*** 4fdo v/s 4p8l ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 20122614375822011.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 20122614375822011.atom to be opened.
Openam> File opened: 20122614375822011.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3222
Mean number per residue = 7.6
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 39.401541 +/- 12.476867 From: 9.467000 To: 70.239000
= 9.100822 +/- 13.128674 From: -22.938000 To: 36.476000
= 4.352681 +/- 10.774170 From: -22.244000 To: 28.241000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.6771 % Filled.
Pdbmat> 1250756 non-zero elements.
Pdbmat> 136846 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.94 +/- 21.40
Maximum number = 130
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 2.736920E+06
Pdbmat> Larger element = 476.407
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
426 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 20122614375822011.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 20122614375822011.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
20122614375822011.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3222 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 426 residues.
Blocpdb> 19 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 23 atoms in block 2
Block first atom: 20
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 43
Blocpdb> 29 atoms in block 4
Block first atom: 62
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 91
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 110
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 128
Blocpdb> 25 atoms in block 8
Block first atom: 151
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 176
Blocpdb> 23 atoms in block 10
Block first atom: 198
Blocpdb> 19 atoms in block 11
Block first atom: 221
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 240
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 259
Blocpdb> 12 atoms in block 14
Block first atom: 276
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 288
Blocpdb> 24 atoms in block 16
Block first atom: 308
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 332
Blocpdb> 29 atoms in block 18
Block first atom: 348
Blocpdb> 20 atoms in block 19
Block first atom: 377
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 397
Blocpdb> 12 atoms in block 21
Block first atom: 419
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 431
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 454
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 477
Blocpdb> 25 atoms in block 25
Block first atom: 500
Blocpdb> 22 atoms in block 26
Block first atom: 525
Blocpdb> 20 atoms in block 27
Block first atom: 547
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 567
Blocpdb> 24 atoms in block 29
Block first atom: 591
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 615
Blocpdb> 24 atoms in block 31
Block first atom: 631
Blocpdb> 25 atoms in block 32
Block first atom: 655
Blocpdb> 19 atoms in block 33
Block first atom: 680
Blocpdb> 26 atoms in block 34
Block first atom: 699
Blocpdb> 26 atoms in block 35
Block first atom: 725
Blocpdb> 21 atoms in block 36
Block first atom: 751
Blocpdb> 19 atoms in block 37
Block first atom: 772
Blocpdb> 27 atoms in block 38
Block first atom: 791
Blocpdb> 21 atoms in block 39
Block first atom: 818
Blocpdb> 13 atoms in block 40
Block first atom: 839
Blocpdb> 19 atoms in block 41
Block first atom: 852
Blocpdb> 26 atoms in block 42
Block first atom: 871
Blocpdb> 21 atoms in block 43
Block first atom: 897
Blocpdb> 26 atoms in block 44
Block first atom: 918
Blocpdb> 15 atoms in block 45
Block first atom: 944
Blocpdb> 23 atoms in block 46
Block first atom: 959
Blocpdb> 28 atoms in block 47
Block first atom: 982
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 1010
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 1032
Blocpdb> 17 atoms in block 50
Block first atom: 1055
Blocpdb> 24 atoms in block 51
Block first atom: 1072
Blocpdb> 25 atoms in block 52
Block first atom: 1096
Blocpdb> 18 atoms in block 53
Block first atom: 1121
Blocpdb> 18 atoms in block 54
Block first atom: 1139
Blocpdb> 28 atoms in block 55
Block first atom: 1157
Blocpdb> 26 atoms in block 56
Block first atom: 1185
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 1211
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 1226
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 1246
Blocpdb> 27 atoms in block 60
Block first atom: 1265
Blocpdb> 20 atoms in block 61
Block first atom: 1292
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1312
Blocpdb> 20 atoms in block 63
Block first atom: 1336
Blocpdb> 24 atoms in block 64
Block first atom: 1356
Blocpdb> 24 atoms in block 65
Block first atom: 1380
Blocpdb> 20 atoms in block 66
Block first atom: 1404
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1424
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1443
Blocpdb> 24 atoms in block 69
Block first atom: 1465
Blocpdb> 23 atoms in block 70
Block first atom: 1489
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1512
Blocpdb> 20 atoms in block 72
Block first atom: 1530
Blocpdb> 30 atoms in block 73
Block first atom: 1550
Blocpdb> 24 atoms in block 74
Block first atom: 1580
Blocpdb> 30 atoms in block 75
Block first atom: 1604
Blocpdb> 21 atoms in block 76
Block first atom: 1634
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1655
Blocpdb> 24 atoms in block 78
Block first atom: 1673
Blocpdb> 20 atoms in block 79
Block first atom: 1697
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1717
Blocpdb> 26 atoms in block 81
Block first atom: 1735
Blocpdb> 20 atoms in block 82
Block first atom: 1761
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 1781
Blocpdb> 20 atoms in block 84
Block first atom: 1802
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 1822
Blocpdb> 22 atoms in block 86
Block first atom: 1846
Blocpdb> 27 atoms in block 87
Block first atom: 1868
Blocpdb> 5 atoms in block 88
Block first atom: 1895
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1900
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 1916
Blocpdb> 24 atoms in block 91
Block first atom: 1939
Blocpdb> 24 atoms in block 92
Block first atom: 1963
Blocpdb> 24 atoms in block 93
Block first atom: 1987
Blocpdb> 33 atoms in block 94
Block first atom: 2011
Blocpdb> 23 atoms in block 95
Block first atom: 2044
Blocpdb> 23 atoms in block 96
Block first atom: 2067
Blocpdb> 31 atoms in block 97
Block first atom: 2090
Blocpdb> 28 atoms in block 98
Block first atom: 2121
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 2149
Blocpdb> 23 atoms in block 100
Block first atom: 2165
Blocpdb> 30 atoms in block 101
Block first atom: 2188
Blocpdb> 26 atoms in block 102
Block first atom: 2218
Blocpdb> 19 atoms in block 103
Block first atom: 2244
Blocpdb> 20 atoms in block 104
Block first atom: 2263
Blocpdb> 29 atoms in block 105
Block first atom: 2283
Blocpdb> 23 atoms in block 106
Block first atom: 2312
Blocpdb> 19 atoms in block 107
Block first atom: 2335
Blocpdb> 20 atoms in block 108
Block first atom: 2354
Blocpdb> 26 atoms in block 109
Block first atom: 2374
Blocpdb> 25 atoms in block 110
Block first atom: 2400
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 2425
Blocpdb> 28 atoms in block 112
Block first atom: 2451
Blocpdb> 22 atoms in block 113
Block first atom: 2479
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 2501
Blocpdb> 21 atoms in block 115
Block first atom: 2523
Blocpdb> 26 atoms in block 116
Block first atom: 2544
Blocpdb> 25 atoms in block 117
Block first atom: 2570
Blocpdb> 22 atoms in block 118
Block first atom: 2595
Blocpdb> 26 atoms in block 119
Block first atom: 2617
Blocpdb> 24 atoms in block 120
Block first atom: 2643
Blocpdb> 20 atoms in block 121
Block first atom: 2667
Blocpdb> 24 atoms in block 122
Block first atom: 2687
Blocpdb> 22 atoms in block 123
Block first atom: 2711
Blocpdb> 23 atoms in block 124
Block first atom: 2733
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2756
Blocpdb> 24 atoms in block 126
Block first atom: 2782
Blocpdb> 23 atoms in block 127
Block first atom: 2806
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 2829
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 2853
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 2876
Blocpdb> 21 atoms in block 131
Block first atom: 2901
Blocpdb> 26 atoms in block 132
Block first atom: 2922
Blocpdb> 27 atoms in block 133
Block first atom: 2948
Blocpdb> 26 atoms in block 134
Block first atom: 2975
Blocpdb> 31 atoms in block 135
Block first atom: 3001
Blocpdb> 24 atoms in block 136
Block first atom: 3032
Blocpdb> 27 atoms in block 137
Block first atom: 3056
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 3083
Blocpdb> 29 atoms in block 139
Block first atom: 3106
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 3135
Blocpdb> 24 atoms in block 141
Block first atom: 3154
Blocpdb> 28 atoms in block 142
Block first atom: 3178
Blocpdb> 17 atoms in block 143
Block first atom: 3205
Blocpdb> 143 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1250899 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 9666
Prepmat> Matrix trace = 2736920.0000
Prepmat> Last element read: 9666 9666 276.2127
Prepmat> 10297 lines saved.
Prepmat> 8813 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3222
RTB> Total mass = 3222.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3222
RTB> Number of blocks = 143
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 193318.1545
RTB> 51243 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 858
Diagstd> Nb of non-zero elements: 51243
Diagstd> Projected matrix trace = 193318.1545
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 858 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 193318.1545
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.8429682 4.0363016 6.3096251 6.8232700
7.4442330 8.8831673 10.0197940 10.7375720 11.2928773
13.1398344 14.1336262 15.2498900 16.2376241 16.6884033
17.8271178 18.0662841 19.0394247 20.1301603 20.2963354
21.2457227 22.4632248 22.8777051 24.4890590 25.1488604
25.5589719 26.6229143 27.3202099 28.1232253 29.5463382
30.4131872 31.1365377 31.4412335 32.0159580 32.6119062
33.0795284 33.7529594 33.8422216 35.1929713 36.0042356
36.7039455 37.1755643 38.3333027 39.1048377 40.1629472
41.0153464 41.5552304 41.9292159 43.2185033 44.1931926
45.2075030 45.8277206 46.3770349 47.3054147 47.8471166
48.7291400 49.4542767 50.8911845 51.1559197 51.9995757
52.6917933 53.0872123 54.2898129 54.6627443 55.6456734
56.4192601 56.6264408 56.9207632 58.1619118 58.8493377
59.3278523 59.8666791 60.6126135 61.1546950 61.7266179
62.2948790 63.0835742 63.7108388 64.4855527 65.5515178
66.2318948 66.6467805 66.9650306 67.6793461 68.6007480
69.4532234 69.9748970 70.2859949 70.9689596 71.7096179
72.2107129 72.6446442 73.2510134 73.7100052 74.1269085
74.4160697 75.0302099 75.2986971 76.4776776 77.3898841
77.9098409
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034333 0.0034336 0.0034346 0.0034347
0.0034362 212.8769669 218.1660069 272.7702853 283.6557295
296.2819939 323.6526752 343.7357292 355.8347220 364.9199321
393.6318455 408.2461341 424.0612956 437.5790509 443.6113746
458.4963124 461.5616293 473.8296033 487.2130326 489.2198795
500.5310624 514.6729361 519.3994784 537.3797894 544.5709064
548.9932071 560.3031668 567.5933468 575.8744934 590.2651086
598.8612990 605.9411394 608.8987302 614.4386571 620.1309003
624.5611053 630.8864629 631.7201252 644.2037492 651.5864997
657.8875317 662.1007273 672.3314079 679.0637138 688.1895405
695.4541005 700.0162590 703.1591798 713.8880984 721.8932300
730.1305827 735.1219805 739.5146287 746.8797889 751.1439368
758.0356903 763.6550140 774.6696825 776.6819791 783.0602528
788.2550653 791.2072180 800.1187593 802.8621722 810.0484244
815.6596406 817.1558857 819.2767638 828.1606993 833.0404117
836.4203558 840.2100348 845.4283077 849.2003852 853.1620349
857.0801826 862.4887246 866.7661487 872.0200960 879.1979284
883.7488672 886.5125085 888.6266143 893.3535289 899.4141295
904.9852142 908.3775956 910.3946119 914.8070430 919.5682847
922.7755876 925.5440232 929.3987818 932.3060472 934.9388881
936.7606621 940.6181639 942.2996091 949.6479301 955.2947224
958.4985032
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3222
Rtb_to_modes> Number of blocs = 143
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.91
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003
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0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000
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0.99997
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 57996 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
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1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999
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0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999
0.99997
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122614375822011.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122614375822011.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 20122614375822011.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122614375822011.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3222
Mean number per residue = 7.6
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.843
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.036
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.310
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.444
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.91
Bfactors> 106 vectors, 9666 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.843000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.632 for 426 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.018 +/- 0.03
Bfactors> = 27.028 +/- 12.91
Bfactors> Shiftng-fct= 27.010
Bfactors> Scaling-fct= 504.206
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20122614375822011.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122614375822011.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.5
Chkmod> 106 vectors, 9666 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3222 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7912
0.0034 0.7612
0.0034 0.9776
0.0034 0.7575
0.0034 0.8055
0.0034 0.7747
212.8687 0.3714
218.1485 0.4960
272.7667 0.0912
283.6379 0.5039
296.2646 0.4795
323.6357 0.3098
343.7245 0.5106
355.8597 0.7592
364.8578 0.7229
393.6174 0.3792
408.1762 0.4651
424.0446 0.6346
437.5923 0.6489
443.6136 0.5481
458.5137 0.2184
461.5893 0.3505
473.8164 0.3489
487.1902 0.2063
489.2430 0.5413
500.5600 0.4017
514.6139 0.5406
519.4032 0.4397
537.3670 0.3936
544.5599 0.3803
548.9807 0.5693
560.2484 0.5656
567.5668 0.6211
575.8168 0.4086
590.2763 0.4655
598.8042 0.4891
605.9488 0.4202
608.8606 0.5401
614.4511 0.4777
620.0862 0.5534
624.5387 0.5801
630.8317 0.4780
631.6723 0.4759
644.1489 0.5930
651.5202 0.4612
657.8239 0.4238
662.1118 0.3992
672.2736 0.4814
678.9926 0.4614
688.1347 0.4281
695.4637 0.3971
700.0264 0.5824
703.1356 0.3876
713.8698 0.5405
721.8362 0.5205
730.1194 0.4566
735.1087 0.5033
739.5065 0.5642
746.8839 0.5505
751.1343 0.5675
758.0098 0.5435
763.5892 0.5329
774.6274 0.6325
776.6796 0.5276
783.0298 0.4789
788.2078 0.5734
791.1940 0.4861
800.0858 0.5687
802.8076 0.3868
810.0451 0.4887
815.6300 0.4587
817.1465 0.4192
819.2361 0.4833
828.1115 0.4893
833.0093 0.5270
836.3996 0.5017
840.1973 0.5139
845.3738 0.5963
849.1313 0.5071
853.1488 0.5125
857.0098 0.5072
862.4273 0.5052
866.7232 0.5667
872.0127 0.5211
879.1500 0.5282
883.6983 0.5326
886.4959 0.4465
888.6214 0.4820
893.3195 0.5878
899.3706 0.4330
904.9254 0.3731
908.3068 0.3033
910.3815 0.4068
914.7745 0.4321
919.5313 0.4052
922.7314 0.4257
925.4747 0.2965
929.3525 0.2691
932.2660 0.5115
934.9182 0.4854
936.7452 0.3965
940.5765 0.4867
942.2673 0.5807
949.6216 0.4334
955.2544 0.5060
958.4583 0.4924
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 20122614375822011.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20122614375822011.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 20122614375822011.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20122614375822011.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 20122614375822011.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
20122614375822011.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 955.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.5
Projmod> 106 vectors, 9666 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 426
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3222
Mean number per residue = 7.6
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 876
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6730
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
Projmod> All atoms of first conformer were found in second one.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 3222 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 71.20
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.170 Sum= 0.029 q= 686.1597
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.338 Sum= 0.143 q= -1365.1337
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.340 Sum= 0.258 q= 1372.8054
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.213 Sum= 0.304 q= -859.3621
Vector: 5 F= 0.00 Cos= -0.735 Sum= 0.843 q= -2969.0964
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.057 Sum= 0.847 q= -231.9235
Vector: 7 F= 212.87 Cos= -0.004 Sum= 0.847 q= -17.8580
Vector: 8 F= 218.15 Cos= 0.049 Sum= 0.849 q= 198.6894
Vector: 9 F= 272.77 Cos= 0.039 Sum= 0.850 q= 158.9839
Vector: 10 F= 283.64 Cos= -0.012 Sum= 0.851 q= -46.8125
Vector: 11 F= 296.26 Cos= 0.034 Sum= 0.852 q= 136.4854
Vector: 12 F= 323.64 Cos= -0.087 Sum= 0.859 q= -350.3521
Vector: 13 F= 343.72 Cos= -0.061 Sum= 0.863 q= -246.9049
Vector: 14 F= 355.86 Cos= -0.151 Sum= 0.886 q= -609.5760
Vector: 15 F= 364.86 Cos= -0.007 Sum= 0.886 q= -26.4474
Vector: 16 F= 393.62 Cos= 0.042 Sum= 0.888 q= 168.3322
Vector: 17 F= 408.18 Cos= -0.065 Sum= 0.892 q= -260.8927
Vector: 18 F= 424.04 Cos= 0.043 Sum= 0.894 q= 172.8008
Vector: 19 F= 437.59 Cos= -0.118 Sum= 0.908 q= -478.7319
Vector: 20 F= 443.61 Cos= 0.106 Sum= 0.919 q= 429.4034
%Projmod-Wn> Eigenvector 21 Norm= 1.0001
Vector: 21 F= 458.51 Cos= 0.015 Sum= 0.919 q= 60.6387
Vector: 22 F= 461.59 Cos= -0.049 Sum= 0.921 q= -197.5809
Vector: 23 F= 473.82 Cos= 0.035 Sum= 0.923 q= 142.8958
Vector: 24 F= 487.19 Cos= 0.020 Sum= 0.923 q= 82.0621
Vector: 25 F= 489.24 Cos= -0.025 Sum= 0.924 q= -102.1931
Vector: 26 F= 500.56 Cos= 0.019 Sum= 0.924 q= 76.6252
Vector: 27 F= 514.61 Cos= 0.086 Sum= 0.932 q= 347.8443
Vector: 28 F= 519.40 Cos= -0.007 Sum= 0.932 q= -27.9144
Vector: 29 F= 537.37 Cos= -0.056 Sum= 0.935 q= -225.9854
Vector: 30 F= 544.56 Cos= -0.063 Sum= 0.939 q= -255.6142
Vector: 31 F= 548.98 Cos= -0.006 Sum= 0.939 q= -22.4281
Vector: 32 F= 560.25 Cos= 0.017 Sum= 0.939 q= 67.8519
Vector: 33 F= 567.57 Cos= 0.032 Sum= 0.940 q= 129.8498
Vector: 34 F= 575.82 Cos= -0.014 Sum= 0.940 q= -56.2983
Vector: 35 F= 590.28 Cos= -0.001 Sum= 0.940 q= -2.9916
Vector: 36 F= 598.80 Cos= -0.022 Sum= 0.941 q= -89.0914
Vector: 37 F= 605.95 Cos= 0.023 Sum= 0.941 q= 93.5322
Vector: 38 F= 608.86 Cos= -0.011 Sum= 0.941 q= -45.8134
Vector: 39 F= 614.45 Cos= 0.046 Sum= 0.944 q= 185.6198
Vector: 40 F= 620.09 Cos= 0.029 Sum= 0.944 q= 116.9264
Vector: 41 F= 624.54 Cos= 0.111 Sum= 0.957 q= 450.1219
Vector: 42 F= 630.83 Cos= -0.018 Sum= 0.957 q= -70.8666
Vector: 43 F= 631.67 Cos= -0.022 Sum= 0.958 q= -87.0335
Vector: 44 F= 644.15 Cos= 0.029 Sum= 0.958 q= 115.9306
Vector: 45 F= 651.52 Cos= -0.040 Sum= 0.960 q= -162.6663
Vector: 46 F= 657.82 Cos= 0.008 Sum= 0.960 q= 33.0009
Vector: 47 F= 662.11 Cos= -0.011 Sum= 0.960 q= -45.6715
Vector: 48 F= 672.27 Cos= -0.045 Sum= 0.962 q= -183.7948
Vector: 49 F= 678.99 Cos= -0.007 Sum= 0.962 q= -28.6173
Vector: 50 F= 688.13 Cos= -0.010 Sum= 0.962 q= -40.3845
Vector: 51 F= 695.46 Cos= -0.008 Sum= 0.962 q= -34.3197
Vector: 52 F= 700.03 Cos= -0.003 Sum= 0.962 q= -13.4771
Vector: 53 F= 703.14 Cos= 0.030 Sum= 0.963 q= 123.0760
Vector: 54 F= 713.87 Cos= 0.064 Sum= 0.967 q= 257.0085
Vector: 55 F= 721.84 Cos= 0.036 Sum= 0.969 q= 146.1900
Vector: 56 F= 730.12 Cos= -0.014 Sum= 0.969 q= -55.8233
Vector: 57 F= 735.11 Cos= 0.010 Sum= 0.969 q= 40.7451
Vector: 58 F= 739.51 Cos= 0.055 Sum= 0.972 q= 222.3729
Vector: 59 F= 746.88 Cos= -0.003 Sum= 0.972 q= -11.2106
Vector: 60 F= 751.13 Cos= 0.019 Sum= 0.972 q= 75.4603
Vector: 61 F= 758.01 Cos= 0.035 Sum= 0.974 q= 140.7854
Vector: 62 F= 763.59 Cos= -0.020 Sum= 0.974 q= -82.0751
Vector: 63 F= 774.63 Cos= -0.002 Sum= 0.974 q= -9.2049
Vector: 64 F= 776.68 Cos= 0.019 Sum= 0.974 q= 75.2476
Vector: 65 F= 783.03 Cos= -0.018 Sum= 0.975 q= -74.3383
Vector: 66 F= 788.21 Cos= 0.045 Sum= 0.977 q= 180.4236
Vector: 67 F= 791.19 Cos= 0.010 Sum= 0.977 q= 39.5770
Vector: 68 F= 800.09 Cos= -0.010 Sum= 0.977 q= -41.0587
Vector: 69 F= 802.81 Cos= 0.023 Sum= 0.977 q= 93.2294
Vector: 70 F= 810.05 Cos= -0.028 Sum= 0.978 q= -112.1152
Vector: 71 F= 815.63 Cos= 0.031 Sum= 0.979 q= 126.7256
Vector: 72 F= 817.15 Cos= 0.028 Sum= 0.980 q= 111.2505
Vector: 73 F= 819.24 Cos= 0.043 Sum= 0.982 q= 175.7156
Vector: 74 F= 828.11 Cos= 0.005 Sum= 0.982 q= 18.8025
Vector: 75 F= 833.01 Cos= -0.011 Sum= 0.982 q= -43.3235
Vector: 76 F= 836.40 Cos= -0.008 Sum= 0.982 q= -32.3370
Vector: 77 F= 840.20 Cos= 0.014 Sum= 0.982 q= 55.1590
Vector: 78 F= 845.37 Cos= -0.020 Sum= 0.983 q= -82.3256
Vector: 79 F= 849.13 Cos= -0.036 Sum= 0.984 q= -146.0128
Vector: 80 F= 853.15 Cos= 0.014 Sum= 0.984 q= 57.8338
Vector: 81 F= 857.01 Cos= 0.002 Sum= 0.984 q= 9.4321
Vector: 82 F= 862.43 Cos= 0.015 Sum= 0.984 q= 60.4827
Vector: 83 F= 866.72 Cos= -0.002 Sum= 0.984 q= -9.2305
Vector: 84 F= 872.01 Cos= -0.004 Sum= 0.984 q= -15.5029
Vector: 85 F= 879.15 Cos= 0.008 Sum= 0.984 q= 31.4762
Vector: 86 F= 883.70 Cos= 0.018 Sum= 0.985 q= 72.4937
Vector: 87 F= 886.50 Cos= 0.019 Sum= 0.985 q= 78.0892
Vector: 88 F= 888.62 Cos= 0.004 Sum= 0.985 q= 15.7305
Vector: 89 F= 893.32 Cos= 0.000 Sum= 0.985 q= 0.7972
Vector: 90 F= 899.37 Cos= 0.002 Sum= 0.985 q= 6.6708
Vector: 91 F= 904.93 Cos= -0.016 Sum= 0.985 q= -63.3950
Vector: 92 F= 908.31 Cos= 0.012 Sum= 0.986 q= 48.2200
Vector: 93 F= 910.38 Cos= -0.022 Sum= 0.986 q= -89.2221
Vector: 94 F= 914.77 Cos= 0.010 Sum= 0.986 q= 41.3104
Vector: 95 F= 919.53 Cos= 0.001 Sum= 0.986 q= 5.3169
Vector: 96 F= 922.73 Cos= -0.002 Sum= 0.986 q= -6.0974
Vector: 97 F= 925.47 Cos= -0.018 Sum= 0.986 q= -72.3823
Vector: 98 F= 929.35 Cos= 0.004 Sum= 0.987 q= 17.7018
Vector: 99 F= 932.27 Cos= -0.022 Sum= 0.987 q= -86.9838
Vector: 100 F= 934.92 Cos= -0.012 Sum= 0.987 q= -46.8894
Vector: 101 F= 936.75 Cos= 0.019 Sum= 0.987 q= 75.3361
Vector: 102 F= 940.58 Cos= -0.009 Sum= 0.988 q= -38.1675
Vector: 103 F= 942.27 Cos= 0.003 Sum= 0.988 q= 11.5689
Vector: 104 F= 949.62 Cos= 0.012 Sum= 0.988 q= 47.7177
Vector: 105 F= 955.25 Cos= -0.002 Sum= 0.988 q= -7.4839
Vector: 106 F= 958.46 Cos= -0.007 Sum= 0.988 q= -27.5657
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003433
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003436
Projmod> Lowest non-zero frequency : 212.868710
Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.73 for mode 5 with F= 0.00 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.540 0.769 0.866 0.904 0.923 0.988
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 20122614375822011 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
making animated gifs
11 models are in 20122614375822011.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 426 2.297 368 1.341
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 426 2.013 388 1.244
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 426 1.759 400 1.093
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 426 1.548 405 0.878
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 426 1.401 407 0.637
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 426 1.373 408 0.499
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 426 1.497 409 0.726
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 426 1.690 405 0.965
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 426 1.934 395 1.124
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 426 2.210 389 1.319
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 20122614375822011 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
making animated gifs
11 models are in 20122614375822011.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 426 2.140 388 1.403
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 426 1.873 399 1.215
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 426 1.642 407 0.987
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 426 1.463 408 0.715
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 426 1.356 407 0.487
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 426 1.415 409 0.672
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 426 1.571 409 0.939
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 426 1.786 405 1.193
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 426 2.041 387 1.302
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 426 2.323 371 1.445
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 20122614375822011 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
making animated gifs
11 models are in 20122614375822011.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 426 2.342 393 1.130
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 426 2.032 403 1.028
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 426 1.756 406 0.854
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 426 1.531 407 0.681
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 426 1.383 407 0.531
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 426 1.407 408 0.521
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 426 1.573 407 0.652
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 426 1.811 406 0.826
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 426 2.096 401 0.955
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 426 2.411 395 1.092
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 20122614375822011 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
making animated gifs
11 models are in 20122614375822011.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20122614375822011.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 426 2.226 385 1.362
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 426 1.951 396 1.170
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 426 1.707 402 0.948
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 426 1.511 407 0.754
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 426 1.381 408 0.552
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 426 1.339 408 0.478
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 426 1.391 408 0.620
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 426 1.528 408 0.885
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 426 1.730 404 1.148
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 426 1.978 392 1.349
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 426 2.255 376 1.507
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 20122614375822011 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20122614375822011.eigenfacs
20122614375822011.atom
making animated gifs
11 models are in 20122614375822011.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 426 2.191 385 1.495
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 426 1.915 397 1.304
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MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 426 1.366 407 0.565
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MODEL 9 MODE=11 DQ=60 426 1.779 407 1.114
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 426 2.037 389 1.268
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 426 2.324 374 1.405
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20122614375822011.11.pdb
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user 0m10.172s
sys 0m0.028s
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elNémo
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by Karsten Suhre.
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