 38 atoms in block 45
Block first atom: 1876
Blocpdb> 47 atoms in block 46
Block first atom: 1914
Blocpdb> 52 atoms in block 47
Block first atom: 1961
Blocpdb> 50 atoms in block 48
Block first atom: 2013
Blocpdb> 36 atoms in block 49
Block first atom: 2063
Blocpdb> 41 atoms in block 50
Block first atom: 2099
Blocpdb> 60 atoms in block 51
Block first atom: 2140
Blocpdb> 42 atoms in block 52
Block first atom: 2200
Blocpdb> 26 atoms in block 53
Block first atom: 2242
Blocpdb> 44 atoms in block 54
Block first atom: 2268
Blocpdb> 54 atoms in block 55
Block first atom: 2312
Blocpdb> 37 atoms in block 56
Block first atom: 2366
Blocpdb> 28 atoms in block 57
Block first atom: 2403
Blocpdb> 40 atoms in block 58
Block first atom: 2431
Blocpdb> 55 atoms in block 59
Block first atom: 2471
Blocpdb> 48 atoms in block 60
Block first atom: 2526
Blocpdb> 51 atoms in block 61
Block first atom: 2574
Blocpdb> 42 atoms in block 62
Block first atom: 2625
Blocpdb> 35 atoms in block 63
Block first atom: 2667
Blocpdb> 60 atoms in block 64
Block first atom: 2702
Blocpdb> 29 atoms in block 65
Block first atom: 2762
Blocpdb> 42 atoms in block 66
Block first atom: 2791
Blocpdb> 40 atoms in block 67
Block first atom: 2833
Blocpdb> 41 atoms in block 68
Block first atom: 2873
Blocpdb> 48 atoms in block 69
Block first atom: 2914
Blocpdb> 40 atoms in block 70
Block first atom: 2962
Blocpdb> 33 atoms in block 71
Block first atom: 3002
Blocpdb> 55 atoms in block 72
Block first atom: 3035
Blocpdb> 46 atoms in block 73
Block first atom: 3090
Blocpdb> 45 atoms in block 74
Block first atom: 3136
Blocpdb> 42 atoms in block 75
Block first atom: 3181
Blocpdb> 40 atoms in block 76
Block first atom: 3223
Blocpdb> 50 atoms in block 77
Block first atom: 3263
Blocpdb> 50 atoms in block 78
Block first atom: 3313
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 3363
Blocpdb> 42 atoms in block 80
Block first atom: 3399
Blocpdb> 53 atoms in block 81
Block first atom: 3441
Blocpdb> 37 atoms in block 82
Block first atom: 3494
Blocpdb> 50 atoms in block 83
Block first atom: 3531
Blocpdb> 36 atoms in block 84
Block first atom: 3581
Blocpdb> 50 atoms in block 85
Block first atom: 3617
Blocpdb> 40 atoms in block 86
Block first atom: 3667
Blocpdb> 27 atoms in block 87
Block first atom: 3707
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 3734
Blocpdb> 55 atoms in block 89
Block first atom: 3779
Blocpdb> 40 atoms in block 90
Block first atom: 3834
Blocpdb> 36 atoms in block 91
Block first atom: 3874
Blocpdb> 55 atoms in block 92
Block first atom: 3910
Blocpdb> 31 atoms in block 93
Block first atom: 3965
Blocpdb> 59 atoms in block 94
Block first atom: 3996
Blocpdb> 45 atoms in block 95
Block first atom: 4055
Blocpdb> 50 atoms in block 96
Block first atom: 4100
Blocpdb> 51 atoms in block 97
Block first atom: 4150
Blocpdb> 28 atoms in block 98
Block first atom: 4201
Blocpdb> 45 atoms in block 99
Block first atom: 4229
Blocpdb> 55 atoms in block 100
Block first atom: 4274
Blocpdb> 55 atoms in block 101
Block first atom: 4329
Blocpdb> 43 atoms in block 102
Block first atom: 4384
Blocpdb> 38 atoms in block 103
Block first atom: 4427
Blocpdb> 57 atoms in block 104
Block first atom: 4465
Blocpdb> 60 atoms in block 105
Block first atom: 4522
Blocpdb> 42 atoms in block 106
Block first atom: 4582
Blocpdb> 38 atoms in block 107
Block first atom: 4624
Blocpdb> 45 atoms in block 108
Block first atom: 4662
Blocpdb> 37 atoms in block 109
Block first atom: 4707
Blocpdb> 50 atoms in block 110
Block first atom: 4744
Blocpdb> 61 atoms in block 111
Block first atom: 4794
Blocpdb> 45 atoms in block 112
Block first atom: 4855
Blocpdb> 41 atoms in block 113
Block first atom: 4900
Blocpdb> 44 atoms in block 114
Block first atom: 4941
Blocpdb> 53 atoms in block 115
Block first atom: 4985
Blocpdb> 45 atoms in block 116
Block first atom: 5038
Blocpdb> 43 atoms in block 117
Block first atom: 5083
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 5126
Blocpdb> 55 atoms in block 119
Block first atom: 5174
Blocpdb> 38 atoms in block 120
Block first atom: 5229
Blocpdb> 49 atoms in block 121
Block first atom: 5267
Blocpdb> 42 atoms in block 122
Block first atom: 5316
Blocpdb> 55 atoms in block 123
Block first atom: 5358
Blocpdb> 59 atoms in block 124
Block first atom: 5413
Blocpdb> 42 atoms in block 125
Block first atom: 5472
Blocpdb> 50 atoms in block 126
Block first atom: 5514
Blocpdb> 45 atoms in block 127
Block first atom: 5564
Blocpdb> 45 atoms in block 128
Block first atom: 5609
Blocpdb> 52 atoms in block 129
Block first atom: 5654
Blocpdb> 39 atoms in block 130
Block first atom: 5706
Blocpdb> 47 atoms in block 131
Block first atom: 5745
Blocpdb> 52 atoms in block 132
Block first atom: 5792
Blocpdb> 52 atoms in block 133
Block first atom: 5844
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 5896
Blocpdb> 51 atoms in block 135
Block first atom: 5954
Blocpdb> 62 atoms in block 136
Block first atom: 6005
Blocpdb> 45 atoms in block 137
Block first atom: 6067
Blocpdb> 60 atoms in block 138
Block first atom: 6112
Blocpdb> 33 atoms in block 139
Block first atom: 6172
Blocpdb> 51 atoms in block 140
Block first atom: 6205
Blocpdb> 58 atoms in block 141
Block first atom: 6256
Blocpdb> 39 atoms in block 142
Block first atom: 6313
Blocpdb> 142 blocks.
Blocpdb> At most, 62 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4779505 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 19056
Prepmat> Matrix trace = 10537780.0000
Prepmat> Last element read: 19056 19056 377.5574
Prepmat> 10154 lines saved.
Prepmat> 8532 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6352
RTB> Total mass = 6352.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6352
RTB> Number of blocks = 142
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 376210.2093
RTB> 56226 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 852
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56226
Diagstd> Projected matrix trace = 376210.2093
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 852 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 376210.2093
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0456068 3.2998545 5.6031778 6.7115527
7.3203445 10.8101502 12.7516977 14.0241802 17.7809716
18.4592808 21.2837385 22.8379619 24.5123997 25.3907776
26.8890873 28.5426716 33.1737550 33.8990581 35.1301400
37.0222549 41.2685501 43.7226335 45.9521438 46.5070715
48.4545434 49.3211557 51.0611536 53.3769930 56.2998077
58.7255441 60.5452850 62.0874740 62.4570291 64.0207929
65.9394433 70.1438633 71.5675766 72.8379681 74.2063891
74.8574010 76.3914249 78.2602147 79.7422734 82.0852271
82.4345538 85.2251653 87.0663910 87.8099633 88.5617089
91.3708318 93.1052257 94.9782362 95.4609211 96.7611032
98.4917876 99.4070290 100.7635784 102.0486275 104.8015009
105.6468537 108.2406114 110.6693878 110.8341399 112.2898069
115.4161539 115.9205126 117.0146929 119.0880764 119.4790098
120.7344688 122.5530747 123.0235618 124.4623492 126.5074017
128.7104273 129.6768683 130.2901768 131.2502921 131.4914026
134.2904330 135.5419302 136.6831990 137.4606191 138.3878866
140.5935828 140.7993143 144.5178551 145.3701523 147.0051914
148.1362570 148.7388975 150.5367898 151.0293065 152.2860819
155.0182449 155.4695735 155.7843674 156.9702513 158.8512894
161.2660646
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034270 0.0034321 0.0034335 0.0034338 0.0034351
0.0034360 111.0400093 197.2616560 257.0469667 281.3239988
293.8062562 357.0352901 387.7745344 406.6624022 457.9025098
466.5548064 500.9786728 518.9481311 537.6358190 547.1838627
563.0971257 580.1530641 625.4499998 632.2503752 643.6284320
660.7340884 697.5974520 718.0396665 736.1192400 740.5506664
755.8968458 762.6265177 775.9622460 793.3637123 814.7957145
832.1637721 844.9586267 855.6522090 858.1949239 868.8720048
881.7955814 909.4736505 918.6571005 926.7747465 935.4399854
939.5343276 949.1122652 960.6513510 969.7048925 983.8474908
985.9387279 1002.4880545 1013.2591910 1017.5767560 1021.9232368
1038.0041016 1047.8094451 1058.2964283 1060.9821823 1068.1830591
1077.6935662 1082.6892567 1090.0516367 1096.9803908 1111.6780521
1116.1525717 1129.7709375 1142.3759039 1143.2259080 1150.7088355
1166.6177481 1169.1639793 1174.6689220 1185.0302059 1186.9736763
1193.1936078 1202.1464718 1204.4518098 1211.4745002 1221.3868738
1231.9757131 1236.5922976 1239.5130886 1244.0717249 1245.2138980
1258.3974145 1264.2475285 1269.5588804 1273.1642290 1277.4512007
1287.5912879 1288.5330135 1305.4373490 1309.2811129 1316.6235420
1321.6789216 1324.3645867 1332.3447211 1334.5224816 1340.0635266
1352.0311201 1353.9978783 1355.3679688 1360.5169506 1368.6444871
1379.0079637
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6352
Rtb_to_modes> Number of blocs = 142
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 161.3
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 852 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002
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0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004
0.99997 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000
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0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
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1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 114336 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002
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1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998
1.00003 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001
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1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002
0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00003
0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00004
0.99997 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201226195629118096.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226195629118096.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 201226195629118096.atom
Openam> file on opening on unit 11:
201226195629118096.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 423
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6352
Mean number per residue = 15.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.046
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.300
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.603
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.712
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.320
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.3
Bfactors> 106 vectors, 19056 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.046000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.276 for 423 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.007 +/- 0.02
Bfactors> = 49.566 +/- 15.69
Bfactors> Shiftng-fct= 49.559
Bfactors> Scaling-fct= 778.658
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201226195629118096.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226195629118096.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4268E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1143.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1245.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1270.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1324.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1332.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1340.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1354.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1369.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1379.
Chkmod> 106 vectors, 19056 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6352 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7188
0.0034 0.8528
0.0034 0.7714
0.0034 0.9906
0.0034 0.7589
0.0034 0.9073
111.0561 0.0494
197.2575 0.0729
257.0319 0.3267
281.3213 0.0413
293.7867 0.4655
357.0175 0.3217
387.7321 0.4967
406.5843 0.4460
457.8703 0.5030
466.5439 0.3547
500.9132 0.5974
518.9490 0.3995
537.5864 0.4841
547.1520 0.3021
563.0825 0.5047
580.1010 0.3070
625.3878 0.6688
632.2320 0.4316
643.5995 0.4065
660.6856 0.6602
697.5798 0.3281
717.9872 0.4453
736.0705 0.3381
740.5422 0.4552
755.8290 0.3090
762.5848 0.4663
775.9202 0.4445
793.3520 0.5228
814.7621 0.6260
832.1596 0.3672
844.9553 0.4000
855.6329 0.5239
858.1785 0.5365
868.8293 0.4012
881.7615 0.3302
909.4096 0.4638
918.6332 0.4379
926.7479 0.5765
935.4226 0.5750
939.5103 0.5218
949.0627 0.3659
960.6088 0.4868
969.6494 0.4804
983.8339 0.2796
985.8692 0.4803
1002.4735 0.6000
1013.2367 0.4447
1017.5333 0.2566
1021.8695 0.4685
1037.9548 0.4638
1047.7913 0.4053
1058.2608 0.4137
1060.9315 0.3801
1068.1311 0.1676
1077.6375 0.4426
1082.6590 0.4089
1090.2018 0.5350
1096.6719 0.4122
1111.6224 0.4180
1115.8571 0.5328
1129.5105 0.5860
1142.4848 0.4807
1143.0008 0.5074
1150.7117 0.4726
1166.4860 0.5454
1169.0103 0.4775
1174.5447 0.3656
1185.0387 0.5825
1187.0270 0.4009
1192.9721 0.3218
1202.3250 0.3800
1204.2848 0.3885
1211.6057 0.3599
1221.2987 0.3708
1231.8729 0.3585
1236.6495 0.4156
1239.5066 0.4443
1244.2539 0.4228
1245.2011 0.3257
1258.3882 0.4516
1263.9977 0.4675
1269.5824 0.4599
1273.2919 0.4558
1277.4523 0.5266
1287.5654 0.4542
1288.4808 0.4886
1305.3007 0.4135
1309.3593 0.4002
1316.5438 0.4659
1321.4604 0.4892
1324.1346 0.5238
1332.1247 0.4724
1334.3357 0.3514
1340.0672 0.4408
1351.8935 0.5557
1354.0722 0.4479
1355.3778 0.3894
1360.5875 0.5554
1368.7956 0.4501
1379.0938 0.4502
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 201226195629118096.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226195629118096.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 201226195629118096.atom
Openam> file on opening on unit 11:
201226195629118096.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 201226195629118096.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
201226195629118096.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4268E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.8
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1038.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1143.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1175.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1185.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1244.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1245.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1270.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1309.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1324.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1332.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1340.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1354.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1361.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1369.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1379.
Projmod> 106 vectors, 19056 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 423
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6352
Mean number per residue = 15.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 454
First residue number = 4
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6973
Mean number per residue = 15.4
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
Projmod> All atoms of first conformer were found in second one.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 6352 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 48.16
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.184 Sum= 0.034 q= -705.1363
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.318 Sum= 0.135 q= 1222.1042
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.216 Sum= 0.182 q= 827.3610
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.571 Sum= 0.508 q= 2191.1880
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.034 Sum= 0.509 q= 129.3158
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.184 Sum= 0.543 q= -707.9666
Vector: 7 F= 111.06 Cos= 0.006 Sum= 0.543 q= 21.9626
Vector: 8 F= 197.26 Cos= 0.035 Sum= 0.544 q= 132.8149
Vector: 9 F= 257.03 Cos= 0.050 Sum= 0.546 q= 192.3317
Vector: 10 F= 281.32 Cos= -0.032 Sum= 0.548 q= -122.9093
Vector: 11 F= 293.79 Cos= -0.040 Sum= 0.549 q= -152.0494
Vector: 12 F= 357.02 Cos= -0.131 Sum= 0.566 q= -503.8202
Vector: 13 F= 387.73 Cos= -0.081 Sum= 0.573 q= -310.2334
Vector: 14 F= 406.58 Cos= -0.007 Sum= 0.573 q= -28.1396
Vector: 15 F= 457.87 Cos= -0.025 Sum= 0.574 q= -94.4081
Vector: 16 F= 466.54 Cos= -0.000 Sum= 0.574 q= -0.4996
Vector: 17 F= 500.91 Cos= 0.046 Sum= 0.576 q= 177.4634
Vector: 18 F= 518.95 Cos= -0.060 Sum= 0.579 q= -231.3160
Vector: 19 F= 537.59 Cos= -0.000 Sum= 0.579 q= -0.2581
Vector: 20 F= 547.15 Cos= -0.110 Sum= 0.591 q= -421.9332
Vector: 21 F= 563.08 Cos= -0.089 Sum= 0.599 q= -343.2665
Vector: 22 F= 580.10 Cos= 0.124 Sum= 0.615 q= 475.7484
Vector: 23 F= 625.39 Cos= 0.075 Sum= 0.620 q= 286.8789
Vector: 24 F= 632.23 Cos= 0.023 Sum= 0.621 q= 89.6509
Vector: 25 F= 643.60 Cos= -0.131 Sum= 0.638 q= -503.7302
Vector: 26 F= 660.69 Cos= 0.336 Sum= 0.751 q= 1288.8472
Vector: 27 F= 697.58 Cos= 0.027 Sum= 0.752 q= 102.5497
Vector: 28 F= 717.99 Cos= -0.150 Sum= 0.774 q= -576.0433
Vector: 29 F= 736.07 Cos= 0.060 Sum= 0.778 q= 230.5122
Vector: 30 F= 740.54 Cos= -0.063 Sum= 0.782 q= -242.8674
Vector: 31 F= 755.83 Cos= 0.016 Sum= 0.782 q= 61.8307
Vector: 32 F= 762.58 Cos= -0.166 Sum= 0.809 q= -636.1950
Vector: 33 F= 775.92 Cos= 0.027 Sum= 0.810 q= 105.1028
Vector: 34 F= 793.35 Cos= 0.006 Sum= 0.810 q= 23.3588
Vector: 35 F= 814.76 Cos= 0.057 Sum= 0.813 q= 218.9234
Vector: 36 F= 832.16 Cos= -0.011 Sum= 0.814 q= -41.7967
Vector: 37 F= 844.96 Cos= 0.069 Sum= 0.818 q= 265.8549
Vector: 38 F= 855.63 Cos= -0.027 Sum= 0.819 q= -102.9301
Vector: 39 F= 858.18 Cos= -0.039 Sum= 0.821 q= -149.0371
Vector: 40 F= 868.83 Cos= 0.081 Sum= 0.827 q= 312.5552
Vector: 41 F= 881.76 Cos= -0.060 Sum= 0.831 q= -229.3338
Vector: 42 F= 909.41 Cos= -0.038 Sum= 0.832 q= -147.3159
Vector: 43 F= 918.63 Cos= 0.055 Sum= 0.835 q= 210.1619
Vector: 44 F= 926.75 Cos= -0.082 Sum= 0.842 q= -314.0257
Vector: 45 F= 935.42 Cos= 0.126 Sum= 0.858 q= 482.0142
Vector: 46 F= 939.51 Cos= 0.025 Sum= 0.858 q= 94.6782
Vector: 47 F= 949.06 Cos= 0.032 Sum= 0.859 q= 124.3106
Vector: 48 F= 960.61 Cos= -0.008 Sum= 0.860 q= -31.4327
Vector: 49 F= 969.65 Cos= 0.041 Sum= 0.861 q= 158.2785
Vector: 50 F= 983.83 Cos= 0.025 Sum= 0.862 q= 96.3256
Vector: 51 F= 985.87 Cos= 0.105 Sum= 0.873 q= 401.8448
Vector: 52 F= 1002.47 Cos= 0.084 Sum= 0.880 q= 322.9898
Vector: 53 F= 1013.24 Cos= -0.050 Sum= 0.882 q= -191.7398
Vector: 54 F= 1017.53 Cos= 0.001 Sum= 0.882 q= 3.9797
Vector: 55 F= 1021.87 Cos= -0.010 Sum= 0.882 q= -37.8025
Vector: 56 F= 1037.95 Cos= 0.027 Sum= 0.883 q= 105.0206
Vector: 57 F= 1047.79 Cos= -0.086 Sum= 0.891 q= -329.0597
Vector: 58 F= 1058.26 Cos= 0.020 Sum= 0.891 q= 77.6085
Vector: 59 F= 1060.93 Cos= -0.006 Sum= 0.891 q= -21.2892
Vector: 60 F= 1068.13 Cos= -0.024 Sum= 0.892 q= -90.6069
Vector: 61 F= 1077.64 Cos= -0.053 Sum= 0.894 q= -202.0751
Vector: 62 F= 1082.66 Cos= -0.001 Sum= 0.894 q= -3.1409
Vector: 63 F= 1090.20 Cos= 0.020 Sum= 0.895 q= 77.3866
Vector: 64 F= 1096.67 Cos= 0.023 Sum= 0.895 q= 87.3454
Vector: 65 F= 1111.62 Cos= 0.005 Sum= 0.895 q= 17.9991
Vector: 66 F= 1115.86 Cos= -0.044 Sum= 0.897 q= -170.1653
Vector: 67 F= 1129.51 Cos= -0.039 Sum= 0.899 q= -148.3381
Vector: 68 F= 1142.48 Cos= -0.036 Sum= 0.900 q= -137.7792
Vector: 69 F= 1143.00 Cos= -0.070 Sum= 0.905 q= -268.7471
Vector: 70 F= 1150.71 Cos= -0.031 Sum= 0.906 q= -117.6038
Vector: 71 F= 1166.49 Cos= 0.056 Sum= 0.909 q= 216.2028
Vector: 72 F= 1169.01 Cos= 0.001 Sum= 0.909 q= 3.2163
Vector: 73 F= 1174.54 Cos= 0.003 Sum= 0.909 q= 12.3608
Vector: 74 F= 1185.04 Cos= 0.012 Sum= 0.909 q= 45.7916
Vector: 75 F= 1187.03 Cos= 0.009 Sum= 0.909 q= 33.4135
Vector: 76 F= 1192.97 Cos= -0.024 Sum= 0.910 q= -92.2849
Vector: 77 F= 1202.32 Cos= -0.011 Sum= 0.910 q= -40.6608
Vector: 78 F= 1204.28 Cos= 0.004 Sum= 0.910 q= 15.4700
Vector: 79 F= 1211.61 Cos= -0.032 Sum= 0.911 q= -122.0068
Vector: 80 F= 1221.30 Cos= 0.039 Sum= 0.913 q= 151.2246
Vector: 81 F= 1231.87 Cos= -0.001 Sum= 0.913 q= -3.4248
Vector: 82 F= 1236.65 Cos= -0.015 Sum= 0.913 q= -55.9334
Vector: 83 F= 1239.51 Cos= -0.078 Sum= 0.919 q= -300.7525
Vector: 84 F= 1244.25 Cos= -0.098 Sum= 0.928 q= -375.0294
Vector: 85 F= 1245.20 Cos= -0.058 Sum= 0.932 q= -224.2824
Vector: 86 F= 1258.39 Cos= 0.035 Sum= 0.933 q= 136.2392
Vector: 87 F= 1264.00 Cos= 0.002 Sum= 0.933 q= 9.3838
Vector: 88 F= 1269.58 Cos= 0.007 Sum= 0.933 q= 25.1909
Vector: 89 F= 1273.29 Cos= 0.029 Sum= 0.934 q= 112.0590
Vector: 90 F= 1277.45 Cos= -0.021 Sum= 0.934 q= -80.8779
Vector: 91 F= 1287.57 Cos= -0.025 Sum= 0.935 q= -94.1459
Vector: 92 F= 1288.48 Cos= 0.042 Sum= 0.937 q= 162.8059
Vector: 93 F= 1305.30 Cos= 0.023 Sum= 0.937 q= 89.3438
Vector: 94 F= 1309.36 Cos= -0.033 Sum= 0.938 q= -124.9217
Vector: 95 F= 1316.54 Cos= -0.026 Sum= 0.939 q= -101.2850
Vector: 96 F= 1321.46 Cos= 0.007 Sum= 0.939 q= 26.0210
Vector: 97 F= 1324.13 Cos= 0.016 Sum= 0.939 q= 61.2679
Vector: 98 F= 1332.12 Cos= -0.034 Sum= 0.941 q= -131.5251
Vector: 99 F= 1334.34 Cos= 0.003 Sum= 0.941 q= 10.3083
Vector: 100 F= 1340.07 Cos= 0.041 Sum= 0.942 q= 156.0601
Vector: 101 F= 1351.89 Cos= -0.050 Sum= 0.945 q= -193.6643
Vector: 102 F= 1354.07 Cos= -0.001 Sum= 0.945 q= -2.0190
Vector: 103 F= 1355.38 Cos= 0.019 Sum= 0.945 q= 73.6057
Vector: 104 F= 1360.59 Cos= -0.048 Sum= 0.947 q= -182.5020
Vector: 105 F= 1368.80 Cos= -0.001 Sum= 0.947 q= -3.1855
Vector: 106 F= 1379.09 Cos= -0.006 Sum= 0.948 q= -23.9765
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003427
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003436
Projmod> Lowest non-zero frequency : 111.056116
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.57 for mode 4 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.326 0.540 0.654 0.722 0.770 0.948
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 201226195629118096 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
making animated gifs
11 models are in 201226195629118096.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 423 1.332 411 0.448
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 423 1.114 412 0.450
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 423 0.902 412 0.413
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 423 0.701 416 0.470
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 423 0.524 421 0.476
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 423 0.402 422 0.366
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 423 0.393 422 0.352
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 423 0.503 422 0.469
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 423 0.675 418 0.505
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 423 0.874 413 0.452
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 423 1.085 412 0.471
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 201226195629118096 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
making animated gifs
11 models are in 201226195629118096.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 423 1.245 415 0.721
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 423 1.024 416 0.636
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 423 0.812 417 0.554
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 423 0.619 419 0.489
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 423 0.465 422 0.435
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 423 0.402 422 0.366
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 423 0.468 422 0.436
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 423 0.622 419 0.478
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 423 0.816 415 0.451
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 423 1.028 415 0.535
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 423 1.249 413 0.588
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 201226195629118096 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
making animated gifs
11 models are in 201226195629118096.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 423 1.247 407 0.973
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 423 1.017 419 0.916
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 423 0.796 421 0.749
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 423 0.595 423 0.595
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 423 0.444 422 0.416
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 423 0.402 422 0.366
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 423 0.498 422 0.465
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 423 0.676 420 0.606
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 423 0.887 419 0.787
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 423 1.113 418 0.982
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 423 1.346 411 1.125
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 201226195629118096 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
making animated gifs
11 models are in 201226195629118096.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226195629118096.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 423 1.141 414 0.646
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 423 0.951 414 0.562
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 423 0.769 418 0.557
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 423 0.603 420 0.504
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 423 0.469 422 0.437
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 423 0.402 422 0.366
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 423 0.434 422 0.401
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 423 0.548 419 0.434
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 423 0.704 416 0.437
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 423 0.882 416 0.515
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 423 1.069 413 0.543
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 201226195629118096 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226195629118096.eigenfacs
201226195629118096.atom
making animated gifs
11 models are in 201226195629118096.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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making small animated gif 100x100
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 423 1.322 411 1.158
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 423 1.090 419 1.031
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 423 0.866 422 0.854
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 423 0.658 423 0.658
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 423 0.487 422 0.462
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 423 0.402 422 0.366
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 423 0.456 422 0.417
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 423 0.613 422 0.579
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 423 0.814 421 0.771
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 423 1.036 415 0.915
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 423 1.266 410 1.060
201226195629118096.10.pdb
201226195629118096.11.pdb
201226195629118096.7.pdb
201226195629118096.8.pdb
201226195629118096.9.pdb
STDERR:
real 0m18.539s
user 0m18.352s
sys 0m0.176s
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elNémo
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