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***  TRANSFERASE 06-JUN-08 3DDS  ***

LOGs for ID: 201202161443130892

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 201202161443130892.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 201202161443130892.atom to be opened. Openam> File opened: 201202161443130892.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1612 First residue number = 12 Last residue number = 830 Number of atoms found = 13111 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 88.357637 +/- 20.341135 From: 36.687000 To: 138.043000 = -80.681321 +/- 17.470100 From: -126.335000 To: -33.733000 = 105.929894 +/- 27.020900 From: 48.242000 To: 156.034000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6831 % Filled. Pdbmat> 5283971 non-zero elements. Pdbmat> 578465 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.24 +/- 21.42 Maximum number = 154 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 1.156930E+07 Pdbmat> Larger element = 561.290 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1612 non-zero elements, NRBL set to 9 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 201202161443130892.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 9 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 201202161443130892.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 201202161443130892.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13111 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 9 residue(s) per block. Blocpdb> 1612 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 66 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 72 atoms in block 3 Block first atom: 84 Blocpdb> 81 atoms in block 4 Block first atom: 156 Blocpdb> 72 atoms in block 5 Block first atom: 237 Blocpdb> 77 atoms in block 6 Block first atom: 309 Blocpdb> 81 atoms in block 7 Block first atom: 386 Blocpdb> 87 atoms in block 8 Block first atom: 467 Blocpdb> 84 atoms in block 9 Block first atom: 554 Blocpdb> 78 atoms in block 10 Block first atom: 638 Blocpdb> 68 atoms in block 11 Block first atom: 716 Blocpdb> 70 atoms in block 12 Block first atom: 784 Blocpdb> 71 atoms in block 13 Block first atom: 854 Blocpdb> 69 atoms in block 14 Block first atom: 925 Blocpdb> 56 atoms in block 15 Block first atom: 994 Blocpdb> 64 atoms in block 16 Block first atom: 1050 Blocpdb> 62 atoms in block 17 Block first atom: 1114 Blocpdb> 83 atoms in block 18 Block first atom: 1176 Blocpdb> 79 atoms in block 19 Block first atom: 1259 Blocpdb> 84 atoms in block 20 Block first atom: 1338 Blocpdb> 81 atoms in block 21 Block first atom: 1422 Blocpdb> 100 atoms in block 22 Block first atom: 1503 Blocpdb> 65 atoms in block 23 Block first atom: 1603 Blocpdb> 76 atoms in block 24 Block first atom: 1668 Blocpdb> 77 atoms in block 25 Block first atom: 1744 Blocpdb> 69 atoms in block 26 Block first atom: 1821 Blocpdb> 75 atoms in block 27 Block first atom: 1890 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 1965 Blocpdb> 69 atoms in block 29 Block first atom: 1988 Blocpdb> 74 atoms in block 30 Block first atom: 2057 Blocpdb> 80 atoms in block 31 Block first atom: 2131 Blocpdb> 76 atoms in block 32 Block first atom: 2211 Blocpdb> 71 atoms in block 33 Block first atom: 2287 Blocpdb> 80 atoms in block 34 Block first atom: 2358 Blocpdb> 63 atoms in block 35 Block first atom: 2438 Blocpdb> 68 atoms in block 36 Block first atom: 2501 Blocpdb> 69 atoms in block 37 Block first atom: 2569 Blocpdb> 67 atoms in block 38 Block first atom: 2638 Blocpdb> 79 atoms in block 39 Block first atom: 2705 Blocpdb> 80 atoms in block 40 Block first atom: 2784 Blocpdb> 75 atoms in block 41 Block first atom: 2864 Blocpdb> 70 atoms in block 42 Block first atom: 2939 Blocpdb> 80 atoms in block 43 Block first atom: 3009 Blocpdb> 77 atoms in block 44 Block first atom: 3089 Blocpdb> 81 atoms in block 45 Block first atom: 3166 Blocpdb> 70 atoms in block 46 Block first atom: 3247 Blocpdb> 78 atoms in block 47 Block first atom: 3317 Blocpdb> 73 atoms in block 48 Block first atom: 3395 Blocpdb> 64 atoms in block 49 Block first atom: 3468 Blocpdb> 61 atoms in block 50 Block first atom: 3532 Blocpdb> 72 atoms in block 51 Block first atom: 3593 Blocpdb> 78 atoms in block 52 Block first atom: 3665 Blocpdb> 76 atoms in block 53 Block first atom: 3743 Blocpdb> 78 atoms in block 54 Block first atom: 3819 Blocpdb> 63 atoms in block 55 Block first atom: 3897 Blocpdb> 72 atoms in block 56 Block first atom: 3960 Blocpdb> 71 atoms in block 57 Block first atom: 4032 Blocpdb> 70 atoms in block 58 Block first atom: 4103 Blocpdb> 71 atoms in block 59 Block first atom: 4173 Blocpdb> 78 atoms in block 60 Block first atom: 4244 Blocpdb> 85 atoms in block 61 Block first atom: 4322 Blocpdb> 69 atoms in block 62 Block first atom: 4407 Blocpdb> 84 atoms in block 63 Block first atom: 4476 Blocpdb> 75 atoms in block 64 Block first atom: 4560 Blocpdb> 80 atoms in block 65 Block first atom: 4635 Blocpdb> 74 atoms in block 66 Block first atom: 4715 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 4789 Blocpdb> 71 atoms in block 68 Block first atom: 4846 Blocpdb> 66 atoms in block 69 Block first atom: 4917 Blocpdb> 61 atoms in block 70 Block first atom: 4983 Blocpdb> 75 atoms in block 71 Block first atom: 5044 Blocpdb> 75 atoms in block 72 Block first atom: 5119 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 5194 Blocpdb> 60 atoms in block 74 Block first atom: 5259 Blocpdb> 65 atoms in block 75 Block first atom: 5319 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 5384 Blocpdb> 62 atoms in block 77 Block first atom: 5443 Blocpdb> 72 atoms in block 78 Block first atom: 5505 Blocpdb> 73 atoms in block 79 Block first atom: 5577 Blocpdb> 63 atoms in block 80 Block first atom: 5650 Blocpdb> 76 atoms in block 81 Block first atom: 5713 Blocpdb> 74 atoms in block 82 Block first atom: 5789 Blocpdb> 73 atoms in block 83 Block first atom: 5863 Blocpdb> 71 atoms in block 84 Block first atom: 5936 Blocpdb> 88 atoms in block 85 Block first atom: 6007 Blocpdb> 76 atoms in block 86 Block first atom: 6095 Blocpdb> 71 atoms in block 87 Block first atom: 6171 Blocpdb> 86 atoms in block 88 Block first atom: 6242 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 6328 Blocpdb> 70 atoms in block 90 Block first atom: 6392 Blocpdb> 82 atoms in block 91 Block first atom: 6462 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 6544 Blocpdb> 72 atoms in block 93 Block first atom: 6573 Blocpdb> 80 atoms in block 94 Block first atom: 6645 Blocpdb> 73 atoms in block 95 Block first atom: 6725 Blocpdb> 78 atoms in block 96 Block first atom: 6798 Blocpdb> 80 atoms in block 97 Block first atom: 6876 Blocpdb> 86 atoms in block 98 Block first atom: 6956 Blocpdb> 81 atoms in block 99 Block first atom: 7042 Blocpdb> 76 atoms in block 100 Block first atom: 7123 Blocpdb> 68 atoms in block 101 Block first atom: 7199 Blocpdb> 66 atoms in block 102 Block first atom: 7267 Blocpdb> 75 atoms in block 103 Block first atom: 7333 Blocpdb> 69 atoms in block 104 Block first atom: 7408 Blocpdb> 59 atoms in block 105 Block first atom: 7477 Blocpdb> 62 atoms in block 106 Block first atom: 7536 Blocpdb> 65 atoms in block 107 Block first atom: 7598 Blocpdb> 79 atoms in block 108 Block first atom: 7663 Blocpdb> 74 atoms in block 109 Block first atom: 7742 Blocpdb> 79 atoms in block 110 Block first atom: 7816 Blocpdb> 86 atoms in block 111 Block first atom: 7895 Blocpdb> 86 atoms in block 112 Block first atom: 7981 Blocpdb> 73 atoms in block 113 Block first atom: 8067 Blocpdb> 81 atoms in block 114 Block first atom: 8140 Blocpdb> 69 atoms in block 115 Block first atom: 8221 Blocpdb> 68 atoms in block 116 Block first atom: 8290 Blocpdb> 78 atoms in block 117 Block first atom: 8358 Blocpdb> 68 atoms in block 118 Block first atom: 8436 Blocpdb> 69 atoms in block 119 Block first atom: 8504 Blocpdb> 74 atoms in block 120 Block first atom: 8573 Blocpdb> 80 atoms in block 121 Block first atom: 8647 Blocpdb> 76 atoms in block 122 Block first atom: 8727 Blocpdb> 79 atoms in block 123 Block first atom: 8803 Blocpdb> 80 atoms in block 124 Block first atom: 8882 Blocpdb> 43 atoms in block 125 Block first atom: 8962 Blocpdb> 68 atoms in block 126 Block first atom: 9005 Blocpdb> 69 atoms in block 127 Block first atom: 9073 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 9142 Blocpdb> 79 atoms in block 129 Block first atom: 9209 Blocpdb> 80 atoms in block 130 Block first atom: 9288 Blocpdb> 75 atoms in block 131 Block first atom: 9368 Blocpdb> 70 atoms in block 132 Block first atom: 9443 Blocpdb> 80 atoms in block 133 Block first atom: 9513 Blocpdb> 77 atoms in block 134 Block first atom: 9593 Blocpdb> 81 atoms in block 135 Block first atom: 9670 Blocpdb> 70 atoms in block 136 Block first atom: 9751 Blocpdb> 78 atoms in block 137 Block first atom: 9821 Blocpdb> 73 atoms in block 138 Block first atom: 9899 Blocpdb> 64 atoms in block 139 Block first atom: 9972 Blocpdb> 61 atoms in block 140 Block first atom: 10036 Blocpdb> 69 atoms in block 141 Block first atom: 10097 Blocpdb> 78 atoms in block 142 Block first atom: 10166 Blocpdb> 76 atoms in block 143 Block first atom: 10244 Blocpdb> 78 atoms in block 144 Block first atom: 10320 Blocpdb> 63 atoms in block 145 Block first atom: 10398 Blocpdb> 72 atoms in block 146 Block first atom: 10461 Blocpdb> 71 atoms in block 147 Block first atom: 10533 Blocpdb> 70 atoms in block 148 Block first atom: 10604 Blocpdb> 77 atoms in block 149 Block first atom: 10674 Blocpdb> 84 atoms in block 150 Block first atom: 10751 Blocpdb> 77 atoms in block 151 Block first atom: 10835 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 10912 Blocpdb> 84 atoms in block 153 Block first atom: 10981 Blocpdb> 75 atoms in block 154 Block first atom: 11065 Blocpdb> 80 atoms in block 155 Block first atom: 11140 Blocpdb> 73 atoms in block 156 Block first atom: 11220 Blocpdb> 57 atoms in block 157 Block first atom: 11293 Blocpdb> 71 atoms in block 158 Block first atom: 11350 Blocpdb> 66 atoms in block 159 Block first atom: 11421 Blocpdb> 72 atoms in block 160 Block first atom: 11487 Blocpdb> 75 atoms in block 161 Block first atom: 11559 Blocpdb> 75 atoms in block 162 Block first atom: 11634 Blocpdb> 65 atoms in block 163 Block first atom: 11709 Blocpdb> 60 atoms in block 164 Block first atom: 11774 Blocpdb> 65 atoms in block 165 Block first atom: 11834 Blocpdb> 59 atoms in block 166 Block first atom: 11899 Blocpdb> 62 atoms in block 167 Block first atom: 11958 Blocpdb> 81 atoms in block 168 Block first atom: 12020 Blocpdb> 84 atoms in block 169 Block first atom: 12101 Blocpdb> 66 atoms in block 170 Block first atom: 12185 Blocpdb> 76 atoms in block 171 Block first atom: 12251 Blocpdb> 74 atoms in block 172 Block first atom: 12327 Blocpdb> 73 atoms in block 173 Block first atom: 12401 Blocpdb> 80 atoms in block 174 Block first atom: 12474 Blocpdb> 88 atoms in block 175 Block first atom: 12554 Blocpdb> 76 atoms in block 176 Block first atom: 12642 Blocpdb> 71 atoms in block 177 Block first atom: 12718 Blocpdb> 78 atoms in block 178 Block first atom: 12789 Blocpdb> 64 atoms in block 179 Block first atom: 12867 Blocpdb> 70 atoms in block 180 Block first atom: 12931 Blocpdb> 82 atoms in block 181 Block first atom: 13001 Blocpdb> 29 atoms in block 182 Block first atom: 13082 Blocpdb> 182 blocks. Blocpdb> At most, 100 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5284153 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39333 Prepmat> Matrix trace = 11569300.0000 Prepmat> Last element read: 39333 39333 198.4221 Prepmat> 16654 lines saved. Prepmat> 15021 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13111 RTB> Total mass = 13111.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13111 RTB> Number of blocks = 182 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 195517.0968 RTB> 56022 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1092 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56022 Diagstd> Projected matrix trace = 195517.0968 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1092 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 195517.0968 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5123035 0.5780275 1.0396299 1.9801285 2.1819319 2.8736474 3.3552993 3.5902186 4.4132409 4.7065490 4.8937563 5.6444354 5.8356641 6.9953537 7.7352827 8.6787068 9.4061015 9.6841393 10.2051618 10.6668055 10.8789089 11.0039864 11.6416806 11.9927992 12.2865804 12.6885026 12.7383935 13.1666162 13.6107733 14.0237117 14.1826780 14.4842622 14.8590502 15.8698185 16.0481454 16.8643614 17.1925225 17.4935960 18.1041977 18.6462136 18.8524663 18.9773218 19.9741717 20.1363117 21.2141516 21.4644255 22.3536097 22.5021772 22.9248316 23.5142367 23.6906626 23.9882476 24.0312955 24.5977229 24.7202650 25.5931591 25.8741945 26.6157239 26.6994413 27.4053556 27.8473373 28.1359617 28.5687405 28.8330547 29.1815475 29.3569907 29.8090245 29.9051082 30.1133323 30.7079161 30.8109533 31.4706518 31.7196718 32.5822704 32.9748691 33.1757228 33.3118496 33.7106104 34.3330295 34.5640529 35.1058350 35.4779169 35.5973620 35.8620952 36.3219853 36.9170168 37.0114962 37.6703726 37.7461685 38.2991255 38.7282942 39.0254565 39.2233562 39.6763678 40.1206629 40.3055012 40.6758666 41.0183615 41.5748397 42.2793138 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034330 0.0034331 0.0034333 0.0034338 0.0034348 0.0034362 77.7246801 82.5599696 110.7221873 152.8065500 160.4042528 184.0822943 198.9119686 205.7575258 228.1256392 235.5844233 240.2240301 257.9915819 262.3254481 287.2103715 302.0183811 319.9062974 333.0428466 337.9292583 346.9007417 354.6602109 358.1689630 360.2220581 370.5127184 376.0586311 380.6368177 386.8124701 387.5721939 394.0327947 400.6237393 406.6556101 408.9539446 413.2791248 418.5918859 432.5947663 435.0184785 445.9439035 450.2617768 454.1871325 462.0456886 468.9112018 471.4974702 473.0562030 485.3216544 487.2874685 500.1590305 503.1006918 513.4156609 515.1189777 519.9341672 526.5755899 528.5473315 531.8565860 532.3335914 538.5707122 539.9105839 549.3602455 552.3682403 560.2274975 561.1078787 568.4771342 573.0428757 576.0048795 580.4179402 583.0967332 586.6099698 588.3707144 592.8832249 593.8379782 595.9017880 601.7560328 602.7647520 609.1835249 611.5889392 619.8490674 623.5723081 625.4685502 626.7504492 630.4905603 636.2844993 638.4216566 643.4057444 646.8064414 647.8943427 650.2990357 654.4554210 659.7943310 660.6380770 666.4924564 667.1626382 672.0316225 675.7864267 678.3741277 680.0919848 684.0080832 687.8271754 689.4097855 692.5700192 695.4796617 700.1814034 706.0886741 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13111 Rtb_to_modes> Number of blocs = 182 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5123 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5780 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.040 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.980 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.874 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.644 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.679 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.28 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1092 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 235998 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201202161443130892.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201202161443130892.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 201202161443130892.atom Openam> file on opening on unit 11: 201202161443130892.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1612 First residue number = 12 Last residue number = 830 Number of atoms found = 13111 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9992E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5123 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5780 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.040 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.980 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.874 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.413 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.644 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.679 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.28 Bfactors> 106 vectors, 39333 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.512300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.835 for 1628 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.014 +/- 0.01 Bfactors> = 30.923 +/- 7.41 Bfactors> Shiftng-fct= 30.909 Bfactors> Scaling-fct= 611.493 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201202161443130892.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201202161443130892.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 184.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.0 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vecteur en lecture: 609.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Chkmod> 106 vectors, 39333 coordinates in file. Chkmod> That is: 13111 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7455 0.0034 0.7939 0.0034 0.7588 0.0034 0.9364 0.0034 0.9961 0.0034 0.7598 77.7211 0.6648 82.5545 0.7186 110.7371 0.6631 152.7950 0.6407 160.3999 0.5711 184.0857 0.6387 198.8946 0.4354 205.7424 0.6047 228.1096 0.2822 235.5856 0.4284 240.2197 0.2214 257.9706 0.6642 262.3217 0.5958 287.1908 0.2709 301.9999 0.1164 319.8980 0.2319 333.0268 0.3280 337.9123 0.4612 346.9681 0.5724 354.6981 0.4050 358.1715 0.3407 360.1413 0.1332 370.4701 0.5129 375.9986 0.4571 380.6734 0.3208 386.8187 0.2709 387.5800 0.3447 394.0665 0.1754 400.5952 0.4690 406.5843 0.5148 408.8978 0.2411 413.2006 0.4738 418.5873 0.5315 432.5787 0.3344 435.0249 0.3521 445.8671 0.3877 450.2094 0.4291 454.1210 0.2910 461.9723 0.5142 468.9387 0.3343 471.4464 0.4768 473.0693 0.4406 485.2501 0.3355 487.3112 0.4025 500.0886 0.5157 503.0272 0.3574 513.3522 0.4109 515.0719 0.3730 519.8571 0.3299 526.5055 0.4014 528.5173 0.3795 531.8532 0.4579 532.2964 0.3873 538.5725 0.4967 539.8845 0.2797 549.3028 0.3452 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201202161443130892.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201202161443130892.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 201202161443130892 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 201202161443130892 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom making animated gifs 11 models are in 201202161443130892.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201202161443130892.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201202161443130892.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 201202161443130892 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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201202161443130892.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 201202161443130892 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201202161443130892.eigenfacs 201202161443130892.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201202161443130892.eigenfacs 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201202161443130892.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 201202161443130892.10.pdb 201202161443130892.11.pdb 201202161443130892.7.pdb 201202161443130892.8.pdb 201202161443130892.9.pdb STDERR: real 1m1.273s user 1m0.920s sys 0m0.292s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw 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