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LOGs for ID: 19010710393553610

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 19010710393553610.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 19010710393553610.atom to be opened. Openam> File opened: 19010710393553610.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 195 First residue number = 26 Last residue number = 123 Number of atoms found = 1533 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 20.831188 +/- 6.661763 From: 5.973000 To: 37.805000 = -11.845573 +/- 7.998103 From: -30.629000 To: 9.096000 = 21.494270 +/- 20.431691 From: -15.516000 To: 59.017000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.1022 % Filled. Pdbmat> 539696 non-zero elements. Pdbmat> 58957 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.92 +/- 22.65 Maximum number = 133 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 1.179140E+06 Pdbmat> Larger element = 463.210 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 195 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 19010710393553610.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 19010710393553610.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 19010710393553610.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1533 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 195 residues. Blocpdb> 8 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 9 Blocpdb> 11 atoms in block 3 Block first atom: 16 Blocpdb> 7 atoms in block 4 Block first atom: 27 Blocpdb> 6 atoms in block 5 Block first atom: 34 Blocpdb> 8 atoms in block 6 Block first atom: 40 Blocpdb> 6 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 5 atoms in block 8 Block first atom: 54 Blocpdb> 9 atoms in block 9 Block first atom: 59 Blocpdb> 7 atoms in block 10 Block first atom: 68 Blocpdb> 4 atoms in block 11 Block first atom: 75 Blocpdb> 7 atoms in block 12 Block first atom: 79 Blocpdb> 7 atoms in block 13 Block first atom: 86 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 93 Blocpdb> 7 atoms in block 15 Block first atom: 101 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 108 Blocpdb> 4 atoms in block 17 Block first atom: 116 Blocpdb> 6 atoms in block 18 Block first atom: 120 Blocpdb> 10 atoms in block 19 Block first atom: 126 Blocpdb> 7 atoms in block 20 Block first atom: 136 Blocpdb> 7 atoms in block 21 Block first atom: 143 Blocpdb> 11 atoms in block 22 Block first atom: 150 Blocpdb> 7 atoms in block 23 Block first atom: 161 Blocpdb> 6 atoms in block 24 Block first atom: 168 Blocpdb> 11 atoms in block 25 Block first atom: 174 Blocpdb> 4 atoms in block 26 Block first atom: 185 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 189 Blocpdb> 7 atoms in block 28 Block first atom: 196 Blocpdb> 4 atoms in block 29 Block first atom: 203 Blocpdb> 7 atoms in block 30 Block first atom: 207 Blocpdb> 9 atoms in block 31 Block first atom: 214 Blocpdb> 7 atoms in block 32 Block first atom: 223 Blocpdb> 11 atoms in block 33 Block first atom: 230 Blocpdb> 11 atoms in block 34 Block first atom: 241 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 252 Blocpdb> 9 atoms in block 36 Block first atom: 260 Blocpdb> 11 atoms in block 37 Block first atom: 269 Blocpdb> 9 atoms in block 38 Block first atom: 280 Blocpdb> 6 atoms in block 39 Block first atom: 289 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 295 Blocpdb> 6 atoms in block 41 Block first atom: 306 Blocpdb> 7 atoms in block 42 Block first atom: 312 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 319 Blocpdb> 8 atoms in block 44 Block first atom: 331 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 339 Blocpdb> 7 atoms in block 46 Block first atom: 347 Blocpdb> 9 atoms in block 47 Block first atom: 354 Blocpdb> 8 atoms in block 48 Block first atom: 363 Blocpdb> 7 atoms in block 49 Block first atom: 371 Blocpdb> 6 atoms in block 50 Block first atom: 378 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 384 Blocpdb> 5 atoms in block 52 Block first atom: 393 Blocpdb> 6 atoms in block 53 Block first atom: 398 Blocpdb> 7 atoms in block 54 Block first atom: 404 Blocpdb> 6 atoms in block 55 Block first atom: 411 Blocpdb> 9 atoms in block 56 Block first atom: 417 Blocpdb> 6 atoms in block 57 Block first atom: 426 Blocpdb> 9 atoms in block 58 Block first atom: 432 Blocpdb> 5 atoms in block 59 Block first atom: 441 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 446 Blocpdb> 11 atoms in block 61 Block first atom: 457 Blocpdb> 11 atoms in block 62 Block first atom: 468 Blocpdb> 8 atoms in block 63 Block first atom: 479 Blocpdb> 8 atoms in block 64 Block first atom: 487 Blocpdb> 6 atoms in block 65 Block first atom: 495 Blocpdb> 7 atoms in block 66 Block first atom: 501 Blocpdb> 6 atoms in block 67 Block first atom: 508 Blocpdb> 9 atoms in block 68 Block first atom: 514 Blocpdb> 4 atoms in block 69 Block first atom: 523 Blocpdb> 8 atoms in block 70 Block first atom: 527 Blocpdb> 5 atoms in block 71 Block first atom: 535 Blocpdb> 4 atoms in block 72 Block first atom: 540 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 544 Blocpdb> 12 atoms in block 74 Block first atom: 551 Blocpdb> 11 atoms in block 75 Block first atom: 563 Blocpdb> 6 atoms in block 76 Block first atom: 574 Blocpdb> 8 atoms in block 77 Block first atom: 580 Blocpdb> 12 atoms in block 78 Block first atom: 588 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 600 Blocpdb> 9 atoms in block 80 Block first atom: 612 Blocpdb> 7 atoms in block 81 Block first atom: 621 Blocpdb> 7 atoms in block 82 Block first atom: 628 Blocpdb> 9 atoms in block 83 Block first atom: 635 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 644 Blocpdb> 6 atoms in block 85 Block first atom: 658 Blocpdb> 9 atoms in block 86 Block first atom: 664 Blocpdb> 9 atoms in block 87 Block first atom: 673 Blocpdb> 6 atoms in block 88 Block first atom: 682 Blocpdb> 8 atoms in block 89 Block first atom: 688 Blocpdb> 12 atoms in block 90 Block first atom: 696 Blocpdb> 8 atoms in block 91 Block first atom: 708 Blocpdb> 9 atoms in block 92 Block first atom: 716 Blocpdb> 8 atoms in block 93 Block first atom: 725 Blocpdb> 8 atoms in block 94 Block first atom: 733 Blocpdb> 7 atoms in block 95 Block first atom: 741 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 748 Blocpdb> 8 atoms in block 97 Block first atom: 757 Blocpdb> 8 atoms in block 98 Block first atom: 765 Blocpdb> 7 atoms in block 99 Block first atom: 773 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 780 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 791 Blocpdb> 6 atoms in block 102 Block first atom: 798 Blocpdb> 8 atoms in block 103 Block first atom: 804 Blocpdb> 6 atoms in block 104 Block first atom: 812 Blocpdb> 5 atoms in block 105 Block first atom: 818 Blocpdb> 9 atoms in block 106 Block first atom: 823 Blocpdb> 7 atoms in block 107 Block first atom: 832 Blocpdb> 4 atoms in block 108 Block first atom: 839 Blocpdb> 7 atoms in block 109 Block first atom: 843 Blocpdb> 7 atoms in block 110 Block first atom: 850 Blocpdb> 8 atoms in block 111 Block first atom: 857 Blocpdb> 7 atoms in block 112 Block first atom: 865 Blocpdb> 8 atoms in block 113 Block first atom: 872 Blocpdb> 4 atoms in block 114 Block first atom: 880 Blocpdb> 6 atoms in block 115 Block first atom: 884 Blocpdb> 10 atoms in block 116 Block first atom: 890 Blocpdb> 7 atoms in block 117 Block first atom: 900 Blocpdb> 7 atoms in block 118 Block first atom: 907 Blocpdb> 11 atoms in block 119 Block first atom: 914 Blocpdb> 7 atoms in block 120 Block first atom: 925 Blocpdb> 6 atoms in block 121 Block first atom: 932 Blocpdb> 11 atoms in block 122 Block first atom: 938 Blocpdb> 4 atoms in block 123 Block first atom: 949 Blocpdb> 7 atoms in block 124 Block first atom: 953 Blocpdb> 7 atoms in block 125 Block first atom: 960 Blocpdb> 4 atoms in block 126 Block first atom: 967 Blocpdb> 7 atoms in block 127 Block first atom: 971 Blocpdb> 9 atoms in block 128 Block first atom: 978 Blocpdb> 7 atoms in block 129 Block first atom: 987 Blocpdb> 11 atoms in block 130 Block first atom: 994 Blocpdb> 11 atoms in block 131 Block first atom: 1005 Blocpdb> 8 atoms in block 132 Block first atom: 1016 Blocpdb> 9 atoms in block 133 Block first atom: 1024 Blocpdb> 11 atoms in block 134 Block first atom: 1033 Blocpdb> 9 atoms in block 135 Block first atom: 1044 Blocpdb> 6 atoms in block 136 Block first atom: 1053 Blocpdb> 11 atoms in block 137 Block first atom: 1059 Blocpdb> 6 atoms in block 138 Block first atom: 1070 Blocpdb> 7 atoms in block 139 Block first atom: 1076 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 1083 Blocpdb> 8 atoms in block 141 Block first atom: 1095 Blocpdb> 8 atoms in block 142 Block first atom: 1103 Blocpdb> 7 atoms in block 143 Block first atom: 1111 Blocpdb> 9 atoms in block 144 Block first atom: 1118 Blocpdb> 8 atoms in block 145 Block first atom: 1127 Blocpdb> 7 atoms in block 146 Block first atom: 1135 Blocpdb> 6 atoms in block 147 Block first atom: 1142 Blocpdb> 9 atoms in block 148 Block first atom: 1148 Blocpdb> 5 atoms in block 149 Block first atom: 1157 Blocpdb> 6 atoms in block 150 Block first atom: 1162 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 1168 Blocpdb> 6 atoms in block 152 Block first atom: 1175 Blocpdb> 9 atoms in block 153 Block first atom: 1181 Blocpdb> 6 atoms in block 154 Block first atom: 1190 Blocpdb> 9 atoms in block 155 Block first atom: 1196 Blocpdb> 5 atoms in block 156 Block first atom: 1205 Blocpdb> 11 atoms in block 157 Block first atom: 1210 Blocpdb> 11 atoms in block 158 Block first atom: 1221 Blocpdb> 11 atoms in block 159 Block first atom: 1232 Blocpdb> 8 atoms in block 160 Block first atom: 1243 Blocpdb> 8 atoms in block 161 Block first atom: 1251 Blocpdb> 6 atoms in block 162 Block first atom: 1259 Blocpdb> 7 atoms in block 163 Block first atom: 1265 Blocpdb> 6 atoms in block 164 Block first atom: 1272 Blocpdb> 9 atoms in block 165 Block first atom: 1278 Blocpdb> 4 atoms in block 166 Block first atom: 1287 Blocpdb> 8 atoms in block 167 Block first atom: 1291 Blocpdb> 5 atoms in block 168 Block first atom: 1299 Blocpdb> 4 atoms in block 169 Block first atom: 1304 Blocpdb> 7 atoms in block 170 Block first atom: 1308 Blocpdb> 12 atoms in block 171 Block first atom: 1315 Blocpdb> 11 atoms in block 172 Block first atom: 1327 Blocpdb> 6 atoms in block 173 Block first atom: 1338 Blocpdb> 8 atoms in block 174 Block first atom: 1344 Blocpdb> 12 atoms in block 175 Block first atom: 1352 Blocpdb> 12 atoms in block 176 Block first atom: 1364 Blocpdb> 9 atoms in block 177 Block first atom: 1376 Blocpdb> 7 atoms in block 178 Block first atom: 1385 Blocpdb> 7 atoms in block 179 Block first atom: 1392 Blocpdb> 9 atoms in block 180 Block first atom: 1399 Blocpdb> 14 atoms in block 181 Block first atom: 1408 Blocpdb> 6 atoms in block 182 Block first atom: 1422 Blocpdb> 9 atoms in block 183 Block first atom: 1428 Blocpdb> 9 atoms in block 184 Block first atom: 1437 Blocpdb> 6 atoms in block 185 Block first atom: 1446 Blocpdb> 8 atoms in block 186 Block first atom: 1452 Blocpdb> 12 atoms in block 187 Block first atom: 1460 Blocpdb> 8 atoms in block 188 Block first atom: 1472 Blocpdb> 9 atoms in block 189 Block first atom: 1480 Blocpdb> 8 atoms in block 190 Block first atom: 1489 Blocpdb> 8 atoms in block 191 Block first atom: 1497 Blocpdb> 7 atoms in block 192 Block first atom: 1505 Blocpdb> 9 atoms in block 193 Block first atom: 1512 Blocpdb> 9 atoms in block 194 Block first atom: 1521 Blocpdb> 4 atoms in block 195 Block first atom: 1529 Blocpdb> 195 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 539891 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4599 Prepmat> Matrix trace = 1179140.0000 Prepmat> Last element read: 4599 4599 76.0887 Prepmat> 19111 lines saved. Prepmat> 16783 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1533 RTB> Total mass = 1533.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1533 RTB> Number of blocks = 195 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 275092.2937 RTB> 80847 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1170 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80847 Diagstd> Projected matrix trace = 275092.2937 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1170 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 275092.2937 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1870338 0.2066885 0.8319962 0.9808755 2.5542999 4.2905355 6.3643000 7.4907879 8.2470816 8.6891580 11.1392970 14.0336041 15.3084847 15.9868516 16.5757057 17.6440669 18.1219637 19.6917517 20.4844469 20.7603067 22.1676976 22.8441057 23.0058433 24.9065119 25.5531776 25.6119307 26.8416541 30.5019243 30.9369576 31.1957244 31.6646098 32.9403646 34.0243774 34.4671448 34.7928394 36.1778797 36.6709031 37.3451310 37.8553029 39.4816465 39.7668747 40.6133238 41.3277714 41.8821949 42.3396870 43.2852959 44.0089226 44.5686736 45.1408276 45.9097074 47.6091247 48.9819454 49.3219345 49.9043743 50.5234311 51.6042769 51.9439047 52.2546081 53.1570361 53.9688024 54.2569327 54.6709709 54.7452968 55.6009972 56.5346385 57.1152927 58.2332244 58.6235635 59.0324637 59.7641104 60.1228318 61.4553713 62.3878040 63.2140682 63.4769952 63.8689528 65.6780850 66.2114495 66.7684911 67.2642906 67.8039632 68.8042305 69.4263009 70.3371168 70.9935608 71.7461071 72.2217877 73.0572878 74.1094962 74.5763358 75.1253898 75.3801559 75.9415671 76.6916167 77.0374896 78.1884864 78.6260055 78.8776305 79.1121955 79.8891410 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034327 0.0034340 0.0034344 0.0034360 0.0034362 0.0034363 46.9629407 49.3689024 99.0503367 107.5479730 173.5526409 224.9318895 273.9495564 297.2069982 311.8497681 320.0988593 362.4300267 406.7990137 424.8752005 434.1869359 442.1109724 456.1362926 462.2723396 481.8783953 491.4817564 494.7800304 511.2761979 519.0179291 520.8520268 541.9406591 548.9309736 549.5616756 562.6002461 599.7343169 603.9960264 606.5167760 611.0578820 623.2459736 633.4179612 637.5260495 640.5310935 653.1558716 657.5913371 663.6090099 668.1264163 682.3275518 684.7877938 692.0373702 698.0978064 702.7647946 706.5926273 714.4395293 720.3866373 724.9534734 729.5919590 735.7792614 749.2735101 759.9994798 762.6325388 767.1222649 771.8656218 780.0781776 782.6409661 784.9781670 791.7273708 797.7497388 799.8764294 802.9225843 803.4681903 809.7231776 816.4932334 820.6755284 828.6682499 831.4409054 834.3355228 839.4899665 842.0056277 851.2854367 857.7191959 863.3803308 865.1740018 867.8410278 880.0462992 883.6124531 887.3216156 890.6099924 894.1756105 900.7470561 904.8097949 910.7256351 914.9655870 919.8022150 922.8463468 928.1689862 934.8290735 937.7688461 941.2145875 942.8091658 946.3135480 950.9752778 953.1172756 960.2110142 962.8937915 964.4333239 965.8662676 970.5974727 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1533 Rtb_to_modes> Number of blocs = 195 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1870 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9809 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.554 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.89 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1170 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 27594 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00002 1.00003 1.00001 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 19010710393553610.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 19010710393553610.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 19010710393553610.atom Openam> file on opening on unit 11: 19010710393553610.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 195 First residue number = 26 Last residue number = 123 Number of atoms found = 1533 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9925E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1870 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9809 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.554 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.89 Bfactors> 106 vectors, 4599 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.187000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.544 for 195 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.153 +/- 0.10 Bfactors> = 77.576 +/- 18.15 Bfactors> Shiftng-fct= 77.424 Bfactors> Scaling-fct= 181.084 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 19010710393553610.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 19010710393553610.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.9 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Chkmod> That is: 1533 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19010710393553610.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19010710393553610.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 19010710393553610 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=0 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom 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0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=0 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=80 19010710393553610.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 19010710393553610 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=0 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 19010710393553610 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=0 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=20 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=40 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=60 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=80 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom calculating perturbed structure for DQ=100 19010710393553610.eigenfacs 19010710393553610.atom making animated gifs 11 models are in 19010710393553610.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19010710393553610.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 19010710393553610.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 19010710393553610.10.pdb 19010710393553610.11.pdb 19010710393553610.7.pdb 19010710393553610.8.pdb 19010710393553610.9.pdb STDERR: real 0m19.045s user 0m19.008s sys 0m0.028s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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