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***  OXIDOREDUCTASE 07-APR-18 6G83  ***

LOGs for ID: 20122618531975650

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20122618531975650.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20122618531975650.atom to be opened. Openam> File opened: 20122618531975650.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 837 First residue number = 8 Last residue number = 461 Number of atoms found = 12277 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 13.791047 +/- 21.062686 From: -30.516000 To: 60.387000 = -15.405510 +/- 12.394945 From: -55.095000 To: 16.232000 = 99.911135 +/- 22.097042 From: 52.930000 To: 144.898000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3716 % Filled. Pdbmat> 9303454 non-zero elements. Pdbmat> 1025693 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 167.09 +/- 45.93 Maximum number = 252 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 2.051386E+07 Pdbmat> Larger element = 899.638 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 837 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20122618531975650.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20122618531975650.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20122618531975650.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12277 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 837 residues. Blocpdb> 52 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 53 Blocpdb> 56 atoms in block 3 Block first atom: 124 Blocpdb> 75 atoms in block 4 Block first atom: 180 Blocpdb> 74 atoms in block 5 Block first atom: 255 Blocpdb> 71 atoms in block 6 Block first atom: 329 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 400 Blocpdb> 42 atoms in block 8 Block first atom: 459 Blocpdb> 67 atoms in block 9 Block first atom: 501 Blocpdb> 67 atoms in block 10 Block first atom: 568 Blocpdb> 75 atoms in block 11 Block first atom: 635 Blocpdb> 62 atoms in block 12 Block first atom: 710 Blocpdb> 68 atoms in block 13 Block first atom: 772 Blocpdb> 76 atoms in block 14 Block first atom: 840 Blocpdb> 76 atoms in block 15 Block first atom: 916 Blocpdb> 67 atoms in block 16 Block first atom: 992 Blocpdb> 88 atoms in block 17 Block first atom: 1059 Blocpdb> 59 atoms in block 18 Block first atom: 1147 Blocpdb> 84 atoms in block 19 Block first atom: 1206 Blocpdb> 75 atoms in block 20 Block first atom: 1290 Blocpdb> 86 atoms in block 21 Block first atom: 1365 Blocpdb> 70 atoms in block 22 Block first atom: 1451 Blocpdb> 85 atoms in block 23 Block first atom: 1521 Blocpdb> 59 atoms in block 24 Block first atom: 1606 Blocpdb> 69 atoms in block 25 Block first atom: 1665 Blocpdb> 77 atoms in block 26 Block first atom: 1734 Blocpdb> 59 atoms in block 27 Block first atom: 1811 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 1870 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 1948 Blocpdb> 50 atoms in block 30 Block first atom: 2025 Blocpdb> 93 atoms in block 31 Block first atom: 2075 Blocpdb> 54 atoms in block 32 Block first atom: 2168 Blocpdb> 88 atoms in block 33 Block first atom: 2222 Blocpdb> 54 atoms in block 34 Block first atom: 2310 Blocpdb> 61 atoms in block 35 Block first atom: 2364 Blocpdb> 89 atoms in block 36 Block first atom: 2425 Blocpdb> 79 atoms in block 37 Block first atom: 2514 Blocpdb> 63 atoms in block 38 Block first atom: 2593 Blocpdb> 82 atoms in block 39 Block first atom: 2656 Blocpdb> 59 atoms in block 40 Block first atom: 2738 Blocpdb> 71 atoms in block 41 Block first atom: 2797 Blocpdb> 76 atoms in block 42 Block first atom: 2868 Blocpdb> 54 atoms in block 43 Block first atom: 2944 Blocpdb> 91 atoms in block 44 Block first atom: 2998 Blocpdb> 60 atoms in block 45 Block first atom: 3089 Blocpdb> 64 atoms in block 46 Block first atom: 3149 Blocpdb> 86 atoms in block 47 Block first atom: 3213 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 3299 Blocpdb> 74 atoms in block 49 Block first atom: 3370 Blocpdb> 81 atoms in block 50 Block first atom: 3444 Blocpdb> 86 atoms in block 51 Block first atom: 3525 Blocpdb> 54 atoms in block 52 Block first atom: 3611 Blocpdb> 7 atoms in block 53 Block first atom: 3665 Blocpdb> 80 atoms in block 54 Block first atom: 3672 Blocpdb> 54 atoms in block 55 Block first atom: 3752 Blocpdb> 89 atoms in block 56 Block first atom: 3806 Blocpdb> 60 atoms in block 57 Block first atom: 3895 Blocpdb> 86 atoms in block 58 Block first atom: 3955 Blocpdb> 84 atoms in block 59 Block first atom: 4041 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 4125 Blocpdb> 73 atoms in block 61 Block first atom: 4158 Blocpdb> 86 atoms in block 62 Block first atom: 4231 Blocpdb> 67 atoms in block 63 Block first atom: 4317 Blocpdb> 98 atoms in block 64 Block first atom: 4384 Blocpdb> 78 atoms in block 65 Block first atom: 4482 Blocpdb> 66 atoms in block 66 Block first atom: 4560 Blocpdb> 55 atoms in block 67 Block first atom: 4626 Blocpdb> 88 atoms in block 68 Block first atom: 4681 Blocpdb> 79 atoms in block 69 Block first atom: 4769 Blocpdb> 78 atoms in block 70 Block first atom: 4848 Blocpdb> 78 atoms in block 71 Block first atom: 4926 Blocpdb> 77 atoms in block 72 Block first atom: 5004 Blocpdb> 74 atoms in block 73 Block first atom: 5081 Blocpdb> 84 atoms in block 74 Block first atom: 5155 Blocpdb> 81 atoms in block 75 Block first atom: 5239 Blocpdb> 94 atoms in block 76 Block first atom: 5320 Blocpdb> 78 atoms in block 77 Block first atom: 5414 Blocpdb> 69 atoms in block 78 Block first atom: 5492 Blocpdb> 77 atoms in block 79 Block first atom: 5561 Blocpdb> 78 atoms in block 80 Block first atom: 5638 Blocpdb> 87 atoms in block 81 Block first atom: 5716 Blocpdb> 85 atoms in block 82 Block first atom: 5803 Blocpdb> 98 atoms in block 83 Block first atom: 5888 Blocpdb> 93 atoms in block 84 Block first atom: 5986 Blocpdb> 60 atoms in block 85 Block first atom: 6079 Blocpdb> 101 atoms in block 86 Block first atom: 6139 Blocpdb> 20 atoms in block 87 Block first atom: 6240 Blocpdb> 52 atoms in block 88 Block first atom: 6260 Blocpdb> 71 atoms in block 89 Block first atom: 6312 Blocpdb> 52 atoms in block 90 Block first atom: 6383 Blocpdb> 60 atoms in block 91 Block first atom: 6435 Blocpdb> 83 atoms in block 92 Block first atom: 6495 Blocpdb> 69 atoms in block 93 Block first atom: 6578 Blocpdb> 50 atoms in block 94 Block first atom: 6647 Blocpdb> 51 atoms in block 95 Block first atom: 6697 Blocpdb> 55 atoms in block 96 Block first atom: 6748 Blocpdb> 79 atoms in block 97 Block first atom: 6803 Blocpdb> 70 atoms in block 98 Block first atom: 6882 Blocpdb> 67 atoms in block 99 Block first atom: 6952 Blocpdb> 56 atoms in block 100 Block first atom: 7019 Blocpdb> 76 atoms in block 101 Block first atom: 7075 Blocpdb> 84 atoms in block 102 Block first atom: 7151 Blocpdb> 64 atoms in block 103 Block first atom: 7235 Blocpdb> 83 atoms in block 104 Block first atom: 7299 Blocpdb> 64 atoms in block 105 Block first atom: 7382 Blocpdb> 81 atoms in block 106 Block first atom: 7446 Blocpdb> 78 atoms in block 107 Block first atom: 7527 Blocpdb> 84 atoms in block 108 Block first atom: 7605 Blocpdb> 79 atoms in block 109 Block first atom: 7689 Blocpdb> 78 atoms in block 110 Block first atom: 7768 Blocpdb> 54 atoms in block 111 Block first atom: 7846 Blocpdb> 71 atoms in block 112 Block first atom: 7900 Blocpdb> 77 atoms in block 113 Block first atom: 7971 Blocpdb> 56 atoms in block 114 Block first atom: 8048 Blocpdb> 74 atoms in block 115 Block first atom: 8104 Blocpdb> 83 atoms in block 116 Block first atom: 8178 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 8261 Blocpdb> 86 atoms in block 118 Block first atom: 8323 Blocpdb> 64 atoms in block 119 Block first atom: 8409 Blocpdb> 76 atoms in block 120 Block first atom: 8473 Blocpdb> 71 atoms in block 121 Block first atom: 8549 Blocpdb> 61 atoms in block 122 Block first atom: 8620 Blocpdb> 86 atoms in block 123 Block first atom: 8681 Blocpdb> 75 atoms in block 124 Block first atom: 8767 Blocpdb> 67 atoms in block 125 Block first atom: 8842 Blocpdb> 80 atoms in block 126 Block first atom: 8909 Blocpdb> 61 atoms in block 127 Block first atom: 8989 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 9050 Blocpdb> 79 atoms in block 129 Block first atom: 9117 Blocpdb> 56 atoms in block 130 Block first atom: 9196 Blocpdb> 90 atoms in block 131 Block first atom: 9252 Blocpdb> 59 atoms in block 132 Block first atom: 9342 Blocpdb> 62 atoms in block 133 Block first atom: 9401 Blocpdb> 76 atoms in block 134 Block first atom: 9463 Blocpdb> 71 atoms in block 135 Block first atom: 9539 Blocpdb> 84 atoms in block 136 Block first atom: 9610 Blocpdb> 81 atoms in block 137 Block first atom: 9694 Blocpdb> 74 atoms in block 138 Block first atom: 9775 Blocpdb> 66 atoms in block 139 Block first atom: 9849 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 9915 Blocpdb> 83 atoms in block 141 Block first atom: 9935 Blocpdb> 77 atoms in block 142 Block first atom: 10018 Blocpdb> 61 atoms in block 143 Block first atom: 10095 Blocpdb> 91 atoms in block 144 Block first atom: 10156 Blocpdb> 83 atoms in block 145 Block first atom: 10247 Blocpdb> 86 atoms in block 146 Block first atom: 10330 Blocpdb> 67 atoms in block 147 Block first atom: 10416 Blocpdb> 83 atoms in block 148 Block first atom: 10483 Blocpdb> 78 atoms in block 149 Block first atom: 10566 Blocpdb> 66 atoms in block 150 Block first atom: 10644 Blocpdb> 55 atoms in block 151 Block first atom: 10710 Blocpdb> 88 atoms in block 152 Block first atom: 10765 Blocpdb> 79 atoms in block 153 Block first atom: 10853 Blocpdb> 78 atoms in block 154 Block first atom: 10932 Blocpdb> 78 atoms in block 155 Block first atom: 11010 Blocpdb> 77 atoms in block 156 Block first atom: 11088 Blocpdb> 69 atoms in block 157 Block first atom: 11165 Blocpdb> 69 atoms in block 158 Block first atom: 11234 Blocpdb> 81 atoms in block 159 Block first atom: 11303 Blocpdb> 94 atoms in block 160 Block first atom: 11384 Blocpdb> 78 atoms in block 161 Block first atom: 11478 Blocpdb> 69 atoms in block 162 Block first atom: 11556 Blocpdb> 60 atoms in block 163 Block first atom: 11625 Blocpdb> 78 atoms in block 164 Block first atom: 11685 Blocpdb> 87 atoms in block 165 Block first atom: 11763 Blocpdb> 85 atoms in block 166 Block first atom: 11850 Blocpdb> 98 atoms in block 167 Block first atom: 11935 Blocpdb> 64 atoms in block 168 Block first atom: 12033 Blocpdb> 60 atoms in block 169 Block first atom: 12097 Blocpdb> 101 atoms in block 170 Block first atom: 12157 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 12257 Blocpdb> 171 blocks. Blocpdb> At most, 101 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 9303625 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 36831 Prepmat> Matrix trace = 20513860.0000 Prepmat> Last element read: 36831 36831 446.9603 Prepmat> 14707 lines saved. Prepmat> 12963 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12277 RTB> Total mass = 12277.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12277 RTB> Number of blocks = 171 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 415332.6730 RTB> 60183 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1026 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60183 Diagstd> Projected matrix trace = 415332.6730 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1026 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 415332.6730 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3434505 0.4402832 0.5544209 1.5116794 2.9879008 4.0612952 4.8644591 5.3078019 6.9340237 7.5786927 10.1304436 11.1056669 12.1633557 13.0631786 14.5910791 16.4500067 16.6421458 18.5937676 19.1416090 22.9501592 23.4152799 23.8762139 24.8725019 26.4431441 27.8816707 30.1085388 31.3549429 31.7144779 33.1739238 35.3286110 35.9325544 37.9118272 39.7358500 40.7321823 41.3318617 41.3718878 42.6825754 43.2251423 44.1646063 46.9088371 47.8461113 48.8532752 49.5951481 52.0274007 53.9709305 55.3788476 55.8390419 56.7365019 59.6399352 60.2925200 61.1351206 61.3497710 63.9188587 64.9394240 66.0513149 66.7945370 68.3746721 68.9551861 70.5090821 71.2473832 72.6198181 72.8442848 73.0391683 73.9179085 75.0658161 76.6900093 77.4060593 78.5960579 79.1735140 80.0961452 81.8921394 82.1722364 83.4752832 85.0415096 86.8954510 87.8741701 88.1820739 88.6079672 89.5180969 90.3222440 92.2511234 93.9740811 94.3372489 95.9788028 96.9177353 97.2344797 98.1210407 98.9470897 100.2315877 101.5123342 102.8734427 103.6792717 105.5063590 106.5754132 107.7135693 108.7708018 109.0811724 109.4152340 110.7906358 110.9725183 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034269 0.0034304 0.0034329 0.0034345 0.0034349 0.0034351 63.6395872 72.0545378 80.8565269 133.5134817 187.7060904 218.8404312 239.5038834 250.1800252 285.9485790 298.9457820 345.6284726 361.8825166 378.7232649 392.4819714 414.8002283 440.4314466 442.9961398 468.2512868 475.0994203 520.2213023 525.4664067 530.6131519 541.5705207 558.4082503 573.3960234 595.8543573 608.0625932 611.5388661 625.4515906 645.4439905 650.9375514 668.6250423 684.5206186 693.0492851 698.1323519 698.4703087 709.4480323 713.9429285 721.6597142 743.7425243 751.1360454 759.0006059 764.7418828 783.2697324 797.7654669 808.1039645 811.4546613 817.9496263 838.6173855 843.1930117 849.0644686 850.5537293 868.1800185 875.0835026 882.5432832 887.4946676 897.9308826 901.7346285 911.8382597 916.5997600 925.3858588 926.8149317 928.0538783 933.6199330 940.8413266 950.9653116 955.3945496 962.7103970 966.2405085 971.8541375 982.6896656 984.3687857 992.1429047 1001.4073177 1012.2640215 1017.9487150 1019.7305596 1022.1900916 1027.4263523 1032.0307550 1042.9923239 1052.6871560 1054.7192775 1063.8562381 1069.0472701 1070.7927635 1075.6633042 1080.1816438 1087.1703139 1094.0941285 1101.4046793 1105.7100300 1115.4101656 1121.0469279 1127.0170570 1132.5345120 1134.1491687 1135.8845098 1143.0015190 1143.9393546 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12277 Rtb_to_modes> Number of blocs = 171 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9590E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9794E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3435 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5544 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.988 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.061 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.864 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.308 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.579 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 220986 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00003 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20122618531975650.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20122618531975650.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20122618531975650.atom Openam> file on opening on unit 11: 20122618531975650.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 837 First residue number = 8 Last residue number = 461 Number of atoms found = 12277 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9590E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9794E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9938E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3435 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5544 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.864 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.308 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.579 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0 Bfactors> 106 vectors, 36831 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.343500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.472 for 837 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.014 +/- 0.02 Bfactors> = 60.553 +/- 16.38 Bfactors> Shiftng-fct= 60.539 Bfactors> Scaling-fct= 1067.094 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20122618531975650.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20122618531975650.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4268E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7072 0.0034 0.7644 0.0034 0.6240 0.0034 0.6405 0.0034 0.9085 0.0034 0.7766 63.6414 0.6485 72.0528 0.7171 80.8515 0.7730 133.5219 0.0315 187.7011 0.4137 218.8231 0.8719 239.4823 0.4116 250.1740 0.3326 285.9358 0.2388 298.9390 0.2351 345.6061 0.4911 361.9376 0.4151 378.6548 0.0192 392.4174 0.3566 414.7671 0.4111 440.4125 0.2124 442.9486 0.3201 468.1837 0.4532 475.0591 0.4649 520.1972 0.1855 525.4968 0.6714 530.6324 0.3207 541.5200 0.6183 558.3511 0.7451 573.3542 0.6841 595.8432 0.4485 607.9886 0.2950 611.4694 0.1518 625.3878 0.3230 645.4290 0.2740 650.8865 0.3529 668.5802 0.2047 684.5270 0.4457 693.0010 0.1689 698.0867 0.4115 698.4244 0.3752 709.3962 0.3775 713.9524 0.4622 721.5911 0.4417 743.7198 0.2500 751.1343 0.5412 758.9426 0.2933 764.7465 0.3285 783.2557 0.3378 797.7243 0.4082 808.0777 0.2104 811.4268 0.4263 817.9397 0.3212 838.5818 0.2904 843.1392 0.4345 849.0619 0.4380 850.5188 0.5641 868.1505 0.3716 875.0498 0.4149 882.4966 0.3121 887.4264 0.3399 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perturbed structure for DQ=-80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom making animated gifs 11 models are in 20122618531975650.7.pdb, 1 models will 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20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom making animated gifs 11 models are in 20122618531975650.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618531975650 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom making animated gifs 11 models are in 20122618531975650.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618531975650 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom 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will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618531975650 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20122618531975650.eigenfacs 20122618531975650.atom making animated gifs 11 models are in 20122618531975650.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618531975650.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 20122618531975650.10.pdb 20122618531975650.11.pdb 20122618531975650.7.pdb 20122618531975650.8.pdb 20122618531975650.9.pdb STDERR: real 0m58.287s user 0m57.824s sys 0m0.408s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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