CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  S1-M1  ***

LOGs for ID: 2009250847271249

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2009250847271249.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2009250847271249.atom to be opened. Openam> File opened: 2009250847271249.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 217 First residue number = 333 Last residue number = 23 Number of atoms found = 2086 Mean number per residue = 9.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.156543 +/- 15.231201 From: -30.257000 To: 34.795000 = -0.026446 +/- 8.983021 From: -20.620000 To: 21.221000 = 0.001125 +/- 6.207714 From: -15.818000 To: 15.187000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.6802 % Filled. Pdbmat> 916581 non-zero elements. Pdbmat> 100475 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 96.33 +/- 28.70 Maximum number = 162 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 2.009500E+06 Pdbmat> Larger element = 589.139 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 217 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2009250847271249.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2009250847271249.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2009250847271249.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2086 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 217 residues. Blocpdb> 20 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 21 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 37 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 56 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 71 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 91 Blocpdb> 26 atoms in block 7 Block first atom: 108 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 134 Blocpdb> 16 atoms in block 9 Block first atom: 152 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 168 Blocpdb> 27 atoms in block 11 Block first atom: 188 Blocpdb> 30 atoms in block 12 Block first atom: 215 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 245 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 271 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 290 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 305 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 320 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 342 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 359 Blocpdb> 14 atoms in block 20 Block first atom: 384 Blocpdb> 20 atoms in block 21 Block first atom: 398 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 418 Blocpdb> 25 atoms in block 23 Block first atom: 435 Blocpdb> 21 atoms in block 24 Block first atom: 460 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 481 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 494 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 509 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 531 Blocpdb> 18 atoms in block 29 Block first atom: 551 Blocpdb> 19 atoms in block 30 Block first atom: 569 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 588 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 608 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 630 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 645 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 665 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 682 Blocpdb> 19 atoms in block 37 Block first atom: 704 Blocpdb> 25 atoms in block 38 Block first atom: 723 Blocpdb> 21 atoms in block 39 Block first atom: 748 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 769 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 782 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 799 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 813 Blocpdb> 15 atoms in block 44 Block first atom: 835 Blocpdb> 25 atoms in block 45 Block first atom: 850 Blocpdb> 27 atoms in block 46 Block first atom: 875 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 902 Blocpdb> 18 atoms in block 48 Block first atom: 918 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 936 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 957 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 969 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 986 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1008 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 1027 Blocpdb> 18 atoms in block 55 Block first atom: 1049 Blocpdb> 21 atoms in block 56 Block first atom: 1067 Blocpdb> 13 atoms in block 57 Block first atom: 1088 Blocpdb> 16 atoms in block 58 Block first atom: 1101 Blocpdb> 25 atoms in block 59 Block first atom: 1117 Blocpdb> 23 atoms in block 60 Block first atom: 1142 Blocpdb> 31 atoms in block 61 Block first atom: 1165 Blocpdb> 21 atoms in block 62 Block first atom: 1196 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 1217 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 1247 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1266 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1288 Blocpdb> 27 atoms in block 67 Block first atom: 1307 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1334 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1352 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1369 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1388 Blocpdb> 11 atoms in block 72 Block first atom: 1414 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1425 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1442 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1456 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1472 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1490 Blocpdb> 18 atoms in block 78 Block first atom: 1507 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1525 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1551 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1567 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 1587 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 1606 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1630 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1646 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1662 Blocpdb> 26 atoms in block 87 Block first atom: 1675 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 1701 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 1722 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1747 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1763 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 1780 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 1802 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 1820 Blocpdb> 13 atoms in block 95 Block first atom: 1838 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1851 Blocpdb> 12 atoms in block 97 Block first atom: 1868 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1880 Blocpdb> 18 atoms in block 99 Block first atom: 1894 Blocpdb> 21 atoms in block 100 Block first atom: 1912 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1933 Blocpdb> 11 atoms in block 102 Block first atom: 1953 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 1964 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 1989 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 2007 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 2025 Blocpdb> 19 atoms in block 107 Block first atom: 2038 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 2057 Blocpdb> 8 atoms in block 109 Block first atom: 2078 Blocpdb> 109 blocks. Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 916690 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6258 Prepmat> Matrix trace = 2009500.0000 Prepmat> Last element read: 6258 6258 70.6957 Prepmat> 5996 lines saved. Prepmat> 4856 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2086 RTB> Total mass = 2086.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2086 RTB> Number of blocks = 109 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 173681.7637 RTB> 39369 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 654 Diagstd> Nb of non-zero elements: 39369 Diagstd> Projected matrix trace = 173681.7637 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 654 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 173681.7637 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.6579764 3.7324322 4.0415715 7.2144777 7.5631278 8.8847837 13.1177073 13.2043835 13.4709757 15.6824605 17.5434304 18.1362036 19.6784862 22.1315721 23.5195423 24.1521031 25.5769276 27.0484100 27.7416809 29.6927864 30.3526752 31.8797854 33.1717098 34.7752191 36.7212952 37.2968638 37.7120358 39.0769816 40.3373778 42.5160190 43.4069016 44.7385249 45.4736416 45.6532977 47.9811714 48.4862059 48.8222457 49.3312619 51.7467195 53.3172034 53.8974872 54.2382568 55.2588057 56.6661306 58.1544370 58.8206824 59.1573615 60.6488901 62.1311274 63.0896762 63.6795717 64.4407693 65.3921503 66.4680273 68.4192275 70.3554945 70.5687794 71.8997223 72.5004127 73.7984493 75.7142572 76.4253906 76.9666365 77.7390757 78.1587379 79.5055743 80.6999340 81.1707184 82.4966861 83.6219630 84.8070367 85.0064770 86.9520920 87.8661611 88.5635230 89.1189608 90.4665343 91.9224735 92.1185187 92.8840175 94.1813102 95.5727217 95.8889130 96.7661350 98.0587046 99.3301262 99.9796400 100.4185408 102.3573769 103.4206799 104.0831497 105.0597455 105.2486436 106.6482002 107.2115293 108.7976777 109.1800254 109.6066719 111.1307794 111.6174085 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034313 0.0034318 0.0034324 0.0034330 0.0034343 0.0034355 177.0397704 209.7931221 218.3083833 291.6740075 298.6386399 323.6821193 393.3002738 394.5975138 398.5610060 430.0335924 454.8335990 462.4539263 481.7160573 510.8594282 526.6349938 533.6699597 549.1860120 564.7628880 571.9547433 591.7261434 598.2652362 613.1305767 625.4307196 640.3688788 658.0430027 663.1800261 666.8609230 678.8218071 689.6823495 708.0624715 715.4423983 726.3335596 732.2765854 733.7216886 752.1954524 756.1437747 758.7595253 762.7046472 781.1540549 792.9192493 797.2224851 799.7387538 807.2276466 817.4422095 828.1074809 832.8375725 835.2176784 845.6812644 855.9529584 862.5304370 866.5534330 871.7172469 878.1285342 885.3228530 898.2233974 910.8446045 912.2241870 920.7863802 924.6247615 932.8652134 944.8962236 949.3232423 952.6788731 957.4474936 960.0283302 968.2646348 975.5103242 978.3516347 986.3102172 993.0142013 1000.0258456 1001.2010334 1012.5938795 1017.9023250 1021.9337033 1025.1332904 1032.8547637 1041.1328062 1042.2424391 1046.5639626 1053.8471955 1061.6032938 1063.3579392 1068.2108323 1075.3215665 1082.2703829 1085.8030683 1088.1837431 1098.6386013 1104.3302652 1107.8615589 1113.0468696 1114.0470526 1121.4296790 1124.3875440 1132.6744211 1134.6629542 1136.8777731 1144.7547662 1147.2584042 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2086 Rtb_to_modes> Number of blocs = 109 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9845E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.658 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.042 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 654 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99995 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 37548 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997 0.99997 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 0.99996 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99995 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2009250847271249.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2009250847271249.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2009250847271249.atom Openam> file on opening on unit 11: 2009250847271249.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 217 First residue number = 333 Last residue number = 23 Number of atoms found = 2086 Mean number per residue = 9.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9845E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.658 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.042 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.6 Bfactors> 106 vectors, 6258 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.658000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.022 +/- 0.02 Bfactors> = 10.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= 9.978 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2009250847271249.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2009250847271249.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 920.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 960.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 993.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1068. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1088. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147. Chkmod> 106 vectors, 6258 coordinates in file. Chkmod> That is: 2086 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7302 0.0034 0.7040 0.0034 0.9431 0.0034 0.7938 0.0034 0.8528 0.0034 0.8523 177.0330 0.5468 209.7720 0.4683 218.3106 0.3607 291.6518 0.4105 298.6233 0.3619 323.6722 0.2534 393.3178 0.3540 394.5151 0.6071 398.5295 0.3725 429.9814 0.3059 454.7696 0.5693 462.4825 0.2662 481.7139 0.1952 510.8194 0.3548 526.6175 0.1071 533.6238 0.3134 549.1954 0.5314 564.7552 0.4318 571.9129 0.4061 591.6730 0.4693 598.2132 0.3776 613.1063 0.1803 625.3878 0.2587 640.3854 0.4148 658.0032 0.5538 663.1794 0.4188 666.8143 0.4206 678.8189 0.4167 689.6752 0.5026 708.0652 0.4787 715.4372 0.4692 726.3144 0.2116 732.2158 0.4169 733.6637 0.1482 752.1540 0.3895 756.1409 0.3772 758.7095 0.3845 762.6622 0.3839 781.1453 0.2491 792.9060 0.4902 797.2068 0.3086 799.7173 0.3448 807.2017 0.3958 817.4350 0.4654 828.0403 0.1575 832.7970 0.3815 835.2004 0.3539 845.6527 0.3631 855.9084 0.1415 862.4956 0.3941 866.5191 0.4363 871.6746 0.4598 878.0764 0.2355 885.2980 0.4507 898.1899 0.4764 910.8347 0.2426 912.1929 0.2548 920.7486 0.3589 924.5824 0.3315 932.8350 0.3772 944.8291 0.2319 949.3111 0.4485 952.6588 0.4235 957.4121 0.2968 959.9949 0.3220 968.2500 0.2910 975.4688 0.3486 978.3053 0.2717 986.2877 0.3134 992.9599 0.4071 1000.0004 0.4949 1001.1788 0.2766 1012.5382 0.4577 1017.8809 0.4784 1021.8695 0.4721 1025.0953 0.3346 1032.8302 0.5071 1041.0741 0.4679 1042.2061 0.4947 1046.4964 0.4467 1053.7946 0.5701 1061.5426 0.5154 1063.3183 0.4586 1068.1863 0.4736 1075.2825 0.3824 1082.2232 0.4528 1085.7584 0.4147 1088.0366 0.2402 1098.8202 0.3282 1104.1724 0.3307 1107.9037 0.4632 1113.2123 0.4839 1113.7418 0.4571 1121.1281 0.3832 1124.2788 0.4146 1132.6379 0.4580 1134.7180 0.5471 1136.7944 0.5004 1144.5471 0.4800 1147.1197 0.4952 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2009250847271249 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom making animated gifs 11 models are in 2009250847271249.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2009250847271249 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom making animated gifs 11 models are in 2009250847271249.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2009250847271249 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom making animated gifs 11 models are in 2009250847271249.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2009250847271249 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom making animated gifs 11 models are in 2009250847271249.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2009250847271249 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2009250847271249.eigenfacs 2009250847271249.atom making animated gifs 11 models are in 2009250847271249.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2009250847271249.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2009250847271249.10.pdb 2009250847271249.11.pdb 2009250847271249.7.pdb 2009250847271249.8.pdb 2009250847271249.9.pdb STDERR: real 0m4.649s user 0m4.632s sys 0m0.012s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.