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***  MEMBRANE PROTEIN 23-JUL-98 1BL8  ***

LOGs for ID: 20112421594637804

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 20112421594637804.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 20112421594637804.atom to be opened. Openam> File opened: 20112421594637804.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 388 First residue number = 23 Last residue number = 119 Number of atoms found = 2820 Mean number per residue = 7.3 Pdbmat> Coordinate statistics: = 72.189935 +/- 11.216919 From: 43.568000 To: 96.625000 = 26.599682 +/- 10.748912 From: 0.976000 To: 52.231000 = 19.898374 +/- 13.557813 From: -6.410000 To: 55.766000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9667 % Filled. Pdbmat> 1061789 non-zero elements. Pdbmat> 116121 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.36 +/- 22.63 Maximum number = 127 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 2.322420E+06 Pdbmat> Larger element = 498.000 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 388 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 20112421594637804.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 20112421594637804.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 20112421594637804.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2820 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 388 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 24 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 10 atoms in block 3 Block first atom: 38 Blocpdb> 9 atoms in block 4 Block first atom: 48 Blocpdb> 10 atoms in block 5 Block first atom: 57 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 67 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 81 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 97 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 112 Blocpdb> 13 atoms in block 10 Block first atom: 127 Blocpdb> 10 atoms in block 11 Block first atom: 140 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 150 Blocpdb> 12 atoms in block 13 Block first atom: 170 Blocpdb> 13 atoms in block 14 Block first atom: 182 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 195 Blocpdb> 9 atoms in block 16 Block first atom: 215 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 224 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 235 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 249 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 264 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 283 Blocpdb> 13 atoms in block 22 Block first atom: 295 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 308 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 336 Blocpdb> 12 atoms in block 25 Block first atom: 349 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 361 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 373 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 387 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 403 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 415 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 435 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 449 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 464 Blocpdb> 17 atoms in block 34 Block first atom: 482 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 499 Blocpdb> 14 atoms in block 36 Block first atom: 511 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 525 Blocpdb> 12 atoms in block 38 Block first atom: 540 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 552 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 564 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 577 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 592 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 607 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 619 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 632 Blocpdb> 25 atoms in block 46 Block first atom: 644 Blocpdb> 11 atoms in block 47 Block first atom: 669 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 680 Blocpdb> 9 atoms in block 49 Block first atom: 697 Blocpdb> 13 atoms in block 50 Block first atom: 706 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 719 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 743 Blocpdb> 9 atoms in block 53 Block first atom: 753 Blocpdb> 10 atoms in block 54 Block first atom: 762 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 772 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 786 Blocpdb> 15 atoms in block 57 Block first atom: 802 Blocpdb> 15 atoms in block 58 Block first atom: 817 Blocpdb> 13 atoms in block 59 Block first atom: 832 Blocpdb> 10 atoms in block 60 Block first atom: 845 Blocpdb> 20 atoms in block 61 Block first atom: 855 Blocpdb> 12 atoms in block 62 Block first atom: 875 Blocpdb> 13 atoms in block 63 Block first atom: 887 Blocpdb> 20 atoms in block 64 Block first atom: 900 Blocpdb> 9 atoms in block 65 Block first atom: 920 Blocpdb> 11 atoms in block 66 Block first atom: 929 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 940 Blocpdb> 15 atoms in block 68 Block first atom: 954 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 969 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 988 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1000 Blocpdb> 28 atoms in block 72 Block first atom: 1013 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1041 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 1054 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1066 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1078 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1092 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 1108 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1120 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1140 Blocpdb> 15 atoms in block 81 Block first atom: 1154 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1169 Blocpdb> 17 atoms in block 83 Block first atom: 1187 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 1204 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1216 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1230 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1245 Blocpdb> 12 atoms in block 88 Block first atom: 1257 Blocpdb> 13 atoms in block 89 Block first atom: 1269 Blocpdb> 15 atoms in block 90 Block first atom: 1282 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 1297 Blocpdb> 12 atoms in block 92 Block first atom: 1312 Blocpdb> 13 atoms in block 93 Block first atom: 1324 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1337 Blocpdb> 25 atoms in block 95 Block first atom: 1349 Blocpdb> 11 atoms in block 96 Block first atom: 1374 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1385 Blocpdb> 9 atoms in block 98 Block first atom: 1402 Blocpdb> 13 atoms in block 99 Block first atom: 1411 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 1424 Blocpdb> 10 atoms in block 101 Block first atom: 1448 Blocpdb> 9 atoms in block 102 Block first atom: 1458 Blocpdb> 10 atoms in block 103 Block first atom: 1467 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1477 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1491 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1507 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1522 Blocpdb> 13 atoms in block 108 Block first atom: 1537 Blocpdb> 10 atoms in block 109 Block first atom: 1550 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 1560 Blocpdb> 12 atoms in block 111 Block first atom: 1580 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1592 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 1605 Blocpdb> 9 atoms in block 114 Block first atom: 1625 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 1634 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 1645 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1659 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1674 Blocpdb> 12 atoms in block 119 Block first atom: 1693 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1705 Blocpdb> 28 atoms in block 121 Block first atom: 1718 Blocpdb> 13 atoms in block 122 Block first atom: 1746 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1759 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1771 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 1783 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 1797 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 1813 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 1825 Blocpdb> 14 atoms in block 129 Block first atom: 1845 Blocpdb> 15 atoms in block 130 Block first atom: 1859 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 1874 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 1892 Blocpdb> 12 atoms in block 133 Block first atom: 1909 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 1921 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 1935 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 1950 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 1962 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 1974 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 1987 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2002 Blocpdb> 12 atoms in block 141 Block first atom: 2017 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2029 Blocpdb> 12 atoms in block 143 Block first atom: 2042 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 2054 Blocpdb> 11 atoms in block 145 Block first atom: 2079 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2090 Blocpdb> 9 atoms in block 147 Block first atom: 2107 Blocpdb> 13 atoms in block 148 Block first atom: 2116 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 2129 Blocpdb> 10 atoms in block 150 Block first atom: 2153 Blocpdb> 9 atoms in block 151 Block first atom: 2163 Blocpdb> 10 atoms in block 152 Block first atom: 2172 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2182 Blocpdb> 16 atoms in block 154 Block first atom: 2196 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2212 Blocpdb> 15 atoms in block 156 Block first atom: 2227 Blocpdb> 13 atoms in block 157 Block first atom: 2242 Blocpdb> 10 atoms in block 158 Block first atom: 2255 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2265 Blocpdb> 12 atoms in block 160 Block first atom: 2285 Blocpdb> 13 atoms in block 161 Block first atom: 2297 Blocpdb> 20 atoms in block 162 Block first atom: 2310 Blocpdb> 9 atoms in block 163 Block first atom: 2330 Blocpdb> 11 atoms in block 164 Block first atom: 2339 Blocpdb> 14 atoms in block 165 Block first atom: 2350 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2364 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 2379 Blocpdb> 12 atoms in block 168 Block first atom: 2398 Blocpdb> 13 atoms in block 169 Block first atom: 2410 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 2423 Blocpdb> 13 atoms in block 171 Block first atom: 2451 Blocpdb> 12 atoms in block 172 Block first atom: 2464 Blocpdb> 12 atoms in block 173 Block first atom: 2476 Blocpdb> 14 atoms in block 174 Block first atom: 2488 Blocpdb> 16 atoms in block 175 Block first atom: 2502 Blocpdb> 12 atoms in block 176 Block first atom: 2518 Blocpdb> 20 atoms in block 177 Block first atom: 2530 Blocpdb> 14 atoms in block 178 Block first atom: 2550 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 2564 Blocpdb> 18 atoms in block 180 Block first atom: 2579 Blocpdb> 17 atoms in block 181 Block first atom: 2597 Blocpdb> 12 atoms in block 182 Block first atom: 2614 Blocpdb> 14 atoms in block 183 Block first atom: 2626 Blocpdb> 15 atoms in block 184 Block first atom: 2640 Blocpdb> 12 atoms in block 185 Block first atom: 2655 Blocpdb> 12 atoms in block 186 Block first atom: 2667 Blocpdb> 13 atoms in block 187 Block first atom: 2679 Blocpdb> 15 atoms in block 188 Block first atom: 2692 Blocpdb> 15 atoms in block 189 Block first atom: 2707 Blocpdb> 12 atoms in block 190 Block first atom: 2722 Blocpdb> 13 atoms in block 191 Block first atom: 2734 Blocpdb> 12 atoms in block 192 Block first atom: 2747 Blocpdb> 25 atoms in block 193 Block first atom: 2759 Blocpdb> 11 atoms in block 194 Block first atom: 2784 Blocpdb> 17 atoms in block 195 Block first atom: 2795 Blocpdb> 9 atoms in block 196 Block first atom: 2811 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1061985 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8460 Prepmat> Matrix trace = 2322420.0000 Prepmat> Last element read: 8460 8460 134.7210 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17175 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2820 RTB> Total mass = 2820.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2820 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 275111.5577 RTB> 73776 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 73776 Diagstd> Projected matrix trace = 275111.5577 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 275111.5577 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.0031056 3.6974040 3.7097540 3.7452431 5.6948047 6.3624113 6.3948010 6.5410495 7.5901301 7.6765727 7.6898528 8.0049001 8.1449440 8.5593272 8.5809540 9.2595814 9.8686836 9.8961032 10.0184032 10.0716266 11.8801879 12.5713447 12.5915770 13.3342851 13.7341530 15.3491252 15.5154811 16.1047755 18.3780344 18.4844075 20.0362506 20.3219137 21.3883782 21.7652713 22.7983782 23.4767087 23.5928295 23.6306835 23.7684269 25.4809683 25.5633728 25.6120472 26.3012629 26.4683364 26.4998752 27.5397129 29.6278671 30.2505152 30.3176618 30.3880620 31.5585441 33.2022029 33.4340685 33.9200059 34.6970015 35.2780483 35.8024277 35.8808913 36.6994830 36.8420839 37.7548020 38.4263899 38.5959737 39.6793233 39.7176552 41.1037043 41.3810354 41.7009396 41.8494452 43.3807251 43.4956955 43.7485131 44.2308468 44.8078488 44.8895642 45.7468439 46.0127704 46.7068220 48.6685300 48.9885827 49.0634454 49.2696576 51.8267453 52.2927095 52.6985664 52.7545565 53.9159566 54.0290208 54.8000329 55.0730904 56.6408350 56.7004998 57.3367358 57.6150576 58.7432067 58.8231820 59.8288565 59.9206052 60.9540572 61.0361308 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034328 0.0034338 0.0034342 0.0034350 0.0034355 153.6905637 208.8063655 209.1548005 210.1528503 259.1401455 273.9089041 274.6052258 277.7275732 299.1712745 300.8700544 301.1301875 307.2368036 309.9126695 317.6984482 318.0995587 330.4387399 341.1339114 341.6074929 343.7118729 344.6236589 374.2888888 385.0225332 385.3322372 396.5337415 402.4354418 425.4387993 427.7380674 435.7853419 465.5269312 466.8722355 486.0752494 489.5280496 502.2086718 506.6141581 518.4982050 526.1552233 527.4548558 527.8778292 529.4140952 548.1548289 549.0404695 549.5629259 556.9081601 558.6741841 559.0069335 569.8689373 591.0789242 597.2575770 597.9200712 598.6138798 610.0336054 625.7181175 627.8991486 632.4456936 639.6483040 644.9819416 649.7578255 650.4694308 657.8475377 659.1243774 667.2389325 673.1472451 674.6309810 684.0335589 684.3638817 696.2027937 698.5475229 701.2424537 702.4899781 715.2266425 716.1737855 718.2521405 722.2007038 726.8960810 727.5585934 734.4730231 736.6046763 742.1393156 757.5641157 760.0509706 760.6314908 762.2282700 781.7578457 785.2642980 788.3057249 788.7243857 797.3590680 798.1946796 803.8697567 805.8700284 817.2597373 817.6900698 822.2649206 824.2582079 832.2889050 832.8552681 839.9445787 840.5883674 847.8062022 848.3767882 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2820 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.745 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.695 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.395 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.590 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.005 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.145 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.559 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.581 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.04 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 50760 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112421594637804.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112421594637804.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 20112421594637804.atom Openam> file on opening on unit 11: 20112421594637804.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 388 First residue number = 23 Last residue number = 119 Number of atoms found = 2820 Mean number per residue = 7.3 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.745 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.695 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.395 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.590 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.005 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.145 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.559 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.581 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.869 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.04 Bfactors> 106 vectors, 8460 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.003000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.466 for 388 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.029 +/- 0.04 Bfactors> = 89.810 +/- 37.87 Bfactors> Shiftng-fct= 89.781 Bfactors> Scaling-fct= 999.655 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 20112421594637804.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 20112421594637804.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 317.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 2820 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8637 0.0034 0.9294 0.0034 0.6827 0.0034 0.7872 0.0034 0.7363 0.0034 0.7668 153.6799 0.4766 208.7860 0.4937 209.1528 0.5169 210.1370 0.4894 259.1335 0.4777 273.8883 0.5268 274.5977 0.5392 277.7146 0.1468 299.1559 0.4653 300.8655 0.3452 301.1201 0.3480 307.2255 0.3763 309.9004 0.0394 317.6787 0.4802 318.0868 0.4680 330.4320 0.5591 341.1247 0.2739 341.5910 0.2058 343.7245 0.7072 344.5810 0.2272 374.2699 0.4713 384.9854 0.3317 385.2916 0.3345 396.4530 0.5685 402.3573 0.3844 425.4327 0.3718 427.7820 0.3919 435.7020 0.6068 465.5318 0.4241 466.7965 0.3912 486.0999 0.0511 489.4840 0.1641 502.2062 0.4807 506.6474 0.4149 518.4944 0.0634 526.1695 0.0284 527.4006 0.2870 527.8475 0.1703 529.4089 0.3082 548.1209 0.4344 548.9807 0.3673 549.5174 0.4176 556.8709 0.2179 558.6678 0.4530 558.9843 0.4255 569.8474 0.5694 591.0748 0.5068 597.2269 0.3753 597.9175 0.3755 598.6073 0.4086 610.0215 0.2678 625.6705 0.2813 627.8340 0.2848 632.4185 0.3293 639.6485 0.3364 644.9721 0.3732 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112421594637804.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112421594637804.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 20112421594637804 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=100 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom making animated gifs 11 models are in 20112421594637804.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112421594637804.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 20112421594637804.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 20112421594637804 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=0 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=20 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=40 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=60 20112421594637804.eigenfacs 20112421594637804.atom calculating perturbed structure for DQ=80 20112421594637804.eigenfacs 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