***  SIGNALING PROTEIN/AGONIST 18-SEP-13 4MS4  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 20111300122393249.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 20111300122393249.atom to be opened.
Openam> File opened: 20111300122393249.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 408
First residue number = 50
Last residue number = 465
Number of atoms found = 6479
Mean number per residue = 15.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -22.915710 +/- 16.878915 From: -60.748000 To: 23.590000
= 13.676998 +/- 9.848092 From: -11.657000 To: 40.173000
= -30.791314 +/- 10.802971 From: -55.103000 To: -3.179000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.5854 % Filled.
Pdbmat> 4884112 non-zero elements.
Pdbmat> 538447 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 166.21 +/- 50.05
Maximum number = 249
Minimum number = 20
Pdbmat> Matrix trace = 1.076894E+07
Pdbmat> Larger element = 927.524
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
408 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 20111300122393249.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 20111300122393249.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
20111300122393249.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6479 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 408 residues.
Blocpdb> 58 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 56 atoms in block 2
Block first atom: 59
Blocpdb> 36 atoms in block 3
Block first atom: 115
Blocpdb> 51 atoms in block 4
Block first atom: 151
Blocpdb> 25 atoms in block 5
Block first atom: 202
Blocpdb> 45 atoms in block 6
Block first atom: 227
Blocpdb> 34 atoms in block 7
Block first atom: 272
Blocpdb> 42 atoms in block 8
Block first atom: 306
Blocpdb> 41 atoms in block 9
Block first atom: 348
Blocpdb> 46 atoms in block 10
Block first atom: 389
Blocpdb> 43 atoms in block 11
Block first atom: 435
Blocpdb> 49 atoms in block 12
Block first atom: 478
Blocpdb> 55 atoms in block 13
Block first atom: 527
Blocpdb> 45 atoms in block 14
Block first atom: 582
Blocpdb> 55 atoms in block 15
Block first atom: 627
Blocpdb> 60 atoms in block 16
Block first atom: 682
Blocpdb> 46 atoms in block 17
Block first atom: 742
Blocpdb> 43 atoms in block 18
Block first atom: 788
Blocpdb> 33 atoms in block 19
Block first atom: 831
Blocpdb> 41 atoms in block 20
Block first atom: 864
Blocpdb> 62 atoms in block 21
Block first atom: 905
Blocpdb> 55 atoms in block 22
Block first atom: 967
Blocpdb> 54 atoms in block 23
Block first atom: 1022
Blocpdb> 45 atoms in block 24
Block first atom: 1076
Blocpdb> 60 atoms in block 25
Block first atom: 1121
Blocpdb> 50 atoms in block 26
Block first atom: 1181
Blocpdb> 28 atoms in block 27
Block first atom: 1231
Blocpdb> 38 atoms in block 28
Block first atom: 1259
Blocpdb> 49 atoms in block 29
Block first atom: 1297
Blocpdb> 35 atoms in block 30
Block first atom: 1346
Blocpdb> 51 atoms in block 31
Block first atom: 1381
Blocpdb> 57 atoms in block 32
Block first atom: 1432
Blocpdb> 54 atoms in block 33
Block first atom: 1489
Blocpdb> 39 atoms in block 34
Block first atom: 1543
Blocpdb> 33 atoms in block 35
Block first atom: 1582
Blocpdb> 43 atoms in block 36
Block first atom: 1615
Blocpdb> 49 atoms in block 37
Block first atom: 1658
Blocpdb> 61 atoms in block 38
Block first atom: 1707
Blocpdb> 48 atoms in block 39
Block first atom: 1768
Blocpdb> 58 atoms in block 40
Block first atom: 1816
Blocpdb> 42 atoms in block 41
Block first atom: 1874
Blocpdb> 43 atoms in block 42
Block first atom: 1916
Blocpdb> 45 atoms in block 43
Block first atom: 1959
Blocpdb> 54 atoms in block 44
Block first atom: 2004
Blocpdb> 61 atoms in block 45
Block first atom: 2058
Blocpdb> 61 atoms in block 46
Block first atom: 2119
Blocpdb> 53 atoms in block 47
Block first atom: 2180
Blocpdb> 51 atoms in block 48
Block first atom: 2233
Blocpdb> 50 atoms in block 49
Block first atom: 2284
Blocpdb> 45 atoms in block 50
Block first atom: 2334
Blocpdb> 51 atoms in block 51
Block first atom: 2379
Blocpdb> 39 atoms in block 52
Block first atom: 2430
Blocpdb> 43 atoms in block 53
Block first atom: 2469
Blocpdb> 49 atoms in block 54
Block first atom: 2512
Blocpdb> 62 atoms in block 55
Block first atom: 2561
Blocpdb> 32 atoms in block 56
Block first atom: 2623
Blocpdb> 53 atoms in block 57
Block first atom: 2655
Blocpdb> 58 atoms in block 58
Block first atom: 2708
Blocpdb> 48 atoms in block 59
Block first atom: 2766
Blocpdb> 43 atoms in block 60
Block first atom: 2814
Blocpdb> 40 atoms in block 61
Block first atom: 2857
Blocpdb> 52 atoms in block 62
Block first atom: 2897
Blocpdb> 55 atoms in block 63
Block first atom: 2949
Blocpdb> 53 atoms in block 64
Block first atom: 3004
Blocpdb> 53 atoms in block 65
Block first atom: 3057
Blocpdb> 42 atoms in block 66
Block first atom: 3110
Blocpdb> 60 atoms in block 67
Block first atom: 3152
Blocpdb> 44 atoms in block 68
Block first atom: 3212
Blocpdb> 56 atoms in block 69
Block first atom: 3256
Blocpdb> 46 atoms in block 70
Block first atom: 3312
Blocpdb> 52 atoms in block 71
Block first atom: 3358
Blocpdb> 61 atoms in block 72
Block first atom: 3410
Blocpdb> 46 atoms in block 73
Block first atom: 3471
Blocpdb> 65 atoms in block 74
Block first atom: 3517
Blocpdb> 60 atoms in block 75
Block first atom: 3582
Blocpdb> 45 atoms in block 76
Block first atom: 3642
Blocpdb> 55 atoms in block 77
Block first atom: 3687
Blocpdb> 50 atoms in block 78
Block first atom: 3742
Blocpdb> 61 atoms in block 79
Block first atom: 3792
Blocpdb> 47 atoms in block 80
Block first atom: 3853
Blocpdb> 44 atoms in block 81
Block first atom: 3900
Blocpdb> 40 atoms in block 82
Block first atom: 3944
Blocpdb> 44 atoms in block 83
Block first atom: 3984
Blocpdb> 39 atoms in block 84
Block first atom: 4028
Blocpdb> 38 atoms in block 85
Block first atom: 4067
Blocpdb> 51 atoms in block 86
Block first atom: 4105
Blocpdb> 48 atoms in block 87
Block first atom: 4156
Blocpdb> 52 atoms in block 88
Block first atom: 4204
Blocpdb> 38 atoms in block 89
Block first atom: 4256
Blocpdb> 52 atoms in block 90
Block first atom: 4294
Blocpdb> 41 atoms in block 91
Block first atom: 4346
Blocpdb> 45 atoms in block 92
Block first atom: 4387
Blocpdb> 43 atoms in block 93
Block first atom: 4432
Blocpdb> 51 atoms in block 94
Block first atom: 4475
Blocpdb> 55 atoms in block 95
Block first atom: 4526
Blocpdb> 65 atoms in block 96
Block first atom: 4581
Blocpdb> 63 atoms in block 97
Block first atom: 4646
Blocpdb> 44 atoms in block 98
Block first atom: 4709
Blocpdb> 28 atoms in block 99
Block first atom: 4753
Blocpdb> 52 atoms in block 100
Block first atom: 4781
Blocpdb> 43 atoms in block 101
Block first atom: 4833
Blocpdb> 43 atoms in block 102
Block first atom: 4876
Blocpdb> 53 atoms in block 103
Block first atom: 4919
Blocpdb> 39 atoms in block 104
Block first atom: 4972
Blocpdb> 48 atoms in block 105
Block first atom: 5011
Blocpdb> 50 atoms in block 106
Block first atom: 5059
Blocpdb> 11 atoms in block 107
Block first atom: 5109
Blocpdb> 58 atoms in block 108
Block first atom: 5120
Blocpdb> 46 atoms in block 109
Block first atom: 5178
Blocpdb> 49 atoms in block 110
Block first atom: 5224
Blocpdb> 50 atoms in block 111
Block first atom: 5273
Blocpdb> 43 atoms in block 112
Block first atom: 5323
Blocpdb> 64 atoms in block 113
Block first atom: 5366
Blocpdb> 41 atoms in block 114
Block first atom: 5430
Blocpdb> 33 atoms in block 115
Block first atom: 5471
Blocpdb> 42 atoms in block 116
Block first atom: 5504
Blocpdb> 34 atoms in block 117
Block first atom: 5546
Blocpdb> 49 atoms in block 118
Block first atom: 5580
Blocpdb> 42 atoms in block 119
Block first atom: 5629
Blocpdb> 29 atoms in block 120
Block first atom: 5671
Blocpdb> 51 atoms in block 121
Block first atom: 5700
Blocpdb> 57 atoms in block 122
Block first atom: 5751
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 5808
Blocpdb> 43 atoms in block 124
Block first atom: 5859
Blocpdb> 39 atoms in block 125
Block first atom: 5902
Blocpdb> 63 atoms in block 126
Block first atom: 5941
Blocpdb> 49 atoms in block 127
Block first atom: 6004
Blocpdb> 37 atoms in block 128
Block first atom: 6053
Blocpdb> 46 atoms in block 129
Block first atom: 6090
Blocpdb> 54 atoms in block 130
Block first atom: 6136
Blocpdb> 47 atoms in block 131
Block first atom: 6190
Blocpdb> 58 atoms in block 132
Block first atom: 6237
Blocpdb> 33 atoms in block 133
Block first atom: 6295
Blocpdb> 39 atoms in block 134
Block first atom: 6328
Blocpdb> 34 atoms in block 135
Block first atom: 6367
Blocpdb> 55 atoms in block 136
Block first atom: 6401
Blocpdb> 24 atoms in block 137
Block first atom: 6455
Blocpdb> 137 blocks.
Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4884249 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 19437
Prepmat> Matrix trace = 10768940.0000
Prepmat> Last element read: 19437 19437 110.5111
Prepmat> 9454 lines saved.
Prepmat> 7802 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6479
RTB> Total mass = 6479.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6479
RTB> Number of blocks = 137
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 364464.8666
RTB> 57381 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 822
Diagstd> Nb of non-zero elements: 57381
Diagstd> Projected matrix trace = 364464.8666
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 822 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 364464.8666
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.6860029 4.2709183 5.0816209 6.5269586
8.9296005 14.0247850 14.3128654 16.0769818 19.3690277
21.5982885 26.4452081 27.2326433 31.6519308 33.8015206
34.2308730 37.2181204 37.3974287 39.7895974 41.8214684
43.7206708 45.9600750 46.0056289 48.2887774 51.5829910
53.0220984 54.0484141 55.1760290 56.6755228 58.0944254
58.7353157 59.8852957 62.6765633 64.6201219 66.6558929
67.0554199 67.7835061 69.4946537 70.3426225 70.8445905
72.6884866 73.7579344 76.6271841 77.9832382 78.5709044
80.6351986 82.1538906 82.4089159 84.0661465 86.1964278
86.9719376 87.7740822 89.7198421 92.0341792 92.7964082
93.6684417 95.1358286 97.4980550 98.4450276 100.2171160
101.6176060 105.3577913 106.2469359 108.6095126 110.2725872
110.6534947 112.4870643 112.7609883 114.4569039 116.0156274
117.1691386 120.1653864 121.9950204 122.7636333 124.5837478
125.1394459 126.4469595 127.6390029 128.6934340 129.6179833
130.3139786 131.8934005 133.7840060 134.7357378 136.9573715
138.7268426 138.7930506 139.4907132 143.4108721 144.0863219
144.4000870 145.8272114 147.3302986 148.8241994 150.6846883
152.6793360 155.0174004 155.3548074 156.8784330 158.1247594
158.6538972
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034333 0.0034337 0.0034341 0.0034341 0.0034344
0.0034363 208.4841858 224.4170827 244.7915444 277.4282675
324.4974558 406.6711714 410.8266177 435.4091392 477.9133804
504.6670487 558.4300429 566.6829934 610.9355310 631.3401359
635.3371758 662.4795830 664.0735022 684.9834092 702.2551273
718.0235496 736.1827633 736.5475112 754.6027530 779.9172764
790.7218426 798.3379192 806.6228136 817.5099509 827.6800945
832.2330029 840.3406638 859.7018627 872.9294928 886.5731114
889.2261452 894.0407102 905.2550951 910.7612784 914.0051178
925.8232728 932.6091093 950.5757120 958.9498882 962.5563346
975.1189813 984.2588939 985.7853977 995.6480569 1008.1842634
1012.7094280 1017.3688328 1028.5834464 1041.7652148 1046.0702802
1050.9738931 1059.1740523 1072.2430901 1077.4377130 1087.0918271
1094.6612883 1114.6245624 1119.3179987 1131.6945191 1140.3260939
1142.2938736 1151.7191066 1153.1205639 1161.7596195 1169.6435408
1175.4438789 1190.3782250 1199.4063183 1203.1787331 1212.0651826
1214.7653460 1221.0950642 1226.8373290 1231.8943832 1236.3115035
1239.6263022 1247.1158906 1256.0223819 1260.4821001 1270.8315449
1279.0146862 1279.3198575 1282.5311664 1300.4280203 1303.4868612
1304.9053381 1311.3377568 1318.0786176 1324.7442946 1332.9990572
1341.7926593 1352.0274374 1353.4980324 1360.1189817 1365.5110507
1367.7938684
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6479
Rtb_to_modes> Number of blocs = 137
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.686
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.271
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.082
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.527
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.930
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 822 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00002
1.00003 0.99997 0.99994 0.99999 1.00000
0.99997 0.99997 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 116622 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00002
1.00003 0.99997 0.99994 0.99999 1.00000
0.99997 0.99997 0.99998 1.00002 1.00000
0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002
1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995
1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001
0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001
0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00000
0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20111300122393249.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20111300122393249.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 20111300122393249.atom
Openam> file on opening on unit 11:
20111300122393249.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 408
First residue number = 50
Last residue number = 465
Number of atoms found = 6479
Mean number per residue = 15.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.686
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.271
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.082
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.527
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.930
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.7
Bfactors> 106 vectors, 19437 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.686000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.186 for 408 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.005 +/- 0.02
Bfactors> = 23.658 +/- 12.79
Bfactors> Shiftng-fct= 23.653
Bfactors> Scaling-fct= 834.334
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 20111300122393249.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
20111300122393249.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 913.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 962.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1132.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1162.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1176.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1300.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1311.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1325.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1333.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1342.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1354.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1360.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1365.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1368.
Chkmod> 106 vectors, 19437 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6479 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 0.9998 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7765
0.0034 0.7213
0.0034 0.9912
0.0034 0.8151
0.0034 0.9358
0.0034 0.7429
208.4752 0.2301
224.4096 0.2148
244.7902 0.5016
277.4172 0.3597
324.4908 0.0135
406.5843 0.7288
410.7679 0.0064
435.4313 0.6659
477.9049 0.6860
504.6654 0.1680
558.4567 0.3735
566.6312 0.3743
610.8907 0.3044
631.2988 0.2638
635.3018 0.2865
662.4679 0.0841
664.0678 0.3420
684.9575 0.1537
702.2127 0.3544
717.9872 0.1976
736.1506 0.3866
736.5509 0.3405
754.5799 0.3691
779.8612 0.3133
790.6723 0.2588
798.3154 0.3614
806.6172 0.4393
817.5071 0.5427
827.6130 0.3741
832.2305 0.3481
840.3376 0.4639
859.6885 0.4358
872.8912 0.3679
886.5624 0.3945
889.2183 0.3950
893.9792 0.2388
905.1859 0.4070
910.7052 0.4452
913.9363 0.3164
925.7932 0.3353
932.5821 0.4673
950.5524 0.2462
958.8888 0.4716
962.5095 0.2733
975.1062 0.2478
984.1933 0.4859
985.7496 0.4598
995.6281 0.4344
1008.1619 0.4848
1012.6547 0.5065
1017.3015 0.4908
1028.5402 0.3534
1041.6968 0.4754
1046.0456 0.3438
1050.9375 0.3904
1059.1518 0.4621
1072.2078 0.3469
1077.4187 0.3956
1086.9523 0.3555
1094.5195 0.3286
1114.8000 0.4673
1119.0227 0.2599
1131.5964 0.3943
1140.4189 0.1486
1142.4848 0.4114
1151.7359 0.4077
1153.2705 0.2880
1161.9284 0.4940
1169.5146 0.2958
1175.5482 0.4651
1190.4985 0.2737
1199.3793 0.4366
1203.3053 0.5018
1212.0922 0.3669
1214.5217 0.3990
1220.8159 0.3804
1226.5972 0.4398
1231.8729 0.4003
1236.1727 0.4290
1239.5066 0.5366
1247.0936 0.4015
1256.0435 0.3293
1260.2608 0.3293
1270.9747 0.5229
1278.8360 0.5285
1279.2970 0.4590
1282.5188 0.4461
1300.3229 0.4993
1303.4928 0.4578
1304.8489 0.5136
1311.1591 0.5014
1317.8865 0.5240
1324.5797 0.5084
1333.0096 0.4406
1341.8259 0.4843
1351.8935 0.4715
1353.6368 0.4251
1360.1541 0.5310
1365.3455 0.5301
1367.9339 0.5161
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 20111300122393249 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
making animated gifs
11 models are in 20111300122393249.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 20111300122393249 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
making animated gifs
11 models are in 20111300122393249.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 20111300122393249 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
making animated gifs
11 models are in 20111300122393249.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 20111300122393249 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
making animated gifs
11 models are in 20111300122393249.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 20111300122393249 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
20111300122393249.eigenfacs
20111300122393249.atom
making animated gifs
11 models are in 20111300122393249.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 20111300122393249.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
20111300122393249.10.pdb
20111300122393249.11.pdb
20111300122393249.7.pdb
20111300122393249.8.pdb
20111300122393249.9.pdb
STDERR:
real 0m18.736s
user 0m18.560s
sys 0m0.148s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|