Tuesday, May 30th 2017                           

EBSI TEAM

Elucidation of Biosynthesis by isotopic spectrometry

 

OVERVIEW

 

EBSI « Elucidation de Biosynthèse par Spectrométries Isotopiques », était l'équipe phare de l'UMR-6006 (LAIEM) avant son intégration dans CEISAM. A ce jour, elle est composée d'une douzaine de permanents qui possèdent des compétences très complémentaires allant de la méthodologie instrumentale aux applications dans le domaine des mécanismes réactionnels, en passant par l'étape indispensable de la préparation de l'échantillon, associée à la qualité des mesures. Cela lui donne sa cohérence et son caractère scientifique unique.

Son positionnement scientifique est l'un de ses points forts. Deux éléments émergent :
•  L'analyse isotopique en abondance naturelle . Très peu d'équipes, au niveau international, maitrisent à la fois les méthodologies liées aux mesures isotopiques par Spectrométrie de Masse (irm-MS) et par Résonance Magnétique Nucléaire (RMN), tout en proposant des applications originales de ces méthodologies.
•  La RMN ultra-rapide . Méthode émergente, permettant des analyses de durée de l'ordre de la seconde.

En termes du nombre de publications, EBSI est la 1 ère équipe au niveau mondial en ce qui concerne la RMN ( 13 C ) isotopique, et les applications quantitatives de la RMN ultra rapide. Grâce à ces niches d'excellence, EBSI a une réputation internationalement reconnue dans ces domaines. De plus, la production scientifique est à un très bon niveau tant par le choix de journaux à IF élevé, que par les invitations à participer et à organiser des congrès internationaux. Cette notoriété et cette compétence sont mises à disposition de CEISAM par l'intermédiaire de la gestion de la plateforme spectrométrie. De plus, une ouverture vers le monde socio-économique a été réalisée en créant début 2012 une cellule de compétence «  SpectroMaitrise  », gérée par CAPACITÉS (Filiale de valorisation de l'Université de Nantes)

Les Mots Clés sont en lien avec les compétences de l'équipe :

Fractionnement isotopique  -  Quantification  -  RMN  -  SMRI  -  Authentification

Trois Domaines de recherche permettent de délimiter les activités de l'équipe :

Environnement  : physiologie des plantes, effets climatiques, suivi de contamination de sols ou des eaux, études "forensiques".
Métabolisme  : métabolomique, fluxomique, nutrition, filiation, réactivité enzymatique.
Développements méthodologiques : méthodes de quantification précises et reproductibles d'un signal RMN. Applications nouvelles de la SMRI.

Cet ensemble, caractérisé par une grande synergie entre chaque domaine et l'interconnexion des projets , est décrit par le schéma suivant :

EBSI Personnel:

Researchers Technical staff PhDs, post docs
AKOKA Serge (NMR platform)
BAGUET-GENRE-GRANDPIERRE Evelyne
FARJON Jonathan
GIRAUDEAU Patrick
REMAUD Gérald
ROBINS Richard
TEA Illa
CHARRIER Benoît (NMR platform)
GRAND Mathilde
LOQUET Denis (Chromatography)
MARTINEAU Estelle
SCHIPHORST Anne-Marie (SMRI)
SILVESTRE Virginie (NMR platform)
GOUILLEUX Boris
GRZYBKOWSKA Anna
JEZEQUEL Tangi
JOUBERT Valentin
JULIEN Maxime
MARCHAND Jérémy
ROUGER Laetitia
SOKOLENKO Stanislav

Specific Equipments:

Spectromètre RMN AVANCE HD 700 MHz BRUKER, sonde: CRYO inverse 1H/13C/15N/2H .

Spectromètre RMN AVANCE III 500 MHz BRUKER,sonde: CRYO 1H/13C et sonde1H/2H.

  • Spectromètre RMN AVANCE 400 MHz BRUKER, sondes: DUAL+ 1H/13C, 1H/2H.
  • Spectromètre de Masse de Rapports Isotopiques avec ces 2 interfaces: Analyseur Élémentaire et Chromatographie Gazeuse (AE/ CG-C/ SMRI Delta V Advantge Thermo Electron ).
  • Spectromètre de Masse de Rapports Isotopiques couplé à un Analyseur Élémentaire (AE/ SMRI Integra 2 Sercon).
  • Spectromètre RMN bas champs SPINSOLVE 43MHz MAGRITEK, sonde 1H avec gradient et lock 19F intégré.

Main Partners:

  Spectromaitrise (Cellule de Compétence via CAPACITÉS)

  Plate forme Corsaire (Biogenouest)

   L'opération Equipement RMN CEISAM est cofinancée par l'Union Européenne. L'Europe s'engage en Pays de la Loire avec le FEDER

Ongoing scientific projects:

Projet régional «RésoNantes» : Résonance Magnétique Nucléaire à bas champ pour l'élucidation de mécanismes réactionnels en temps réel   (11/2014 - 10/2017)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     
Intervenants : Boris GOUILLEUX, Benoît CHARRIER, Serge AKOKA, François-Xavier ELPIN, Mireia RODRIGUEZ-ZUBIRI
Partenariat : Equipe CORAIL, CEISAM

 

ANR FRIME (Défi 9) : Expériences de mesures intra-moléculaires isotopiques pour la Police scientifique : Développement et utilisation de la spectrométrie RMN quantitative 13C et 15N    (10/2015 - 03/2019)

Responsable : Gérald S. REMAUD     
Intervenants : Gérald S. REMAUD, Serge AKOKA 
Partenaire : Laboratoire de la police Scientifique de Lyon

 

Projet régional « stratégie internationale » ‘PLAISIR' : Collaboration internationale en Pays de Loire pour le développement et la valorisation du nouveau concept « Isotopomics ». Pays de la Loire Association for International Structure on Isotopomic Research  (07/2015 – 07/2018)  

Responsable : Gérald Remaud
Intervenant: Maxime JULIEN
Partenariat : Centre de Recherche en Nutrition Humaine, CRNH (Nantes), LABERCA (Nantes), LEVA (Angers), Institute of Applied Radiation Chemistry (University of Lodz, Poland), Research school of biology (RSB) (Australian National University, Canberra, Australia), Earth-Life Science Institute and Dpt of Environmental Chemistry and Engineering (Tokyo Institute of Technology, Japan)

 

Projet ANSM jeune chercheur :Profil Isotopique des Médicaments, une empreinte unique  (01/2015 - 12/2017)

Responsable : Pierrick NUN     
Intervenants : Gérald REMAUD, Christine HERRENKNECHT, Rémi VANEL, Mathilde GRAND, Virginie SILVESTRE
Partenariat : laboratoire MMS, EA2660, Nantes

 

Projet IUF « SPAF-qNMR». RMN quantitative sensible, précise et rapide  (10/2014 - 09/2019)  

Responsable  : Patrick GIRAUDEAU
Intervenant : Patrick GIRAUDEAU

 

ANR ISOTO-POL : Modélisation des effets isotopiques mesurés par RMN quantitative au cours du suivi de la contamination d’un sol par un polluant issu de carburants (ANR 2011 CESA 009 01)    (01/2012 - 00/2016)

Responsable : Gérald S. REMAUD     Co-Responsable: Richard J. ROBINS
Intervenants : Gérald S. REMAUD, Richard J. ROBINS  

 

POST-DOCTORAT dans le cadre du projet PLAISIR: Développement de méthodes analytiques pour déterminer la teneur en carbone-13 position-spécifique dans les acides gras.    (12/2015 - 11/2016)

Responsable : Gérald Remaud
Intervenant: Maxime JULIEN
Partenariat : Earth-Life Science Institute and Dpt of Environmental Chemistry and Engineering (Tokyo Institute of Technology, Japan)

 

THESE :thèse MENRT Développements méthodologiques en RMN 1D et 2D hétéronucléaire pour l'analyse isotopique en abondance naturelle

Responsables : Patrick GIRAUDEAU, Serge AKOKA
Intervenant  : Tangi JEZEQUEL

 

THESE : thèse CIFRE en collaboration avec EUROFINS (Nantes) (07/2015 – 07/2018)

Responsable : Gérald Remaud
Intervenant : Sophie GUYADER

 

THESE : thèse projet ANR FRIIME Développement et utilisation de la spectrométrie RMN quantitative 13 C et 15 N pour des mesures intra-moléculaires isotopiques comme outil d'investigation de la Police Scientifiq

Responsables : Gérald REMAUD, Serge AKOKA
Intervenant : Valentin JOUBERT

 

THESE: Thèse CIFRE en collaboration avec Michelin    (00/2015 - 11/2017)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     
Intervenants : Patrick GIRAUDEAU, Laetitia ROUGER

 

THESE: Résonance Magnétique Nucléaire à bas champ pour l’élucidation de mécanismes réactionnels en temps réel    (11/2014 - 11/2017)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     
Intervenants : Boris GOUILLEUX, Patrick GIRAUDEAU, Benoît CHARRIER 

 

THESE: Effets isotopiques mesurés par RMN quantitative au cours du suivi de la pollution d’un sol par les éthers présents dans les carburants.    (10/2012 - 10/2015)

Responsable : Gérald S. REMAUD     Co-Responsable: Pierrick NUN
Intervenant : Maxime JULIEN

 

CONTRAT: Développement de méthodologies en Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) pour l’analyse quantitative.    (02/2012 - 00/2018)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     Co-Responsable: Gérald S. REMAUD
Intervenant : Estelle MARTINEAU

 

CONTRAT: Staboxal, collaboration avec l'INRA de Clermont-Ferrand    (01/2014 - 00/2016)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     
Intervenant(s) : Patrick GIRAUDEAU

 

CONTRAT: Contrat industriel - Sanofi Pasteur    (01/2014 - 00/2016)

Responsable : Patrick GIRAUDEAU     
Intervenant(s) : Patrick GIRAUDEAU  Estelle MARTINEAU  Serge AKOKA