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***  test  ***

LOGs for ID: 20120411105959066

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20120411105959066.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20120411105959066.atom to be opened. Openam> File opened: 20120411105959066.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1324 First residue number = 1 Last residue number = 1324 Number of atoms found = 10260 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 133.348272 +/- 11.317458 From: 102.650000 To: 168.740000 = 133.429546 +/- 31.261490 From: 62.880000 To: 192.930000 = 62.872866 +/- 31.784940 From: -4.090000 To: 133.550000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7971 % Filled. Pdbmat> 3776181 non-zero elements. Pdbmat> 413426 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.59 +/- 22.20 Maximum number = 129 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 8.268520E+06 Pdbmat> Larger element = 482.839 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1324 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20120411105959066.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20120411105959066.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20120411105959066.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10260 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1324 residues. Blocpdb> 54 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 55 Blocpdb> 51 atoms in block 3 Block first atom: 102 Blocpdb> 47 atoms in block 4 Block first atom: 153 Blocpdb> 48 atoms in block 5 Block first atom: 200 Blocpdb> 74 atoms in block 6 Block first atom: 248 Blocpdb> 52 atoms in block 7 Block first atom: 322 Blocpdb> 55 atoms in block 8 Block first atom: 374 Blocpdb> 53 atoms in block 9 Block first atom: 429 Blocpdb> 47 atoms in block 10 Block first atom: 482 Blocpdb> 51 atoms in block 11 Block first atom: 529 Blocpdb> 51 atoms in block 12 Block first atom: 580 Blocpdb> 64 atoms in block 13 Block first atom: 631 Blocpdb> 58 atoms in block 14 Block first atom: 695 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 753 Blocpdb> 60 atoms in block 16 Block first atom: 798 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 858 Blocpdb> 58 atoms in block 18 Block first atom: 902 Blocpdb> 52 atoms in block 19 Block first atom: 960 Blocpdb> 47 atoms in block 20 Block first atom: 1012 Blocpdb> 66 atoms in block 21 Block first atom: 1059 Blocpdb> 60 atoms in block 22 Block first atom: 1125 Blocpdb> 48 atoms in block 23 Block first atom: 1185 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1233 Blocpdb> 55 atoms in block 25 Block first atom: 1285 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1340 Blocpdb> 51 atoms in block 27 Block first atom: 1392 Blocpdb> 68 atoms in block 28 Block first atom: 1443 Blocpdb> 53 atoms in block 29 Block first atom: 1511 Blocpdb> 45 atoms in block 30 Block first atom: 1564 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1609 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 1667 Blocpdb> 55 atoms in block 33 Block first atom: 1674 Blocpdb> 52 atoms in block 34 Block first atom: 1729 Blocpdb> 44 atoms in block 35 Block first atom: 1781 Blocpdb> 49 atoms in block 36 Block first atom: 1825 Blocpdb> 70 atoms in block 37 Block first atom: 1874 Blocpdb> 57 atoms in block 38 Block first atom: 1944 Blocpdb> 56 atoms in block 39 Block first atom: 2001 Blocpdb> 45 atoms in block 40 Block first atom: 2057 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 2102 Blocpdb> 61 atoms in block 42 Block first atom: 2158 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 2219 Blocpdb> 58 atoms in block 44 Block first atom: 2267 Blocpdb> 57 atoms in block 45 Block first atom: 2325 Blocpdb> 58 atoms in block 46 Block first atom: 2382 Blocpdb> 69 atoms in block 47 Block first atom: 2440 Blocpdb> 62 atoms in block 48 Block first atom: 2509 Blocpdb> 45 atoms in block 49 Block first atom: 2571 Blocpdb> 44 atoms in block 50 Block first atom: 2616 Blocpdb> 51 atoms in block 51 Block first atom: 2660 Blocpdb> 51 atoms in block 52 Block first atom: 2711 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2762 Blocpdb> 62 atoms in block 54 Block first atom: 2803 Blocpdb> 57 atoms in block 55 Block first atom: 2865 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2922 Blocpdb> 51 atoms in block 57 Block first atom: 2966 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 3017 Blocpdb> 52 atoms in block 59 Block first atom: 3065 Blocpdb> 47 atoms in block 60 Block first atom: 3117 Blocpdb> 52 atoms in block 61 Block first atom: 3164 Blocpdb> 55 atoms in block 62 Block first atom: 3216 Blocpdb> 59 atoms in block 63 Block first atom: 3271 Blocpdb> 54 atoms in block 64 Block first atom: 3330 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 3384 Blocpdb> 50 atoms in block 66 Block first atom: 3429 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 3479 Blocpdb> 56 atoms in block 68 Block first atom: 3536 Blocpdb> 55 atoms in block 69 Block first atom: 3592 Blocpdb> 49 atoms in block 70 Block first atom: 3647 Blocpdb> 55 atoms in block 71 Block first atom: 3696 Blocpdb> 69 atoms in block 72 Block first atom: 3751 Blocpdb> 50 atoms in block 73 Block first atom: 3820 Blocpdb> 61 atoms in block 74 Block first atom: 3870 Blocpdb> 64 atoms in block 75 Block first atom: 3931 Blocpdb> 49 atoms in block 76 Block first atom: 3995 Blocpdb> 65 atoms in block 77 Block first atom: 4044 Blocpdb> 58 atoms in block 78 Block first atom: 4109 Blocpdb> 49 atoms in block 79 Block first atom: 4167 Blocpdb> 53 atoms in block 80 Block first atom: 4216 Blocpdb> 49 atoms in block 81 Block first atom: 4269 Blocpdb> 62 atoms in block 82 Block first atom: 4318 Blocpdb> 55 atoms in block 83 Block first atom: 4380 Blocpdb> 54 atoms in block 84 Block first atom: 4435 Blocpdb> 49 atoms in block 85 Block first atom: 4489 Blocpdb> 57 atoms in block 86 Block first atom: 4538 Blocpdb> 57 atoms in block 87 Block first atom: 4595 Blocpdb> 62 atoms in block 88 Block first atom: 4652 Blocpdb> 51 atoms in block 89 Block first atom: 4714 Blocpdb> 54 atoms in block 90 Block first atom: 4765 Blocpdb> 59 atoms in block 91 Block first atom: 4819 Blocpdb> 62 atoms in block 92 Block first atom: 4878 Blocpdb> 51 atoms in block 93 Block first atom: 4940 Blocpdb> 58 atoms in block 94 Block first atom: 4991 Blocpdb> 61 atoms in block 95 Block first atom: 5049 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 5110 Blocpdb> 54 atoms in block 97 Block first atom: 5131 Blocpdb> 47 atoms in block 98 Block first atom: 5185 Blocpdb> 51 atoms in block 99 Block first atom: 5232 Blocpdb> 47 atoms in block 100 Block first atom: 5283 Blocpdb> 48 atoms in block 101 Block first atom: 5330 Blocpdb> 74 atoms in block 102 Block first atom: 5378 Blocpdb> 52 atoms in block 103 Block first atom: 5452 Blocpdb> 55 atoms in block 104 Block first atom: 5504 Blocpdb> 53 atoms in block 105 Block first atom: 5559 Blocpdb> 47 atoms in block 106 Block first atom: 5612 Blocpdb> 51 atoms in block 107 Block first atom: 5659 Blocpdb> 51 atoms in block 108 Block first atom: 5710 Blocpdb> 64 atoms in block 109 Block first atom: 5761 Blocpdb> 58 atoms in block 110 Block first atom: 5825 Blocpdb> 45 atoms in block 111 Block first atom: 5883 Blocpdb> 60 atoms in block 112 Block first atom: 5928 Blocpdb> 44 atoms in block 113 Block first atom: 5988 Blocpdb> 58 atoms in block 114 Block first atom: 6032 Blocpdb> 52 atoms in block 115 Block first atom: 6090 Blocpdb> 47 atoms in block 116 Block first atom: 6142 Blocpdb> 66 atoms in block 117 Block first atom: 6189 Blocpdb> 60 atoms in block 118 Block first atom: 6255 Blocpdb> 48 atoms in block 119 Block first atom: 6315 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 6363 Blocpdb> 55 atoms in block 121 Block first atom: 6415 Blocpdb> 52 atoms in block 122 Block first atom: 6470 Blocpdb> 51 atoms in block 123 Block first atom: 6522 Blocpdb> 68 atoms in block 124 Block first atom: 6573 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 6641 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 6694 Blocpdb> 58 atoms in block 127 Block first atom: 6739 Blocpdb> 7 atoms in block 128 Block first atom: 6797 Blocpdb> 55 atoms in block 129 Block first atom: 6804 Blocpdb> 52 atoms in block 130 Block first atom: 6859 Blocpdb> 44 atoms in block 131 Block first atom: 6911 Blocpdb> 49 atoms in block 132 Block first atom: 6955 Blocpdb> 70 atoms in block 133 Block first atom: 7004 Blocpdb> 57 atoms in block 134 Block first atom: 7074 Blocpdb> 56 atoms in block 135 Block first atom: 7131 Blocpdb> 45 atoms in block 136 Block first atom: 7187 Blocpdb> 56 atoms in block 137 Block first atom: 7232 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 7288 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 7349 Blocpdb> 58 atoms in block 140 Block first atom: 7397 Blocpdb> 57 atoms in block 141 Block first atom: 7455 Blocpdb> 58 atoms in block 142 Block first atom: 7512 Blocpdb> 69 atoms in block 143 Block first atom: 7570 Blocpdb> 62 atoms in block 144 Block first atom: 7639 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 7701 Blocpdb> 44 atoms in block 146 Block first atom: 7746 Blocpdb> 51 atoms in block 147 Block first atom: 7790 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 7841 Blocpdb> 41 atoms in block 149 Block first atom: 7892 Blocpdb> 62 atoms in block 150 Block first atom: 7933 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 7995 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 8052 Blocpdb> 51 atoms in block 153 Block first atom: 8096 Blocpdb> 48 atoms in block 154 Block first atom: 8147 Blocpdb> 52 atoms in block 155 Block first atom: 8195 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 8247 Blocpdb> 52 atoms in block 157 Block first atom: 8294 Blocpdb> 55 atoms in block 158 Block first atom: 8346 Blocpdb> 59 atoms in block 159 Block first atom: 8401 Blocpdb> 54 atoms in block 160 Block first atom: 8460 Blocpdb> 45 atoms in block 161 Block first atom: 8514 Blocpdb> 50 atoms in block 162 Block first atom: 8559 Blocpdb> 57 atoms in block 163 Block first atom: 8609 Blocpdb> 56 atoms in block 164 Block first atom: 8666 Blocpdb> 55 atoms in block 165 Block first atom: 8722 Blocpdb> 49 atoms in block 166 Block first atom: 8777 Blocpdb> 55 atoms in block 167 Block first atom: 8826 Blocpdb> 69 atoms in block 168 Block first atom: 8881 Blocpdb> 50 atoms in block 169 Block first atom: 8950 Blocpdb> 61 atoms in block 170 Block first atom: 9000 Blocpdb> 64 atoms in block 171 Block first atom: 9061 Blocpdb> 49 atoms in block 172 Block first atom: 9125 Blocpdb> 65 atoms in block 173 Block first atom: 9174 Blocpdb> 58 atoms in block 174 Block first atom: 9239 Blocpdb> 49 atoms in block 175 Block first atom: 9297 Blocpdb> 53 atoms in block 176 Block first atom: 9346 Blocpdb> 49 atoms in block 177 Block first atom: 9399 Blocpdb> 62 atoms in block 178 Block first atom: 9448 Blocpdb> 55 atoms in block 179 Block first atom: 9510 Blocpdb> 54 atoms in block 180 Block first atom: 9565 Blocpdb> 49 atoms in block 181 Block first atom: 9619 Blocpdb> 57 atoms in block 182 Block first atom: 9668 Blocpdb> 57 atoms in block 183 Block first atom: 9725 Blocpdb> 62 atoms in block 184 Block first atom: 9782 Blocpdb> 51 atoms in block 185 Block first atom: 9844 Blocpdb> 54 atoms in block 186 Block first atom: 9895 Blocpdb> 59 atoms in block 187 Block first atom: 9949 Blocpdb> 62 atoms in block 188 Block first atom: 10008 Blocpdb> 51 atoms in block 189 Block first atom: 10070 Blocpdb> 58 atoms in block 190 Block first atom: 10121 Blocpdb> 61 atoms in block 191 Block first atom: 10179 Blocpdb> 21 atoms in block 192 Block first atom: 10239 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 74 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3776373 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 30780 Prepmat> Matrix trace = 8268520.0000 Prepmat> Last element read: 30780 30780 102.6380 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16986 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10260 RTB> Total mass = 10260.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10260 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 208385.1472 RTB> 52632 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52632 Diagstd> Projected matrix trace = 208385.1472 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 208385.1472 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0555007 0.0778524 0.1195846 0.1254744 0.1553026 0.2957333 0.4649982 0.5363887 1.0559037 1.1004916 1.2732576 1.5181342 1.7747432 2.2494395 2.4381403 2.5172692 2.6895604 2.8771155 3.5297427 3.7446852 3.9294100 4.2625108 5.0122434 5.0972346 6.0709961 6.3164681 6.6876322 7.4584100 7.7089409 7.8308904 8.1890831 8.3318360 8.3915020 8.9134992 9.0900313 9.4764698 9.9073360 10.1803940 10.2289891 11.0764124 11.8469009 12.4087095 13.0464840 13.2402113 13.6136363 14.7754315 15.0655695 15.2988794 15.8259064 16.5464842 17.5602596 18.1789918 18.4889543 18.8287698 19.3428939 19.8742907 20.2860420 20.3178494 21.0219447 21.2757499 21.4539315 21.7494361 21.8012570 22.2883899 22.8691371 23.3207300 23.6810259 24.3583309 24.5338451 25.5084090 26.1009386 26.2481300 26.8680741 27.2922918 27.7333212 27.8451530 28.4100778 28.8783389 29.0478564 29.9440055 30.3347972 30.4754119 31.0163635 31.3886955 32.0058264 32.2527667 32.6114958 32.8527947 33.0983933 33.4754970 33.9327892 34.6280683 34.9577264 35.1362591 35.5463921 35.9905436 36.5634065 36.9592018 37.0631450 37.4141672 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034309 0.0034334 0.0034340 0.0034341 0.0034346 0.0034352 25.5826006 30.2992102 37.5519885 38.4656274 42.7941667 59.0534701 74.0492964 79.5307526 111.5854168 113.9170276 122.5331017 133.7982278 144.6648547 162.8667525 169.5604772 172.2900163 178.0885210 184.1933421 204.0172100 210.1371983 215.2578280 224.1960860 243.1147765 245.1673263 267.5625071 272.9181590 280.8222211 296.5639842 301.5036951 303.8791143 310.7512742 313.4480966 314.5684270 324.2047655 327.3994685 334.2862951 341.8013121 346.4795243 347.3054826 361.4055679 373.7641621 382.5239119 392.2310978 395.1324877 400.6658732 417.4124197 421.4907580 424.7418862 431.9958518 441.7210999 455.0517057 462.9991326 466.9296521 471.2010544 477.5908587 484.1067066 489.0958080 489.4790956 497.8880754 500.8846452 502.9776938 506.4298331 507.0327921 512.6661327 519.3022082 524.4044286 528.4398203 535.9435436 537.8709508 548.4499052 554.7832527 556.3453523 562.8770593 567.3032654 571.8685603 573.0204018 578.8039571 583.5544494 585.2646919 594.2240531 598.0890181 599.4736143 604.7706681 608.3897851 614.3414283 616.7068434 620.1269983 622.4169920 624.7391705 628.2880466 632.5648562 639.0125874 642.0470722 643.6844841 647.4303349 651.4625925 656.6268020 660.1711966 661.0988700 664.2221001 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10260 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9822E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.5501E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.7852E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1255 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1553 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.056 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.273 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.518 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.249 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.929 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.012 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.071 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.316 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.458 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.709 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.332 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.090 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.907 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.41 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99995 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99996 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 184680 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99995 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 0.99996 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 0.99998 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20120411105959066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20120411105959066.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20120411105959066.atom Openam> file on opening on unit 11: 20120411105959066.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1324 First residue number = 1 Last residue number = 1324 Number of atoms found = 10260 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9822E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.5501E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.7852E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1255 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1553 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.056 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.273 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.518 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.249 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.929 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.012 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.071 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.316 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.458 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.709 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.332 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.090 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.907 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.41 Bfactors> 106 vectors, 30780 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.055501 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.108 +/- 0.06 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.108 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20120411105959066.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20120411105959066.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.2 Chkmod> 106 vectors, 30780 coordinates in file. Chkmod> That is: 10260 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 63 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6616 0.0034 0.7904 0.0034 0.6869 0.0034 0.6962 0.0034 0.9453 0.0034 0.8939 25.5816 0.5762 30.2978 0.7499 37.5528 0.6842 38.4679 0.5320 42.7920 0.6161 59.0476 0.5694 74.0463 0.7745 79.5282 0.7197 111.5857 0.5505 113.8867 0.7045 122.5154 0.7284 133.7866 0.5895 144.6691 0.6604 162.8439 0.2925 169.5483 0.6579 172.2734 0.3669 178.0954 0.2462 184.1817 0.1694 204.0159 0.7000 210.1370 0.7110 215.2374 0.6933 224.1993 0.5804 243.0984 0.5833 245.1512 0.4887 267.5511 0.4541 272.8963 0.5518 280.8179 0.4032 296.5431 0.2550 301.4919 0.4039 303.8682 0.6540 310.7364 0.3415 313.4377 0.4013 314.5643 0.5355 324.1818 0.5807 327.3849 0.4545 334.2637 0.2235 341.7808 0.2951 346.4579 0.4550 347.3077 0.3756 361.4486 0.4492 373.7970 0.3155 382.5274 0.2071 392.2671 0.4299 395.1124 0.4845 400.5952 0.3563 417.4590 0.5462 421.5346 0.2623 424.7392 0.4903 432.0332 0.4454 441.7491 0.4968 455.0288 0.2856 462.9921 0.3518 466.9228 0.2825 471.1962 0.4670 477.5346 0.3935 484.0337 0.4040 489.1225 0.4546 489.4840 0.2855 497.8437 0.4994 500.9132 0.4349 502.9100 0.4079 506.4147 0.4054 506.9964 0.4574 512.6626 0.2945 519.2897 0.3588 524.3737 0.5308 528.4057 0.4228 535.9389 0.5728 537.8057 0.3631 548.4435 0.5654 554.7495 0.3628 556.3413 0.4524 562.8731 0.1235 567.2551 0.2480 571.8098 0.3522 573.0457 0.2903 578.7783 0.4182 583.5462 0.4062 585.2612 0.4526 594.1588 0.4649 598.0161 0.3699 599.4930 0.3270 604.7802 0.3294 608.3763 0.4255 614.3551 0.3492 616.6539 0.5253 620.0862 0.3762 622.3638 0.3211 624.7275 0.3360 628.3033 0.4484 632.5117 0.4267 639.0030 0.3588 642.0404 0.2235 643.6911 0.4537 647.4354 0.4144 651.4297 0.3375 656.5680 0.4027 660.1500 0.4360 661.0424 0.4230 664.1566 0.4850 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 20120411105959066 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom making animated gifs 11 models are in 20120411105959066.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20120411105959066.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20120411105959066.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20120411105959066 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom making animated gifs 11 models are in 20120411105959066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20120411105959066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20120411105959066.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 20120411105959066 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20120411105959066.eigenfacs 20120411105959066.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20120411105959066.eigenfacs 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