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***  TREK1  ***

LOGs for ID: 19071905024851611

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 19071905024851611.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 19071905024851611.atom to be opened. Openam> File opened: 19071905024851611.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 516 First residue number = 58 Last residue number = 313 Number of atoms found = 4034 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.515263 +/- 17.868448 From: -41.722000 To: 43.150000 = 142.091040 +/- 13.143299 From: 112.760000 To: 177.509000 = 23.056460 +/- 12.248623 From: -7.254000 To: 55.518000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0017 % Filled. Pdbmat> 1465960 non-zero elements. Pdbmat> 160224 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.44 +/- 21.55 Maximum number = 132 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 3.204480E+06 Pdbmat> Larger element = 540.357 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 516 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 19071905024851611.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 19071905024851611.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 19071905024851611.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4034 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 516 residues. Blocpdb> 32 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 33 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 53 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 79 Blocpdb> 27 atoms in block 5 Block first atom: 101 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 128 Blocpdb> 16 atoms in block 7 Block first atom: 152 Blocpdb> 27 atoms in block 8 Block first atom: 168 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 195 Blocpdb> 26 atoms in block 10 Block first atom: 217 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 243 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 266 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 293 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 315 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 341 Blocpdb> 23 atoms in block 16 Block first atom: 368 Blocpdb> 22 atoms in block 17 Block first atom: 391 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 413 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 434 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 458 Blocpdb> 26 atoms in block 21 Block first atom: 483 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 509 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 529 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 550 Blocpdb> 23 atoms in block 25 Block first atom: 567 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 590 Blocpdb> 23 atoms in block 27 Block first atom: 609 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 632 Blocpdb> 30 atoms in block 29 Block first atom: 656 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 686 Blocpdb> 33 atoms in block 31 Block first atom: 702 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 735 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 751 Blocpdb> 19 atoms in block 34 Block first atom: 773 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 792 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 815 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 836 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 863 Blocpdb> 25 atoms in block 39 Block first atom: 880 Blocpdb> 28 atoms in block 40 Block first atom: 905 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 933 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 954 Blocpdb> 23 atoms in block 43 Block first atom: 973 Blocpdb> 27 atoms in block 44 Block first atom: 996 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 1023 Blocpdb> 21 atoms in block 46 Block first atom: 1039 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 1060 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1079 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1102 Blocpdb> 21 atoms in block 50 Block first atom: 1123 Blocpdb> 24 atoms in block 51 Block first atom: 1144 Blocpdb> 28 atoms in block 52 Block first atom: 1168 Blocpdb> 29 atoms in block 53 Block first atom: 1196 Blocpdb> 22 atoms in block 54 Block first atom: 1225 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 1247 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 1275 Blocpdb> 23 atoms in block 57 Block first atom: 1297 Blocpdb> 27 atoms in block 58 Block first atom: 1320 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1347 Blocpdb> 26 atoms in block 60 Block first atom: 1368 Blocpdb> 20 atoms in block 61 Block first atom: 1394 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 1414 Blocpdb> 28 atoms in block 63 Block first atom: 1434 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1462 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1489 Blocpdb> 21 atoms in block 66 Block first atom: 1513 Blocpdb> 25 atoms in block 67 Block first atom: 1534 Blocpdb> 25 atoms in block 68 Block first atom: 1559 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1584 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1607 Blocpdb> 19 atoms in block 71 Block first atom: 1629 Blocpdb> 27 atoms in block 72 Block first atom: 1648 Blocpdb> 13 atoms in block 73 Block first atom: 1675 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1688 Blocpdb> 29 atoms in block 75 Block first atom: 1710 Blocpdb> 31 atoms in block 76 Block first atom: 1739 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1770 Blocpdb> 32 atoms in block 78 Block first atom: 1793 Blocpdb> 30 atoms in block 79 Block first atom: 1825 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1855 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 1874 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1902 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1919 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1941 Blocpdb> 33 atoms in block 85 Block first atom: 1961 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 1994 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 2015 Blocpdb> 32 atoms in block 88 Block first atom: 2034 Blocpdb> 20 atoms in block 89 Block first atom: 2066 Blocpdb> 26 atoms in block 90 Block first atom: 2086 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 2112 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2134 Blocpdb> 24 atoms in block 93 Block first atom: 2161 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 2185 Blocpdb> 27 atoms in block 95 Block first atom: 2201 Blocpdb> 22 atoms in block 96 Block first atom: 2228 Blocpdb> 26 atoms in block 97 Block first atom: 2250 Blocpdb> 23 atoms in block 98 Block first atom: 2276 Blocpdb> 27 atoms in block 99 Block first atom: 2299 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 2326 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 2348 Blocpdb> 27 atoms in block 102 Block first atom: 2374 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2401 Blocpdb> 22 atoms in block 104 Block first atom: 2424 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2446 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 2467 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 2491 Blocpdb> 26 atoms in block 108 Block first atom: 2516 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 2542 Blocpdb> 21 atoms in block 110 Block first atom: 2562 Blocpdb> 17 atoms in block 111 Block first atom: 2583 Blocpdb> 23 atoms in block 112 Block first atom: 2600 Blocpdb> 19 atoms in block 113 Block first atom: 2623 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2642 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2665 Blocpdb> 30 atoms in block 116 Block first atom: 2689 Blocpdb> 16 atoms in block 117 Block first atom: 2719 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 2735 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 2768 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 2784 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 2806 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 2825 Blocpdb> 21 atoms in block 123 Block first atom: 2848 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2869 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 2896 Blocpdb> 25 atoms in block 126 Block first atom: 2913 Blocpdb> 28 atoms in block 127 Block first atom: 2938 Blocpdb> 21 atoms in block 128 Block first atom: 2966 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 2987 Blocpdb> 23 atoms in block 130 Block first atom: 3006 Blocpdb> 27 atoms in block 131 Block first atom: 3029 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 3056 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 3072 Blocpdb> 19 atoms in block 134 Block first atom: 3093 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 3112 Blocpdb> 21 atoms in block 136 Block first atom: 3135 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 3156 Blocpdb> 24 atoms in block 138 Block first atom: 3177 Blocpdb> 28 atoms in block 139 Block first atom: 3201 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 3229 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3258 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 3280 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3308 Blocpdb> 23 atoms in block 144 Block first atom: 3330 Blocpdb> 27 atoms in block 145 Block first atom: 3353 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3380 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 3401 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 3427 Blocpdb> 20 atoms in block 149 Block first atom: 3447 Blocpdb> 28 atoms in block 150 Block first atom: 3467 Blocpdb> 27 atoms in block 151 Block first atom: 3495 Blocpdb> 24 atoms in block 152 Block first atom: 3522 Blocpdb> 21 atoms in block 153 Block first atom: 3546 Blocpdb> 25 atoms in block 154 Block first atom: 3567 Blocpdb> 25 atoms in block 155 Block first atom: 3592 Blocpdb> 23 atoms in block 156 Block first atom: 3617 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3640 Blocpdb> 19 atoms in block 158 Block first atom: 3662 Blocpdb> 27 atoms in block 159 Block first atom: 3681 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 3708 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3721 Blocpdb> 29 atoms in block 162 Block first atom: 3743 Blocpdb> 31 atoms in block 163 Block first atom: 3772 Blocpdb> 23 atoms in block 164 Block first atom: 3803 Blocpdb> 32 atoms in block 165 Block first atom: 3826 Blocpdb> 30 atoms in block 166 Block first atom: 3858 Blocpdb> 19 atoms in block 167 Block first atom: 3888 Blocpdb> 28 atoms in block 168 Block first atom: 3907 Blocpdb> 17 atoms in block 169 Block first atom: 3935 Blocpdb> 22 atoms in block 170 Block first atom: 3952 Blocpdb> 20 atoms in block 171 Block first atom: 3974 Blocpdb> 33 atoms in block 172 Block first atom: 3994 Blocpdb> 8 atoms in block 173 Block first atom: 4026 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1466133 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12102 Prepmat> Matrix trace = 3204480.0000 Prepmat> Last element read: 12102 12102 35.6494 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 13401 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4034 RTB> Total mass = 4034.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4034 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 215270.7388 RTB> 56805 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56805 Diagstd> Projected matrix trace = 215270.7388 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 215270.7388 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4874636 0.7223823 0.9544189 1.1463072 1.4005321 1.9426481 2.1957687 3.0263647 3.3809924 3.7149956 3.9345642 4.3103439 4.3623624 4.5572589 4.8508474 5.2467281 5.5828433 6.5080011 7.1419043 8.1305543 8.8000756 8.8894059 9.5959630 10.1771433 10.3246785 10.6227267 10.9507200 11.6044101 11.7430699 12.4378967 12.7367928 13.1009234 13.6910071 14.2719441 14.8350978 14.8868248 15.6182971 16.5060755 16.8681325 17.2560571 17.6539788 18.2696770 18.7509240 19.6192520 20.1310807 21.2472181 21.7906744 22.3635623 22.5341663 23.0257884 23.3960046 24.1402490 24.1850260 24.3796039 24.8977730 25.7456674 26.4593398 27.0478236 27.5860980 28.0800767 28.1289621 28.7684443 29.1070101 29.4287716 30.0805979 30.3838199 31.7801730 32.5085576 32.5821404 32.9826161 34.3954346 34.4542575 34.5746485 34.9884389 35.1240028 35.5014452 36.9978522 37.4300412 38.4255946 38.8842676 39.3348007 39.7045268 40.3224375 40.6619647 41.1743244 41.8283940 42.4869152 42.6925259 43.1478025 44.2324046 44.8015797 45.0682087 46.0212402 46.5631932 46.7672791 46.9970686 47.6757652 48.8210395 49.1176049 50.0302307 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034335 0.0034337 0.0034342 0.0034349 0.0034349 75.8169579 92.2951382 106.0876437 116.2641430 128.5114464 151.3534602 160.9120510 188.9104181 199.6720951 209.3025065 215.3989583 225.4505212 226.8068429 231.8179883 239.1685580 248.7365242 256.5801170 277.0250801 290.2032654 309.6387876 322.1354210 323.7663050 336.3872775 346.4242011 348.9261749 353.9266659 359.3491471 369.9191502 372.1226491 382.9735258 387.5478420 393.0485822 401.8028171 410.2389091 418.2543696 418.9829194 429.1529672 441.1813991 445.9937593 451.0929758 456.2643962 464.1525222 470.2259769 480.9905048 487.2241704 500.5486779 506.9097166 513.5299434 515.4849952 521.0777572 525.2500823 533.5389781 534.0335713 536.1775213 541.8455755 550.9946193 558.5792284 564.7567660 570.3486495 575.4325509 575.9332265 582.4430522 585.8603117 589.0895889 595.5778159 598.5720957 612.1719257 619.1475100 619.8478304 623.6455536 636.8625052 637.4068518 638.5195028 642.3290490 643.5722091 647.0208808 660.5162959 664.3629924 673.1402788 677.1458825 681.0574642 684.2507665 689.5546139 692.4516582 696.8006086 702.3132716 707.8200821 709.5307233 713.3039378 722.2134214 726.8452292 729.0048685 736.6724687 740.9973557 742.6194714 744.4416539 749.7977213 758.7501526 761.0511931 768.0889782 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4034 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7224 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9544 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.401 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.943 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.026 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.381 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.715 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.935 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.310 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.362 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.851 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.508 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.142 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.889 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00004 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 72612 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99997 1.00004 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00005 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99995 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 19071905024851611.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 19071905024851611.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 19071905024851611.atom Openam> file on opening on unit 11: 19071905024851611.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 516 First residue number = 58 Last residue number = 313 Number of atoms found = 4034 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9926E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7224 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9544 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.401 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.943 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.026 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.381 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.715 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.935 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.310 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.362 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.851 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.508 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.142 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.889 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03 Bfactors> 106 vectors, 12102 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.487500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.430 for 516 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.045 +/- 0.06 Bfactors> = 0.670 +/- 0.09 Bfactors> Shiftng-fct= 0.625 Bfactors> Scaling-fct= 1.583 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 19071905024851611.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 19071905024851611.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 116.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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Chkmod> That is: 4034 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19071905024851611.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19071905024851611.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 19071905024851611 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure 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0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=0 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=20 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=40 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=60 19071905024851611.eigenfacs 19071905024851611.atom calculating perturbed structure for DQ=80 19071905024851611.eigenfacs 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