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***  4ff6 and 4p8y  ***

LOGs for ID: 20122618423269598

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20122618423269598.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20122618423269598.atom to be opened. Openam> File opened: 20122618423269598.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 837 First residue number = 7 Last residue number = 461 Number of atoms found = 6338 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -4.351065 +/- 21.307186 From: -50.232000 To: 40.268000 = -15.227355 +/- 12.507965 From: -54.377000 To: 16.844000 = 18.819848 +/- 22.023177 From: -25.448000 To: 65.043000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3488 % Filled. Pdbmat> 2438250 non-zero elements. Pdbmat> 266728 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.17 +/- 21.60 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 5.334560E+06 Pdbmat> Larger element = 491.232 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 837 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20122618423269598.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20122618423269598.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20122618423269598.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6338 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 837 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 44 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 28 atoms in block 3 Block first atom: 76 Blocpdb> 33 atoms in block 4 Block first atom: 104 Blocpdb> 41 atoms in block 5 Block first atom: 137 Blocpdb> 37 atoms in block 6 Block first atom: 178 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 215 Blocpdb> 27 atoms in block 8 Block first atom: 246 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 273 Blocpdb> 32 atoms in block 10 Block first atom: 305 Blocpdb> 41 atoms in block 11 Block first atom: 337 Blocpdb> 34 atoms in block 12 Block first atom: 378 Blocpdb> 31 atoms in block 13 Block first atom: 412 Blocpdb> 38 atoms in block 14 Block first atom: 443 Blocpdb> 39 atoms in block 15 Block first atom: 481 Blocpdb> 36 atoms in block 16 Block first atom: 520 Blocpdb> 40 atoms in block 17 Block first atom: 556 Blocpdb> 32 atoms in block 18 Block first atom: 596 Blocpdb> 41 atoms in block 19 Block first atom: 628 Blocpdb> 34 atoms in block 20 Block first atom: 669 Blocpdb> 44 atoms in block 21 Block first atom: 703 Blocpdb> 33 atoms in block 22 Block first atom: 747 Blocpdb> 41 atoms in block 23 Block first atom: 780 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 821 Blocpdb> 37 atoms in block 25 Block first atom: 849 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 886 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 927 Blocpdb> 40 atoms in block 28 Block first atom: 959 Blocpdb> 38 atoms in block 29 Block first atom: 999 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 1037 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1070 Blocpdb> 31 atoms in block 32 Block first atom: 1114 Blocpdb> 47 atoms in block 33 Block first atom: 1145 Blocpdb> 27 atoms in block 34 Block first atom: 1192 Blocpdb> 31 atoms in block 35 Block first atom: 1219 Blocpdb> 40 atoms in block 36 Block first atom: 1250 Blocpdb> 39 atoms in block 37 Block first atom: 1290 Blocpdb> 32 atoms in block 38 Block first atom: 1329 Blocpdb> 44 atoms in block 39 Block first atom: 1361 Blocpdb> 31 atoms in block 40 Block first atom: 1405 Blocpdb> 38 atoms in block 41 Block first atom: 1436 Blocpdb> 37 atoms in block 42 Block first atom: 1474 Blocpdb> 32 atoms in block 43 Block first atom: 1511 Blocpdb> 48 atoms in block 44 Block first atom: 1543 Blocpdb> 44 atoms in block 45 Block first atom: 1591 Blocpdb> 31 atoms in block 46 Block first atom: 1635 Blocpdb> 39 atoms in block 47 Block first atom: 1666 Blocpdb> 34 atoms in block 48 Block first atom: 1705 Blocpdb> 35 atoms in block 49 Block first atom: 1739 Blocpdb> 36 atoms in block 50 Block first atom: 1774 Blocpdb> 35 atoms in block 51 Block first atom: 1810 Blocpdb> 40 atoms in block 52 Block first atom: 1845 Blocpdb> 5 atoms in block 53 Block first atom: 1885 Blocpdb> 41 atoms in block 54 Block first atom: 1890 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1931 Blocpdb> 46 atoms in block 56 Block first atom: 1965 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 2011 Blocpdb> 40 atoms in block 58 Block first atom: 2047 Blocpdb> 43 atoms in block 59 Block first atom: 2087 Blocpdb> 17 atoms in block 60 Block first atom: 2130 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2147 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2191 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2233 Blocpdb> 46 atoms in block 64 Block first atom: 2269 Blocpdb> 36 atoms in block 65 Block first atom: 2315 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 2351 Blocpdb> 34 atoms in block 67 Block first atom: 2388 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 2422 Blocpdb> 40 atoms in block 69 Block first atom: 2465 Blocpdb> 39 atoms in block 70 Block first atom: 2505 Blocpdb> 41 atoms in block 71 Block first atom: 2544 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2585 Blocpdb> 36 atoms in block 73 Block first atom: 2625 Blocpdb> 39 atoms in block 74 Block first atom: 2661 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 2700 Blocpdb> 46 atoms in block 76 Block first atom: 2742 Blocpdb> 39 atoms in block 77 Block first atom: 2788 Blocpdb> 35 atoms in block 78 Block first atom: 2827 Blocpdb> 39 atoms in block 79 Block first atom: 2862 Blocpdb> 41 atoms in block 80 Block first atom: 2901 Blocpdb> 45 atoms in block 81 Block first atom: 2942 Blocpdb> 44 atoms in block 82 Block first atom: 2987 Blocpdb> 46 atoms in block 83 Block first atom: 3031 Blocpdb> 44 atoms in block 84 Block first atom: 3077 Blocpdb> 32 atoms in block 85 Block first atom: 3121 Blocpdb> 47 atoms in block 86 Block first atom: 3153 Blocpdb> 9 atoms in block 87 Block first atom: 3200 Blocpdb> 31 atoms in block 88 Block first atom: 3209 Blocpdb> 44 atoms in block 89 Block first atom: 3240 Blocpdb> 34 atoms in block 90 Block first atom: 3284 Blocpdb> 33 atoms in block 91 Block first atom: 3318 Blocpdb> 41 atoms in block 92 Block first atom: 3351 Blocpdb> 37 atoms in block 93 Block first atom: 3392 Blocpdb> 31 atoms in block 94 Block first atom: 3429 Blocpdb> 27 atoms in block 95 Block first atom: 3460 Blocpdb> 32 atoms in block 96 Block first atom: 3487 Blocpdb> 32 atoms in block 97 Block first atom: 3519 Blocpdb> 41 atoms in block 98 Block first atom: 3551 Blocpdb> 34 atoms in block 99 Block first atom: 3592 Blocpdb> 31 atoms in block 100 Block first atom: 3626 Blocpdb> 38 atoms in block 101 Block first atom: 3657 Blocpdb> 39 atoms in block 102 Block first atom: 3695 Blocpdb> 36 atoms in block 103 Block first atom: 3734 Blocpdb> 40 atoms in block 104 Block first atom: 3770 Blocpdb> 32 atoms in block 105 Block first atom: 3810 Blocpdb> 41 atoms in block 106 Block first atom: 3842 Blocpdb> 34 atoms in block 107 Block first atom: 3883 Blocpdb> 44 atoms in block 108 Block first atom: 3917 Blocpdb> 33 atoms in block 109 Block first atom: 3961 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 3994 Blocpdb> 28 atoms in block 111 Block first atom: 4035 Blocpdb> 37 atoms in block 112 Block first atom: 4063 Blocpdb> 41 atoms in block 113 Block first atom: 4100 Blocpdb> 32 atoms in block 114 Block first atom: 4141 Blocpdb> 40 atoms in block 115 Block first atom: 4173 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 4213 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 4251 Blocpdb> 44 atoms in block 118 Block first atom: 4284 Blocpdb> 35 atoms in block 119 Block first atom: 4328 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 4363 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 4410 Blocpdb> 31 atoms in block 122 Block first atom: 4437 Blocpdb> 40 atoms in block 123 Block first atom: 4468 Blocpdb> 39 atoms in block 124 Block first atom: 4508 Blocpdb> 32 atoms in block 125 Block first atom: 4547 Blocpdb> 44 atoms in block 126 Block first atom: 4579 Blocpdb> 31 atoms in block 127 Block first atom: 4623 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 4654 Blocpdb> 37 atoms in block 129 Block first atom: 4692 Blocpdb> 32 atoms in block 130 Block first atom: 4729 Blocpdb> 48 atoms in block 131 Block first atom: 4761 Blocpdb> 35 atoms in block 132 Block first atom: 4809 Blocpdb> 31 atoms in block 133 Block first atom: 4844 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 4875 Blocpdb> 34 atoms in block 135 Block first atom: 4914 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 4948 Blocpdb> 36 atoms in block 137 Block first atom: 4983 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 5019 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 5054 Blocpdb> 8 atoms in block 140 Block first atom: 5084 Blocpdb> 44 atoms in block 141 Block first atom: 5092 Blocpdb> 33 atoms in block 142 Block first atom: 5136 Blocpdb> 43 atoms in block 143 Block first atom: 5169 Blocpdb> 41 atoms in block 144 Block first atom: 5212 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 5253 Blocpdb> 40 atoms in block 146 Block first atom: 5281 Blocpdb> 42 atoms in block 147 Block first atom: 5321 Blocpdb> 36 atoms in block 148 Block first atom: 5363 Blocpdb> 44 atoms in block 149 Block first atom: 5399 Blocpdb> 36 atoms in block 150 Block first atom: 5443 Blocpdb> 37 atoms in block 151 Block first atom: 5479 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 5516 Blocpdb> 43 atoms in block 153 Block first atom: 5556 Blocpdb> 40 atoms in block 154 Block first atom: 5599 Blocpdb> 39 atoms in block 155 Block first atom: 5639 Blocpdb> 41 atoms in block 156 Block first atom: 5678 Blocpdb> 40 atoms in block 157 Block first atom: 5719 Blocpdb> 34 atoms in block 158 Block first atom: 5759 Blocpdb> 37 atoms in block 159 Block first atom: 5793 Blocpdb> 42 atoms in block 160 Block first atom: 5830 Blocpdb> 46 atoms in block 161 Block first atom: 5872 Blocpdb> 39 atoms in block 162 Block first atom: 5918 Blocpdb> 35 atoms in block 163 Block first atom: 5957 Blocpdb> 39 atoms in block 164 Block first atom: 5992 Blocpdb> 41 atoms in block 165 Block first atom: 6031 Blocpdb> 45 atoms in block 166 Block first atom: 6072 Blocpdb> 44 atoms in block 167 Block first atom: 6117 Blocpdb> 46 atoms in block 168 Block first atom: 6161 Blocpdb> 44 atoms in block 169 Block first atom: 6207 Blocpdb> 32 atoms in block 170 Block first atom: 6251 Blocpdb> 47 atoms in block 171 Block first atom: 6283 Blocpdb> 9 atoms in block 172 Block first atom: 6329 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2438422 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 19014 Prepmat> Matrix trace = 5334560.0000 Prepmat> Last element read: 19014 19014 213.1077 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13328 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6338 RTB> Total mass = 6338.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6338 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 207351.1980 RTB> 53220 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 53220 Diagstd> Projected matrix trace = 207351.1980 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 207351.1980 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1401632 0.1839969 0.2423024 0.6678727 1.2475502 1.7846467 1.8840894 2.1433508 2.7406691 3.1147986 3.9835472 4.4194619 4.8699450 5.7557282 6.4019816 6.9931011 7.2124768 7.6361369 7.8673969 10.1615104 10.2727807 10.7744154 11.4239166 11.9481470 12.3649264 13.2830202 13.9184921 14.6465524 15.5460190 16.0153942 16.9490470 17.1941818 17.4456102 17.6926351 18.0628219 19.1911543 19.7675921 19.9501106 20.3410872 20.7397279 21.7117764 22.0128304 22.3812426 22.8094266 23.0974397 23.2439394 24.0950884 24.7761772 25.2495887 25.7856975 26.4802689 27.0505575 27.7083705 28.1165768 28.5241192 28.8020673 29.2469691 29.8870835 30.5082349 30.6186003 30.7714262 31.6276770 31.9422146 32.5358696 32.9903851 33.4049798 34.3370439 34.4276741 35.0436176 35.5681437 36.1558925 36.3586680 37.3570311 37.9835651 38.1717210 39.2502734 39.6387066 40.0209424 40.2119476 41.0345102 41.4762781 41.6224953 42.0967625 43.4740927 43.7208404 43.8938924 44.5720340 44.9574899 45.3768875 45.6181377 46.9952358 47.4677625 47.7845729 48.1801067 48.6688454 49.1740672 49.6460045 49.9901442 50.5881641 50.8897131 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034337 0.0034347 0.0034348 0.0034352 0.0034353 40.6548408 46.5801116 53.4532475 88.7446362 121.2898052 145.0679273 149.0548226 158.9797852 179.7726329 191.6506376 216.7356056 228.2863673 239.6388959 260.5226082 274.7593574 287.1641246 291.6335576 300.0766017 304.5866118 346.1580321 348.0481171 356.4446805 367.0310379 375.3578979 381.8484642 395.7707530 405.1271728 415.5879862 428.1588033 434.5743571 447.0621701 450.2835048 453.5637760 456.7636561 461.5174014 475.7138861 482.8054520 485.0292548 489.7589273 494.5347430 505.9911950 509.4871377 513.7328986 518.6238249 521.8878679 523.5403356 533.0396829 540.5208235 545.6603965 551.4228037 558.8001007 564.7853074 571.6112575 575.8064196 579.9644877 582.7833167 587.2671564 593.6589895 599.7963532 600.8802738 602.3779877 610.7014171 613.7306209 619.4075431 623.7189987 627.6259435 636.3216976 637.1609068 642.8353437 647.6283925 652.9573632 654.7858150 663.7147314 669.2573395 670.9129131 680.3253026 683.6833722 686.9718410 688.6092216 695.6165514 699.3509500 700.5825840 704.5626697 715.9959135 718.0249428 719.4445512 724.9808028 728.1088465 731.4971394 733.4390961 744.4271376 748.1603023 750.6528445 753.7531832 757.5665699 761.4884940 765.1338773 767.7812026 772.3599394 774.6584837 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6338 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1840 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.143 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.870 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.867 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 114084 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20122618423269598.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20122618423269598.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20122618423269598.atom Openam> file on opening on unit 11: 20122618423269598.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 837 First residue number = 7 Last residue number = 461 Number of atoms found = 6338 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1840 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.143 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.870 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.867 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Bfactors> 106 vectors, 19014 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.140200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.418 for 837 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.062 +/- 0.08 Bfactors> = 50.237 +/- 15.82 Bfactors> Shiftng-fct= 50.175 Bfactors> Scaling-fct= 209.746 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20122618423269598.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20122618423269598.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Chkmod> 106 vectors, 19014 coordinates in file. Chkmod> That is: 6338 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7318 0.0034 0.8491 0.0034 0.9308 0.0034 0.7120 0.0034 0.7447 0.0034 0.6410 40.6584 0.6646 46.5785 0.7261 53.4507 0.7812 88.7426 0.0310 121.3065 0.2171 145.0761 0.7728 149.0449 0.3139 158.9600 0.6625 179.7758 0.1696 191.6486 0.0820 216.7386 0.1201 228.2646 0.3647 239.6300 0.2860 260.5176 0.3098 274.7480 0.4015 287.1497 0.5458 291.6114 0.3129 300.0610 0.4482 304.5659 0.4114 346.1174 0.3376 347.9861 0.3546 356.3563 0.7316 366.9524 0.6103 375.3709 0.6810 381.7560 0.6492 395.7088 0.3612 405.1317 0.3896 415.6191 0.4193 428.1952 0.3398 434.6182 0.2946 447.0555 0.3633 450.2094 0.3313 453.6014 0.4005 456.7100 0.2763 461.4615 0.4341 475.6792 0.5131 482.8141 0.2948 485.0071 0.3839 489.7248 0.1659 494.5168 0.5535 505.9488 0.1925 509.4325 0.4848 513.6966 0.4409 518.6081 0.2928 521.8944 0.2998 523.4735 0.3063 533.0711 0.2600 540.5393 0.3932 545.6414 0.3461 551.4451 0.4127 558.7733 0.5215 564.7552 0.3929 571.6035 0.5002 575.8168 0.6331 579.8977 0.5752 582.7374 0.5440 587.2724 0.5167 593.6625 0.4699 599.7880 0.3066 600.8682 0.5010 602.3382 0.4151 610.6976 0.4636 613.6830 0.3821 619.4203 0.5171 623.6886 0.4921 627.5522 0.5094 636.3218 0.5094 637.1551 0.5575 642.7746 0.4569 647.6175 0.5290 652.9664 0.4592 654.7697 0.3371 663.7126 0.4167 669.1972 0.3418 670.8690 0.4696 680.2937 0.4178 683.6652 0.5992 686.9343 0.5645 688.5630 0.5770 695.5485 0.6276 699.3523 0.4687 700.5315 0.4150 704.5595 0.4832 715.9315 0.4783 717.9872 0.2894 719.3818 0.4517 724.9331 0.5682 728.0979 0.4871 731.4908 0.4042 733.4226 0.4834 744.4329 0.4149 748.1458 0.4582 750.5847 0.4229 753.7200 0.4409 757.5430 0.3484 761.4243 0.5589 765.1318 0.4836 767.7471 0.4606 772.3408 0.4663 774.6274 0.4162 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 20122618423269598.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20122618423269598.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 20122618423269598.atom Openam> file on opening on unit 11: 20122618423269598.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 20122618423269598.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 20122618423269598.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 53.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Projmod> 106 vectors, 19014 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 837 First residue number = 7 Last residue number = 461 Number of atoms found = 6338 Mean number per residue = 7.6 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 871 First residue number = 4 Last residue number = 461 Number of atoms found = 6724 Mean number per residue = 7.7 %Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer. %Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer. Projmod> All atoms of first conformer were found in second one. Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 6338 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 44.80 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.154 Sum= 0.024 q= 548.9459 Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.194 Sum= 0.061 q= -691.8325 Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.278 Sum= 0.138 q= -989.8030 Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.029 Sum= 0.139 q= 104.4127 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.278 Sum= 0.217 q= 992.9606 Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.388 Sum= 0.367 q= -1384.2275 Vector: 7 F= 40.66 Cos= -0.261 Sum= 0.435 q= -930.8360 Vector: 8 F= 46.58 Cos= -0.017 Sum= 0.436 q= -60.2672 Vector: 9 F= 53.45 Cos= 0.047 Sum= 0.438 q= 167.2675 Vector: 10 F= 88.74 Cos= -0.002 Sum= 0.438 q= -5.8342 Vector: 11 F= 121.31 Cos= -0.077 Sum= 0.444 q= -275.1432 Vector: 12 F= 145.08 Cos= 0.490 Sum= 0.684 q= 1746.3920 Vector: 13 F= 149.04 Cos= -0.236 Sum= 0.739 q= -840.4247 Vector: 14 F= 158.96 Cos= -0.072 Sum= 0.744 q= -256.9010 Vector: 15 F= 179.78 Cos= -0.012 Sum= 0.744 q= -43.7508 Vector: 16 F= 191.65 Cos= -0.000 Sum= 0.744 q= -1.7753 Vector: 17 F= 216.74 Cos= -0.045 Sum= 0.747 q= -161.9792 Vector: 18 F= 228.26 Cos= 0.012 Sum= 0.747 q= 43.2238 Vector: 19 F= 239.63 Cos= -0.047 Sum= 0.749 q= -168.7190 Vector: 20 F= 260.52 Cos= -0.014 Sum= 0.749 q= -48.6408 Vector: 21 F= 274.75 Cos= 0.022 Sum= 0.750 q= 77.6046 Vector: 22 F= 287.15 Cos= 0.005 Sum= 0.750 q= 18.8848 Vector: 23 F= 291.61 Cos= -0.097 Sum= 0.759 q= -344.6077 Vector: 24 F= 300.06 Cos= -0.009 Sum= 0.759 q= -33.6539 Vector: 25 F= 304.57 Cos= 0.040 Sum= 0.761 q= 141.2283 Vector: 26 F= 346.12 Cos= -0.015 Sum= 0.761 q= -52.9082 Vector: 27 F= 347.99 Cos= -0.023 Sum= 0.761 q= -81.7557 Vector: 28 F= 356.36 Cos= -0.024 Sum= 0.762 q= -84.1139 Vector: 29 F= 366.95 Cos= 0.050 Sum= 0.764 q= 179.1888 Vector: 30 F= 375.37 Cos= 0.045 Sum= 0.766 q= 160.8317 Vector: 31 F= 381.76 Cos= -0.062 Sum= 0.770 q= -219.4406 Vector: 32 F= 395.71 Cos= -0.037 Sum= 0.772 q= -133.4095 Vector: 33 F= 405.13 Cos= -0.042 Sum= 0.773 q= -149.0007 Vector: 34 F= 415.62 Cos= 0.075 Sum= 0.779 q= 266.4486 Vector: 35 F= 428.20 Cos= -0.037 Sum= 0.780 q= -130.8336 Vector: 36 F= 434.62 Cos= -0.136 Sum= 0.799 q= -485.5452 Vector: 37 F= 447.06 Cos= -0.031 Sum= 0.800 q= -111.9951 Vector: 38 F= 450.21 Cos= -0.013 Sum= 0.800 q= -46.8366 Vector: 39 F= 453.60 Cos= 0.041 Sum= 0.802 q= 144.6193 Vector: 40 F= 456.71 Cos= 0.031 Sum= 0.803 q= 109.2988 Vector: 41 F= 461.46 Cos= -0.127 Sum= 0.819 q= -452.7302 Vector: 42 F= 475.68 Cos= -0.048 Sum= 0.821 q= -171.6468 Vector: 43 F= 482.81 Cos= 0.066 Sum= 0.825 q= 234.6591 Vector: 44 F= 485.01 Cos= 0.086 Sum= 0.833 q= 305.8442 Vector: 45 F= 489.72 Cos= -0.059 Sum= 0.836 q= -211.4595 Vector: 46 F= 494.52 Cos= 0.018 Sum= 0.837 q= 64.3238 Vector: 47 F= 505.95 Cos= -0.058 Sum= 0.840 q= -205.5342 Vector: 48 F= 509.43 Cos= -0.080 Sum= 0.846 q= -286.1577 Vector: 49 F= 513.70 Cos= -0.109 Sum= 0.858 q= -388.4891 Vector: 50 F= 518.61 Cos= 0.022 Sum= 0.859 q= 77.0316 Vector: 51 F= 521.89 Cos= 0.016 Sum= 0.859 q= 58.7558 Vector: 52 F= 523.47 Cos= -0.050 Sum= 0.861 q= -176.9242 Vector: 53 F= 533.07 Cos= -0.094 Sum= 0.870 q= -333.5612 Vector: 54 F= 540.54 Cos= -0.018 Sum= 0.870 q= -65.1333 Vector: 55 F= 545.64 Cos= -0.090 Sum= 0.879 q= -321.1998 Vector: 56 F= 551.45 Cos= 0.045 Sum= 0.881 q= 160.7962 Vector: 57 F= 558.77 Cos= -0.064 Sum= 0.885 q= -227.2478 Vector: 58 F= 564.76 Cos= 0.021 Sum= 0.885 q= 76.0428 Vector: 59 F= 571.60 Cos= -0.070 Sum= 0.890 q= -250.1205 Vector: 60 F= 575.82 Cos= 0.004 Sum= 0.890 q= 15.8769 Vector: 61 F= 579.90 Cos= -0.002 Sum= 0.890 q= -5.4182 Vector: 62 F= 582.74 Cos= 0.043 Sum= 0.892 q= 154.4257 Vector: 63 F= 587.27 Cos= -0.006 Sum= 0.892 q= -20.2877 Vector: 64 F= 593.66 Cos= -0.017 Sum= 0.892 q= -59.9543 Vector: 65 F= 599.79 Cos= -0.001 Sum= 0.892 q= -4.8355 Vector: 66 F= 600.87 Cos= 0.001 Sum= 0.892 q= 4.1033 Vector: 67 F= 602.34 Cos= -0.003 Sum= 0.892 q= -11.0522 Vector: 68 F= 610.70 Cos= -0.028 Sum= 0.893 q= -99.6888 Vector: 69 F= 613.68 Cos= 0.055 Sum= 0.896 q= 197.8088 Vector: 70 F= 619.42 Cos= -0.045 Sum= 0.898 q= -161.1227 Vector: 71 F= 623.69 Cos= 0.017 Sum= 0.898 q= 60.3167 Vector: 72 F= 627.55 Cos= 0.022 Sum= 0.899 q= 77.4835 Vector: 73 F= 636.32 Cos= -0.029 Sum= 0.900 q= -103.2639 Vector: 74 F= 637.16 Cos= -0.056 Sum= 0.903 q= -199.1759 Vector: 75 F= 642.77 Cos= 0.056 Sum= 0.906 q= 198.7641 Vector: 76 F= 647.62 Cos= 0.006 Sum= 0.906 q= 21.6422 Vector: 77 F= 652.97 Cos= 0.003 Sum= 0.906 q= 10.5429 Vector: 78 F= 654.77 Cos= -0.007 Sum= 0.906 q= -25.7957 Vector: 79 F= 663.71 Cos= 0.018 Sum= 0.906 q= 63.4147 Vector: 80 F= 669.20 Cos= -0.010 Sum= 0.906 q= -35.7697 Vector: 81 F= 670.87 Cos= -0.056 Sum= 0.910 q= -200.9704 Vector: 82 F= 680.29 Cos= -0.027 Sum= 0.910 q= -95.4236 Vector: 83 F= 683.67 Cos= 0.051 Sum= 0.913 q= 181.0457 Vector: 84 F= 686.93 Cos= 0.027 Sum= 0.914 q= 97.4020 Vector: 85 F= 688.56 Cos= -0.003 Sum= 0.914 q= -10.4895 Vector: 86 F= 695.55 Cos= -0.053 Sum= 0.917 q= -190.5911 Vector: 87 F= 699.35 Cos= -0.022 Sum= 0.917 q= -77.4019 Vector: 88 F= 700.53 Cos= 0.022 Sum= 0.918 q= 79.4538 Vector: 89 F= 704.56 Cos= 0.004 Sum= 0.918 q= 12.5280 Vector: 90 F= 715.93 Cos= -0.045 Sum= 0.920 q= -161.1778 Vector: 91 F= 717.99 Cos= -0.013 Sum= 0.920 q= -48.0522 Vector: 92 F= 719.38 Cos= -0.030 Sum= 0.921 q= -107.8611 Vector: 93 F= 724.93 Cos= -0.022 Sum= 0.921 q= -79.9779 Vector: 94 F= 728.10 Cos= -0.014 Sum= 0.921 q= -49.3438 Vector: 95 F= 731.49 Cos= 0.052 Sum= 0.924 q= 185.7381 Vector: 96 F= 733.42 Cos= 0.047 Sum= 0.926 q= 168.6465 Vector: 97 F= 744.43 Cos= 0.012 Sum= 0.926 q= 43.3253 Vector: 98 F= 748.15 Cos= 0.034 Sum= 0.928 q= 121.0846 Vector: 99 F= 750.58 Cos= 0.001 Sum= 0.928 q= 2.8328 Vector: 100 F= 753.72 Cos= -0.043 Sum= 0.929 q= -152.3127 Vector: 101 F= 757.54 Cos= -0.005 Sum= 0.929 q= -19.4320 Vector: 102 F= 761.42 Cos= -0.025 Sum= 0.930 q= -87.5593 Vector: 103 F= 765.13 Cos= -0.034 Sum= 0.931 q= -122.0114 Vector: 104 F= 767.75 Cos= 0.051 Sum= 0.934 q= 180.2989 Vector: 105 F= 772.34 Cos= 0.009 Sum= 0.934 q= 32.1071 Vector: 106 F= 774.63 Cos= 0.024 Sum= 0.934 q= 84.1666 Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433 Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435 Projmod> Lowest non-zero frequency : 40.658434 Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.49 for mode 12 with F= 145.08 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.240 0.468 0.669 0.748 0.786 0.934 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618423269598 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom making animated gifs 11 models are in 20122618423269598.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 423 0.452 422 0.417 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 423 0.437 422 0.401 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 423 0.424 422 0.387 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 423 0.413 422 0.375 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 423 0.405 422 0.366 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 423 0.398 422 0.359 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 423 0.395 422 0.356 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 423 0.394 422 0.355 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 423 0.397 422 0.358 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 423 0.403 422 0.364 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 423 0.412 422 0.374 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618423269598 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20122618423269598.eigenfacs 20122618423269598.atom making animated gifs 11 models are in 20122618423269598.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 423 0.445 422 0.412 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 423 0.431 422 0.396 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 423 0.420 422 0.384 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 423 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 423 0.393 422 0.352 MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 423 0.391 422 0.350 MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 423 0.391 422 0.350 MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 423 0.392 422 0.352 MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 423 0.395 422 0.355 MODEL 6 MODE=9 DQ=0 423 0.398 422 0.359 MODEL 7 MODE=9 DQ=20 423 0.403 422 0.365 MODEL 8 MODE=9 DQ=40 423 0.409 422 0.371 MODEL 9 MODE=9 DQ=60 423 0.415 422 0.378 MODEL 10 MODE=9 DQ=80 423 0.423 422 0.386 MODEL 11 MODE=9 DQ=100 423 0.432 422 0.396 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 20122618423269598 10 -100 100 20 on on normal 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100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20122618423269598.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 423 1.191 414 0.634 MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 423 0.980 415 0.556 MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 423 0.778 415 0.461 MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 423 0.594 419 0.465 MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 423 0.452 422 0.415 MODEL 6 MODE=11 DQ=0 423 0.398 422 0.359 MODEL 7 MODE=11 DQ=20 423 0.466 422 0.435 MODEL 8 MODE=11 DQ=40 423 0.615 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