*** 4P8H ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2012260726487193.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2012260726487193.atom to be opened.
Openam> File opened: 2012260726487193.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 457
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3512
Mean number per residue = 7.7
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -20.790802 +/- 11.608747 From: -48.990000 To: 8.844000
= -13.529368 +/- 14.786103 From: -55.208000 To: 18.031000
= 2.557475 +/- 11.870636 From: -26.144000 To: 32.703000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.3810 % Filled.
Pdbmat> 1321652 non-zero elements.
Pdbmat> 144530 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 82.31 +/- 22.60
Maximum number = 128
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 2.890600E+06
Pdbmat> Larger element = 483.018
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
457 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2012260726487193.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2012260726487193.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2012260726487193.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3512 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 457 residues.
Blocpdb> 16 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 17
Blocpdb> 26 atoms in block 3
Block first atom: 36
Blocpdb> 25 atoms in block 4
Block first atom: 62
Blocpdb> 22 atoms in block 5
Block first atom: 87
Blocpdb> 18 atoms in block 6
Block first atom: 109
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 127
Blocpdb> 26 atoms in block 8
Block first atom: 147
Blocpdb> 22 atoms in block 9
Block first atom: 173
Blocpdb> 22 atoms in block 10
Block first atom: 195
Blocpdb> 24 atoms in block 11
Block first atom: 217
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 241
Blocpdb> 23 atoms in block 13
Block first atom: 258
Blocpdb> 19 atoms in block 14
Block first atom: 281
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 300
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 319
Blocpdb> 20 atoms in block 17
Block first atom: 336
Blocpdb> 23 atoms in block 18
Block first atom: 356
Blocpdb> 22 atoms in block 19
Block first atom: 379
Blocpdb> 21 atoms in block 20
Block first atom: 401
Blocpdb> 21 atoms in block 21
Block first atom: 422
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 443
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 459
Blocpdb> 22 atoms in block 24
Block first atom: 482
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 504
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 527
Blocpdb> 21 atoms in block 27
Block first atom: 551
Blocpdb> 24 atoms in block 28
Block first atom: 572
Blocpdb> 23 atoms in block 29
Block first atom: 596
Blocpdb> 21 atoms in block 30
Block first atom: 619
Blocpdb> 19 atoms in block 31
Block first atom: 640
Blocpdb> 25 atoms in block 32
Block first atom: 659
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 684
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 709
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 727
Blocpdb> 29 atoms in block 36
Block first atom: 749
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 778
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 800
Blocpdb> 27 atoms in block 39
Block first atom: 818
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 845
Blocpdb> 17 atoms in block 41
Block first atom: 863
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 880
Blocpdb> 22 atoms in block 43
Block first atom: 899
Blocpdb> 27 atoms in block 44
Block first atom: 921
Blocpdb> 21 atoms in block 45
Block first atom: 948
Blocpdb> 21 atoms in block 46
Block first atom: 969
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 990
Blocpdb> 24 atoms in block 48
Block first atom: 1012
Blocpdb> 24 atoms in block 49
Block first atom: 1036
Blocpdb> 20 atoms in block 50
Block first atom: 1060
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 1080
Blocpdb> 29 atoms in block 52
Block first atom: 1101
Blocpdb> 22 atoms in block 53
Block first atom: 1130
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 1152
Blocpdb> 22 atoms in block 55
Block first atom: 1172
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1194
Blocpdb> 19 atoms in block 57
Block first atom: 1227
Blocpdb> 16 atoms in block 58
Block first atom: 1246
Blocpdb> 19 atoms in block 59
Block first atom: 1262
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1281
Blocpdb> 24 atoms in block 61
Block first atom: 1301
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1325
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1349
Blocpdb> 20 atoms in block 64
Block first atom: 1371
Blocpdb> 28 atoms in block 65
Block first atom: 1391
Blocpdb> 21 atoms in block 66
Block first atom: 1419
Blocpdb> 19 atoms in block 67
Block first atom: 1440
Blocpdb> 18 atoms in block 68
Block first atom: 1459
Blocpdb> 25 atoms in block 69
Block first atom: 1477
Blocpdb> 20 atoms in block 70
Block first atom: 1502
Blocpdb> 24 atoms in block 71
Block first atom: 1522
Blocpdb> 18 atoms in block 72
Block first atom: 1546
Blocpdb> 25 atoms in block 73
Block first atom: 1564
Blocpdb> 31 atoms in block 74
Block first atom: 1589
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1620
Blocpdb> 33 atoms in block 76
Block first atom: 1637
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1670
Blocpdb> 19 atoms in block 78
Block first atom: 1689
Blocpdb> 21 atoms in block 79
Block first atom: 1708
Blocpdb> 21 atoms in block 80
Block first atom: 1729
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1750
Blocpdb> 23 atoms in block 82
Block first atom: 1774
Blocpdb> 19 atoms in block 83
Block first atom: 1797
Blocpdb> 26 atoms in block 84
Block first atom: 1816
Blocpdb> 21 atoms in block 85
Block first atom: 1842
Blocpdb> 25 atoms in block 86
Block first atom: 1863
Blocpdb> 24 atoms in block 87
Block first atom: 1888
Blocpdb> 28 atoms in block 88
Block first atom: 1912
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 1940
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 1961
Blocpdb> 23 atoms in block 91
Block first atom: 1984
Blocpdb> 25 atoms in block 92
Block first atom: 2007
Blocpdb> 20 atoms in block 93
Block first atom: 2032
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2052
Blocpdb> 30 atoms in block 95
Block first atom: 2074
Blocpdb> 19 atoms in block 96
Block first atom: 2104
Blocpdb> 21 atoms in block 97
Block first atom: 2123
Blocpdb> 37 atoms in block 98
Block first atom: 2144
Blocpdb> 19 atoms in block 99
Block first atom: 2181
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 2200
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 2230
Blocpdb> 25 atoms in block 102
Block first atom: 2250
Blocpdb> 27 atoms in block 103
Block first atom: 2275
Blocpdb> 29 atoms in block 104
Block first atom: 2302
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 2331
Blocpdb> 24 atoms in block 106
Block first atom: 2355
Blocpdb> 33 atoms in block 107
Block first atom: 2379
Blocpdb> 21 atoms in block 108
Block first atom: 2412
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 2433
Blocpdb> 28 atoms in block 110
Block first atom: 2449
Blocpdb> 32 atoms in block 111
Block first atom: 2477
Blocpdb> 22 atoms in block 112
Block first atom: 2509
Blocpdb> 21 atoms in block 113
Block first atom: 2531
Blocpdb> 24 atoms in block 114
Block first atom: 2552
Blocpdb> 29 atoms in block 115
Block first atom: 2576
Blocpdb> 20 atoms in block 116
Block first atom: 2605
Blocpdb> 24 atoms in block 117
Block first atom: 2625
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 2649
Blocpdb> 28 atoms in block 119
Block first atom: 2664
Blocpdb> 27 atoms in block 120
Block first atom: 2692
Blocpdb> 27 atoms in block 121
Block first atom: 2719
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 2746
Blocpdb> 26 atoms in block 123
Block first atom: 2769
Blocpdb> 21 atoms in block 124
Block first atom: 2795
Blocpdb> 25 atoms in block 125
Block first atom: 2816
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 2841
Blocpdb> 26 atoms in block 127
Block first atom: 2863
Blocpdb> 21 atoms in block 128
Block first atom: 2889
Blocpdb> 26 atoms in block 129
Block first atom: 2910
Blocpdb> 25 atoms in block 130
Block first atom: 2936
Blocpdb> 16 atoms in block 131
Block first atom: 2961
Blocpdb> 27 atoms in block 132
Block first atom: 2977
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 3004
Blocpdb> 30 atoms in block 134
Block first atom: 3027
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3057
Blocpdb> 19 atoms in block 136
Block first atom: 3081
Blocpdb> 31 atoms in block 137
Block first atom: 3100
Blocpdb> 21 atoms in block 138
Block first atom: 3131
Blocpdb> 25 atoms in block 139
Block first atom: 3152
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 3177
Blocpdb> 27 atoms in block 141
Block first atom: 3196
Blocpdb> 23 atoms in block 142
Block first atom: 3223
Blocpdb> 30 atoms in block 143
Block first atom: 3246
Blocpdb> 24 atoms in block 144
Block first atom: 3276
Blocpdb> 28 atoms in block 145
Block first atom: 3300
Blocpdb> 29 atoms in block 146
Block first atom: 3328
Blocpdb> 24 atoms in block 147
Block first atom: 3357
Blocpdb> 26 atoms in block 148
Block first atom: 3381
Blocpdb> 23 atoms in block 149
Block first atom: 3407
Blocpdb> 22 atoms in block 150
Block first atom: 3430
Blocpdb> 27 atoms in block 151
Block first atom: 3452
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 3479
Blocpdb> 9 atoms in block 153
Block first atom: 3503
Blocpdb> 153 blocks.
Blocpdb> At most, 37 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1321805 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10536
Prepmat> Matrix trace = 2890600.0000
Prepmat> Last element read: 10536 10536 207.9169
Prepmat> 11782 lines saved.
Prepmat> 10219 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3512
RTB> Total mass = 3512.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3512
RTB> Number of blocks = 153
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 199626.1567
RTB> 53937 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 918
Diagstd> Nb of non-zero elements: 53937
Diagstd> Projected matrix trace = 199626.1567
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 918 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 199626.1567
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.5753277 2.7557426 2.8501534 3.3230812
4.2939212 5.3498841 5.6156898 6.6132958 6.9183629
8.0257525 8.6912040 9.1024089 9.9513819 10.4419247
10.9405838 11.2872843 11.5516381 11.9667706 13.3569114
13.8989501 14.4950337 15.4726231 15.5172914 16.2552010
16.5684270 17.0186477 17.4093945 18.1457262 18.3492642
19.2009686 19.9856934 20.4550066 22.0594024 22.3207916
23.0535098 23.6095115 23.7987692 24.7069575 24.7369159
25.2264748 27.1609110 27.2409160 27.3648991 28.5440514
28.6030870 29.1879951 30.1413578 31.2567221 31.7190530
33.3474085 33.8249715 34.1863233 34.4307844 35.3807885
35.7686058 36.6673624 37.0595105 37.9425493 38.3437563
38.5122432 39.9102210 40.2559822 40.6828064 41.4686395
42.1152172 42.3956641 43.0526414 43.5918373 43.9843899
45.1616214 45.8287149 46.3114891 46.3949096 47.8218384
48.4109963 49.0424708 49.7863939 50.1738765 50.4326990
50.6038349 51.4067228 51.6530454 52.1815027 52.8103882
53.5854753 54.4368039 54.7869435 55.6834302 56.0924057
56.3192292 56.7395959 57.6149994 58.2532690 58.7691234
59.2645039 59.5395855 60.5208373 60.7581970 61.2577633
61.7818083
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034331 0.0034334 0.0034334 0.0034340
0.0034355 136.2952538 180.2663239 183.3282518 197.9546720
225.0206189 251.1698277 257.3338017 279.2571189 285.6254826
307.6367118 320.1365438 327.6222973 342.5602573 350.9017702
359.1827968 364.8295533 369.0770726 375.6503196 396.8700285
404.8426678 413.4327680 427.1468950 427.7630206 437.8158216
442.0138925 447.9791532 453.0927511 462.5753186 465.1624051
475.8355106 485.4616086 491.1284501 510.0258067 513.0386411
521.3913324 527.6412993 529.7519068 539.7652409 540.0923876
545.4105863 565.9361635 566.7690601 568.0573794 580.1670875
580.7667357 586.6747712 596.1790170 607.1094543 611.5829737
627.0848733 631.5591041 634.9236113 637.1896883 645.9204486
649.4508457 657.5595898 661.0664541 668.8958998 672.4230746
673.8988081 686.0208997 688.9861537 692.6290975 699.2865484
704.7170882 707.0595649 712.5169189 716.9648550 720.1858205
729.7599799 735.1299554 738.9918572 739.6571277 750.9454915
755.5570992 760.4688887 766.2149397 769.1908485 771.1722360
772.4795572 778.5835785 780.4466957 784.4288740 789.1416407
794.9115807 801.2011973 803.7737455 810.3231950 813.2935225
814.9362403 817.9719285 824.2577915 828.8108561 832.4724825
835.9736854 837.9115631 844.7880154 846.4430024 849.9156925
853.5433601
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3512
Rtb_to_modes> Number of blocs = 153
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.575
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.756
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.850
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.323
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.294
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.350
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.616
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.613
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.918
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.026
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.691
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.102
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.951
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.78
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 918 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
0.99997 1.00002 1.00001 0.99994 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99996 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00004 0.99999 0.99999
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 63216 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000
1.00000 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001
1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000
0.99997 1.00002 1.00001 0.99994 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99996
1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 0.99999
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997
1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001
1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998
0.99996 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00004 0.99999 0.99999
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2012260726487193.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2012260726487193.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2012260726487193.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2012260726487193.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 457
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3512
Mean number per residue = 7.7
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.575
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.850
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.323
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.294
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.350
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.616
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.613
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.918
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.026
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.691
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.102
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.951
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.78
Bfactors> 106 vectors, 10536 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.575000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.629 for 457 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.023 +/- 0.03
Bfactors> = 34.159 +/- 12.84
Bfactors> Shiftng-fct= 34.136
Bfactors> Scaling-fct= 428.162
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2012260726487193.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2012260726487193.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.5
Chkmod> 106 vectors, 10536 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3512 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8077
0.0034 0.7725
0.0034 0.7404
0.0034 0.7288
0.0034 0.8087
0.0034 0.9051
136.2752 0.3032
180.2670 0.2426
183.3154 0.0404
197.9438 0.2095
225.0130 0.3120
251.1618 0.3281
257.3299 0.3595
279.2389 0.3972
285.6057 0.4927
307.6282 0.2030
320.1190 0.2561
327.6009 0.6537
342.5390 0.5236
350.8544 0.3559
359.1578 0.4606
364.8578 0.1323
369.0351 0.3476
375.6849 0.3844
396.8989 0.3980
404.8406 0.1793
413.4858 0.2456
427.0924 0.4090
427.7820 0.1124
437.8616 0.3208
442.0159 0.3828
447.9777 0.4013
453.0812 0.2519
462.6099 0.3672
465.1518 0.4011
475.8031 0.3072
485.4931 0.4766
491.1673 0.3708
510.0108 0.4075
513.0075 0.4608
521.3293 0.3869
527.6241 0.4808
529.7429 0.1799
539.7753 0.2736
540.1029 0.4463
545.4253 0.4423
565.9024 0.3819
566.7352 0.3979
567.9821 0.2944
580.1010 0.3136
580.7105 0.5189
586.6697 0.5707
596.1400 0.4216
607.1152 0.4514
611.5658 0.5213
627.0823 0.4038
631.4856 0.5399
634.9305 0.3792
637.1551 0.3749
645.8855 0.4720
649.4356 0.4320
657.5550 0.3428
661.0424 0.3260
668.8447 0.4977
672.3613 0.3195
673.8503 0.4117
685.9896 0.4801
688.9910 0.4910
692.5755 0.3372
699.2680 0.4294
704.7268 0.5000
707.0654 0.4187
712.4645 0.4689
716.9190 0.4514
720.1190 0.3591
729.7156 0.4976
735.1087 0.3940
738.9483 0.2999
739.5862 0.4705
750.8988 0.2065
755.5169 0.4743
760.4171 0.5356
766.2098 0.4258
769.1281 0.3920
771.1185 0.4535
772.4171 0.5499
778.5750 0.4125
780.3902 0.4238
784.3839 0.4480
789.1049 0.3640
794.9110 0.4269
801.1903 0.4705
803.7617 0.4542
810.2635 0.5222
813.2412 0.4659
814.9068 0.3633
817.9397 0.3950
824.1866 0.3584
828.7520 0.4066
832.4430 0.4618
835.9060 0.4723
837.8785 0.4652
844.7459 0.3461
846.4192 0.3071
849.8947 0.5250
853.4942 0.4917
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2012260726487193.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2012260726487193.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2012260726487193.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2012260726487193.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2012260726487193.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2012260726487193.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.5
Projmod> 106 vectors, 10536 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 457
First residue number = 5
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3512
Mean number per residue = 7.7
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 416
First residue number = 7
Last residue number = 461
Number of atoms found = 3192
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2012260726487193 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
making animated gifs
11 models are in 2012260726487193.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 416 1.428 401 0.909
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 416 1.250 405 0.858
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 416 1.083 406 0.797
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 416 0.933 409 0.759
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 416 0.809 414 0.756
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 416 0.725 414 0.691
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 416 0.695 415 0.677
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 416 0.726 415 0.707
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 416 0.811 415 0.792
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 416 0.936 414 0.906
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 416 1.086 409 0.977
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2012260726487193 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
making animated gifs
11 models are in 2012260726487193.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 416 1.360 405 1.202
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 416 1.159 410 1.059
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 416 0.979 412 0.906
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 416 0.832 414 0.791
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 416 0.741 415 0.720
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 416 0.725 414 0.691
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 416 0.789 413 0.742
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 416 0.917 412 0.851
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 416 1.087 408 0.961
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 416 1.281 405 1.101
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 416 1.491 402 1.260
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2012260726487193 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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2012260726487193.atom
making animated gifs
11 models are in 2012260726487193.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 416 0.947 407 0.762
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 416 0.888 411 0.779
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 416 0.835 411 0.741
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 416 0.789 413 0.734
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 416 0.752 414 0.718
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 416 0.725 414 0.691
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 416 0.708 414 0.675
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 416 0.704 415 0.686
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 416 0.711 415 0.693
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 416 0.730 415 0.712
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 416 0.760 414 0.725
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2012260726487193 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
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2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2012260726487193.eigenfacs
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making animated gifs
11 models are in 2012260726487193.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 416 1.213 410 1.135
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 416 1.020 414 0.993
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 416 0.855 415 0.839
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 416 0.735 416 0.735
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 416 0.687 415 0.670
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 416 0.725 414 0.691
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 416 0.836 412 0.767
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 416 0.997 406 0.817
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 416 1.187 403 0.913
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 416 1.395 400 1.023
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 416 1.614 395 1.112
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2012260726487193 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2012260726487193.eigenfacs
2012260726487193.atom
making animated gifs
11 models are in 2012260726487193.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2012260726487193.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 416 1.365 399 1.149
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 416 1.170 407 1.055
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 416 0.994 412 0.942
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 416 0.849 415 0.833
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 416 0.753 415 0.739
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 416 0.725 414 0.691
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 416 0.772 414 0.731
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 416 0.884 413 0.823
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 416 1.039 413 0.971
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 416 1.221 410 1.117
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 416 1.419 404 1.254
2012260726487193.10.pdb
2012260726487193.11.pdb
2012260726487193.7.pdb
2012260726487193.8.pdb
2012260726487193.9.pdb
STDERR:
real 0m12.008s
user 0m11.972s
sys 0m0.028s
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