CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***    ***

LOGs for ID: 20112615465264077

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20112615465264077.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20112615465264077.atom to be opened. Openam> File opened: 20112615465264077.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 97 First residue number = 23 Last residue number = 119 Number of atoms found = 705 Mean number per residue = 7.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 60.735234 +/- 9.381788 From: 43.568000 To: 85.329000 = 27.810664 +/- 6.356461 From: 12.635000 To: 45.892000 = 24.413757 +/- 12.009882 From: 3.354000 To: 51.746000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 10.2026 % Filled. Pdbmat> 228300 non-zero elements. Pdbmat> 24900 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 70.64 +/- 21.56 Maximum number = 126 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 498000. Pdbmat> Larger element = 476.911 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 97 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20112615465264077.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20112615465264077.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20112615465264077.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 705 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 97 residues. Blocpdb> 5 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 6 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 24 Blocpdb> 5 atoms in block 5 Block first atom: 38 Blocpdb> 5 atoms in block 6 Block first atom: 43 Blocpdb> 5 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 4 atoms in block 8 Block first atom: 53 Blocpdb> 5 atoms in block 9 Block first atom: 57 Blocpdb> 5 atoms in block 10 Block first atom: 62 Blocpdb> 7 atoms in block 11 Block first atom: 67 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 74 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 81 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 89 Blocpdb> 7 atoms in block 15 Block first atom: 97 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 104 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 112 Blocpdb> 8 atoms in block 18 Block first atom: 119 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 127 Blocpdb> 5 atoms in block 20 Block first atom: 135 Blocpdb> 4 atoms in block 21 Block first atom: 140 Blocpdb> 6 atoms in block 22 Block first atom: 144 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 150 Blocpdb> 8 atoms in block 24 Block first atom: 162 Blocpdb> 5 atoms in block 25 Block first atom: 170 Blocpdb> 7 atoms in block 26 Block first atom: 175 Blocpdb> 8 atoms in block 27 Block first atom: 182 Blocpdb> 5 atoms in block 28 Block first atom: 190 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 195 Blocpdb> 11 atoms in block 30 Block first atom: 204 Blocpdb> 4 atoms in block 31 Block first atom: 215 Blocpdb> 5 atoms in block 32 Block first atom: 219 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 224 Blocpdb> 4 atoms in block 34 Block first atom: 231 Blocpdb> 5 atoms in block 35 Block first atom: 235 Blocpdb> 9 atoms in block 36 Block first atom: 240 Blocpdb> 8 atoms in block 37 Block first atom: 249 Blocpdb> 7 atoms in block 38 Block first atom: 257 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 264 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 271 Blocpdb> 7 atoms in block 41 Block first atom: 283 Blocpdb> 5 atoms in block 42 Block first atom: 290 Blocpdb> 5 atoms in block 43 Block first atom: 295 Blocpdb> 8 atoms in block 44 Block first atom: 300 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 308 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 322 Blocpdb> 6 atoms in block 47 Block first atom: 336 Blocpdb> 7 atoms in block 48 Block first atom: 342 Blocpdb> 5 atoms in block 49 Block first atom: 349 Blocpdb> 7 atoms in block 50 Block first atom: 354 Blocpdb> 5 atoms in block 51 Block first atom: 361 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 366 Blocpdb> 7 atoms in block 53 Block first atom: 373 Blocpdb> 7 atoms in block 54 Block first atom: 380 Blocpdb> 4 atoms in block 55 Block first atom: 387 Blocpdb> 12 atoms in block 56 Block first atom: 391 Blocpdb> 4 atoms in block 57 Block first atom: 403 Blocpdb> 8 atoms in block 58 Block first atom: 407 Blocpdb> 8 atoms in block 59 Block first atom: 415 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 423 Blocpdb> 7 atoms in block 61 Block first atom: 435 Blocpdb> 7 atoms in block 62 Block first atom: 442 Blocpdb> 7 atoms in block 63 Block first atom: 449 Blocpdb> 8 atoms in block 64 Block first atom: 456 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 464 Blocpdb> 4 atoms in block 66 Block first atom: 478 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 482 Blocpdb> 6 atoms in block 68 Block first atom: 493 Blocpdb> 7 atoms in block 69 Block first atom: 499 Blocpdb> 5 atoms in block 70 Block first atom: 506 Blocpdb> 7 atoms in block 71 Block first atom: 511 Blocpdb> 7 atoms in block 72 Block first atom: 518 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 525 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 532 Blocpdb> 7 atoms in block 75 Block first atom: 540 Blocpdb> 5 atoms in block 76 Block first atom: 547 Blocpdb> 4 atoms in block 77 Block first atom: 552 Blocpdb> 8 atoms in block 78 Block first atom: 556 Blocpdb> 7 atoms in block 79 Block first atom: 564 Blocpdb> 6 atoms in block 80 Block first atom: 571 Blocpdb> 11 atoms in block 81 Block first atom: 577 Blocpdb> 4 atoms in block 82 Block first atom: 588 Blocpdb> 8 atoms in block 83 Block first atom: 592 Blocpdb> 7 atoms in block 84 Block first atom: 600 Blocpdb> 7 atoms in block 85 Block first atom: 607 Blocpdb> 5 atoms in block 86 Block first atom: 614 Blocpdb> 5 atoms in block 87 Block first atom: 619 Blocpdb> 8 atoms in block 88 Block first atom: 624 Blocpdb> 5 atoms in block 89 Block first atom: 632 Blocpdb> 7 atoms in block 90 Block first atom: 637 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 644 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 658 Blocpdb> 7 atoms in block 93 Block first atom: 669 Blocpdb> 4 atoms in block 94 Block first atom: 676 Blocpdb> 8 atoms in block 95 Block first atom: 680 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 688 Blocpdb> 9 atoms in block 97 Block first atom: 696 Blocpdb> 97 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 228397 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 2115 Prepmat> Matrix trace = 498000.0000 Prepmat> Last element read: 2115 2115 128.7619 Prepmat> 4754 lines saved. Prepmat> 3688 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 705 RTB> Total mass = 705.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 705 RTB> Number of blocks = 97 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 124673.2552 RTB> 36885 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 582 Diagstd> Nb of non-zero elements: 36885 Diagstd> Projected matrix trace = 124673.2552 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 582 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 124673.2552 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4527740 1.0266704 1.3472514 3.0093736 3.8569976 6.0132371 6.9092887 7.7925081 10.7095390 11.9962505 14.0364571 15.7676583 18.1587406 20.0104358 20.4536239 22.9034571 23.8346705 25.3641955 27.3627847 28.3228177 28.9074686 29.8814837 31.6432499 33.7926891 35.7230480 36.1965644 38.1939713 40.5222133 41.8455800 42.4193147 44.3890733 44.5969619 47.6292875 48.0006293 48.9987374 50.4198952 50.7364243 52.3821884 53.0501307 54.2808376 55.9414620 57.2447618 59.4110007 59.7325916 61.0691850 62.2415840 63.3292014 63.7700573 65.1625453 65.3936770 66.1813308 66.8982819 68.7089354 70.2275484 70.8211330 71.2962638 71.8416880 72.9855775 74.3366649 75.1842110 77.0014272 77.1526908 79.1170659 80.0271016 81.4258282 82.1448072 82.4307772 83.7899805 84.6691544 85.7876659 86.9090445 87.3140652 87.7057731 88.9443605 89.9299191 90.4964402 92.1269259 93.0017407 94.3200171 94.9396350 95.1099436 95.7966707 96.8257595 97.2666569 98.4844335 100.9499784 101.2476676 101.9124335 102.4241378 103.5132826 104.9776093 105.6994085 107.5293388 107.8573565 108.2659241 109.7530169 110.5924266 111.1796178 112.3307072 112.9063324 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034324 0.0034332 0.0034338 0.0034339 0.0034349 73.0694784 110.0299189 126.0432523 188.3793666 213.2651848 266.2866806 285.4381060 303.1334843 355.3699235 376.1127396 406.8403614 431.2001276 462.7411728 485.7620177 491.1118501 519.6917237 530.1513316 546.8973594 568.0354327 577.9143905 583.8486915 593.6033722 610.8517474 631.2576536 649.0371168 653.3245169 671.1084216 691.2606886 702.4575365 707.2567550 723.4913109 725.1835050 749.4321550 752.3479567 760.1297404 771.0743376 773.4909001 785.9358503 790.9308390 800.0526178 812.1985060 821.6051570 837.0062755 839.2685696 848.6064774 856.7134763 864.1662200 867.1688800 876.5855358 878.1387849 883.4114589 888.1836256 900.1230646 910.0160121 913.8537858 916.9141313 920.4146957 927.7133463 936.2607488 941.5829886 952.8941655 953.8296512 965.8959982 971.4351733 979.8878493 984.2044800 985.9161428 994.0113078 999.2125762 1005.7909095 1012.3431951 1014.6993556 1016.9728782 1024.1285862 1029.7869447 1033.0254673 1042.2899978 1047.2269712 1054.6229448 1058.0813494 1059.0299498 1062.8463571 1068.5398820 1070.9699244 1077.6533316 1091.0594006 1092.6669167 1096.2481317 1098.9968274 1104.8245621 1112.6116920 1116.4301561 1126.0528340 1127.7690356 1129.9030314 1137.6364900 1141.9786221 1145.0062802 1150.9183829 1153.8634864 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 705 Rtb_to_modes> Number of blocs = 97 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.347 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.857 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.013 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.9 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 582 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00005 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99995 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 12690 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00003 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 0.99998 0.99998 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 0.99999 1.00005 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 0.99997 0.99998 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 0.99996 1.00001 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99995 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112615465264077.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112615465264077.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20112615465264077.atom Openam> file on opening on unit 11: 20112615465264077.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 97 First residue number = 23 Last residue number = 119 Number of atoms found = 705 Mean number per residue = 7.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.347 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.857 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.013 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.9 Bfactors> 106 vectors, 2115 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.452800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.569 for 97 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.124 +/- 0.17 Bfactors> = 92.066 +/- 36.02 Bfactors> Shiftng-fct= 91.942 Bfactors> Scaling-fct= 205.853 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112615465264077.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112615465264077.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 888.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1138. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154. Chkmod> 106 vectors, 2115 coordinates in file. Chkmod> That is: 705 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 72 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7321 0.0034 0.8734 0.0034 0.9998 0.0034 0.9708 0.0034 0.9212 0.0034 0.7025 73.0684 0.4864 110.0429 0.4848 126.0261 0.2399 188.3596 0.3251 213.2561 0.5836 266.2700 0.0919 285.4199 0.5868 303.1300 0.5924 355.3623 0.6105 376.1554 0.4710 406.8742 0.4799 431.2136 0.4383 462.7374 0.3750 485.7359 0.2629 491.0473 0.3147 519.6302 0.3672 530.0766 0.3144 546.8287 0.2042 567.9821 0.5094 577.8608 0.4011 583.8492 0.3839 593.5632 0.3699 610.7942 0.5537 631.2054 0.5166 648.9816 0.3411 653.3275 0.4551 671.0447 0.2442 691.2121 0.4436 702.4645 0.4899 707.2321 0.3432 723.4678 0.5188 725.1771 0.5175 749.4056 0.3833 752.3107 0.0500 760.1069 0.3480 771.0420 0.4958 773.4850 0.3829 785.8857 0.4365 790.8959 0.4608 800.0121 0.3859 812.1530 0.5437 821.5357 0.4127 836.9633 0.4740 839.2143 0.3957 848.5757 0.3826 856.6658 0.3177 864.1346 0.3916 867.1313 0.4263 876.5308 0.3322 878.0764 0.3746 883.3647 0.3309 888.1569 0.4894 900.0914 0.5173 909.9928 0.0730 913.8072 0.2313 916.8988 0.2819 920.3644 0.5137 927.7016 0.2728 936.2416 0.3016 941.5162 0.2587 952.8444 0.3410 953.7721 0.4109 965.8724 0.4234 971.4111 0.4698 979.8709 0.3711 984.1334 0.0594 985.8692 0.4679 993.9688 0.3490 999.1747 0.3766 1005.7614 0.3976 1012.3053 0.3770 1014.6322 0.4022 1016.9537 0.3861 1024.0595 0.2882 1029.7432 0.4358 1033.0014 0.1629 1042.2626 0.4324 1047.1722 0.1520 1054.5776 0.2018 1058.0380 0.3055 1058.9848 0.3498 1062.8192 0.2619 1068.5174 0.3925 1070.9424 0.3596 1077.5828 0.3832 1090.7425 0.3907 1092.3628 0.3829 1096.1342 0.3162 1098.8202 0.4359 1104.7063 0.3911 1112.6826 0.4112 1116.3854 0.4242 1125.8509 0.3732 1127.9435 0.3811 1130.0323 0.3419 1137.8311 0.2181 1141.9687 0.2574 1145.0621 0.3515 1150.7117 0.1693 1153.7816 0.1525 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 20112615465264077 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom making animated gifs 11 models are in 20112615465264077.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20112615465264077 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom making animated gifs 11 models are in 20112615465264077.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 20112615465264077 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom making animated gifs 11 models are in 20112615465264077.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 20112615465264077 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom making animated gifs 11 models are in 20112615465264077.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 20112615465264077 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112615465264077.eigenfacs 20112615465264077.atom making animated gifs 11 models are in 20112615465264077.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112615465264077.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 20112615465264077.10.pdb 20112615465264077.11.pdb 20112615465264077.7.pdb 20112615465264077.8.pdb 20112615465264077.9.pdb STDERR: real 0m2.474s user 0m2.456s sys 0m0.016s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.