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***  TRANSPORT PROTEIN 20-JUN-16 5GHK  ***

LOGs for ID: 20112707095998351

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20112707095998351.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20112707095998351.atom to be opened. Openam> File opened: 20112707095998351.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 563 First residue number = 3 Last residue number = 584 Number of atoms found = 4424 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -10.893845 +/- 11.066997 From: -44.370000 To: 12.551000 = -29.415560 +/- 16.598715 From: -64.981000 To: 8.838000 = -28.277769 +/- 17.348852 From: -74.751000 To: 14.136000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8275 % Filled. Pdbmat> 1609688 non-zero elements. Pdbmat> 175936 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.54 +/- 21.71 Maximum number = 132 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 3.518720E+06 Pdbmat> Larger element = 509.898 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 563 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20112707095998351.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20112707095998351.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20112707095998351.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4424 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 563 residues. Blocpdb> 27 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 22 atoms in block 2 Block first atom: 28 Blocpdb> 33 atoms in block 3 Block first atom: 50 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 83 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 107 Blocpdb> 32 atoms in block 6 Block first atom: 129 Blocpdb> 19 atoms in block 7 Block first atom: 161 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 180 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 200 Blocpdb> 29 atoms in block 10 Block first atom: 226 Blocpdb> 22 atoms in block 11 Block first atom: 255 Blocpdb> 28 atoms in block 12 Block first atom: 277 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 305 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 331 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 353 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 376 Blocpdb> 20 atoms in block 17 Block first atom: 401 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 421 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 440 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 459 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 478 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 501 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 526 Blocpdb> 25 atoms in block 24 Block first atom: 549 Blocpdb> 20 atoms in block 25 Block first atom: 574 Blocpdb> 5 atoms in block 26 Block first atom: 594 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 599 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 618 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 642 Blocpdb> 27 atoms in block 30 Block first atom: 667 Blocpdb> 26 atoms in block 31 Block first atom: 694 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 720 Blocpdb> 25 atoms in block 33 Block first atom: 743 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 768 Blocpdb> 18 atoms in block 35 Block first atom: 787 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 805 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 826 Blocpdb> 28 atoms in block 38 Block first atom: 842 Blocpdb> 26 atoms in block 39 Block first atom: 870 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 896 Blocpdb> 25 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 29 atoms in block 42 Block first atom: 948 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 977 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1001 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1029 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 1064 Blocpdb> 28 atoms in block 47 Block first atom: 1085 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1113 Blocpdb> 30 atoms in block 49 Block first atom: 1139 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1169 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 1191 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1211 Blocpdb> 22 atoms in block 53 Block first atom: 1231 Blocpdb> 16 atoms in block 54 Block first atom: 1253 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 1269 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1288 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1314 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1338 Blocpdb> 22 atoms in block 59 Block first atom: 1363 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1385 Blocpdb> 31 atoms in block 61 Block first atom: 1405 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 1436 Blocpdb> 23 atoms in block 63 Block first atom: 1456 Blocpdb> 24 atoms in block 64 Block first atom: 1479 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1503 Blocpdb> 25 atoms in block 66 Block first atom: 1527 Blocpdb> 27 atoms in block 67 Block first atom: 1552 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1579 Blocpdb> 26 atoms in block 69 Block first atom: 1603 Blocpdb> 27 atoms in block 70 Block first atom: 1629 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 1656 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1680 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1702 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1724 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1746 Blocpdb> 26 atoms in block 76 Block first atom: 1770 Blocpdb> 21 atoms in block 77 Block first atom: 1796 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 1817 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1839 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1864 Blocpdb> 24 atoms in block 81 Block first atom: 1883 Blocpdb> 21 atoms in block 82 Block first atom: 1907 Blocpdb> 29 atoms in block 83 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 84 Block first atom: 1957 Blocpdb> 23 atoms in block 85 Block first atom: 1980 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 2003 Blocpdb> 26 atoms in block 87 Block first atom: 2024 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 2050 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2071 Blocpdb> 24 atoms in block 90 Block first atom: 2095 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 2119 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2143 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 2162 Blocpdb> 28 atoms in block 94 Block first atom: 2187 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 2215 Blocpdb> 23 atoms in block 96 Block first atom: 2234 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2257 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2276 Blocpdb> 24 atoms in block 99 Block first atom: 2300 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 2324 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2349 Blocpdb> 30 atoms in block 102 Block first atom: 2372 Blocpdb> 22 atoms in block 103 Block first atom: 2402 Blocpdb> 26 atoms in block 104 Block first atom: 2424 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 2450 Blocpdb> 29 atoms in block 106 Block first atom: 2472 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2501 Blocpdb> 28 atoms in block 108 Block first atom: 2529 Blocpdb> 27 atoms in block 109 Block first atom: 2557 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2584 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2605 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2632 Blocpdb> 30 atoms in block 113 Block first atom: 2654 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 2684 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2704 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 2728 Blocpdb> 21 atoms in block 117 Block first atom: 2739 Blocpdb> 23 atoms in block 118 Block first atom: 2760 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 2783 Blocpdb> 28 atoms in block 120 Block first atom: 2807 Blocpdb> 24 atoms in block 121 Block first atom: 2835 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2859 Blocpdb> 24 atoms in block 123 Block first atom: 2883 Blocpdb> 24 atoms in block 124 Block first atom: 2907 Blocpdb> 21 atoms in block 125 Block first atom: 2931 Blocpdb> 28 atoms in block 126 Block first atom: 2952 Blocpdb> 26 atoms in block 127 Block first atom: 2980 Blocpdb> 25 atoms in block 128 Block first atom: 3006 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 3031 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 3055 Blocpdb> 26 atoms in block 131 Block first atom: 3076 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 3102 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 3130 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3151 Blocpdb> 21 atoms in block 135 Block first atom: 3173 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3194 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 3218 Blocpdb> 21 atoms in block 138 Block first atom: 3242 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 3263 Blocpdb> 22 atoms in block 140 Block first atom: 3283 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 3305 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 3329 Blocpdb> 28 atoms in block 143 Block first atom: 3351 Blocpdb> 17 atoms in block 144 Block first atom: 3379 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3396 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3424 Blocpdb> 23 atoms in block 147 Block first atom: 3445 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 3468 Blocpdb> 25 atoms in block 149 Block first atom: 3493 Blocpdb> 25 atoms in block 150 Block first atom: 3518 Blocpdb> 20 atoms in block 151 Block first atom: 3543 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 3563 Blocpdb> 22 atoms in block 153 Block first atom: 3590 Blocpdb> 21 atoms in block 154 Block first atom: 3612 Blocpdb> 21 atoms in block 155 Block first atom: 3633 Blocpdb> 30 atoms in block 156 Block first atom: 3654 Blocpdb> 24 atoms in block 157 Block first atom: 3684 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 3708 Blocpdb> 24 atoms in block 159 Block first atom: 3726 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 3750 Blocpdb> 23 atoms in block 161 Block first atom: 3778 Blocpdb> 28 atoms in block 162 Block first atom: 3801 Blocpdb> 21 atoms in block 163 Block first atom: 3829 Blocpdb> 29 atoms in block 164 Block first atom: 3850 Blocpdb> 23 atoms in block 165 Block first atom: 3879 Blocpdb> 21 atoms in block 166 Block first atom: 3902 Blocpdb> 24 atoms in block 167 Block first atom: 3923 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 3947 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 3970 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 3995 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 4020 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 4040 Blocpdb> 28 atoms in block 173 Block first atom: 4065 Blocpdb> 21 atoms in block 174 Block first atom: 4093 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 4114 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 4138 Blocpdb> 22 atoms in block 177 Block first atom: 4164 Blocpdb> 23 atoms in block 178 Block first atom: 4186 Blocpdb> 20 atoms in block 179 Block first atom: 4209 Blocpdb> 25 atoms in block 180 Block first atom: 4229 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 4254 Blocpdb> 15 atoms in block 182 Block first atom: 4271 Blocpdb> 14 atoms in block 183 Block first atom: 4286 Blocpdb> 23 atoms in block 184 Block first atom: 4300 Blocpdb> 22 atoms in block 185 Block first atom: 4323 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4345 Blocpdb> 17 atoms in block 187 Block first atom: 4369 Blocpdb> 19 atoms in block 188 Block first atom: 4386 Blocpdb> 20 atoms in block 189 Block first atom: 4404 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1609877 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13272 Prepmat> Matrix trace = 3518720.0000 Prepmat> Last element read: 13272 13272 79.4578 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 16110 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4424 RTB> Total mass = 4424.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4424 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 230714.3254 RTB> 63585 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63585 Diagstd> Projected matrix trace = 230714.3254 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 230714.3254 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4836449 0.5825602 1.1372322 1.3568672 1.8770915 2.4035931 2.5913454 2.9275223 3.5030381 3.9118641 4.3315159 4.6527369 4.9918638 5.5850829 6.8356838 7.3818922 7.7555533 8.4601696 9.1079394 9.6525358 10.5278619 10.6193880 11.5640465 11.7433530 12.3441054 13.3652552 13.7000206 13.9991393 14.3946882 14.7920982 15.5450768 15.8138177 16.0894423 16.4502062 16.9630718 17.2956236 17.7773861 18.6267897 18.8809262 19.7606417 20.1157173 20.8719786 21.5775880 22.0991280 22.7291149 23.1215637 23.4328013 23.7273148 24.5553321 24.7284019 25.4425333 25.8172323 26.5831500 27.1453835 27.7190801 27.8414409 28.0419702 28.5774494 28.7604546 29.3271007 29.6236101 30.0706693 30.4382372 31.0585849 31.6130474 31.8877745 32.1885833 32.4562892 32.9128454 33.6374189 33.6861926 34.7235880 35.2131269 35.4448289 36.1999312 36.5694915 36.9071709 37.4499409 37.8118691 38.6255571 39.1024422 39.3578413 39.8093821 40.1173576 40.2058422 40.5731199 41.2038963 41.8610563 41.9951413 42.5127333 43.0510665 43.4171171 43.9020425 44.1798244 45.0204423 45.6961812 46.2598131 46.6336068 46.9216851 47.3963244 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034324 0.0034327 0.0034338 0.0034339 0.0034340 75.5194077 82.8830417 115.8030101 126.4922600 148.7777568 168.3548975 174.8066417 185.7998618 203.2439887 214.7766980 226.0035386 234.2337803 242.6200246 256.6315772 283.9136427 295.0387974 302.4138473 315.8528609 327.7218110 337.3774034 352.3427738 353.8710421 369.2752450 372.1271341 381.5268365 396.9939685 401.9350603 406.2991818 411.9992370 417.6477746 428.1458276 431.8308291 435.5778383 440.4341173 447.2470965 451.6098364 457.8563403 468.6669038 471.8532254 482.7205663 487.0382185 496.1089832 504.4251457 510.4848401 517.7099867 522.1603382 525.6629712 528.9560345 538.1064355 539.9994347 547.7412593 551.7598843 559.8845727 565.7743718 571.7217141 572.9822047 575.0419683 580.5064008 582.3621669 588.0711116 591.0364588 595.4795171 599.1078754 605.1821531 610.5601587 613.2073976 616.0929111 618.6495657 622.9855810 629.8057367 630.2621747 639.8933212 644.3881953 646.5047532 653.3549008 656.6814387 659.7063403 664.5395735 667.7430137 674.8894803 679.0429140 681.2569024 685.1536865 687.7988413 688.5569436 691.6947550 697.0507885 702.5874238 703.7117519 708.0351104 712.5038866 715.5265810 719.5113401 721.7840368 728.6184411 734.0662117 738.5794456 741.5574182 743.8443701 747.5971069 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4424 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5826 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.137 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.357 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.503 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.332 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.585 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.382 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.756 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.108 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00005 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 79632 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00005 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112707095998351.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112707095998351.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20112707095998351.atom Openam> file on opening on unit 11: 20112707095998351.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 563 First residue number = 3 Last residue number = 584 Number of atoms found = 4424 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9896E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5826 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.137 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.357 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.503 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.332 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.585 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.382 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.756 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.108 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.40 Bfactors> 106 vectors, 13272 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.483600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.638 for 563 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.044 +/- 0.05 Bfactors> = 46.724 +/- 17.33 Bfactors> Shiftng-fct= 46.680 Bfactors> Scaling-fct= 361.380 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112707095998351.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112707095998351.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 174.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 471.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4 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vecteur en lecture: 639.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.6 Chkmod> 106 vectors, 13272 coordinates in file. Chkmod> That is: 4424 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8935 0.0034 0.7738 0.0034 0.7379 0.0034 0.7330 0.0034 0.9658 0.0034 0.8363 75.5127 0.3844 82.8823 0.4467 115.7862 0.5895 126.4930 0.4730 148.7677 0.3895 168.3619 0.3610 174.7875 0.5830 185.8070 0.4781 203.2342 0.4948 214.7712 0.6225 226.0065 0.4038 234.2303 0.5916 242.6129 0.4855 256.6187 0.4661 283.9080 0.5371 295.0283 0.5013 302.4096 0.5960 315.8361 0.0586 327.7088 0.5725 337.3710 0.4996 352.3634 0.3822 353.8660 0.3904 369.1948 0.5429 372.0580 0.3472 381.4470 0.4667 397.0474 0.3910 401.9175 0.5179 406.2942 0.2690 411.9145 0.4769 417.6002 0.1853 428.1952 0.2560 431.7602 0.3767 435.5667 0.3754 440.4125 0.4193 447.1874 0.5274 451.6476 0.4793 457.8703 0.2770 468.6872 0.3938 471.8214 0.3634 482.6920 0.4362 487.0692 0.1702 496.0642 0.4823 504.4317 0.1498 510.4730 0.5657 517.6978 0.3244 522.1203 0.3106 525.6090 0.3224 528.9633 0.3983 538.1345 0.3845 539.9937 0.3625 547.6905 0.3231 551.7658 0.3335 559.8274 0.5101 565.7982 0.2050 571.7067 0.3011 572.9428 0.2888 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112707095998351.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112707095998351.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20112707095998351 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom 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0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112707095998351.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 20112707095998351 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 20112707095998351 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112707095998351.eigenfacs 20112707095998351.atom making animated gifs 11 models are in 20112707095998351.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112707095998351.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112707095998351.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 20112707095998351.10.pdb 20112707095998351.11.pdb 20112707095998351.7.pdb 20112707095998351.8.pdb 20112707095998351.9.pdb STDERR: real 0m21.734s user 0m21.680s sys 0m0.044s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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