CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  6CM4  ***

LOGs for ID: 201006003033114740

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 201006003033114740.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 201006003033114740.atom to be opened. Openam> File opened: 201006003033114740.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 423 First residue number = 35 Last residue number = 442 Number of atoms found = 6217 Mean number per residue = 14.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 17.556498 +/- 15.439664 From: -14.028000 To: 59.574000 = 1.381174 +/- 11.249622 From: -28.184000 To: 27.606000 = 14.766978 +/- 20.515046 From: -27.056000 To: 51.887000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5119 % Filled. Pdbmat> 4369226 non-zero elements. Pdbmat> 481401 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.87 +/- 45.87 Maximum number = 246 Minimum number = 28 Pdbmat> Matrix trace = 9.628020E+06 Pdbmat> Larger element = 898.622 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 423 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 201006003033114740.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 201006003033114740.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 201006003033114740.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6217 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 423 residues. Blocpdb> 39 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 43 atoms in block 2 Block first atom: 40 Blocpdb> 42 atoms in block 3 Block first atom: 83 Blocpdb> 48 atoms in block 4 Block first atom: 125 Blocpdb> 51 atoms in block 5 Block first atom: 173 Blocpdb> 41 atoms in block 6 Block first atom: 224 Blocpdb> 51 atoms in block 7 Block first atom: 265 Blocpdb> 38 atoms in block 8 Block first atom: 316 Blocpdb> 51 atoms in block 9 Block first atom: 354 Blocpdb> 28 atoms in block 10 Block first atom: 405 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 433 Blocpdb> 42 atoms in block 12 Block first atom: 483 Blocpdb> 59 atoms in block 13 Block first atom: 525 Blocpdb> 46 atoms in block 14 Block first atom: 584 Blocpdb> 36 atoms in block 15 Block first atom: 630 Blocpdb> 50 atoms in block 16 Block first atom: 666 Blocpdb> 40 atoms in block 17 Block first atom: 716 Blocpdb> 52 atoms in block 18 Block first atom: 756 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 808 Blocpdb> 56 atoms in block 20 Block first atom: 862 Blocpdb> 39 atoms in block 21 Block first atom: 918 Blocpdb> 40 atoms in block 22 Block first atom: 957 Blocpdb> 40 atoms in block 23 Block first atom: 997 Blocpdb> 60 atoms in block 24 Block first atom: 1037 Blocpdb> 41 atoms in block 25 Block first atom: 1097 Blocpdb> 50 atoms in block 26 Block first atom: 1138 Blocpdb> 47 atoms in block 27 Block first atom: 1188 Blocpdb> 45 atoms in block 28 Block first atom: 1235 Blocpdb> 35 atoms in block 29 Block first atom: 1280 Blocpdb> 43 atoms in block 30 Block first atom: 1315 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 1358 Blocpdb> 49 atoms in block 32 Block first atom: 1398 Blocpdb> 57 atoms in block 33 Block first atom: 1447 Blocpdb> 40 atoms in block 34 Block first atom: 1504 Blocpdb> 41 atoms in block 35 Block first atom: 1544 Blocpdb> 38 atoms in block 36 Block first atom: 1585 Blocpdb> 29 atoms in block 37 Block first atom: 1623 Blocpdb> 49 atoms in block 38 Block first atom: 1652 Blocpdb> 47 atoms in block 39 Block first atom: 1701 Blocpdb> 49 atoms in block 40 Block first atom: 1748 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 1797 Blocpdb> 50 atoms in block 42 Block first atom: 1853 Blocpdb> 44 atoms in block 43 Block first atom: 1903 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1947 Blocpdb> 46 atoms in block 45 Block first atom: 1991 Blocpdb> 42 atoms in block 46 Block first atom: 2037 Blocpdb> 28 atoms in block 47 Block first atom: 2079 Blocpdb> 34 atoms in block 48 Block first atom: 2107 Blocpdb> 48 atoms in block 49 Block first atom: 2141 Blocpdb> 38 atoms in block 50 Block first atom: 2189 Blocpdb> 52 atoms in block 51 Block first atom: 2227 Blocpdb> 43 atoms in block 52 Block first atom: 2279 Blocpdb> 46 atoms in block 53 Block first atom: 2322 Blocpdb> 57 atoms in block 54 Block first atom: 2368 Blocpdb> 53 atoms in block 55 Block first atom: 2425 Blocpdb> 49 atoms in block 56 Block first atom: 2478 Blocpdb> 56 atoms in block 57 Block first atom: 2527 Blocpdb> 53 atoms in block 58 Block first atom: 2583 Blocpdb> 56 atoms in block 59 Block first atom: 2636 Blocpdb> 37 atoms in block 60 Block first atom: 2692 Blocpdb> 57 atoms in block 61 Block first atom: 2729 Blocpdb> 9 atoms in block 62 Block first atom: 2786 Blocpdb> 53 atoms in block 63 Block first atom: 2795 Blocpdb> 51 atoms in block 64 Block first atom: 2848 Blocpdb> 55 atoms in block 65 Block first atom: 2899 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 2954 Blocpdb> 52 atoms in block 67 Block first atom: 2995 Blocpdb> 49 atoms in block 68 Block first atom: 3047 Blocpdb> 35 atoms in block 69 Block first atom: 3096 Blocpdb> 49 atoms in block 70 Block first atom: 3131 Blocpdb> 40 atoms in block 71 Block first atom: 3180 Blocpdb> 44 atoms in block 72 Block first atom: 3220 Blocpdb> 32 atoms in block 73 Block first atom: 3264 Blocpdb> 32 atoms in block 74 Block first atom: 3296 Blocpdb> 37 atoms in block 75 Block first atom: 3328 Blocpdb> 42 atoms in block 76 Block first atom: 3365 Blocpdb> 37 atoms in block 77 Block first atom: 3407 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 3444 Blocpdb> 39 atoms in block 79 Block first atom: 3475 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 3514 Blocpdb> 34 atoms in block 81 Block first atom: 3540 Blocpdb> 35 atoms in block 82 Block first atom: 3574 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 3609 Blocpdb> 48 atoms in block 84 Block first atom: 3649 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 3697 Blocpdb> 38 atoms in block 86 Block first atom: 3740 Blocpdb> 50 atoms in block 87 Block first atom: 3778 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 3828 Blocpdb> 33 atoms in block 89 Block first atom: 3873 Blocpdb> 37 atoms in block 90 Block first atom: 3906 Blocpdb> 51 atoms in block 91 Block first atom: 3943 Blocpdb> 42 atoms in block 92 Block first atom: 3994 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 4036 Blocpdb> 58 atoms in block 94 Block first atom: 4074 Blocpdb> 48 atoms in block 95 Block first atom: 4132 Blocpdb> 47 atoms in block 96 Block first atom: 4180 Blocpdb> 54 atoms in block 97 Block first atom: 4227 Blocpdb> 36 atoms in block 98 Block first atom: 4281 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 4317 Blocpdb> 41 atoms in block 100 Block first atom: 4350 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 4391 Blocpdb> 60 atoms in block 102 Block first atom: 4430 Blocpdb> 56 atoms in block 103 Block first atom: 4490 Blocpdb> 57 atoms in block 104 Block first atom: 4546 Blocpdb> 35 atoms in block 105 Block first atom: 4603 Blocpdb> 41 atoms in block 106 Block first atom: 4638 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 4679 Blocpdb> 54 atoms in block 108 Block first atom: 4709 Blocpdb> 37 atoms in block 109 Block first atom: 4763 Blocpdb> 52 atoms in block 110 Block first atom: 4800 Blocpdb> 43 atoms in block 111 Block first atom: 4852 Blocpdb> 49 atoms in block 112 Block first atom: 4895 Blocpdb> 58 atoms in block 113 Block first atom: 4944 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 5002 Blocpdb> 46 atoms in block 115 Block first atom: 5031 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 5077 Blocpdb> 27 atoms in block 117 Block first atom: 5098 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 5125 Blocpdb> 33 atoms in block 119 Block first atom: 5158 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 5191 Blocpdb> 45 atoms in block 121 Block first atom: 5235 Blocpdb> 33 atoms in block 122 Block first atom: 5280 Blocpdb> 58 atoms in block 123 Block first atom: 5313 Blocpdb> 54 atoms in block 124 Block first atom: 5371 Blocpdb> 54 atoms in block 125 Block first atom: 5425 Blocpdb> 50 atoms in block 126 Block first atom: 5479 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 5529 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 5570 Blocpdb> 33 atoms in block 129 Block first atom: 5608 Blocpdb> 47 atoms in block 130 Block first atom: 5641 Blocpdb> 38 atoms in block 131 Block first atom: 5688 Blocpdb> 41 atoms in block 132 Block first atom: 5726 Blocpdb> 57 atoms in block 133 Block first atom: 5767 Blocpdb> 44 atoms in block 134 Block first atom: 5824 Blocpdb> 35 atoms in block 135 Block first atom: 5868 Blocpdb> 44 atoms in block 136 Block first atom: 5903 Blocpdb> 59 atoms in block 137 Block first atom: 5947 Blocpdb> 48 atoms in block 138 Block first atom: 6006 Blocpdb> 31 atoms in block 139 Block first atom: 6054 Blocpdb> 38 atoms in block 140 Block first atom: 6085 Blocpdb> 39 atoms in block 141 Block first atom: 6123 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 6162 Blocpdb> 9 atoms in block 143 Block first atom: 6208 Blocpdb> 143 blocks. Blocpdb> At most, 60 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4369369 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18651 Prepmat> Matrix trace = 9628020.0000 Prepmat> Last element read: 18651 18651 154.7356 Prepmat> 10297 lines saved. Prepmat> 8832 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6217 RTB> Total mass = 6217.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6217 RTB> Number of blocks = 143 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 341314.9236 RTB> 50559 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 858 Diagstd> Nb of non-zero elements: 50559 Diagstd> Projected matrix trace = 341314.9236 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 858 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 341314.9236 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1787660 0.2116660 0.3904289 2.1061446 2.3579025 3.3265934 4.5245816 4.6965753 7.7022974 8.0810001 8.6425919 11.0697129 11.3029258 12.0007147 14.4644247 15.9453085 17.8311605 18.6369014 20.7547089 21.8127112 23.4867458 25.4970286 27.7122203 28.3159729 29.3384014 30.3541037 31.4589965 32.4622274 33.5264946 34.9328550 36.8815429 40.0717740 41.8479687 42.6018009 43.5382771 44.5973190 44.8694968 46.0771924 46.7831927 48.9392080 50.1739649 52.2440094 52.8874933 55.5646694 56.0267059 57.8764282 61.1904896 62.2729759 63.4570525 64.0797685 66.6063663 67.5365866 68.2698356 69.3090567 69.8646513 72.3196705 73.1915436 73.8295046 74.4235621 75.4988318 76.7516466 78.7317350 78.8452857 80.4283307 81.3934097 82.4969284 85.0600528 85.7337159 88.1616936 89.0995550 89.7987550 91.9620737 92.4979283 94.3368224 95.3624870 95.4186518 96.5353735 97.8071374 98.5360222 100.3356645 101.6638567 102.5986712 103.3248100 105.3102498 106.8000858 108.3762359 109.1425577 111.2461289 111.6850007 112.7640967 114.3230046 115.1828660 116.5979024 117.5835087 119.4248482 120.5164814 122.4987744 122.9616095 124.3306526 124.5977940 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034293 0.0034301 0.0034325 0.0034348 0.0034361 0.0034369 45.9132212 49.9598158 67.8525670 157.5938873 166.7470648 198.0592542 230.9853809 235.3346772 301.3737500 308.6937494 319.2399857 361.2962542 365.0822509 376.1827151 412.9960163 433.6224339 458.5482974 468.7940969 494.7133193 507.1659695 526.2676858 548.3275481 571.6509656 577.8445535 588.1844023 598.2793137 609.0707069 618.7061571 628.7664407 641.8186327 659.4772536 687.4079727 702.4775857 708.7764180 716.5242608 725.1864086 727.3959518 737.1201525 742.7458066 759.6678529 769.1915264 784.8985553 789.7175178 809.4586111 812.8170871 826.1257151 849.4488725 856.9294935 865.0380843 869.2721133 886.2436796 892.4108333 897.2422358 904.0454698 907.6617377 923.4715062 929.0214328 933.0614728 936.8078184 943.5510367 951.3473900 963.5409824 964.2355647 973.8673541 979.6927659 986.3116655 1001.5164897 1005.4746000 1019.6127147 1025.0216719 1029.0356910 1041.3570417 1044.3865815 1054.7168931 1060.4350276 1060.7472590 1066.9363728 1073.9413252 1077.9355460 1087.7346063 1094.9103743 1099.9327882 1103.8182948 1114.3730533 1122.2279503 1130.4785122 1134.4682445 1145.3487179 1147.6057245 1153.1364575 1161.0798688 1165.4381235 1172.5750497 1177.5205305 1186.7046095 1192.1159591 1201.8801211 1204.1485025 1210.8333851 1212.1335078 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6217 Rtb_to_modes> Number of blocs = 143 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9730E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9778E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1788 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3904 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.106 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.327 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.697 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.081 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.643 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 858 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00004 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99995 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 111906 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00004 1.00004 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 0.99995 1.00002 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00003 0.99997 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201006003033114740.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201006003033114740.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 201006003033114740.atom Openam> file on opening on unit 11: 201006003033114740.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 423 First residue number = 35 Last residue number = 442 Number of atoms found = 6217 Mean number per residue = 14.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9730E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9778E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9914E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0017E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1788 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3904 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.106 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.697 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.081 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.643 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6 Bfactors> 106 vectors, 18651 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.178800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.043 +/- 0.03 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.043 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 201006003033114740.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 201006003033114740.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4292E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4300E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4367E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 849.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 869.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 979.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1134. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1192. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212. Chkmod> 106 vectors, 18651 coordinates in file. Chkmod> That is: 6217 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 40 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 51 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7175 0.0034 0.8334 0.0034 0.9459 0.0034 0.7606 0.0034 0.9273 0.0034 0.8456 45.9156 0.6265 49.9617 0.6956 67.8471 0.6672 157.5817 0.5940 166.7434 0.7589 198.0629 0.5781 230.9861 0.4064 235.3352 0.3605 301.3550 0.3239 308.6805 0.3352 319.2338 0.2331 361.2854 0.2151 365.0193 0.0855 376.1554 0.1043 412.9151 0.2292 433.6676 0.0782 458.5137 0.0465 468.8129 0.3031 494.6360 0.1174 507.1127 0.1953 526.2815 0.1789 548.3360 0.1569 571.6035 0.2457 577.8608 0.3759 588.1752 0.2520 598.2132 0.4395 609.0543 0.3795 618.6584 0.3883 628.7723 0.3949 641.7649 0.4157 659.4352 0.4416 687.3632 0.2573 702.4645 0.2064 708.7310 0.0983 716.5077 0.2940 725.1771 0.2450 727.3688 0.2465 737.1110 0.2517 742.6886 0.1716 759.6414 0.2659 769.1281 0.2820 784.8347 0.1712 789.7023 0.2650 809.3899 0.2253 812.8061 0.3363 826.1157 0.2544 849.4090 0.3667 856.8722 0.1534 865.0210 0.3453 869.2364 0.3830 886.2298 0.4741 892.3951 0.3872 897.2048 0.4233 904.0128 0.2774 907.5926 0.5266 923.4340 0.4675 928.9718 0.4557 933.0245 0.3384 936.7452 0.4115 943.5178 0.2822 951.2963 0.2032 963.4890 0.1027 964.2230 0.2824 973.8357 0.0505 979.6302 0.4314 986.2877 0.5374 1001.4732 0.3716 1005.4096 0.5340 1019.5592 0.3687 1024.9802 0.4749 1028.9987 0.5232 1041.3006 0.4430 1044.3534 0.3522 1054.6894 0.3843 1060.3757 0.3945 1060.7092 0.3924 1066.9161 0.4392 1073.9109 0.3839 1077.9110 0.4855 1087.4946 0.5188 1095.0580 0.4221 1099.8927 0.4646 1103.6384 0.3862 1114.2710 0.4285 1122.1793 0.3868 1130.5539 0.4017 1134.1984 0.5061 1145.0621 0.3033 1147.6335 0.4511 1153.2705 0.4879 1160.9132 0.5071 1165.4748 0.4684 1172.5353 0.5258 1177.5526 0.4108 1186.5302 0.4375 1191.9833 0.5488 1201.8345 0.4703 1204.2848 0.4724 1210.6321 0.4477 1212.0922 0.4205 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 12 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 12 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 12 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.12.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.12.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.12.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 13 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 13 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.13.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.13.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.13.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 14 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 14 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 14 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.14.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.14.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.14.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 15 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 15 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 15 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.15.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.15.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.15.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 16 running: ../../bin/get_modes.sh 201006003033114740 16 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 16 calculating perturbed structure for DQ=-100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=0 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=20 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=40 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=60 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=80 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom calculating perturbed structure for DQ=100 201006003033114740.eigenfacs 201006003033114740.atom making animated gifs 11 models are in 201006003033114740.16.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.16.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 201006003033114740.16.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 201006003033114740.10.pdb 201006003033114740.11.pdb 201006003033114740.12.pdb 201006003033114740.13.pdb 201006003033114740.14.pdb 201006003033114740.15.pdb 201006003033114740.16.pdb 201006003033114740.7.pdb 201006003033114740.8.pdb 201006003033114740.9.pdb STDERR: real 0m18.132s user 0m17.980s sys 0m0.116s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.