*** 4P8L V/S 4FDO ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 201226135454138664.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 201226135454138664.atom to be opened.
Openam> File opened: 201226135454138664.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 876
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6730
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.793578 +/- 20.862812 From: -48.990000 To: 41.272000
= -15.938372 +/- 12.997297 From: -55.208000 To: 18.031000
= 19.670768 +/- 21.987925 From: -26.144000 To: 64.914000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.2634 % Filled.
Pdbmat> 2575076 non-zero elements.
Pdbmat> 281679 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.71 +/- 22.15
Maximum number = 130
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 5.633580E+06
Pdbmat> Larger element = 488.544
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
876 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 201226135454138664.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 201226135454138664.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
201226135454138664.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6730 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 876 residues.
Blocpdb> 30 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 38 atoms in block 2
Block first atom: 31
Blocpdb> 40 atoms in block 3
Block first atom: 69
Blocpdb> 30 atoms in block 4
Block first atom: 109
Blocpdb> 41 atoms in block 5
Block first atom: 139
Blocpdb> 37 atoms in block 6
Block first atom: 180
Blocpdb> 36 atoms in block 7
Block first atom: 217
Blocpdb> 37 atoms in block 8
Block first atom: 253
Blocpdb> 29 atoms in block 9
Block first atom: 290
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 319
Blocpdb> 33 atoms in block 11
Block first atom: 352
Blocpdb> 37 atoms in block 12
Block first atom: 385
Blocpdb> 29 atoms in block 13
Block first atom: 422
Blocpdb> 39 atoms in block 14
Block first atom: 451
Blocpdb> 37 atoms in block 15
Block first atom: 490
Blocpdb> 40 atoms in block 16
Block first atom: 527
Blocpdb> 37 atoms in block 17
Block first atom: 567
Blocpdb> 36 atoms in block 18
Block first atom: 604
Blocpdb> 35 atoms in block 19
Block first atom: 640
Blocpdb> 39 atoms in block 20
Block first atom: 675
Blocpdb> 35 atoms in block 21
Block first atom: 714
Blocpdb> 43 atoms in block 22
Block first atom: 749
Blocpdb> 37 atoms in block 23
Block first atom: 792
Blocpdb> 34 atoms in block 24
Block first atom: 829
Blocpdb> 28 atoms in block 25
Block first atom: 863
Blocpdb> 39 atoms in block 26
Block first atom: 891
Blocpdb> 39 atoms in block 27
Block first atom: 930
Blocpdb> 33 atoms in block 28
Block first atom: 969
Blocpdb> 42 atoms in block 29
Block first atom: 1002
Blocpdb> 36 atoms in block 30
Block first atom: 1044
Blocpdb> 40 atoms in block 31
Block first atom: 1080
Blocpdb> 39 atoms in block 32
Block first atom: 1120
Blocpdb> 35 atoms in block 33
Block first atom: 1159
Blocpdb> 45 atoms in block 34
Block first atom: 1194
Blocpdb> 27 atoms in block 35
Block first atom: 1239
Blocpdb> 35 atoms in block 36
Block first atom: 1266
Blocpdb> 39 atoms in block 37
Block first atom: 1301
Blocpdb> 38 atoms in block 38
Block first atom: 1340
Blocpdb> 41 atoms in block 39
Block first atom: 1378
Blocpdb> 33 atoms in block 40
Block first atom: 1419
Blocpdb> 33 atoms in block 41
Block first atom: 1452
Blocpdb> 37 atoms in block 42
Block first atom: 1485
Blocpdb> 36 atoms in block 43
Block first atom: 1522
Blocpdb> 43 atoms in block 44
Block first atom: 1558
Blocpdb> 36 atoms in block 45
Block first atom: 1601
Blocpdb> 46 atoms in block 46
Block first atom: 1637
Blocpdb> 34 atoms in block 47
Block first atom: 1683
Blocpdb> 33 atoms in block 48
Block first atom: 1717
Blocpdb> 39 atoms in block 49
Block first atom: 1750
Blocpdb> 36 atoms in block 50
Block first atom: 1789
Blocpdb> 38 atoms in block 51
Block first atom: 1825
Blocpdb> 41 atoms in block 52
Block first atom: 1863
Blocpdb> 41 atoms in block 53
Block first atom: 1904
Blocpdb> 39 atoms in block 54
Block first atom: 1945
Blocpdb> 41 atoms in block 55
Block first atom: 1984
Blocpdb> 32 atoms in block 56
Block first atom: 2025
Blocpdb> 47 atoms in block 57
Block first atom: 2057
Blocpdb> 32 atoms in block 58
Block first atom: 2104
Blocpdb> 54 atoms in block 59
Block first atom: 2136
Blocpdb> 40 atoms in block 60
Block first atom: 2190
Blocpdb> 37 atoms in block 61
Block first atom: 2230
Blocpdb> 47 atoms in block 62
Block first atom: 2267
Blocpdb> 41 atoms in block 63
Block first atom: 2314
Blocpdb> 46 atoms in block 64
Block first atom: 2355
Blocpdb> 39 atoms in block 65
Block first atom: 2401
Blocpdb> 37 atoms in block 66
Block first atom: 2440
Blocpdb> 47 atoms in block 67
Block first atom: 2477
Blocpdb> 35 atoms in block 68
Block first atom: 2524
Blocpdb> 46 atoms in block 69
Block first atom: 2559
Blocpdb> 35 atoms in block 70
Block first atom: 2605
Blocpdb> 34 atoms in block 71
Block first atom: 2640
Blocpdb> 45 atoms in block 72
Block first atom: 2674
Blocpdb> 46 atoms in block 73
Block first atom: 2719
Blocpdb> 39 atoms in block 74
Block first atom: 2765
Blocpdb> 37 atoms in block 75
Block first atom: 2804
Blocpdb> 40 atoms in block 76
Block first atom: 2841
Blocpdb> 37 atoms in block 77
Block first atom: 2881
Blocpdb> 43 atoms in block 78
Block first atom: 2918
Blocpdb> 36 atoms in block 79
Block first atom: 2961
Blocpdb> 38 atoms in block 80
Block first atom: 2997
Blocpdb> 46 atoms in block 81
Block first atom: 3035
Blocpdb> 38 atoms in block 82
Block first atom: 3081
Blocpdb> 41 atoms in block 83
Block first atom: 3119
Blocpdb> 36 atoms in block 84
Block first atom: 3160
Blocpdb> 42 atoms in block 85
Block first atom: 3196
Blocpdb> 45 atoms in block 86
Block first atom: 3238
Blocpdb> 45 atoms in block 87
Block first atom: 3283
Blocpdb> 45 atoms in block 88
Block first atom: 3328
Blocpdb> 41 atoms in block 89
Block first atom: 3373
Blocpdb> 38 atoms in block 90
Block first atom: 3414
Blocpdb> 44 atoms in block 91
Block first atom: 3452
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 3496
Blocpdb> 33 atoms in block 93
Block first atom: 3513
Blocpdb> 44 atoms in block 94
Block first atom: 3546
Blocpdb> 34 atoms in block 95
Block first atom: 3590
Blocpdb> 33 atoms in block 96
Block first atom: 3624
Blocpdb> 41 atoms in block 97
Block first atom: 3657
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 3698
Blocpdb> 37 atoms in block 99
Block first atom: 3735
Blocpdb> 31 atoms in block 100
Block first atom: 3772
Blocpdb> 28 atoms in block 101
Block first atom: 3803
Blocpdb> 36 atoms in block 102
Block first atom: 3831
Blocpdb> 37 atoms in block 103
Block first atom: 3867
Blocpdb> 38 atoms in block 104
Block first atom: 3904
Blocpdb> 27 atoms in block 105
Block first atom: 3942
Blocpdb> 38 atoms in block 106
Block first atom: 3969
Blocpdb> 41 atoms in block 107
Block first atom: 4007
Blocpdb> 35 atoms in block 108
Block first atom: 4048
Blocpdb> 39 atoms in block 109
Block first atom: 4083
Blocpdb> 32 atoms in block 110
Block first atom: 4122
Blocpdb> 41 atoms in block 111
Block first atom: 4154
Blocpdb> 35 atoms in block 112
Block first atom: 4195
Blocpdb> 44 atoms in block 113
Block first atom: 4230
Blocpdb> 36 atoms in block 114
Block first atom: 4274
Blocpdb> 38 atoms in block 115
Block first atom: 4310
Blocpdb> 27 atoms in block 116
Block first atom: 4348
Blocpdb> 35 atoms in block 117
Block first atom: 4375
Blocpdb> 41 atoms in block 118
Block first atom: 4410
Blocpdb> 31 atoms in block 119
Block first atom: 4451
Blocpdb> 40 atoms in block 120
Block first atom: 4482
Blocpdb> 41 atoms in block 121
Block first atom: 4522
Blocpdb> 32 atoms in block 122
Block first atom: 4563
Blocpdb> 46 atoms in block 123
Block first atom: 4595
Blocpdb> 34 atoms in block 124
Block first atom: 4641
Blocpdb> 41 atoms in block 125
Block first atom: 4675
Blocpdb> 37 atoms in block 126
Block first atom: 4716
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 4753
Blocpdb> 39 atoms in block 128
Block first atom: 4784
Blocpdb> 37 atoms in block 129
Block first atom: 4823
Blocpdb> 34 atoms in block 130
Block first atom: 4860
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 4894
Blocpdb> 34 atoms in block 132
Block first atom: 4935
Blocpdb> 36 atoms in block 133
Block first atom: 4969
Blocpdb> 38 atoms in block 134
Block first atom: 5005
Blocpdb> 33 atoms in block 135
Block first atom: 5043
Blocpdb> 47 atoms in block 136
Block first atom: 5076
Blocpdb> 42 atoms in block 137
Block first atom: 5123
Blocpdb> 32 atoms in block 138
Block first atom: 5165
Blocpdb> 35 atoms in block 139
Block first atom: 5197
Blocpdb> 34 atoms in block 140
Block first atom: 5232
Blocpdb> 39 atoms in block 141
Block first atom: 5266
Blocpdb> 40 atoms in block 142
Block first atom: 5305
Blocpdb> 40 atoms in block 143
Block first atom: 5345
Blocpdb> 39 atoms in block 144
Block first atom: 5385
Blocpdb> 31 atoms in block 145
Block first atom: 5424
Blocpdb> 47 atoms in block 146
Block first atom: 5455
Blocpdb> 37 atoms in block 147
Block first atom: 5502
Blocpdb> 43 atoms in block 148
Block first atom: 5539
Blocpdb> 41 atoms in block 149
Block first atom: 5582
Blocpdb> 40 atoms in block 150
Block first atom: 5623
Blocpdb> 44 atoms in block 151
Block first atom: 5663
Blocpdb> 42 atoms in block 152
Block first atom: 5707
Blocpdb> 36 atoms in block 153
Block first atom: 5749
Blocpdb> 46 atoms in block 154
Block first atom: 5785
Blocpdb> 36 atoms in block 155
Block first atom: 5831
Blocpdb> 37 atoms in block 156
Block first atom: 5867
Blocpdb> 40 atoms in block 157
Block first atom: 5904
Blocpdb> 43 atoms in block 158
Block first atom: 5944
Blocpdb> 40 atoms in block 159
Block first atom: 5987
Blocpdb> 39 atoms in block 160
Block first atom: 6027
Blocpdb> 41 atoms in block 161
Block first atom: 6066
Blocpdb> 40 atoms in block 162
Block first atom: 6107
Blocpdb> 36 atoms in block 163
Block first atom: 6147
Blocpdb> 39 atoms in block 164
Block first atom: 6183
Blocpdb> 42 atoms in block 165
Block first atom: 6222
Blocpdb> 46 atoms in block 166
Block first atom: 6264
Blocpdb> 39 atoms in block 167
Block first atom: 6310
Blocpdb> 35 atoms in block 168
Block first atom: 6349
Blocpdb> 39 atoms in block 169
Block first atom: 6384
Blocpdb> 41 atoms in block 170
Block first atom: 6423
Blocpdb> 45 atoms in block 171
Block first atom: 6464
Blocpdb> 44 atoms in block 172
Block first atom: 6509
Blocpdb> 46 atoms in block 173
Block first atom: 6553
Blocpdb> 44 atoms in block 174
Block first atom: 6599
Blocpdb> 32 atoms in block 175
Block first atom: 6643
Blocpdb> 47 atoms in block 176
Block first atom: 6675
Blocpdb> 9 atoms in block 177
Block first atom: 6721
Blocpdb> 177 blocks.
Blocpdb> At most, 54 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2575253 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 20190
Prepmat> Matrix trace = 5633580.0000
Prepmat> Last element read: 20190 20190 219.1205
Prepmat> 15754 lines saved.
Prepmat> 14117 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6730
RTB> Total mass = 6730.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6730
RTB> Number of blocks = 177
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 212228.0980
RTB> 56241 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1062
Diagstd> Nb of non-zero elements: 56241
Diagstd> Projected matrix trace = 212228.0980
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1062 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 212228.0980
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1920589 0.2153678 0.2697186 1.5159027
1.7927074 1.8249948 2.5512271 3.0804314 3.6323108
4.6165971 4.6721895 5.2777707 5.8512652 6.4898583
6.7073648 7.0949180 7.5394194 8.1365904 8.5627545
9.2520701 9.5811151 10.6343896 10.9955606 11.2157699
11.7971812 12.0713757 12.7376025 13.2767931 13.5558584
14.1582426 14.4444570 15.4037811 16.5067905 16.7698995
17.3305338 17.6484241 18.1668914 18.4346325 19.2647221
19.6124923 19.9677273 20.5450162 20.6399882 20.9293264
21.2201741 21.4007080 21.6905663 22.1952350 23.1407221
23.6089871 23.9137686 25.0190471 25.3430312 25.7104787
25.8667089 26.5945477 26.7696640 27.5002039 27.9853794
28.4790790 28.7920935 29.2288951 29.7983859 29.8599267
30.6019205 31.3565768 31.4955682 31.8228938 32.5333164
33.0940819 33.3348273 33.4749534 34.0550261 34.5978446
34.7287974 35.0628972 35.4302073 35.8642072 36.0453213
37.5156614 37.8272323 39.0077320 39.0279130 39.5055737
39.6864147 40.4137968 40.5775373 41.0961474 41.5114987
41.7179862 42.1801809 42.3448120 42.7331991 43.2539261
44.1290991 44.2526428 45.2982260 45.7079442 46.2378748
46.5208709
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034313 0.0034316 0.0034334 0.0034335 0.0034335
0.0034342 47.5896489 50.3947919 56.3963163 133.6998591
145.3951717 146.6986415 173.4482177 190.5904121 206.9601737
233.3223101 234.7229242 249.4712699 262.6758651 276.6386688
281.2362143 289.2470706 298.1701964 309.7537032 317.7620486
330.3046875 336.1269293 354.1209037 360.0841200 363.6719675
372.9790214 377.2885825 387.5601604 395.6779726 399.8147310
408.6014989 412.7108534 426.1955875 441.1909553 444.6932229
452.0653810 456.1926104 462.8450142 466.2432122 476.6248204
480.9076367 485.2433575 492.2078371 493.3441726 496.7900694
500.2300199 502.3534063 505.7439843 511.5936603 522.3766231
527.6354394 531.0302875 543.1636058 546.6691419 550.6179458
552.2883317 560.0045868 561.8452843 569.4600172 574.4614362
579.5064187 582.6824029 587.0856693 592.7774179 593.3892151
600.7165835 608.0784361 609.4246327 612.5832460 619.3832391
624.6984792 626.9665708 628.2829455 633.7031834 638.7336588
639.9413196 643.0121506 646.3713925 650.3181839 651.9581684
665.1224152 667.8786548 678.2200587 678.3954776 682.5342772
684.0946807 690.3353405 691.7324083 696.1387923 699.6478225
701.3857668 705.2604003 706.6353912 709.8686284 714.1805970
721.3695579 722.3786240 730.8628335 734.1606861 738.4042923
740.6605244
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6730
Rtb_to_modes> Number of blocs = 177
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.53
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
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1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000
0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00006 1.00004 0.99999 1.00002
0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 0.99997
1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
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1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
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1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002
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0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 121140 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
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0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
0.99998 1.00006 1.00004 0.99999 1.00002
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1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999
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0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
0.99995 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999
1.00003 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002
1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001
0.99998 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201226135454138664.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226135454138664.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 201226135454138664.atom
Openam> file on opening on unit 11:
201226135454138664.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 876
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6730
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9843E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9862E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1921
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2154
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2697
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.516
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.793
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.551
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52
Bfactors> 106 vectors, 20190 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.192100
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.581 for 876 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.048 +/- 0.04
Bfactors> = 37.434 +/- 13.02
Bfactors> Shiftng-fct= 37.387
Bfactors> Scaling-fct= 364.450
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 201226135454138664.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226135454138664.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6
Chkmod> 106 vectors, 20190 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6730 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7211
0.0034 0.7081
0.0034 0.6865
0.0034 0.7489
0.0034 0.9046
0.0034 0.9829
47.5927 0.7347
50.3964 0.6660
56.3919 0.7753
133.6984 0.7135
145.4008 0.2746
146.6926 0.8416
173.4331 0.2966
190.5689 0.4364
206.9424 0.0843
233.3225 0.3759
234.7081 0.4603
249.4660 0.0781
262.6586 0.4975
276.6298 0.4978
281.2165 0.1067
289.2363 0.4136
298.1491 0.3443
309.7482 0.3095
317.7530 0.2424
330.2893 0.2482
336.1105 0.1160
354.0326 0.2809
360.1413 0.4341
363.7249 0.4919
373.0076 0.5861
377.2509 0.4448
387.5800 0.6885
395.7088 0.3244
399.8586 0.2599
408.6093 0.2688
412.6295 0.2755
426.1250 0.2623
441.2149 0.4471
444.6755 0.3178
452.0390 0.5262
456.1934 0.2841
462.8647 0.3539
466.1646 0.4586
476.5459 0.2296
480.8564 0.1647
485.2501 0.2480
492.2464 0.4349
493.3231 0.2382
496.7767 0.2145
500.2065 0.2927
502.3235 0.4927
505.7157 0.3790
511.6266 0.3866
522.3460 0.4309
527.6241 0.3462
530.9656 0.4739
543.1506 0.1989
546.6130 0.4423
550.5892 0.4435
552.2998 0.3464
559.9327 0.4202
561.8247 0.5113
569.4335 0.5529
574.4842 0.3284
579.4909 0.2459
582.6362 0.5406
587.0716 0.1904
592.7680 0.5329
593.3645 0.5290
600.6719 0.4704
608.0855 0.5626
609.4413 0.3490
612.5291 0.3681
619.3251 0.3557
624.6331 0.4706
626.8943 0.4700
628.2095 0.4830
633.7223 0.4801
638.7261 0.2276
639.9249 0.3286
642.9580 0.4169
646.3418 0.5848
650.2521 0.4980
651.9725 0.5930
665.1323 0.5012
667.8744 0.3668
678.2107 0.3490
678.3845 0.5219
682.5432 0.3996
684.0962 0.5103
690.2733 0.4623
691.7237 0.4610
696.1415 0.4502
699.6052 0.4262
701.3726 0.3882
705.2286 0.3641
706.5649 0.5132
709.8116 0.2133
714.1175 0.4944
721.3460 0.3459
722.3260 0.4614
730.8458 0.4395
734.1457 0.2642
738.3896 0.5473
740.6218 0.4696
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 201226135454138664.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
201226135454138664.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 201226135454138664.atom
Openam> file on opening on unit 11:
201226135454138664.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 201226135454138664.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
201226135454138664.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6
Projmod> 106 vectors, 20190 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 876
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6730
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 829
First residue number = 8
Last residue number = 461
Number of atoms found = 6370
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 201226135454138664 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
making animated gifs
11 models are in 201226135454138664.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 413 0.501 413 0.501
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 413 0.499 413 0.499
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 413 0.497 413 0.497
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 413 0.497 413 0.497
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 413 0.497 413 0.497
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 413 0.499 413 0.499
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 413 0.501 413 0.501
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 413 0.503 413 0.503
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 413 0.507 413 0.507
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 413 0.511 413 0.511
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 413 0.516 413 0.516
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 201226135454138664 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
making animated gifs
11 models are in 201226135454138664.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 413 0.466 413 0.466
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 413 0.470 413 0.470
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 413 0.476 413 0.476
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 413 0.482 413 0.482
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 413 0.490 413 0.490
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 413 0.499 413 0.499
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 413 0.508 413 0.508
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 413 0.518 413 0.518
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 413 0.529 413 0.529
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 413 0.541 413 0.541
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 413 0.553 413 0.553
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 201226135454138664 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
making animated gifs
11 models are in 201226135454138664.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 413 0.541 413 0.541
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 413 0.531 413 0.531
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 413 0.521 413 0.521
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 413 0.513 413 0.513
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 413 0.505 413 0.505
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 413 0.499 413 0.499
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 413 0.493 413 0.493
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 413 0.488 413 0.488
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 413 0.484 413 0.484
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 413 0.481 413 0.481
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 413 0.480 413 0.480
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 201226135454138664 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
making animated gifs
11 models are in 201226135454138664.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 413 0.519 413 0.519
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 413 0.467 413 0.467
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 413 0.437 413 0.437
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 413 0.433 413 0.433
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 413 0.454 413 0.454
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 413 0.499 413 0.499
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 413 0.560 413 0.560
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 413 0.634 413 0.634
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 413 0.716 413 0.716
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 413 0.804 413 0.804
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 413 0.896 413 0.896
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 201226135454138664 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
201226135454138664.eigenfacs
201226135454138664.atom
making animated gifs
11 models are in 201226135454138664.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 201226135454138664.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 413 1.028 407 0.844
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 413 0.897 407 0.746
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 413 0.772 410 0.699
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 413 0.659 411 0.623
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 413 0.564 413 0.564
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 413 0.499 413 0.499
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 413 0.474 413 0.474
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 413 0.496 413 0.496
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 413 0.560 413 0.560
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 413 0.653 413 0.653
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 413 0.765 410 0.717
201226135454138664.10.pdb
201226135454138664.11.pdb
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